山东沿海褶牡蛎与太平洋牡蛎等位基因酶的遗传变异

采用水平淀粉凝胶电泳技术研究了山东沿海莱州 (LZ)、俚岛 (LD)和青岛 (QD)三地褶牡蛎自然群体以及荣成的太平洋牡蛎 (TP)养殖群体的等位基因酶遗传变异。进行测试的 9种酶中共检测到 2 0个位点。LZ与QD群体的多态位点比例为 6 0 .0 % ,其余两群体均为 5 5 .0 %。LZ、LD、TP和QD各位点平均有效等位基因数分别为 1.42 2± 0 .16 5、1.2 38± 0 .0 85、1.2 0 7± 0 .0 86和 1.32 6± 0 .119。平均杂合度观察值分别为 0 .2 16± 0 .0 5 0、0 .16 5± 0 .0 36、0 .139± 0 .0 34和 0 .195± 0 .0 42。结果表明 ,LZ和QD群体的遗传变异水平高于LD和TP群体。同时 ,各群体中普遍存在杂合子缺失现象。太平洋牡蛎群体与其它三个褶牡蛎群体的遗传距离很小 ,甚至小于莱州和青岛的两个褶牡蛎群体间的遗传距离 0 .0 5 0 0 ,尤其是与俚岛褶牡蛎群体遗传相似度最大 ,遗传距离小于其它各群体之间的距离 ,仅为 0 .0 0 99。     

梭鱼养殖群体与自然群体等位基因酶的遗传变异

采用水平淀粉凝胶电泳技术研究了梭鱼 (L iza haematochelia)自然群体 (2 9尾 )与养殖群体(31尾 ) 10种酶 2 2个位点的等位基因酶遗传变异情况。自然群体和养殖群体的多态位点比例 (P95)分别为 0 .2 6 2和 0 .131。在养殖群体中的 G3PD- 3和 PGM位点观察到相当多的杂合子 ,导致这两个位点杂合度远大于自然群体 ,进而造成养殖群体平均杂合度 0 .0 92± 0 .0 5 1高于自然群体的平均杂合度0 .0 6 4± 0 .0 36。而养殖群体的平均杂合子缺失指数 - 0 .36 4± 0 .10 4和平均有效等位基因数 1.132±0 .0 5 9高于自然群体的相应各值 :- 0 .0 6 77± 0 .0 76和 1.10 1± 0 .0 36。对两个群体各位点等位基因分布以及杂合度进行相关性检验 ,其相关系数分别为 0 .9838和 0 .816 3,相关程度较高。与其他位点相比 ,G3PD- 3和 PGM位点属于多变异位点 ,养殖群体在这两个位点杂合度较高的原因 ,可能与养殖过程中环境因素造成的蛋白质表达的个体差异有关。两个群体的 Nei遗传距离很近 ,为 0 .0 0 9;遗传相似程度很高 ,遗传相似性系数达 0 .991     

青岛近海魁蚶群体等位基因酶遗传变异研究

采用淀粉凝胶电泳技术研究了青岛近海魁蚶（Ｓｃａｐｈａｒｃａｂｒｏｕｇｈｔｏｎｉ）自然群体的等位基因酶遗传变异。在１０种等位基因酶中共检测到了２２个基因座位,多态位点比例为４５．５％,位点有效等位基因数分布为１．０００～２．４６９（平均值１．４１５）,位点杂合度观察值分布为０．０００～０．５９５（平均杂合度０．１０５±０．０２３）,在６个基因座位上存在相当明显的杂合子缺失现象。文中讨论了杂合子缺失的原因。     

绥芬河三块鱼和珠星三块鱼种群的生化遗传变异及亲缘关系

采用淀粉凝胶电泳方法，对由日本海溯河洄游到中国境内绥芬河的三块鱼（Tribolodonbrandti）和珠星三块鱼（Tribolodon hakonensis）繁殖群体的生化遗传结构及变异进行比较研究。结果表明，在选取的12种同工酶中共检测出27个基因位点，三块鱼和珠星三块鱼的多态位点比例分别为22．22％和18．52％，平均杂合度分别为0．0670和0．0695；除了三块鱼的Gpi-1和珠星三块鱼的Est多态位点外，两种鱼的Ldh—1、α—Gpd-1、Sdh—1、Aat—1及三块鱼的Est多态位点上的基因型分布都显著地偏离Hardy—Weinberg平衡，表现出杂合子明显缺失或过剩现象；三块鱼和珠星三块鱼种群间相同基因位点上的等位基因分布频率出现显著的分化，遗传相似度和遗传距离分别为0．6912和0．3693。结论认为，三块鱼和珠星三块鱼的遗传多样性已达到种的差异水平。     

