基于卷积神经网络的仿刺参非侵入式标记方法的初步研究

使用体外标记技术可对仿刺参(Apostichopus japonicus)进行种群和个体尺度上的时空行为学研究、种群动态研究、良种繁育、高效采捕方法的研究。由于仿刺参体壁柔软, 排异能力较强, 使得传统的侵入式标记方法留存率较低; 且传统标记对体壁的破坏会导致伤口溃烂, 影响仿刺参的正常生活。为研发非侵入性的仿刺参识别技术, 本研究利用深度学习中的卷积神经网络模型, 对仿刺参图像进行特征提取, 该特征能够表征个体独特的体表纹理模式。对 50 d 内连续拍摄的仿刺参图像进行特征提取并训练分类器后, 发现分类器在测试集上最高可达到 0.996±0.011 的精度; 而传统的侵入式标记方法最高只能达到约 0.75 的精度。对实验仿刺参个体进行个体识别跟踪, 使用前 25 d 的仿刺参图像进行特征提取并训练模型, 对后 25 d 的图像进行预测, 可达到 0.946±0.058 的精度。实验结果表明, 使用 ResNet50 卷积神经网络可有效地对仿刺参进行预测, 并在时间追踪任务中取得优于传统标记方法的精度。     

原料及关键工艺参数对水产膨化饲料物理质量影响研究进展

我国快速发展的水产养殖业对饲料种类及产量的需求越来越大，但优质饲用蛋白质资源短缺，鱼粉、豆粕等原料进口依赖严重，成为了限制产业发展的“卡脖子”因素。因此，开发应用新型蛋白质资源，建立基于多元化配方的数字化、智能化水产饲料精细加工技术体系是保证水产饲料行业高效稳定发展的重要途径。除营养价值外，原料性质以及工艺参数都会对水产膨化饲料的生产效率及物理质量产生直接影响，进而决定饲料的饲喂效果以及动物的生长性能。文章就水产膨化饲料物理质量的评估方法，原料种类及工艺参数对水产膨化饲料品质的影响进行了综述，为多元化水产膨化饲料配方的工艺参数及品质优化研究提供参考。     

中间球海胆己糖激酶基因克隆及高温-酸化胁迫对其表达影响的初步研究

为明确中间球海胆己糖激酶的序列信息和表达规律，了解高温-酸化胁迫对其表达和生物活性的影响，以中间球海胆为研究对象，利用cDNA末端快速扩增技术获得中间球海胆已糖激酶基因的全长cDNA序列（SiHK），并利用生物信息学软件分析其序列特征，分析高温-酸化胁迫下中间球海胆肠和性腺组织中SiHK基因的表达及其酶活力变化。结果表明，SiHK基因的cDNA全长2 041 bp，编码476个氨基酸，SiHK蛋白的理论等电点为6.44，蛋白质分子质量52.72 kD。生物信息学分析显示，SiHK蛋白氨基酸序列与紫球海胆HK氨基酸序列相似最高。实时荧光定量PCR结果显示，SiHK基因的表达具有组织特异性，其中，肠和性腺组织中SiHK基因的相对表达量较高，而在体腔液和管足中SiHK酶活力较高。高温-酸化胁迫处理60 d后，与对照组相比，处理组中间球海胆的肠和性腺组织中SiHK基因的相对表达量和SiHK酶活性均发生改变。由此表明，高温-酸化胁迫可能通过调控糖代谢关键酶活性对海胆的物质代谢过程产生影响。     

红鳍东方鲀体表溃烂病优势菌的分离、鉴定及治疗

2021年11月，辽宁大连某养殖场红鳍东方鲀(Takifugu rubripes)出现死亡。通过对患病红鳍东方鲀病灶部位进行细菌分离培养、细菌革兰氏染色、以及细菌16S rDNA序列分析，从患病红鳍东方鲀中共分离出3株优势菌且均为弧菌，分别为哈维弧菌(Vibrio harveyi)、大菱鲆源弧菌(V.scophthalmi)、费氏弧菌(Aliivibrio fischeri)。药敏检测结果表明，费氏弧菌对复方新诺明、氟苯尼考、多西环素3种抗生素敏感；大菱鲆源弧菌仅对恩诺沙星敏感；哈维弧菌对环丙沙星、复方新诺明、氟苯尼考、多西环素、恩诺沙星5种抗生素敏感。3种优势菌对16种抗生素的药物敏感实验结果表明3种优势菌均为多重耐药菌。结合药敏实验结果与相关研究，推荐联合多西环素与山苍子植物精油对红鳍东方鲀体表溃烂病进行防治。     

