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本研究旨在探索L1(Long Interspersed Nucleotide Element 1)和RTE(Retrotransposable Element)在牛和猪基因组中的分布、起源及传递方式和相互间作用。使用软件Repeat Masker和Censor探测了牛和猪基因组中L1和RTE的含量及在各条染色体上的分布。结果,L1在牛和猪基因组中的平均含量分别为7.89%和10.64%,平均长度分别为529和608 bp;RTE在牛基因组中的平均含量为11.83%,平均长度为433 bp。猪基因组未发现RTE序列。牛和猪基因组中的L1共有序列各自分为6个家族和14个亚族。牛和猪基因组中的L1含量均随着染色体GC含量的升高而降低,牛基因组中的RTE含量也呈此变化趋势。牛基因组中RTE序列不是从祖先物种纵向传递而来,而是通过横向传递来源于其它未知物种。牛和猪的L1内部、牛RTE内部以及牛基因组中L1和RTE之间存在选择性进化现象。 相似文献
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研究了MSHR基因G676A突变在22个山羊群体634个个体中的变异,发现白色山羊群体166个个体绝大多数为GG纯合子,G为优势等位基因,频率为0.99。以红棕色为主色调山羊群体的197个个体中A为优势等位基因,频率为0.33,且国外引入品种具有更高的A等位基因频率(0.89)。以黑色为主色调山羊群体的271个个体中,A等位基因频率为0.21,处于白色山羊群体(0.01)和以红棕色为主色调的山羊群体(0.33)之间。研究结果显示AA基因型可能与山羊的棕色皮毛形成有关,而GG基因型可能与白色被毛形成有关。遗传多样性分析表明,G676A突变位点表现出丰富的遗传多样性,只是在以黑色为主色调的建昌黑山羊、雷州山羊、武安山羊、都安山羊和青色的济宁青山羊中表现出遗传多样性的缺乏。遗传分化结果显示,国内外山羊群体间的基因分化(0.449)明显大于国内品种间的分化(0.237),国内南北地区山羊群体间分化程度较低,以黑色和棕红色为主色调的山羊群体间具有较大的基因流动。聚类分析结果也与毛色变异基本一致。 相似文献
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毛皮动物养殖业这一新事物在我国虽然发展时间不长,但其发展速度很快,有的种类已走向餐桌,向更深入的方向发展。进入20世纪80年代后,由于改革开放政策的深入,科学技术的进步,我国毛皮动物养殖业得到迅猛发展,毛皮市场繁荣,呈现出一派兴旺景象。党中央在调整结构中强调要发展特色农业,我国加入了世界贸易组织,毛皮产品的主要消费国家经济形势转好,这些都为我国毛皮动物养殖业的发展带来新的机遇和挑战。1我国毛皮市场存在的问题品种退化,产品质量低档,是我国毛皮市场缺乏竞争力的主要原因。由于国内饲养场只顾赚钱不重视育… 相似文献
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选取787只坝上长尾鸡(公鸡379只,母鸡408只)对育雏期雏鸡的外貌变化和不同羽色雏鸡生长发育规律进行了分析。结果表明,到育雏结束雏鸡外貌有明显变化,性别对黑羽、麻羽、芦花、白花、银灰坝上长尾鸡初生重没有影响,白羽公鸡初生重显著大于母鸡(P0.05),不同羽色公鸡之间,母鸡之间初生重差异不显著(P0.05),坝上长尾鸡公、母鸡在2周龄之前增重缓慢,之后公鸡则明显高于母鸡,且保持较长时间的快速生长状态,随着周龄的增加,白羽公鸡与母鸡体重差异变大,黑羽、麻羽、白花公鸡与母鸡体重出现差异,2周龄白羽公鸡体重显著大于黑色公鸡(P0.05),不同羽色母鸡之间出现差异。育雏期绝对生长曲线呈上升趋势,相对生长曲线呈下降趋势。 相似文献
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动物皮毛色泽形成过程中成黑素细胞的发育分化形成黑素细胞,其中Kit、Mitf和β-catenin等多种基因发挥关键作用,黑素细胞的黑素体合成真黑素和伪黑素的生物化学过程及agouti和MSH的激素调控作用和黑素体的转运过程.这3个环节是复杂的细胞发育分化、黑色素合成和细胞器的转运过程,其中任何环节的变化都会引起动物皮毛色泽的改变. 相似文献
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本试验扩增了波尔山羊、南江黄羊和承德无角山羊3个品种113个个体的Callipyge基因长度为493 bp的片段。 经测序,发现一个SNP位点,第184 bp处C→T。对Callipyge限制性酶切位点(Fok I)的PCR-RFLP的多态性进行分析,在波尔山羊和南江黄羊两个品种中表现多态性,得到CC、CT和TT 3种基因型,波尔山羊群体中基因型频率分别为0.6571、0.3143、0.0286,南江黄羊群体中基因型频率分别为0.8947、0.1053、0.0000,而承德无角山羊全部为CC基因型。研究结果提示184C→T可能与山羊双肌性状有关。 相似文献
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一段长约11.7 kb的片段缺失导致山羊无角和间性突变,称为无角间性综合征(Polled Intersex Syndrome,PIS)。通过对该缺失片段(AF404302)内4个重复序列(1~3120 bp,3988~4565 bp,4989~7088 bp,7875~9135 bp)的结构分析,发现其右侧一段属于LINE-1家族的L1M3分支(7875~9135 bp),另3段均属于RTE家族的BDDF分支。以缺失片段内两段逆转录酶结构域的全长蛋白序列为参考对NCBI网站牛基因组数据库进行tblastn,并与得到的56条共有序列构建进化树,以此树为基础推断PIS缺失区域大约形成于(22.5~30)百万年前,正好是牛科动物分化趋异的年代,结合其他证据认为该调控方式可能只存在于牛科动物中。该发现也为PIS区域作用机理和non-LTR的竞争学说提供了证据。 相似文献
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旨在克隆获得水貂DCT基因5′UTR序列并分析其结构特征,预测转录调控元件并检测启动子活性,为探究DCT基因在调控水貂毛皮颜色形成中的作用提供理论依据。本研究利用PCR扩增黑貂、白貂和咖啡貂DCT基因5′UTR,构建咖啡貂DCT基因5′UTR的pGL3-1~pGL3-7和黑貂pGL3-4~pGL3-6缺失片段的荧光素酶报告基因重组质粒,检测各片段的启动子活性;利用亚硫酸氢盐法检测3种毛色水貂DCT基因启动子区CpG岛甲基化水平。结果,克隆获得水貂DCT基因长8 203 bp的5′UTR序列,发现g.7133-7336为长204 bp的转座元件,与其高相似度的100条序列中,一条为蜕皮动物总门线虫纲的索巴利吸虫,其他均来自犬形亚目。P3和P4片段具有显著的启动子活性(P<0.05);咖啡貂的CpG岛甲基化水平显著高于黑貂和白貂(P<0.05);咖啡貂CC单倍型启动子活性显著低于黑貂的TT单倍型片段(P<0.05)。结果表明,水貂DCT基因5′UTR长204 bp的犬形亚目特异短散在元件Can-SINEs由蜕皮动物门的索巴利吸虫侵入动物基因组形成;基因上游32 bp元件和近端域共同作用发挥启动子活性,而GC-box和CpG岛结构沉默水貂DCT基因启动;g.-684和g.-621位点的T> C突变形成的CC单倍型导致咖啡貂DCT基因的高甲基化与低启动子活性,从而抑制真黑素合成,产生咖啡色被毛特征。 相似文献