吉富品系尼罗罗非鱼选育过程中遗传变异的微卫星分析

采用微卫星标记技术对选育新品种新吉富罗非鱼（F8－9）群体、基础群体（F0）、以及选育中群体（F6－7）在选育过程中出现的遗传变异进行观察与分析。19个微卫星位点扩增后的等位基因数为3～11个,随引物不同而异,合计得到115个等位基因,大小在70～270 bp之间。五群体平均基因多样性指数分别为,F0：(0.3083±0.1834)、F6：(0.2982±0.1889)、F7：(0.2923±0.1898)、F8：(0.2572±0.1923)、F9：(0.2743±0.1597),表明随着选育的进展,群体呈现出纯化趋势。AMOVA分析表明,在总遗传变异中,93.24%来自选育群体内,仅6.67%来自选育群体间。群体间的校正偏差后相似性系数在 F0与F6、F7之间分别为0.943 5和0.942 2,相对较高;而在F0与F8、F9之间分别为0.933 2和0.930 3, 相对较低。遗传距离在F0与F6、F7之间分别为0.058 1和0.059 5,相对较小;而在F0与F8、F9之间分别为0.069 1和0.072 2,相对较大。配对比较Fst值在F0与F6、F7之间分别为0.037 68和0.064 37,平均 值为0.051 03;而在F0与F8、F9之间分别为0.060 93和0.075 87,平均值为0.068 40,有所提高。这些指标的分析结果表明,经9年9代选育,已在罗非鱼世代间造成程度虽小但却可监测到的遗传分化;同选育群体F6－7相比,\"新吉富罗非鱼\"（F8－9）在遗传上更为稳定。图1表4     

新对虾等位酶的遗传控制

应用聚丙烯酰胺凝胶电泳技术，对新对虾（Metapenaeus.spp）的养殖群体进行了7种等位酶的电泳检测和谱带遗传分析，确定了17个等位酶位点和22个等位基因，其中有4个位点是多态的，它是Esr-1、Sod-1、Me-4、Aat-1(P0.95f标准）。有一个等位基因的位点有Est-2、Lhd-1、Ldh-2、Sdh-1、Me-1、Me-2、Me-3、Me-5、Aat-2、Mdh-1、Mdh-2、Mdh-3、Mdh-4；有二个等位基因的位点有Sod-1、Me-4、Aat-1；有三个等位基因的位点有Est-1。本研究揭示了新对虾群体等位酶位点及其等位基因带谱的变异式样，为新对虾的遗传育种及遗传结构的研究提供了一批等位酶位点及其等位基因的参考图谱。     

西施舌同工酶的组织特异性与多态性初步研究

采用垂直聚丙烯酰胺凝胶电泳技术对西施舌（Coelomactra antiquata）闭壳肌、鳃、外套膜、消化腺和足肌5种组织的18种同工酶进行组织特异性分析，并对其中11种同工酶进行了多态性的筛选。结果表明，西施舌同工酶的表达具有明显的组织特异性。消化腺与肌肉组织中的11种酶（ADH、AK、DIA、EST、GPI、IDH、MDH、PGM、SDH、SOD和XDH）可以得到稳定而清晰的酶谱。在11种酶的17个基因位点中有6个位点（aDH、EST-1、MDH-1、PGM,SOD．J和XDI-1）为多态位点，多态位点比例为35．3％。平均观测杂合度（风）和预期杂合度（见）分别为0．360和0．519，平均等位基因数目（M）为4．40。     

AFLP分析3个不同体色花尾胡椒鲷养殖群体的遗传变异

通过AFLP技术对中国东南沿海的3个不同体色花尾胡椒鲷（Plectorhinchus cinctus）养殖群体进行了遗传分析。6对引物组合从3个群体中扩增出370个位点，其中多态位点比例为49．5％，每对引物组合扩增的片段为51～71条，平均6113条，每对引物组合多态位点检出率为39．4%-56．5％。正常群体、白色和灰色变异群体的多态位点比例分别为41．4％、36．3％、34．3％，平均杂合度分别为0．1145、0．0887和0．0837。遗传多样性衡量指标表明，正常花尾胡椒鲷养殖群体的遗传变异量相对最大，遗传多样性相对较高，白色变异群体次之，而灰色变异群体最低，白色变异群体和灰色变异群体两者间遗传多样性差异并不显著（P〉0．05），显示变异群体的遗传多样性降低。正常群体与白色群体之间的遗传距离（0．0354）最大，遗传相似系数最小（0．9652）。同时，遗传分化系数只（0．1362）和AMOVA方差分量百分比（10．68％）也表明群体间存在着一定程度的遗传结构分化，说明对体色这一特定表型性状的人为定向选育对花尾胡椒鲷养殖群体的遗传变异产生一定的影响。     

