鸡IGF-Ⅰ基因SNPs及其对屠体性状的遗传效应分析

以180只3个品系的温岭草鸡为材料,采用PCR-RFLP方法测定了IGF-Ⅰ基因的3个SNPs座位,同时分析了它们对屠体性状的遗传效应.结果显示PstⅠ、HinfⅠ和TaqⅠ识别座位分别发生T→C、C→A和C→T突变,每个SNPs座位各出现了3种基因型,其中A系在3个座位上均处于Hardy-Weinberg平衡状态(P＞0.05).方差分析显示每个座位基因型对部分屠体性状都有极显著或显著的差异(P≤0.01或0.01＜P≤0.05).多重比较显示在其中6个屠体性状上,每个座位3种基因型的最小二乘均值之间均有突变型＞杂合型＞野生型的关系,联合基因型QF/QF和QE/QF的最小二乘均值在4个屠体性状上显著高于(0.01＜P≤0.05)联合基因型PE/QE,每个座位突变等位基因都对部分屠体性状具有增效作用.A系和B系之间的遗传距离为0.005 3,聚类分析表明两系同为1枝.     

重庆柑橘主产区衰退病毒组群分析

柑橘衰退病毒(CTV)存在严重的株系混合侵染现象,因此需要用一定的方法对混合株系进行识别。本文应用CPGs/HinfⅠ对采自重庆市6个主要柑橘产区的92个CTV阳性样品进行限制性片段长度多态性(RFLP)分析,结果发现在甜橙上既有单一株系侵染(CPGs/HinfⅠRFLP组群以3为主),也有混合株系侵染(CPGs/HinfⅠRFLP组群以1、3或1、3、6组群为主),而在柚类上只带单一的CPGs/HinfⅠRFLP6组群。     

DNA标记技术在梨属植物研究中的应用

综述了几种常见的DNA标记如RFLP、RAPD、SSR、AFLP和SCAR在梨属植物研究中的应用以及所取得的进展。DNA标记技术主要在梨属植物的品种鉴别、亲子关系鉴定、分类和系统关系研究、遗传图谱构建与标记辅助育种等研究领域中得到了广泛的应用。还对各种标记的特点和在梨属植物研究中的应用范围做了总结,期望为今后研究中合理选择适宜的标记技术提供参考。     

Species identification method for <Emphasis Type="Italic">Scombrops boops</Emphasis> and <Emphasis Type="Italic">Scombrops gilberti</Emphasis> based on polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism analysis of mitochondrial DNA

ABSTRACT:   Gnomefish Scombrops boops and Scombrops gilberti are commercially important fishes in Japan, but these species are often confused in the markets because of their morphological similarity. To identify these two species, we performed nucleotide sequencing and restriction fragment length polymorphism (RFLP) analysis on 16S ribosomal RNA (rRNA) gene and the control region in mitochondrial DNA. Five and 12 nucleotide substitutions were observed between species in the 777-bp 16S rRNA gene and 471-bp control region, respectively. Diagnostic restriction sites for discriminating between S. boops and S. gilberti were found in the 16S rRNA gene, but not in the control region. Polymerase chain reaction (PCR)–RFLP analysis using two enzymes, Eco NI and Mva I, clearly discriminated between S. boops and S. gilberti identified by meristic characters. The PCR–RFLP analysis identified most of the 168 Scombrops young caught in the coastal waters of the Izu and Miura peninsulas as S. boops , suggesting that S. gilberti juveniles are rare in this area.     

贵州白山羊GDF9基因外显子2的多态性研究

生长分化因子9(GDF9)是卵母细胞分泌的生长因子,对早期卵泡的生长和分化起重要的调节作用。采用RFLP和SSCP方法检测贵州白山羊GDF9基因外显子2的单核苷酸多态性,结果表明:在所有检测样本中均未发现GDF9基因的FecGH突变;在高繁殖率(3羔以上/胎)母羊和公羊中检测到8个杂合的AB基因型,其中5个为高产的母羊,3个为公羊。碱基序列分析证实GDF9基因编码区第1189bp位点的碱基由G突变为A,该位点位于外显子2中,导致活性肽第79位缬氨酸突变为异亮氨酸(V79I),但在低繁殖率(1~2羔/胎)母羊中没有发现该突变。虽然贵州白山羊GDF9基因中G1189A突变的发生率仅为5%,但该位点编码的氨基酸与FecGH突变(S77F)仅相隔1个氨基酸,因此推测GDF9基因中的G1189A突变可能与贵州白山羊的高繁殖力有关。     

