基于聚类分析和主成分分析法的淡菜醇提物红外指纹图谱

利用傅里叶变换红外光谱仪采集6个不同地区的24个淡菜样品的醇提物红外光谱,原始光谱经过多点基线校正、聚类分析,采用平均值法建立淡菜的红外指纹图谱共有模式。相似度分析表明,各样品红外光谱与所建立的指纹图谱共有模式比较相似度良好,所选用建立共有模式的21批样品相似度均大于0.9,符合指纹图谱要求;而聚类分析中剔除的3个样品(S7、S10和S21)相似度均低于0.9,不符合指纹图谱研究要求,相似度分析和聚类分析结果相吻合。主成分分析建模结果表明,前两个主成分能代表原始数据96%的信息,相同产地的样品在主成分散点图上聚集为同一的类群,基本实现不同产地淡菜的鉴别。载荷因子分析结果表明,不同产地淡菜醇提物的差别主要体现在不饱和脂肪酸和磷脂的含量上。海口、厦门产区的淡菜样品所含不饱和脂肪酸含量较高;大连、烟台产区的淡菜样品含有较多的磷脂成分,舟山产区不饱和脂肪酸及磷脂含量均较低。因此,红外光谱指纹图谱结合聚类分析和主成分分析法可以快速、无损地鉴别不同产地淡菜,并且能反映不同产地淡菜醇提物中不饱和脂肪酸和磷脂含量的差异。     

主成分分析对黄海6种主要饵料鱼类的质量分析评价

根据黄海6种饵料鱼类的碳氮比、脂肪含量、蛋白质含量、碳含量及非水分含量5个指标,采用主成分分析法对其进行质量排序。结果表明,依代表生物基本能量的第1主成分,6种鱼的质量顺序为鳀Engraulis japonicus、凤鲚Coilia mystus、黄鲫Setipinna taty、赤鼻棱鳀Thryssa kammalensis、细条天竺鲷Apogonichthys lineatus和黑鳃梅童鱼Collichthys niveatus;依代表营养价值的第2主成分,6种鱼的质量顺序为黄鲫、凤鲚、黑鳃梅童鱼、赤鼻棱鳀、鳀和细条天竺鲷;营养质量的综合排序为凤鲚、黄鲫、鳀、赤鼻棱鳀、细条天竺鲷和黑鳃梅童鱼。结果表明,单一营养质量指标或同类营养质量指标都不能完全代表整个饵料鱼类的质量。     

南黄海三种石首鱼类的食性

根据2000—2002年秋季和冬季在南黄海进行的定点底拖网调查，利用多元统计分析方法，研究了黑鳃梅童(Collichthys niveatus)、皮氏叫姑鱼(Jobnius belengerii)和小黄鱼(Pseudosciaena polyactis)的食物组成及其差异，摄食随海区、季节和体长的变化，以及3种石首鱼类摄食器官的形态差异对摄食的影响。结果表明：(1)3种鱼的优势饵料生物各不相同，食物组成存在显著差异；(2)3种鱼的食物组成均随海区和季节的不同而有显著的差异；(3)3种鱼的食物组成和饵料多样性都有明显体长变化，黑鳃梅童和皮氏叫姑鱼的饵料多样性随体长的增大而升高，小黄鱼则相反；(4)黑鳃梅童和小黄鱼种内不同体长问的食物重叠指数较高，而皮氏叫姑鱼则较低，3种鱼的种问食物重叠指数位于0．50～0．56；(5)主成分分析(PCA)表明，黑鳃梅童和小黄鱼摄食器官的形态特征与皮氏叫姑鱼存在一定的差异。     