长江流域铜鱼和圆口铜鱼的遗传多样性

利用线粒体DNA控制区序列多态性分析了长江流域铜鱼（Coreius heterodon）和圆口铜鱼（Coreius guichenoti）各4个群体的遗传结构；同时利用9对自行开发的多态性微卫星标记分析圆口铜鱼4个群体的遗传结构。结果显示，铜鱼线粒体DNA（mtDNA）D-loop序列共检出22个多态位点，28种单倍型，平均单倍型多样性指数（h）和核苷酸多样性指数（7r）分别为0．849和0．00257。圆口铜鱼线粒体DNA（mtDNA）D-loop序列共检出18个多态位点，28种单倍型，平均单倍型多样性指数和核苷酸多样性指数分别为0．902和0．00424。分子变异分析（AMOVA）结果提示，铜鱼和圆口铜鱼分别有98．80％和99．17％的遗传变异发生于群体内部，表明铜鱼和圆口铜鱼未出现种群分化。选用的9个微卫星标记在圆口铜鱼群体中共检测到48个等位基因；群体平均观测杂合度在0．631～0．753之间；平均期望杂合度为0．598-0．728：平均多态信息含量为0．548～0．670。结果表明，长江流域铜鱼遗传多样性较低，长江上游圆口铜鱼遗传多样性较高，且均未出现种群遗传分化。圆口铜鱼SSR固定指数为0．12l58，高于D．1oop固定指数，显示SSR标记对圆口铜鱼群体间遗传差异的检测更为灵敏。[中国水产科学，2008，15（3）：377-385]     

卵形鲳鲶育种群体遗传多样性分析

利用11个微卫星位点,对海南三亚和广东大亚湾2个卵形鲳够（Trachinotusovatus）育种群体进行了遗传多样性评价和聚类分析。结果显示,海南三亚和广东大亚湾2个卵形鲳够育种群体的平均等位基因（Na）分别为5．0和3．6,平均有效等位基因（Ne）为2．965和2．244,观测杂合度（Ho）分别为0．292—0．814和0．207—0．840,期望杂合度（He）分别为0．307～0．813和0．189～0．761,海南三亚群体中多态信息含量（PIC）为0．014～0．719,平均为0．509,而广东大亚湾群体的PIC为0．168—0．711,平均为0．436。海南三亚群体有5个位点偏离哈迪-温伯格平衡（P〈0．05）,广东大亚湾群体有2个位点偏离哈温-伯格平衡;2个群体间的遗传相似系数为0．561,遗传距离为0．578,遗传分化指数（Fst）为0．152。Structure软件分析显示海南三亚和广东大亚湾2个卯形鲳鳞群体各为一支,2个群体间具有较大的遗传分化,可作为2个育种群体管理,2个群体问进行杂交选育预期可获得较好的遗传进展。     

用微卫星DNA技术对中国对虾人工选育群体遗传多样性的研究

利用微卫星技术对中国对虾人工选育群体第1代和第6代群体的遗传多样性进行了分析。对10个微卫星位点进行了扩增,共产生74个等位基因,每个位点产生的等位基因数从3到13不等。在两个群体中,所观察到的等位基因数都比有效等位基因数多。多态信息含量PIC值0．5567～0．8877,说明这10个微卫星位点在中国对虾中具有较高的信息含量。两个群体的平均杂合度分别为0．6400(CP1)、0．6300(CP6),并通过计算基因型的P值,确定了对Hardy-Weinberg平衡的偏离情况。对Fis值的计算表明两个群体内共有5个微卫星位点存在杂合度观察值过剩的现象。两个群体的Shannon多样性指数分别为1．6830、1．7382,整个选育群体(两个群体作为一个群体)的遗传多样性指数为1．7742。从遗传多样性所占的比例来看,96．415％的遗传变异是来自群体内,只有3．585％的遗传变异是来自群体间。两个群体间的相似性系数高达0．9187,彼此间的遗传距离仅为0．0848,体现出人工选育群体的遗传分化程度较低。结果均说明第6代群体还有较大的选育潜力,可以继续保持遗传效应,最终保证选种育种工作的成功。     