大豆品种间DNA限制性片段长度多态性（RFLP）的分析

用６２个大豆ＤＮＡ分子探针与５种限制性内切酶组合，对大豆基因组ＤＮＡ限制性片段长度多态性（ＲＦＬＰ）进行分析，结果表明，所选用的两对材料，其多态性ＲＦＬＰ标记的频率均高达６０％，可作为ＲＦＬＰ作图较理想的亲本，ＲＦＬＰ标记的多态性类型表现为共显性，少数为显性，其中一些标记揭示了２个或２个以上的独立分离的基因座位，不同限制性内切酶的揭示多态性的能力上差异不显著，在杂交片段长度上差异显著并都大于预期，     

用籼/籼交重组自交系群体构建的分子遗传图谱及其与籼/粳交群体的分子图谱的比较

为了最终实现对籼稻数量性状基因位点 (QTLs)精确定位 ,用一个包含 1 31个系的籼 /籼交重组自交系群体 (F6∶7)构建了分子遗传连锁图谱。该图谱含由 1 1 3个水稻探针、2 8个小麦探针揭示的 1 6 0个RFLP标记和由 5个PstⅠ /MseⅠ引物组合揭示的 78个AFLP标记。群体的杂合性比率接近期望值 ,表明该群体具有正常的遗传结构。在 6个染色体区域观察到标记的偏分离 ,表明即使在亚种内群体中也可能发生标记的偏分离。本图谱的总长度为 1 4 35 8cM ,相邻标记间的平均距离为 6 38cM。由于采用了一套日本水稻基因组计划 (RGP)的RFLP标记 ,使本图谱能与RGP图谱进行比较。结果表明 ,两个图谱上的共同标记所覆盖图谱总长度几乎相同 ;在水稻 1 2条染色体中的 9条表现完全的连锁保守性。此外 ,水稻的第 1号染色体与小麦的第 3组染色体具有很强共线性。但是 ,两个图谱间也存在明显的差异 ,在 1S、1L、4L和 8L 4个染色体臂上发现 4个小倒位 ;除第 5号和第 6号染色体外的其他染色体上共检测到 1 9个新的位点。籼稻亲本间在染色体臂 2S、7S、1 0L和 1 1S 4个区域的RFLP多态性很低或没有 ,从而导致籼稻图谱在这些区域呈现空白。在这个籼稻图谱中 ,未检测到第 1 1号和 1 2号染色体间的重复性。还就稻属在基因组进化中的染     

Assessment of genetic diversity of cultivated chickpea using microsatellite-derived RFLP markers: Implications for origin

Restriction fragment length polymorphism (RFLP) analysis was performed on 30 accessions of cultivated chickpea (Cicer arietinum L.) collected from 11 different countries representing the Near East, Central Asian and Hindustani regions. A synthetic digoxygenated oligonucleotide (GATA)₄ complementary to a microsatellite DNA sequence was used as a probe. The results revealed that simple repetitive sequences are abundant and polymorphic in the chickpea genome. The fragments detected were used lo estimate the genetic diversity within accessions and a similarity index between the genotypes of the accessions. The genetic distance data were used to construct a dendrogram depicting genetic relationships among the different accessions. The results indicate that the greatest genetic diversity occurs in Pakistan, Iraq, Afghanistan, south-east Russia, Turkey and Lebanon. Lower genetic diversity was found in Iran, India, Syria, Jordan and Palestine, Based on DNA markers, it is concluded that there are three centres of diversity for chickpea: Pakistan-Afghanistan. Iraq Turkey and Lebanon. India, which was previously considered as a secondary center of diversity for chickpea, showed lower diversity than the above regions.     

畜禽DNA指纹的研究与应用

综述了ＤＮＡ指纹技术的原理，方法，以及在个体（品种）鉴别，亲缘关系分析，群体遗传变异分析，连锁分析等方面的研究进展。     

土壤微生物多样性的分子生态学研究方法

传统的平板培养法分离培养和鉴定土壤微生物只能反映极少数微生物的信息,种类只占土壤微生物种类总数的0.1%～1%,分子生态学方法应用于土壤微生物的鉴定显示出极大的优越性.着重阐述了土壤微生物多样性的研究内容、意义及目前的采用分子生态学的方法研究土壤微生物多样性,尤其以DGGE（denaturing gradient gel electrophoresis）分子生物学技术以及RAPD（Random amplified polymorphic DNA ）随机扩增的多态性分析方法更为精确和快速,为土壤微生物多样性研究提供了一个更加广阔的前景.