大黄鱼mtDNA ND5和Cytb基因的克隆与序列分析

2004年4月，将采自浙江省象山港海区网箱养殖的大黄鱼样本，提取总DNA，通过设计特异性引物对大黄鱼线粒体DNA（mtDNA）的辅酶5（ND5）和细胞色素b（Cytb）基因进行PCR扩增。扩增产物经琼脂糖电泳检测、纯化后直接测序。得到ND5的序列1839 bp和Cytb基因序列382 bp。应用primer premier5和MEGA3软件包所作的系统发育分析表明：依据大黄鱼ND5序列所作的进化树总体支持传统的分类地位，大黄鱼更接近塘鳢鱼科。而基于Cytb基因所作的分析表明，黑鳃梅童鱼是大黄鱼在石首鱼科中是遗传距离最小的。     

马鞍列岛及其东部海域鱼类群落格局与环境因子之间的关系

为探究岛礁海域渔业资源群落格局,于2016年8月、12月及2017年2月和5月对马鞍列岛及其东部海域进行了渔业资源季度调查。利用聚类分析、非度量多维标度(nMDS)和生物环境相关分析(BIOENV)等方法,对该海域的鱼类群落组成、时空动态及其与环境因子的相关性进行了研究。共采集鱼类96种,隶属于12目47科77属,其中鲈形目占比最大,其生物量和丰度占比均超过50%。龙头鱼为全年优势种,春季优势种包括刺鲳、黑鳃梅童鱼和宽体舌鳎;夏季优势种为小黄鱼、带鱼和六丝矛尾虾虎鱼;秋季和冬季优势种相同,为棘头梅童鱼和凤鲚。聚类分析和nMDS结果显示,马鞍列岛及其东部海域鱼类群落可分为站位组I (岛礁周围站点为主)、站位组II (邻近岛礁站点为主)和站位组III (远离岛礁站点为主)。除春季站位组I与站位组III、站位组II与站位组III外,鱼类群落种类组成在各季节不同站位组之间皆存在显著差异。BIOENV分析显示,在底层水温、底层盐度和水深3个因素中,底层水温对鱼类群落影响最大。     

黄、东海3个黄姑鱼群体和1个鮸鱼群体的形态学比较研究

对采自黄海中部(青岛)、东海北部(舟山)和东海南部(厦门)海域的3个黄姑鱼自然群体(共121尾)和浙江舟山沿海的1个鮸鱼群体(24尾)的6组分节特征和7组量度特征进行了聚类分析、单因子方差分析和主成分分析。结果表明,鮸鱼群体与3个黄姑鱼群体之间在侧线鳞数、第1背鳍数、第2背鳍数、下鳃耙数和脊椎骨数等分节特征(上鳃耙数除外)和体高/体长、头长/体长、尾柄长/体长、吻至背鳍起点/体长、吻至胸鳍起点/体长、吻至臀鳍起点/体长和背鳍起点至臀鳍起点/体长等量度特征上存在着显著差异,而3个黄姑鱼群体之间在这13组形态特征上也存在着一定差异,但与种间差异相比则很小。另外,对于3个黄姑鱼群体来说,与青岛群体相比较,舟山群体与厦门群体之间更加相近。     

黄、东海3个黄姑鱼群体和1个(鱼免)鱼群体的形态学比较研究

对采自黄海中部(青岛)、东海北部(舟山)和东海南部(厦门)海域的3个黄姑鱼自然群体(共121尾)和浙江舟山沿海的1个(鱼免)鱼群体(24尾)的6组分节特征和7组量度特征进行了聚类分析、单因子方差分析和主成分分析.结果表明,(鱼免)鱼群体与3个黄姑鱼群体之间在侧线鳞数、第1背鳍数、第2背鳍数、下鳃耙数和脊椎骨数等分节特征(上鳃耙数除外)和体高/体长、头长/体长、尾柄长/体长、吻至背鳍起点/体长、吻至胸鳍起点/体长、吻至臀鳍起点/体长和背鳍起点至臀鳍起点/体长等量度特征上存在着显著差异,而3个黄姑鱼群体之间在这13组形态特征上也存在着一定差异,但与种间差异相比则很小.另外,对于3个黄姑鱼群体来说,与青岛群体相比较,舟山群体与厦门群体之间更加相近.     

