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旨在更好的了解内江猪群体结构和遗传多样性,更好的保护和利用内江猪遗传资源。本研究基于低深度全基因组测序,检测了133头(12头公猪,121头母猪)内江猪的SNP,按照SNP检出率大于90%和95%获得两组SNP数据,分别编号为NJ90和NJ95。针对两组数据,通过群体分层、遗传距离、亲缘关系、家系划分等方法分析了内江猪群体结构,通过等位基因频率、有效等位基因数、多态性标记比、杂合度等指标估计了群体遗传多样性,最后利用不同方法评估了群体近交系数。结果显示:1)NJ90共包含135 760个SNPs位点,其等位基因频率为0.87,有效等位基因数为1.27,多态性标记比为0.76,观测杂合度为0.15,期望杂合度为0.21;NJ95包含32 266个SNPs位点,其等位基因频率为0.79,有效等位基因数为1.44,多态性标记比为0.74,观测杂合度为0.30,期望杂合度为0.31。2)NJ90结果显示群体平均遗传距离为0.20,平均亲缘系数为0.9%;NJ95结果显示群体平均遗传距离为0.25,平均亲缘系数为0.7%。3)根据NJ90公猪和群体聚类以及亲缘关系,可将群体分为6个家系。4)根据... 相似文献
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利用生物信息学方法对辣椒TCP转录因子家族成员、基因分类、基因结构、染色体定位、系统进化关系和结构域序列保守性进行了预测和分析。结果表明,辣椒TCP基因家族包含30个成员,Ca TCP蛋白含有95~550个氨基酸,等电点为6.30~10.91。进化树分析将其分为11个不同的亚族。辣椒TCP家族进化树以及基因结构的进一步分析,显示辣椒TCP家族可分为两大类,即Class I类和Class II类,而Class II类可分为两个不同的亚类,即CIN和CYC/TB1亚类。位于同一亚家族的大多数TCP基因具有相似的内含子和外显子结构。此外,染色体定位分析表明,辣椒TCP基因不均衡的分布于辣椒的10条染色体上,其中3号染色体上最多,有7个。 相似文献
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深县猪是河北优质地方猪种之一,为探究其群体遗传多样性情况,本研究利用39头深县猪的全基因组重测序数据分析了深县猪群体全基因SNP变异情况及特征,并进一步利用检出的SNP探究了其有效群体大小、近交状况和个体间亲缘关系等。结果表明深县猪有效群体大小为5.83头,相比于大白猪(42.47)、北京黑猪(10.27)和民猪(8.38)较小,略高于蓝塘猪(3.52),但遗传多样性保持良好。基于ROH的分析表明群体平均近交系数为(0.054±0.01),通过IBS距离分析则发现部分个体间亲缘关系略近。为了更好地鉴定和区分深县猪,本研究综合运用最大分类能力方法及机器学习方法,最终确定了10个SNP作为深县猪群体特征位点。本研究结果有助于了解深县猪群体的保种现状并为其后续保种措施的制定提供一定参考,同时也为深入挖掘深县猪重要性状形成的分子机制提供新的素材,此外本研究中所挖掘的深县猪SNP特征位点可用于对深县猪进行快速鉴定,从而推动深县猪在地方猪育种中更广泛地应用。 相似文献
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正卵巢静止是卵巢机能不全的一种表现。卵巢机能不全是由于卵巢机能暂时性扰乱,机能减退,处于静止状态,不出现周期性活动。如果机能长久衰退,则引起卵巢组织萎缩和硬化。卵巢机能减退在奶牛卵巢疾病中约占26.3%,在黄牛疾病中达49.7%,在母牛不孕症中发病率最高,是导致牛不育最常见的原因之一。1卵巢静止的病因与病理母畜的性周期主要受到"下丘脑―垂体―性腺轴"系统的调控及环境因素的影响。下丘脑分泌促性腺激素释放因子,兴奋或抑制脑垂体的活动,而脑垂体又通过分泌促性腺激素控制着卵巢活动,使卵巢上 相似文献
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<正>我国是世界传统农业大国和人口大国,粮食必须依靠我们自己生产为主。但长期以来,受人多地少、耕地资源有限、农业基础设施落后、农业机械化程度低、生态环境复杂、农业抗自然风险能力弱、农业科技投入不足等因素制约,导致农业生产投入大、收益低、粗放种植、产业链长期脱节、农村劳动力大量转移,粮食安全存在较严重的隐患。因此,必须立足全产业链发展模式,加大农业科技投入,逐步改变"农业落后、农村很穷、农民很苦"的局面,充分保障 相似文献
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2014年6月18日,借中国国际水博会在湛江开幕之际,国联水产举办品牌战略发布和国内市场建设启动仪式,在启动仪式上,国联水产董事长李忠正式向外界宣布,国联水产将会从国外引进更多的海产品,进军水产品内销市场。记者从发布会了解到,接下来,国联水产会迅速调整了产品结构,开发休闲食品和精深加工食品来迎合国内消费者的需求。全国精品系列产品的引入,对国内市场极具诱惑。 相似文献