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【目的】分析无刺龙舌兰叶绿体基因组特征及密码子偏好性,为无刺龙舌兰叶绿体相关基因的表达、修饰和物种进化研究提供参考。【方法】对无刺龙舌兰的叶绿体基因组进行测序、组装和注释,分析密码子偏好性及其影响因素,并通过建立高、低基因表达库,筛选出最优密码子。基于20个已发表的龙舌兰科植物叶绿体基因组数据构建系统发育进化树。【结果】无刺龙舌兰叶绿体基因组总长157579 bp,大单拷贝区(LSC)、小单拷贝区(SSC)和2个反向重复区(IRa和IRb)的长度分别为85940、18279和26680 bp,GC含量为37.8%,包括135个基因(85个蛋白编码基因、38个tRNA基因、8个rRNA基因及4个未知功能的基因),从中筛选出51个长度大于300 bp的基因编码区(CDS)序列,其有效密码子数(ENC)均大于41.0。GC1、GC2、GC3和GC3s含量分别为46.75%、39.61%、29.19%和26.06%,说明密码子第3位多以A/T结尾。GCall与GC1、GC2和GC3均呈极显著相关(P<0.01,下同),但GC3与GC1和GC2均无显著相关性(P>0.05,下同),表明密码子第1、2位的碱基组成相似,但与第3位的相似度不高。选择和突变是导致叶绿体基因组密码子偏好性的主要因素。筛选出14个多以A/U结尾的最优密码子。无刺龙舌兰与克雷塔罗丝兰和西地格丝兰为姊妹关系,自荐值为100%。【结论】无刺龙舌兰叶绿体基因组为保守的四分体结构,叶绿体基因组密码子偏好性较弱,主要受选择和突变等多因素影响。基于植物叶绿体基因组构建系统发育进化树在物种的分类鉴定及确定各物种间系统发育关系的研究中是一种准确、可靠的方法。 相似文献
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党的十九大会议报告指出,农业农村问题关系着国计民生,必须始终坚持把解决好"三农"问题作为全党工作的重中之重.农业资源是实现乡村振兴的重要的物质基础,是实现农业现代化的重要保障.该文以安徽省肥东县为研究区域,基于安徽省2008—2018年统计年鉴的数据,对肥东县农业发展现状、农业产值情况以及农业发展环境进行了分析,以此找出肥东县农业发展中所存在的问题并提出了相关的对策建议,以供参考. 相似文献
36.
钾对黄土区砀山酥梨产量及品质的影响 总被引:11,自引:0,他引:11
连续4年钾肥试验表明,黄土区砀山酥梨施钾平均增产19.7%,产投比在3.0以上。钾对酥梨内质及外观有明显的改善。施钾能增加酥梨一级果率,提高可溶性固形物、可溶性糖、维生素C含量,糖酸比及果实硬度。钾能降低新梢生长量,增加百叶重及叶绿素含量,增大果实,协调果树营养生长和生殖生长的关系。此外,氯化钾有显著降低病虫果率的作用。从产量、品质、果树生长状况及经济效益综合考虑,氯化钾+硫酸钙处理最佳。因此,酥梨应首选氯化钾,同时要补充硫素营养,N:P_2O_5:K_2O的大致比例为1:1:1。 相似文献
37.
钾对黄土区猕猴桃产量和品质的影响 总被引:13,自引:0,他引:13
在黄土区土上研究了猕猴桃不同品种及不同量钾肥与产量品质的关系。连续3年试验结果表明,钾在黄土区猕猴桃上有显著的增产效果和经济效益熏平均增产20.2%,产投比大于2.54。施钾能增加果实可溶糖、维生素C含量及果实硬度熏降低果实酸度,增加糖酸比,提高一级果率及单果重,促进叶生长。氯化钾与硫酸钾在增糖降酸、促进叶生长、提高维生素C方面作用相当,硫酸钾在增加果实硬度、一级果率、叶绿素、氨基酸总量及必需氨基酸方面好于氯化钾,高量钾好于低量钾。过量Cl-不利于果树生长及果实品质的改善。从产量、品质及经济效益综合考虑,以硫酸钾和氯化钾按1∶1掺合施用效果较好,N∶P2O5∶K2O大致比例为1∶0.9∶1.3。猕猴桃施肥以撒施耕翻效果较好。 相似文献
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【目的】根据基因组浅层测序结果,解析无毛青藤叶绿体基因组的结构、大小、基因组成、密码子偏好性、简单重复序列(SSR)位点及系统发育关系。【方法】以无毛青藤为材料,对其叶绿体基因组进行测序,组装后获得其叶绿体DNA全长序列并进行基因组特征、密码子偏好性、SSR位点及系统发育分析。【结果】无毛青藤叶绿体基因组全长为156 513 bp。其中,GC含量为39.1%。其结构包括大单拷贝区(LSC,85 225 bp)、小单拷贝区(SSC,18 779 bp)以及反向重复序列(IRs,26 254 bp)。4个区段中,IR区的GC含量最高(43.3%),LSC区的GC含量为37.7%,SSC区最低。共注释得到131个基因,其中,84个位于LSC区,SSC区13个,两个IR区各17个。鉴定出61个SSR位点,碱基组成以A/T碱基类型为主;33个无毛青藤叶绿体基因组密码子的使用具有偏好性,并以A/U碱基结尾。系统发育进化树表明,青藤属6个种分为两支,其中大花青藤与无毛青藤具有较近的亲缘关系,IR/SC边界分析结果显示除红花青藤外,其余5种青藤属植物的JLB(LSC/IRb)边界较为保守。6种青藤叶绿... 相似文献
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40.
从数据特点、数据处理方案及数据库的主要功能等方面介绍了中医医案数据库的研发现状,并分析了中医医案数据库存在的问题及其未来的发展。 相似文献