济南市玫瑰湖浮游植物群落结构调查及水质初步评价

为了掌握济南市水域的生物资源状况，于2020年秋季调查分析了济南玫瑰湖浮游植物的群落结构特征。共采集到浮游植物6门47种，其中绿藻门种类数最多，占浮游植物总种类数的38.30%,硅藻门次之，占比为31.91%。浮游植物优势种主要为四尾栅藻、双对栅藻、四角十字藻、小席藻、细小平裂藻、湖泊鞘丝藻。浮游植物密度和生物量变化范围分别为104.49～793.47×10⁴cell/L、0.40～39.10mg/L,平均值分别为402.72×10⁴cell/L、9.84mg/L。浮游植物Shannon-Wiener多样性指数、Pielou均匀度指数平均值分别为3.085、0.780。生物多样性指数水质评价结果表明，湖区水质整体处于轻污染-清洁状态。建议进一步加强玫瑰湖水文连通、增加蓄水量，合理增殖放流虑食性鱼类，充分利用饵料生物，以鱼养水，为区域生态保护和高质量发展提供有力支撑。     

卓越农林人才培养模式下混合式教学方法在遗传学课程中的应用

遗传学课程是高等学校一门重要的专业核心课程，在生物科学的教育体系中占有重要的地位。介绍了问题导向教学法(PBL)和案例教学法(CBL)相结合的混合式教学方法在遗传学课程中的应用效果。通过问卷调查和考试成绩的比较，对教学效果进行评价。问卷调查结果显示，学生认为问题导向教学法和案例教学法相结合的混合式教学方法在理解遗传学相关知识、灵活应用遗传学知识方面，能够提高学生发现问题、分析问题、解决问题的能力，充分调动了学生学习的积极性，起到了活跃课堂气氛的作用，改善了学习效果。通过比较常规教学方法和混合式教学方法发现，超过90%的学生认为问题导向教学法和案例教学法对于遗传学课程学习有帮助或非常有帮助。混合式教学方法下学生的平均分数为(85.01±2.23)分，常规教学方法下学生的平均分数为(73.12±3.45)分，混合式教学方法下学生的平均分数明显高于常规教学方法。PBL和CBL相结合的混合式教学方法适用于遗传学课程教学，能够提高遗传学课程的教学效果。     

急性淡水胁迫对四指马鲅幼鱼鳃、心脏、脾脏和肝脏组织结构的影响

【目的】探究急性淡水胁迫对四指马鲅（Eleutheronema tetradactylum）幼鱼鳃、心脏、脾脏和肝脏组织结构的影响，为低盐度养殖及良种选育提供参考。【方法】将暂养于盐度9水体中的四指马鲅幼鱼放入盐度0的水族箱中，分别于淡水胁迫2、6、12、24、48、72 h时进行活体取样，采用组织学方法对四指马鲅幼鱼的鳃、心脏、脾脏和肝脏组织结构进行研究。【结果】四指马鲅幼鱼在受到急性淡水胁迫时，鳃小片长度出现逐渐增长的趋势，宽度先缩小后逐渐增大，鳃小片间距先增大后有回落，线粒体丰富细胞数量持续增多。心肌横纹肌大小、心肌细胞间隙大小和间质血管大小均呈现先增后减的趋势，心肌横纹肌大小的峰值出现在淡水胁迫12 h时，心肌细胞间隙和间质血管大小的峰值出现在淡水胁迫24 h时。脾脏的白髓面积和边缘区面积在胁迫24 h内逐渐增加，黑色素巨噬细胞颜色逐渐加深，胁迫24 h时达到峰值，随后逐渐回落；淡水胁迫72 h时，红髓、边缘区、白髓和黑色素巨噬细胞大致恢复至胁迫前水平。未受淡水胁迫的四指马鲅幼鱼肝细胞体积较大，呈多面体，细胞核呈圆球形且位于中央，部分肝细胞具有2～3个核，肝板结构清晰，肝血窦形...     