黄海重要饵料鱼种矢耳石的形态特征

由于鱼类矢耳石的形态结构稳定,具有种的特征,且坚硬不易被消化,其形态特征可用于鱼类胃含物分析中的种类鉴定。本研究选取黄海"简化食物网"中的30种重要饵料鱼种为研究对象,描述了各种类矢耳石的形态特征,并进行了比较分析。结果发现,这30种重要饵料鱼种的矢耳石中形态结构相似的有7组:赤鼻棱鳀和中颌棱鳀,细条天竺鱼和斑鳍天竺鱼,多鳞鱚和少鳞鱚,皮氏叫姑鱼和白姑鱼,黄姑鱼和小黄鱼,黑鳃梅童鱼和棘头梅童鱼,以及矛尾鰕虎鱼和六丝矛尾鰕虎鱼,本研究为胃含物分析等基于耳石形态的种类鉴别提供了基础资料,同时进一步更广泛深入地研究和认知鱼类的耳石形态,近缘种耳石形态特征的量化研究,以及同一种类耳石形态的地理变异等的研究将有助于更准确地进行种类的鉴别,对提高胃含物分析的准确度也有很大帮助。     

浙江近海棘头梅童鱼的分布生物学与资源变动

<正> 棘头梅童鱼 Collichthylueidus(Richard-son)属鲈形目、石首鱼科、梅童鱼属。沿海渔民把它与黑鳃梅童 Collichthy niveatus(Jordan & Starks)统称为梅童鱼,俗称大头梅童、圆头梅童。有人把它误称为梅子,其实梅童与梅子并非同物异名,后者应为大黄鱼、小黄鱼幼体的别称。棘头梅童鱼为近海常见的小型鱼类,肉质鲜美,浙江沿     

黄姑鱼和日本黄姑鱼染色体核型的比较

采用PHA体内直接注射法制备了黄姑鱼Nibea albiflora和日本黄姑鱼N.japonica肾组织的染色体制片,并对两种鱼的核型进行了比较分析.结果表明,黄姑鱼的核型公式为:2n=48t,NF=48;日本黄姑鱼的核型公式为:2n=48t,NF=48.黄姑鱼染色体相对长度最长为5.94±0.33,最短为3.06±0.20;日本黄姑鱼染色体相对长度最长为5.68±0.22,最短为2.66±0.14.收集文献报道的石首鱼科鱼类的核型研究资料,包括双棘黄姑鱼N.diacanthus、(鱼免)状黄姑鱼N.miichthioides、大黄鱼Pseudosciaena crocea的核型,应用核型进化距离聚类分析方法研究了这5种石首鱼科鱼类的亲缘关系.结果表明,黄姑鱼和双棘黄姑鱼以及(鱼免)状黄姑鱼和日本黄姑鱼的亲缘关系较近,大黄鱼与(鱼免)状黄姑鱼的亲缘关系最远,核型进化距离聚类分析在一定程度上反映了这5种鱼的亲缘关系和进化历程.     

龙凤鲤体型性状的相关及聚类分析

以龙凤鲤、龙凤鲤杂交(第一组)和龙凤鲤、锦鲤杂交(第二组)的93尾子代为实验材料,对所有个体的全长、体高和尾鳍长等10个体型性状指标进行测量,并对结果进行均数差异显著性分析、相关分析和聚类分析。结果表明:两组龙凤鲤的体厚均值存在极显著差异(P<0.01);相关分析表明,两组子代的尾鳍长都与体长有极显著的负相关,第二组子代的尾鳍长与体高、头长、尾柄高有极显著的正相关(P<0.01),相关程度最大的是体高(r=0.536),其它体尺间的相关关系因亲本不同而不同。聚类分析得到,第一组子代的体型指标可以聚为三类,第二组子代的体型指标可以聚为五类。两组龙凤鲤在体型性状上有一定区别。     