基于AFLP分子标记的杂色杜父鱼遗传多样性分析

为了解吉林省杂色杜父鱼野生群体遗传多样性，应用扩增片段长度多态性（amplified fragment length polymorphism, AFLP）标记技术，对漫江、三道松江河和鸭绿江上游采捕的3个杂色杜父鱼群体总计30个个体的遗传多样性、遗传变异及遗传相似性进行分析，并构建系统进化树。8组引物组合总计扩增出915个条带，其中多态性位点843个，占比92.1%。3个群体的观测等位基因数（N_a）分别为1.316 6、1.306 7、1.203 7,有效等位基因数（N_e）分别为1.151 7、1.134 2、1.111 9,Nei’s基因多样性指数（H）分别为0.091 2、0.081 6、0.067 0,Shannon’s信息指数（I）分别为0.141 0、0.127 3、0.102 0,其中漫江群体的遗传多样性水平最高，鸭绿江上游群体最低；3个群体的遗传分化系数(G_st)平均值为0.286 0,表明3个群体之间发生了一定程度的分化；30个个体的遗传相似性在0.809 0～0.945 6,表明所采集的30尾杂色杜父...     

凉山半细毛羊徽卫星标记多态性的研究

利用微卫星技术对凉山半细毛羊核心育种群206个个体第1、2、3、9号染色体上的18个微卫星位点进行研究，检测微卫星在凉山半细毛羊中的等位基因数，计算等位基因频率（Pi）、遗传杂合度（H）和多态信息含量（PIC），分析了凉山半细毛羊微卫星DNA的多态性。实验采用的18个微卫星标记位点在凉山半细毛羊群体中，平均等位基因数为8.2778个（3～19个），平均多态信息含量为0．591（O.253～0.833），遗传杂合度均值为0．500（0.026～0.888）。表明该品种绵羊遗传多态性丰富，群体遗传变异较大，并且所选18个微卫星基因座适用于绵羊的遗传连锁分析研究。     

德国镜鲤选育系F4天津群体中不同体型的遗传结构分析

本文利用15对微卫星分子标记，对德国镜鲤选育系F4天津群体中的高背型和长条型德国镜鲤的遗传结构进行分析，结果表明：两种体型德国镜鲤F4群体平均等位基因数分别为5．0和5．1，平均期望杂合度分别为0．5527和0．5591．平均观测杂合度分别为0．5906和0．5824，平均多态信息含量分别为0．5653和0．5470。以卡方检验估计群体Hardy—Weinberg平衡显示有大部分位点发生了偏离。两体型间遗传相似性为0．8330，相似性较高。群体间遗传分化微弱（Fst=0．0242），群体内变异占总变异的97．58％。说明高背型德国镜鲤和长条型德国镜鲤在遗传结构上差异较小。由天津群体的等位基因数为5．05，期望杂合度为0．5559，观测杂合度为0．5865，多态信息含量为0．5562，可知天津群体属于中度多态，遗传多样性保持较高水平。     

斑节对虾等位酶遗传分析

应用聚丙烯酰胺凝胶电泳技术，对斑节对虾的养殖群体进行了8种等位酶的电泳检测和谱带遗传分析，确定了15个等位酶位点和19个等位基因，其中只有1个位点是多态的，它是Est-1（P0.95标准），有一个等位基因的位点有Est-2、Sod-1、Ldh-1、Adh-1、Sdh-1、Sdh-2、Me-1、Me-2、Mdb-1、Mdh-2、Mdb-3；有二个等位基因的位点有Est-1、Sdh-3、Aat-1、Aat-2、本研究揭示了斑节对虾群体等位酶位点及其等位基因带谱的变异式样，为斑节对虾的遗传育种及遗传结构的研究提供了一批 等位酶位点及其等位基因的参考图谱。     

两种壳色虾夷扇贝的同工酶分析

采用不连续聚丙烯酰胺凝胶垂直电泳技术对两种壳色虾夷扇贝的闭壳肌进行了同工酶检测分析与比较。8种同工酶（MDH、ADH、ME、SOD、EST、GDH、SDH和α-AMY）共检测出17个位点,其中白色贝有7个多态位点,褐色贝有6个多态位点,多态位点（P0.99）的比例分别为41．18％和35．29％,白色贝和褐色贝平均每个位点的等位基因有效数目（Ac）分别为1．1421和1．1040,预期杂合度分别（Hc）为0．0919和0．0674,实际杂合度（Ho）分别为0．1275和0．0907,多态位点的遗传偏离指数表明,白色贝具有更高的遗传变异水平和多样性水平。住点Est-3可以作为鉴定白色贝和褐色贝的特异性蛋白质分子标记。     

