民猪与大白猪背最长肌能量代谢关键酶活性研究

为了揭示肌纤维类型组成对猪骨骼肌能量代谢酶活性的影响，本实验以民猪和大白猪为研究对象，在比较了民猪和大白猪肌纤维类型组成差异的基础上，采用比色法测定民猪和大白猪背最长肌中能量代谢关键酶乳酸脱氢酶（LDH）、琥珀酸脱氢酶（SDH）和苹果酸脱氢酶（MDH）的活性差异。结果表明，民猪氧化型纤维MyHCI型和IIa型含量显著高于大白猪，酵解型纤维MyHCII b型含量显著低于大白猪，民猪有氧代谢酶SDH和MDH活性显著高于大白猪，无氧酵解酶LDH活性显著低于大白猪，这在一定程度上说明民猪与大白猪能量代谢关键酶活性差异的主要因素是骨骼肌纤维类型组成不同。     

东北野猪IFN OMEGA-2基因的克隆测序和遗传多样性分析

本研究针对东北野猪IFNOMEGA-2基因进行克隆测序，并与民猪、大白猪基因序列进行比对，同时进行遗传多样性分析。     

母猪妊娠期营养策略调整

年提供断奶仔猪数（PSY）是衡量母猪生产性能的重要指标，是评估猪场盈利能力的关键指标。母猪妊娠期营养状况是影响PSY的重要因素之一，不仅影响母猪生产性能和利用年限，而且影响仔猪的生产性能（王继强，2007）。母猪妊娠期营养的供给，既要满足自身维持的需要又要满足胎儿生长发育的需求（董刚，2021）。营养水平过高会产生母猪肥胖、难产、乳房水肿、泌乳量少等不良影响，同时还会造成饲料浪费；营养水平过低则会产生母猪瘦弱、仔猪初生体重轻、发情间隔期延长等情况（胡成波，2014）。科学、合理的营养供给是提高产仔数、初生重、断奶活仔数、母猪泌乳量，减少流产、难产、死胎、便秘、疾病、死淘，缩短发情间期和延长母猪利用年限的重要方法。由于初产母猪、二产母猪和三产以上的经产母猪营养需求不同，妊娠期内各阶段的母猪营养需求也不相同，因此，在妊娠期内对母猪营养进行策略调整至关重要。     

低温胁迫下民猪骨骼肌的转录调控分析

为了揭示民猪优良种质特性的遗传机理，解析其低温适应机制。本试验将6头6月龄体重相近的雌性民猪随机分成2组，每组3头个体。对照组个体置于温度控制在（18±2）℃的猪舍内，试验组个体置于室外的半敞篷舍内饲养，环境温度从第1天的5℃/-5℃降到最后1天的-15℃/-24℃，共处理了58 d。两组个体均保证自由采食和饮水，试验结束后，屠宰全部个体，取背最长肌进行RNA-seq。筛选民猪骨骼肌受低温诱导的基因和lncRNA，并对它们进行功能注释以及两者间调控关系的分析。RNA测序分析显示，民猪在经历58 d的低温胁迫后，骨骼肌内86个基因发生了显著上调，16个基因发生了显著下调；112个lncRNAs发生了显著上调，74个lncRNAs发生了显著下调。在发生显著上调的基因中，有4个与神经系统相关的基因NTSR2、ARC、FOSL1和RCAN1发生了显著上调，7个与基质转运相关的基因SLC2A4、SLC2A5、SLC4A10、SLC19A2、SLC20A1、SLC28A1和SLC38A2，6个与炎症和免疫相关的基因AREG、CISH、OTUD1、TRIB1、GPA33和ITPKC均发生了显著上调。而与昼夜节律相关的ARNTL基因和抑制细胞增殖的RASL11A基因等发生了显著下调。低温胁迫下，差异表达基因显著富集到细胞凋亡、直肠癌和癌症的转录误调节通路，说明细胞的增殖和凋亡受到影响。显著变化的lncRNA主要以反式调控作用于靶基因，且与靶基因间的互作关系复杂，它们调控的靶基因富集到单纯疱疹病毒1感染通路、MAPK信号通路和范可尼贫血通路。此外，再无其他通路受到影响。低温胁迫影响了民猪的神经和免疫系统，使细胞内的物质转运发生了变化，细胞的生长、分化也受到了影响，但由于基因发生变化的倍数较小（1～2倍为主），且受影响的通路较少（仅3条），因此推测低温胁迫并未对民猪的骨骼肌造成严重损伤。     

猪FASN基因功能性单核苷酸多态性的生物信息学分析

为了筛选出猪FASN基因中具有生物学功能的非同义单核苷酸多态性(non-synonymous single nucleotide polymorphisms, nsSNPs)位点，试验采用生物信息学方法对FASN基因的nsSNPs位点进行了研究。首先利用Ensembl数据库分析FASN基因nsSNPs位点的相关信息，然后利用SIFT、Polyphen2和Provean三种方法预测nsSNPs位点的有害性，再利用ConSurf server、I-Mutant 3.0、Mupro、BDM-PUB、SUMO plot^TM、NetPhos 2.0 Server等在线软件对nsSNPs位点的进化保守位点、蛋白质稳定性、泛素化位点、磷酸化位点进行预测，SOPMA和MutPred2在线软件分析nsSNPs位点对FASN蛋白二级结构和三级结构的影响，最后使用Phyre2和VMD软件预测和构建野生型和突变型FASN蛋白的空间结构。结果表明：FASN基因有2个转录子，共38个nsSNPs位点，其中有7个位点被SIFT、Polyphen2和Provean三种方法均预测为有害突变位点，分...     

微生物组-转录组联合分析肠道菌群对SPF鸡的调节作用

为了探究肠道菌群对SPF鸡的作用，试验采用广谱抗生素(ABX)鸡尾酒法构建肠道菌群削减SPF鸡模型(ABX鸡),并以SPF鸡为对照，应用微生物组测序技术分析鸡肠道菌群变化情况，转录组测序技术分析鸡回肠和气管差异基因表达情况，同时评估肠道菌群对鸡体重和Ⅰ型干扰素(IFN-Ⅰ)表达的影响，并通过计算Spearman相关系数分析肠道微生物组变化与SPF鸡转录组变化之间的功能相关性。结果表明：与SPF鸡相比，ABX鸡肠道菌群的物种多样性和丰度明显降低；从ABX鸡肠组织共获得156个差异表达基因，其中79个基因上调表达，77个基因下调表达；从气管组织共获得779个差异表达基因，其中176个基因上调表达，603个基因下调表达。气管组织共比对到3 152个GO功能条目，回肠组织共对比到1 202个GO功能条目。气管组织转录组显著富集的KEGG信号通路分别为补体和凝血级联、金黄色葡萄球菌感染、类风湿关节炎、自身免疫性甲状腺疾病，回肠组织转录组显著富集的KEGG信号通路分别为Ⅰ型糖尿病、类固醇生物合成、移植物抗宿主病、同种异体排斥等。从广谱抗生素处理的第11天开始，ABX鸡和SPF鸡的体重差异显著(P&...