三疣梭子蟹形态性状对体重影响的分析

通过对鸭绿江口、莱州湾、海州湾和舟山4个采样地点的三疣梭子蟹Portunus tritubercula-tus12项形态性状的测量,采用相关分析和通径分析方法,计算了以形态性状为自变量对体重作依变量的相关系数、通径系数、决定系数及相关指数,定量分析了形态性状对体重的影响效果。结果表明,三疣梭子蟹12个形态性状均与体重的相关系数达到极显著水平(P<0.01);通径分析揭示了多元分析中多个自变量与依变量的真实关系。全甲宽、甲长、体高、第1侧齿间距、第2侧齿间距、大螯不动指长对体重的通径系数达到显著水平。所选形态性状与体重的复相关指数为R2=0.8826,说明影响体重的主要自变量指标已经找到;多元回归分析建立了全甲宽(X1)、甲长(X2)、体高(X4)、第一侧齿间距(X5)、大螯不动指长(X7)对体重(Y)的回归方程,为三疣梭子蟹育种提供理论依据。     

An optimized and simplified method for analysing urea and ammonia in freshwater aquaculture systems

This study presents a simple urease method for analysis of ammonia and urea in freshwater aquaculture systems. Urea is hydrolysed into ammonia using urease followed by analysis of released ammonia using the salicylate‐hypochlorite method. The hydrolysis of urea is performed at room temperature and without addition of a buffer. A number of tests were performed on water samples obtained from a commercial rainbow trout farm to determine the optimal urease concentration and time for complete hydrolysis. One mL of water sample was spiked with 1.3 mL urea at three different concentrations: 50 μg L^?1, 100 μg L^?1 and 200 μg L^?1 urea‐N. In addition, five concentrations of urease were tested, ranging from 0.1 U mL^?1 to 4 U mL^?1. Samples were hydrolysed for various time periods ranging from 5 to 120 min. A urease concentration of 0.4 UmL^?1 and a hydrolysis period of 120 min gave the best results, with 99.6–101% recovery of urea‐N in samples spiked with 100 or 200 μg L^?1 urea‐N. The level of accurate quantification of ammonia using the method is 50 μg L^?1 NH₄⁺‐N, and the detection level is 5–10 μg L^?1 NH₄⁺‐N.     

Visualization analysis of seabream and seabass aquaculture research using CiteSpace

In terms of production, seabream and seabass are the two most important species of marine Mediterranean aquaculture, which is why they have been extensively studied in the literature. This study uses visualization analysis with the CiteSpace software to determine the research status quo and the most important trends of seabream and seabass aquaculture research. The Web of Science (WoS) database was used to select the papers associated with seabream and seabass literature from the period between 1986 and 2020. The results were separated using two indices (Science Citation Index Expand and Social Science Citation Index). The visualization analysis identified the networks for (1) author, institution, country and category co-authorship, in order to find the most prolific authors, institutions, countries and categories respectively; and (2) journal, document and author co-citation, which identifies the most relevant journals, the most important studies and the most cited and influential authors. Finally, a keywords co-occurrence network was built to identify the most important topics and the research frontiers—body of knowledge—of the seabream and seabass aquaculture research—SSAR.     

三个地理种群鲂的形态差异与判别分析

采集了北江、钱塘江、金沙河水库3个地理种群的鲂（Megalobrama skolkovii）414尾样本,用传统形态学和框架分析法,运用单因素方差分析、聚类分析、主成分分析和判别分析法比较研究了37个形态比例性状。结果表明：3个种群的口裂长／头长、吻长／头长、口宽／头长、上颌厚／头长、全长／体长、体厚／体长、头长／体长、尾柄长／体长、尾柄高／体长、尾柄长／尾柄高、1—2／体长、1—3／体长、2—4／体长、2—5／体长、3—5／体长、4—5／体长、4—6／体长、4—7／体长、5—6／体长、6—8／体长、6—9／体长、7—8／体长,及7—9／体长23个性状差异显著（P〈0．05）（1：吻端;2：头部后缘;3：胸鳍起点;4：背鳍起点;5：腹鳍起点;6：背鳍基部末端;7：臀鳍起点;8：尾鳍背部起点;9：尾鳍腹部起点）;聚类结果显示,北江与金沙河水库首先聚为一类,认为北江群体与金沙河水库群体形态最为相似;主成分分析构建了9个主成分,累计贡献率为60．26％;以Bayes逐步判别分析方法选用18个判别效果较好的比例性状建立了3个鲂地理种群的判别函数,判别率为99．03％。结果显示,可以通过形态比例性状来判断鲂的3个地理群体的归属。     