三种水质调控方式对春秋季刺参池塘水细菌菌群结构的影响

通过16SrRNA高通量测序技术，以自然纳潮和微孔曝气两种水质调控方式池塘为对照，研究了养水机水质调控方式对春秋季刺参养殖池塘水细菌菌群结构的影响。结果表明：各池塘水前10优势门和前3优势纲组成基本一致，但优势属组成差异较大；试验后期（11月份），养水机池塘水与自然纳潮池塘水和微孔曝气池塘水中某些种群丰度具有明显的差异，养水机显著提高了池塘水乳酸菌目的丰度（lefse分析LDA Score＞4），分别提高了251和343倍，显著降低了交替假单胞菌科科和属的丰度（t-test检验），比自然纳潮池塘分别降低了4.1和5.4倍；各池塘水优势功能菌为化能异养12.78%～19.65%和好氧化能异养菌0.96%～4.97%，各功能菌丰度均值差异不显著，但试验后期养水机池塘水发酵菌和植物致病菌丰度增加明显，比自然纳潮池塘和微孔曝气池塘分别提高了32、50和159、216倍；硝酸盐还原菌丰度明显降低，分别降低了4.7和7.7倍；养水机池塘水α-多样性最高，养水机显著提高了池塘水乳酸菌和植物致病菌丰度，提高了细菌种群的α-多样性，前者抑制池塘大型藻生长，后者有益于水质稳定。     

NaHCO3胁迫下杂交鲟皮肤的转录表达特征

为了探明碱胁迫对杂交鲟鲟龙1号皮肤生理功能的影响，采用转录组测序的方法和皮肤组织学切片研究观察了碱胁迫与正常养殖水质条件下杂交鲟皮肤组织的分子特征和组织结构。结果发现，对照组与胁迫组差异表达基因总数量(DEGs)为1 849个，其中1 302个基因在胁迫组的皮肤组织中上调，547个基因下调。对差异表达基因进行GO聚类，主要富集在胞浆钙离子浓度的调节、肌肉收缩、肌钙蛋白复合物、肌钙蛋白T结合、肌钙蛋白C结合等7个GO term上。KEGG富集分析发现，甘氨酸、丝氨酸和苏氨酸代谢，蛋白质的消化和吸收，淀粉和蔗糖代谢等为显著富集通路。代谢通路互作网络分析发现，碱胁迫下鲟龙1号皮肤核心代谢途径为黏着斑、蛋白质消化吸收和血小板活化、补体和凝血级联及缺氧诱导因子-1信号通路等途径为主效途径。组织切片结果显示，杂交鲟在碱胁迫下皮肤组织和肾脏组织受到严重损伤，肾小球和肾小管发生明显皱缩，远曲小管萎缩尤为明显，肾小球上皮细胞体积减小，管壁变薄甚至脱落；皮肤组织的黏液细胞数量随碱度的升高而增多，棒状细胞细胞核发生固缩现象，在碱胁迫下排列更加紧密。揭示了鲟龙1号皮肤组织碱胁迫响应相关基因的总体表达特征，同时...     

鲤疱疹病毒Ⅲ型(CyHV-3)诱导鲤肝组织自噬发生的研究

在鲤(Cyprinus carpio)感染鲤疱疹病毒Ⅲ型(CyHV-3)不同时期,通过分析鲤疱疹病毒标志基因TK和ORF72与自噬标志基因Beclin-1、LC3、P62的差异表达情况,探讨在CyHV-3感染中自噬的发生情况。研究表明:(1)抗病选育组与未选育组鲤TK和ORF72基因以及自噬标志因子Beclin-1、LC3、P62基因相对表达量均呈现先升高后降低的趋势; TK和ORF72基因相对表达量选育组均极显著低于未选育组(P<0.01)且在感染144 h达到最高;(2)选育组鲤Beclin-1、LC3、P62基因相对表达量在感染48h达到最高,且Beclin-1、LC3基因表达量极显著高于未选育组(P<0.001),P62显著高于未选育组(P<0.05);(3)未选育组鲤Beclin-1、LC3、P62基因相对表达量在感染96h达到最高且极显著高于选育组(P<0.001),而P62基因相对表达量持续在感染144h、192h极显著高于选育组(P<0.01),说明P62基因表达发生了聚集;(4) LC3蛋白表达趋势与基因相对表达量趋势一致。以上结果表明C...