大珠母贝两个野生群体遗传多样性的微卫星分析

利用6对微卫星DNA分子标记对三亚和北海的大珠母贝群体进行遗传多样性分析。结果表明,两个群体的平均等位基因数A分别为10．5和9．7,平均有效等位基因数N。为7．0和6．3,平均观察杂合度Ho为0．588和0．445,平均期望杂合度Hc为0．859和0．828,平均多态信息含量PIC为0．853和0．796;卡方检验发现只有位点Pmx＋022、Pmx16—41和Pmxl6—23在三亚种群中Har—dy—Weinberg平衡偏离不显著（P〉O．05）,其他位点在两个种群都有不同程度的偏离。     

罗氏沼虾缅甸引进种和浙江本地种及其杂交种的生长性能与SRAP分析

为改良罗氏沼虾（Macrobrachium rosenbergii）的养殖特性，将缅甸引进种群（BP）和浙江本地种群（ZP）杂交，获得了4个杂交群体，A、B、C、D分别为BP（♀）与ZP（♂）、ZP（♀）与BP（♂）、ZP（♀）与B（♂）、ZP（♀）与A（♂）的杂交子一代。比较BP、ZP、A、B、C、D6个不同群体的繁殖和生长性能。结果表明，BP、B、C、D的抱卵率显著高于ZP和A群体，BP、A、B、D平均出苗量显著高于ZP和C群体。在快速生长期（8月2日至9月28日）BP群体的生长速度显著高于ZP、B、C群体，A群体显著高于ZP、B群体，D群体显著高于ZP群体；其他时期各群体间差异不显著。应用SRAP（Sequencerelated amplified polymorphism）对BP、ZP、A、B、C、D6个不同群体的遗传多样性进行比较分析，其多态位点比例分别是60．3％、55．6％、60．7％、63．3％、61．9％、64．1％，遗传多样指数（Hn）分别为0．185、0．175、0．196、0．192、0．193、0．197。以上结果表明，罗氏沼虾缅甸引进种的遗传多样性高于浙江本地种，同时通过杂交可提高遗传多样性，改良养殖性状。[中国水产科学，2006，13（4）：667—673]     

中国对虾人工选育群体的同工酶分析

采用水平淀粉凝胶电泳技术对中国对虾人工选育子一代、子四代、子五代群体和黄、渤海野生群体遗传变异进行了同工酶比较分析。结果表明，在检测的4个群体肌肉组织的13个基因位点中，MDH-2^*、GPI^*、MPI^*、PGM-2^*和PGM-3^*5个位点呈多态。PGM-3^*位点上的变异程度最高，其等位基因频率呈递减趋势；人工选育群体在MPI^*位点上出现^*c基因，其等位基因频率呈递增趋势。中国对虾野生群体同人工选育群体的多态位点比例相同，为38．46％；其平均观察杂合度分别为0．0577、0．0377、0．0263、0．0231，呈依次递减趋势。中国对虾野生群体和人工选育群体之间的遗传距离平均值为0．0062，远大于子四代和子五代间的遗传距离。人工选育中国对虾群体的遗传多样性已有所降低，但在某些基因座位上出现了特异基因，这是否可作为具有良好生长特性和抗逆能力的人工定向选育群体的基因标记尚有待进一步研究。     

文蛤养殖群体和野生群体遗传多样性的AFLP 分析

应用AFLP标记技术对辽宁和山东沿海文蛤（Meretrix meretrix）养殖群体和野生群体的遗传多样性进行分析。采用7对AFLP引物组合对5个群体（3个野生群体，2个养殖群体）150个个体进行扩增，共得到364个的位点。5个群体内的多态位点比例为84．3945％～87．6465％，总多态位点比例为99．6300％。群体的Nei’s基因多样性指数（H）为0．2301～0．2634；群体的Shannon多样性指数为0．3617～0．4248，群体间的遗传距离为0．0394～0．1609，群体内个体间的遗传距离为0．2592～0．5360。辽宁大洼野生群体和山东河口野生群体的多态位点比例、Shannon多样性指数和群体内遗传距离均高于辽宁盘山和辽宁庄河养殖群体，辽宁庄河野生群体的遗传多样性处于中等水平。用UPGMA方法构建的群体系统进化树显示，辽宁庄河野生群体单独成为一支，辽宁大洼野生群体与庄河养殖群体聚到一起，辽宁盘山养殖群体与山东野生群体聚到一起，但是用这5个群体的150个个体进行的聚类结果显示，所有个体基本是随机交叉聚类，不能形成明显的类群分支。分子变异分析（AMOVA）表明，文蛤群体94．04%的变异来源于群体内，群体间的变异仅占5．96％。以上结果表明，文蛤群体内遗传多样性非常丰富，群体间相似性较大，且存在较强的基因交流。[中国水产科学，2008，15（2）：215-221]