云南药用野生稻BIBAC文库的构建及分析

云南药用野生稻具有许多优良性状和有利基因,其CC基因组的优良基因很难通过有性杂交转移到栽培稻(AA基因组)上,但可以通过双元细菌人工染色体(BIBAC)以大片段的形式转化到栽培稻中.利用BIBAC2载体构建了云南药用野生稻基因组DNA文库,该文库包含53 760个克隆,平均插入片段76 kb,保存在140块384孔板中...     

头孢类抗生素对农杆菌介导非洲菊基因转化的影响

研究了头孢曲松钠、头孢哌酮钠、头孢唑林钠、头孢拉定4种头孢霉素类抗生素对农杆菌LBA4404的抑制作用和对非洲菊愈伤组织的诱导及丛生芽形成的影响,结果表明:4种头孢类抗生素在作为抑菌剂用于非洲菊遗传转化试验时,头孢曲松钠的抑菌效果最好,浓度以200 mg/L为宜,同时该抗生素在低浓度下能提高愈伤组织诱导率和丛生芽诱导率,在高浓度下则抑制愈伤组织和芽的形成,有类似植物激素的活性。     

野生稻种子胚乳蛋白的提取及双向电泳条件的确立

为揭示野生稻与栽培稻之问种子贮存的差异,建立了一套适合于水稻胚乳蛋白双向电泳分析的技术。探讨了种子胚乳蛋白的提取、纯化以及双向电泳的一些关键技术。结果表明,直接使用提取液（7M尿素,2M硫脲,4％3-[3-（胆酰氨丙基）二甲铵基]丙磺酸内盐,0．5％等电聚焦缓冲液3—10,40mM二硫苏糖醇）对单位米粉进行抽提后,直接离心上样,可以防止样品蛋白的丢失,保证样品蛋白的完整性,而在等电聚焦时,延长除盐时问,可以有效地减少凝胶中的横纹和竖纹,通过二向电泳分析结果,我们从合系41种子胚乳中得到蛋白斑点数约为310个,从滇超9号种子胚乳中得到蛋白点数约为327个,普通野生稻中得到蛋白点数约为331个,药用野生稻种子胚乳中得到蛋白点数约为346个,疣粒野生稻种子胚乳中得到蛋白点数约为278个。     

东乡野生稻STK抗病基因片段的克隆及序列分析

根据已报道的STK类抗病基因结构中的氨基酸保守区域,设计简并引物,对东乡野生稻STK类抗病基因片段进行克隆,得到一个733bp的cDNA序列,开放阅读框长度为594bp,可编码198个氨基酸,大小约为22kD,理论等电点为8.61。它与云南普通野生稻(AF510988、AY113701)的DNA序列的同源性较高,达98%以上。对其编码的氨基酸序列分析发现该序列属于STKc超家族成员,并具有ATP结合部位、活性部位和底物结合部位。     

野生茶树大理茶种质资源现状调查

2006年10月至2007年5月对野生茶树大理茶种质资源进行调查,调查结果显示:大理茶种主要存在于滇西和滇西南地区,目前发现的分布点有44个.导致大理茶严重被毁的主要原因是农业开垦、过度放牧、砍伐采摘等.据此提出了对野生茶树资源的保护对策.     

云南地方香稻与非香稻遗传多样性比较(英文)

[Objective] The genetic diversity of the local cultivated aromatic rice and non-aromatic rice in Yunnan Province were compared to provide further genetic resources for breeding practice.[Method] Genetic diversity of 10 aromatic rice and 45 non-aromatic rice were analyzed by 64 SSR primers covered on 12 rice chromosomes. [Result] Per locus 5.44 and 7.98 alleles in average were detected, ranging from 2 to 12 and from 2 to 17 in aromatic and non-aromatic rice , respectively. Average genetic multiplicity index(Hs) was 0.46 and 0.67 respectively. The average polymorphism information content (PIC) was 0.43 and 0.58 in aromatic and non-aromatic rice respectively.[Conclusion] The results indicated that genetic diversity was higher in non-aromatic rice than in aromatic rice.     

云南大理茶资源遗传多样性的AFLP分析

采用AFLP标记对仅在云南南部及周边地区狭域分布的茶树近缘植物大理茶11个居群204个个体的遗传多样性进行了研究。分析结果表明:(1)大理茶遗传多样性水平低。在物种水平上,He=0.099,Ho=0.178;在居群水平上,He=0.083,Ho=0.137;(2)居群间的遗传分化较低。基于Nei’s遗传多样性分析得出的居群间遗传分化系数Gst=0.1606;Shannon’s居群分化系数为16.04%。AMOVA分析显示:大理茶的遗传变异主要存在于居群内,占总变异的80.97%,居群间的遗传变异占19.03%;(3)两两居群间的Nei’s遗传一致度(I)的范围为0.971～0.997。经Mantel检测,居群间的遗传距离和地理距离之间不存在显著的正相关关系(r=0.1127,P<0.001)。推测人类活动的干扰和生境的片断化是导致大理茶濒危现状的主要因素。基于观察到的居群遗传信息,建议采取就地保护和迁地保护的保护策略。     

本山茶与勐库茶疑似杂交后代的RAPD鉴定

应用随机扩增多态性DNA (RAPD) 分子标记技术,对云南临沧白莺山的8个茶树植株进行了亲缘关系鉴定.筛选出的19个RAPD引物在疑似双亲本山茶和勐库茶中,分别能扩增出28和20条各自的特异条带.通过特异条带在疑似杂交后代的表现数量、表现率及聚类树状图两方面的分析,可能的推测是:黑条子茶、二嘎子茶可能是本山茶在长时间的历史过程中发生较大变异的产物;白芽子茶、黑条子茶和二嘎子茶可能是本山茶与勐库茶自然杂交获得的F1代后又经混交,经数代繁衍后形成的产物.     

疣粒野生稻泛素结合酶基因的全长cDNA序列克隆与分析

从已构建疣粒野生稻消减cDNA文库中随机挑取阳性单克隆经测序得到ESTs, 通过生物信息学分析, 选取与泛素结合酶具有同源功能的EST以RACE技术分离克隆到1个疣粒野生稻泛素结合酶基因的全长cDNA序列, 命名为OmE2 (Oryza meyerianaBaill. ubiquitin-conjugating enzyme, OmE2), 该序列长917 bp, 最大开放阅读框为528 bp, 编码的蛋白具有175个氨基酸, 该蛋白的分子量为19.31 kD, 理论等电点为9.32。OmE2蛋白与其他物种的泛素结合酶具有高度的一致性和相似性, 含有泛素结合酶活性位点的保守序列及半胱氨酸残基, 且具有3个跨膜结构域, 推测OmE2是一类泛素结合蛋白兼跨膜蛋白。经RT-PCR分析, OmE2基因是受白叶枯病病原菌胁迫诱导表达的, 是首次从野生稻中发现的可能参与疣粒野生稻胁迫信号传导和抗病应答反应的基因。     

cDNA末端快速扩增技术及其方法的改进

cDNA末端快速扩增(RACE)技术可以快速扩增mRNA3’和5’末端,从而获得全长的cDNA序列,为分离和研究新的基因提供了一个快速简便的方法。从RACE的原理出发,综述RACE技术的优缺点,阐述RACE技术的改良,并对其应用现状和发展前景进行了分析。