汤浦水库及入库支流水质时空变化特征与影响因素分析

运用聚类分析和主成分分析对汤浦水库及入库支流的水质时空特性进行了分析,聚类分析结果表明,汤浦水库水质可分为支流、支流入库库湾、水库库中3个典型空间区域和持续强降雨、雨季、非雨季3个季节时段。汤浦水库3个空间区域的主成分分析显示,第1、2主成分较好地反映了不同区域影响水质状态的主要因素。以水库库中为代表的水域水质明显不同于以北溪和南溪两条主要入库支流下游为代表和支流入库库湾两类区域,规律也不同,它主要受到随季节波动的库区初级生产力状况和无机盐的影响。汤浦水库3个典型季节的主成分分析显示,第1主成分较好地反映了不同季节影响水质状态的主要因素。以1至4月和9至12月非雨季为代表的水库水质变化与持续强降雨季节（6月）和降雨季节（5月、7月和8月）完全不同,主要受到气象因子和水位的双重影响,表现为营养水平波动、细菌等微生物的反硝化作用和水位涨落带的轻微有机及重金属污染。     

不同地理群体菲律宾蛤仔表型性状的相关性与通径分析

随机选取繁殖时期的南方群体北方养殖菲律宾蛤仔(SN)、北方土著品种(NN)和南方群体南方养殖蛤仔(SS),测量其壳长(SL)、壳高(SH)、壳宽(SW)、活体质量(mL)、软体质量(mM)和烘干后软体部干质量(mF),采用相关与通径分析方法分析不同地理群体的菲律宾蛤仔表型性状对软体质量的作用效果,为菲律宾蛤仔的选择育种提供理论依据和测度指标。试验结果表明,不同地理群体菲律宾蛤仔的形态学指标无显著差异(P>0.05);不同地理群体各数量性状之间的相关关系均达到极显著水平(P<0.01);决定系数分析表明,不同地理群体菲律宾蛤仔影响软体质量的主要表型性状并不相同,南方群体北方养殖蛤仔群体的壳宽直接作用最大,壳宽通过壳高的间接作用是次要因素;北方土著品种群体壳长是主要因素,壳长通过壳高的间接作用是次要因素;南方群体南方养殖蛤仔群体壳高的直接作用是主要因素,壳长通过壳高的间接作用是次要因素。对通径系数检验不显著的自变量进行删除,利用逐步回归的方法,建立不同地理群体菲律宾蛤仔软体质量的最优回归方程:SN群体,mM1=-4.276+0.211SH+0.116SW;NN群体,mM2=-2.806+0.088SL+0.087SH;SS群体,mM3=-3.101+0.290SH。回归方程分析表明回归关系均达到极显著水平(P<0.01)。     

Diet and trophic niche overlap of native and nonnative fishes in the Gila River,USA: implications for native fish conservation

