五指山猪H-FABP基因不对称PCR-SSCP研究

以海南五指山猪为试验材料,采用不对称PCR-SSCP和测序相结合技术,对海南五指山猪心脏脂肪酸结合蛋白(H-FABP)基因第3内含子(intron 3)进行多态检测,并分析其与生长性状(体重、体高、体长、胸围)的相关性。结果表明:在五指山猪H-FABP基因in-tron 3中发现了3种基因型,分别命名为AA、AB、BB,对其中的纯合子AA、BB进行测序,发现intron 3的第335位点处发生了突变,都是由碱基A→G的转换造成。AA、AB、BB三种基因型频率分别为63.5%,18.2%,18.2%,A、B等位基因频率分别为73%和27%。不同基因型个体各生长性状的方差分析表明,不同基因型之间的生产性状无显著差异。     

雷州山羊和隆林山羊遗传多样性的微卫星分析

为了调查中国热带、亚热带主要山羊品种的遗传资源现状,应用14对微卫星引物,检测了隆林山羊和雷州山羊不同分布地区的群体遗传多样性水平。隆林山羊（柳州）、隆林山羊（百棚）、雷州山羊（徐闻）、雷州山羊（海南）各群体平均多态信息含量（PIC）分别为0.645、0.600、0.483、0.518;平均杂合度（H）分别为0.281、0.421、0.121、0.157;平均等位基因数（k）分别为5.17、4.93、4.64、4.5,3组数据综合说明两个山羊品种遗传多样性相对匮乏,群体遗传变异较低;NJ法聚类显示,隆林山羊两个群体聚为一类,再与雷州山羊（徐闻）聚在一起,最后为雷州山羊（海南）,这与两个品种的来源及地理分布基本一致。此研究结果为中国热带、亚热带山羊品种资源开发利用提供了基础资料和科学数据。     

文昌鸡群体遗传多样性的微卫星分析

利用10对来自鸡不同染色体的微卫星引物序列,对文昌鸡46个样本（雌雄各半）进行了遗传多样性检测。结果表明：该群体平均多态信息含量为0．808,平均观察杂合度为0．351,平均期望杂合度为0．841,平均等位基因14．6个,表明海南文昌鸡群体遗传变异较大,遗传多样性较为丰富。研究结果为文昌鸡品种资源合理保护与开发利用提供了科学依据。     

五指山猪GH、IGFBP3基因SNPs检测及与生长性状的关联分析

以五指山猪为试验材料,采用PCR-SSCP和测序相结合技术,对GH基因和IGFBP3基因进行多态性检测,并分析其与生长性状（体质量,体高,体长和胸围）的相关性。结果表明,GH基因第2外显子存在一处G→A转换,属沉默突变,该位点与生长性状关联分析显示,BB基因型的体重显著高于AA基因型和AB基因型;IGFBP3基因第2外显子存在一处G→C颠换,属沉默突变,该位点与生长性状关联分析显示,AA基因型的体高显著高于BB基因型;IGFBP3基因第4内含子存在一处碱基C缺失,该位点与生长性状关联分析显示,AA基因型体重显著高于AB基因型和BB基因型。研究将为五指山猪生长发育规律、系统选育及矮小机制等方面研究提供了遗传学依据。     

中国热带地区三个鸡品种遗传多样性的微卫星分析

为了解中国热带主要鸡品种的遗传资源现状,应用21对微卫星引物,检测了文昌鸡、粤黄882和海南黎鸡3个群体,共138个体(公母各半)的遗传多样性水平。21个微卫星位点在三个群体检测的平均等位基因数为12.48,从3到32不等;三个群体平均遗传杂合度分别为0.840、0.768、0.825;多态信息含量分别为0.809、0.738、0.770,结果表明文昌鸡、粤黄882和海南黎鸡均具有较大的遗传变异,且遗传多样性较为丰富。为中国热带鸡品种资源保护与开发提供了科学依据。     

五指山猪健康养殖技术研究与示范

五指山猪是我国特有的小型猪种,是开发高端肉食品的重要猪种。目前项目组在海南省中西部地区构建了五指山猪健康养殖与科技示范推广体系。通过五指山猪健康养殖饲料配制和饲养技术、仔猪健康养殖营养与饲养技术、猪场生物安全控制技术和粪便等废弃物资源化利用技术的集成与示范,带动周边农户科学养殖,共同推动特色猪产业的升级与发展。     