Pilger TJ, Gido KB, Propst DL. Diet and trophic niche overlap of native and nonnative fishes in the Gila River, USA: implications for native fish conservation. Ecology of Freshwater Fish 2010: 19: 300–321. © 2010 John Wiley & Sons A/S Abstract –  The upper Gila River basin is one of the few unimpounded drainage basins west of the Continental Divide, and as such is a stronghold for endemic fishes in the region. Nevertheless, multiple nonindigenous fishes potentially threaten the persistence of native fishes, and little is known of the trophic ecology of either native or nonnative fishes in this system. Gut contents and stable isotopes (¹³C and ¹⁵N) were used to identify trophic relationships, trophic niche overlap and evaluate potential interactions among native and nonnative fishes. Both native and nonnative fishes fed across multiple trophic levels. In general, adult native suckers had lower ¹⁵N signatures and consumed more algae and detritus than smaller native fish, including juvenile suckers. Adult nonnative smallmouth bass (Micropterus dolomieu), yellow bullhead (Ameiurus natalis) and two species of trout preyed on small‐bodied fishes and predaceous aquatic invertebrates leading to significantly higher trophic positions than small and large‐bodied native fishes. Thus, the presence of these nonnative fishes extended community food‐chain lengths by foraging at higher trophic levels. Although predation on juvenile native fishes might threaten persistence of native fishes, the high degree of omnivory suggests that impacts of nonnative predators may be lessened and dependent on environmental variability.     

黑河干流浮游动物与水环境因子关系的多元分析

为探明黑河干流浮游动物与水环境因子之间的关系,分别于2015年4月、7月和12月测定黑河干流浮游动物密度、生物量与水环境因子,应用多元逐步回归分析、通径分析和典范对应分析方法进行研究。结果表明：黑河干游浮游动物种类以轮虫等小型个体为主,其密度、生物量及种群分布受到水环境因子的共同作用,各断面水环境因子的差异是浮游动物数量变动及分布情况不同的主要原因。上游浮游动物数量变动受水体叶绿素a含量和溶氧影响,高锰酸盐指数和总磷决定浮游动物的分布；中游浮游动物数量变动受叶绿素a含量和透明度制约,其分布与pH、溶氧、电导率、总磷、高锰酸盐指数、叶绿素a密切相关; 影响下游浮游动物密度的主要因子是叶绿素a含量、溶氧、总磷和电导率,生物量则与叶绿素a含量、总氮和电导率相关,总磷和溶氧共同决定下游浮游动物的分布。     

不同时期牙鲆形态性状对体重影响的通径分析及曲线拟合研究

以8月龄与14月龄的养殖牙鲆(Paralichthys olivaceus)为研究对象,分别测定体重(Y)和22个形态性状,对各性状进行相关分析,并建立多元回归方程,对各形态性状对体重的影响效果进行通径分析。分别以进入回归方程的各形态性状作为自变量,体重为因变量进行曲线模型拟合,筛选最优拟合模型。结果显示:(1)在不同生长阶段,相同形态性状与体重的相关性存在差异。(2)8月龄阶段,X_(18)(腹鳍基部到背鳍终点的直线距离)、X_4(体宽)和X_(11)(背鳍起点到臀鳍起点的直线距离)对体重的通径系数达到极显著水平(P0.01),14月龄阶段,X_(18),X_(14)(背鳍终点到臀鳍终点的直线距离)和X_9(尾柄长)对体重的通径系数达到显著水平(P0.05),由此可知,不同生长阶段,影响体重的形态性状不尽相同。8月龄和14月龄牙鲆形态性状对体重的多元回归方程分别为:Y=-119.541+7.191X_(18)+10.135X_4+7.197X_(11);Y=-484.931+31.959X_(18)+81.928X_(14)-17.899X_9。(3)8月龄阶段,将回归模型中的3个自变量分别与体重进行模型拟合,最优拟合模型均为线性模型,分别为:Y=-117.866+15.724X_(18);Y=-94.579+24.763X_4;Y=-100.602+33.184X_(11);14月龄阶段,将回归模型中的3个形态性状分别与体重进行模型拟合,最优拟合模型均为幂函数模型,分别为:Y=0.036X_(18)~(3.063);Y=0.095X_(14)~(2.587);Y=62.249X_9~(1.584)。本次研究表明,在牙鲆的不同生长时期,影响体重的主要形态性状不同,两阶段适用的最优拟合模型也不同,这为牙鲆不同时期的选择育种工作提供了理论依据。