五指山猪与长白猪胴体性状和肉品质的比较研究

本试验对五指山猪和长白猪胴体性状、肉质性状、背最长肌氨基酸和脂肪酸含量进行了分析,旨在探讨五指山猪肉和长白猪肉的肉品质差异。结果表明,长白猪宰前重、胴体直长、胴体斜长、屠宰率、眼肌面积、平均背膘厚及瘦肉率均极显著高于五指山猪(P<0.01);五指山猪肌内脂肪含量极显著高于长白猪(P<0.01),pH、熟肉率、滴水损失和剪切力差异不显著(P>0.05);五指山猪肉的鲜味氨基酸、必需氨基酸、饱和脂肪酸和单不饱和脂肪酸含量均极显著高于长白猪(P<0.01)。因此,五指山猪肉品质优于长白猪。     

海南黑山羊生长激素(GH)基因第5外显子单核苷酸多态性分析

利用PCR-SSCP与测序相结合的方法，分析了海南黑山羊GH基因第5外显子的多态性。SSCP结果出现3种基因型，分别定义为CC、CG、GG，3种基因型频率分别为：21.3、73.2和5.5 %，C、G等位基因频率分别为57.9 和42.1 %。以C等位基因为优势基因，Hardy-Weinberg平衡卡方适合性检验结果表明，GH基因第5外显子在此群体中处于Hardy-Weinberg平衡状态(X2=0.002 2，P>0.05)，该位点群体遗传结构及多态指标分析结果显示该位点表现为高度多态。CC和GG基因型进行测序结果发现，GH基因exon5第75位点发生G→C转换，将核苷酸序列翻译成氨基酸序列进行同源性比较，结果exon5第75位点G→C转换没有引起编码的氨基酸转换，属于沉默突变。     

中国热带地区三个鸡品种遗传多样性的微卫星分析

为了解中国热带主要鸡品种的遗传资源现状,应用21对微卫星引物,检测了文昌鸡、粤黄882和海南黎鸡3个群体,共138个体(公母各半)的遗传多样性水平.21个微卫星位点在三个群体检测的平均等位基因数为12.48,从3到32不等;三个群体平均遗传杂合度分别为0.840、0.768、0.825;多态信息含量分别为0.809、0.738、0.770,结果表明文昌鸡、粤黄882和海南黎鸡均具有较大的遗传变异,且遗传多样性较为丰富.为中国热带鸡品种资源保护与开发提供了科学依据.     

中国西南地区5个地方绵羊群体mtDNA遗传多样性及系统进化研究

采用PCR—SSCP技术及mtDNA D-loop序列分析相结合的方法，对我国云南昭通绵羊、腾冲绵羊、宁蒗绵羊及西藏的多玛绵羊、江孜绵羊5个地方绵羊群体共232个个体进行遗传多样性及系统进化分析。PCR-SSCP分析显示，在西藏的多玛绵羊和江孜绵羊中均检测到线粒体编码区的Cytb和ND2基因的3种单倍型A、B和C，且在西藏的多玛绵羊、江孜绵羊中C单倍型比例高于B型；而在云南的昭通绵羊、腾冲绵羊和宁蒗绵羊中只检测到单倍型A和B。根据不同的单倍型从5个群体中筛选出39个样品进行mtDNAD-loop区克隆测序，经过系统进化分析揭示西藏绵羊存在A、B、C3种mtDNA单倍型；而云南绵羊只存在A、B2种mtDNA单倍型。以上基于PCR-SSCP和D-loop区序列的分析结果一致提示西藏绵羊有3个母系来源，云南绵羊有2个母系来源。基于mtDNAD-loop序列的多态性分析结果显示西藏多玛绵羊和江孜绵羊的单倍型多样度（Hd）、核苷酸多样度（Pi）及平均核苷酸差异数（k）均高于云南3个地方绵羊品种，提示西藏绵羊遗传多样性较丰富，云南绵羊遗传多样性相对贫乏。