稻田适养品种呆鲤的遗传多样性分析

为探明湘黔山区稻田养殖呆鲤群体的遗传多样性现状，采用14对微卫星引物对湘西永顺、怀化藕团、黔东南锦屏县的呆鲤养殖群体与湘江野鲤自然群体、兴国红鲤养殖群体的遗传多样性及群体间的遗传分化水平进行研究。结果显示：14个微卫星位点平均等位基因数为16.571～19.214,平均有效等位基因数为9.420～11.143,各群体的平均遗传观测杂合度为0.705～0.778,平均期望杂合度为0.884～0.893,平均多态信息含量为0.883～0.891;各位点群体间的遗传分化系数平均值为0.017,基因流为3.088～27.730,5%的遗传变异来自于群体间，而95%的变异来源于群体内个体间和个体内。试验结果表明，本次采集的5个群体均具有较高的遗传多样性，群体间存在一定的基因流动且遗传分化较弱，在长期的稻田养殖条件下，呆鲤群体遗传多样性未下降，未与湘江野鲤产生明显分化，但藕团呆鲤与湘江野鲤产生了一定的遗传分化。     

建鲤与兴国红鲤RAPD分子标记的研究

利用随机扩增多态DNA(RAPD) 技术对鲤鱼的两个品系, 即建鲤和兴国红鲤进行了遗传分析。在所用20 个10 碱基随机引物扩增产物中, 找到了建鲤与兴国红鲤品系间的RAPD分子遗传标记, 为鲤鱼主要品系的保存和保护以及品种的选育工作提供了一种新的技术手段和基础资料。     

红鲤4群体间主要组织相容性复合体的差异

应用鱼类主要组织相容性复合体(MIC)基因来探讨鱼类种群间遗传结构,寻找分子遗传标记。根据已报道的鲤鱼MICI类基因序列,设计了一对特异性引物,从兴国红鲤、荷包红鲤、玻璃红鲤及瓯江彩鲤基因组DNA中扩增了编码MICI类分子α2链的基因片段,并进行克隆、测序。结果表明,(1)编码MHC I类分子α2链的基因多态性较为丰富,234bp长度中有106个变异位点,多态位点百分率达45．3％;荷包红鲤的基因序列与其它3群体红鲤有显著差异;(2)由编码MICI类分子α2链的基因和氨基酸序列构建的系统进化树一致,兴国红鲤与团江彩鲤关系较近,属于同一进化支,玻璃红鲤和荷包红鲤分别属于另外两个不同的进化支,荷包红鲤是较为特化的群体;(3)多态性丰富的编码MICI类分子α2链的基因,适宜作为鲤鱼不同群体的分子遗传标记。     

RAPD技术分析荷包红鲤抗寒品系与亲本的基因组变化

用４０个随机引物对荷包红鲤、荷包红鲤抗寒品系和黑龙江野鲤三个品系鱼进行ＲＡＰＤ反应，共扩增出３６６条带，获得多态性的ＤＮＡ片段６０条。荷包红鲤抗寒品系与荷包红鲤、荷包红鲤抗寒品系与黑龙江野鲤的基因组变异指数分别为０．７７和０．９０。说明荷包红鲤抗寒品系的基因组与其亲本黑龙江野鲤的基因组较荷包红鲤具有更大的变异。     

红鲤四品系的形态差异和种系关系

综合传统形态学数据和框架测定数据，通过多元变量分析，研究了我国红鲤四个品系（兴国红鲤、玻璃红鲤、荷包红鲤及瓯江彩鲤）的形态差异和种系关系。主要结果：（1）可数性状方面，4品系红鲤无显著差异（P〉0．05）。（2）传统可量性状和框架测定数据合在一起，4品系红鲤间有显著差异（P〈0．05）；聚类分析表明，瓯江彩鲤、兴国红鲤及玻璃红鲤三者形态相近，而荷包红鲤与这三种红鲤的形态差异明显。在28项比例变量基础上所作判别分析表明，红鲤4品系问形态差异极显著（P〈0．01），用优选的8项比例变量判别，综合判别准确率达92％；主成分分析表明，4品系红鲤间形态差异主要系躯体前半部差异所致。（3）把传统可量性状数据和框架测定数据结合在一起，使用多种多元变量分析技术，可大大增强鱼类种内不同群体间差异和亲缘关系的研究能力。     

散鳞镜鲤两个保种群体的遗传多样性

利用20个微卫星标记分析国内仅存的两个散鳞镜鲤（Cyprinus carpio）保种群体（SP、CJ）的遗传多样性。结果表明：共检测到147个等位基因,平均值为7.35,有效等位基因数（Ae）、期望杂合度（He）以及多态信息含量（PIC）的平均值分别为2.7828、0.6041和0.5386。SP群体的Ae、He以及PIC值分别为3.1126、0.6479和0.5948,大于CJ群体（2.4529、0.5602和0.4823）。在两个群体中,群体特有等位基因共53个,其中9个为低频等位基因。对20个引物在两个群体中等位基因的显著性分析表明：其中有16个引物可以作为区分两个群体的特异性分子标记。瓶颈效应分析结果显示：2个群体均经历了瓶颈效应。同胞率检测结果（SP 97.5%;CJ 96.7%）偏高说明群体内近交压力较大。哈迪-温伯格平衡检测表明：两个群体大部分位点偏离平衡并处于杂合子过剩状态。两个群体间的遗传距离（D）为0.5625,SP和CJ群体的个体均各聚为一支。群体间的遗传分化指数（Fst）为0.1138,Nm值为1.9462。该研究表明：散鳞镜鲤群体遗传多样性水平较高,其中SP群体的遗传多样性水平高于CJ群体,两群体处于中度遗传分化。     

青海湖裸鲤繁殖群体遗传多样性的RAPD分析

采用随机扩增多态性DNA(RAPD)方法对青海湖裸鲤的3个洄游繁殖群体-黑马河(HM)、布哈河(BH)及沙柳河(SL)群体各30个个体的DNA多态性进行了分析。用13个引物在三个群体中共检测出85个位点，其中多态性位点68个。青海湖裸鲤群体总的DNA多态位点百分率为80．0％。数据分析结果显示：青海湖裸鲤3个群体总的Nei基因多样性为0．3395，Shannon遗传多样性信息指数为0．4861，存在着较为丰富的遗传多样性。青海湖裸鲤3个群体间平均遗传距离为0．0788，基因分化系数Gst为0．1070，表明3个繁殖群体间产生了一定程度的遗传分化，通过UPGMA方法进行聚类分析显示，HM群体和BH群体优先聚类，表示它们之间的基因交流程度要高于它们分别与SL群体之间的交流。     

中国鲤几个代表种群基因组DNA遗传多样性分析

中国鲤具有悠久的养殖历史和重要的经济价值,无论是天然种群还是养殖品种,年产量远超过其它鱼类。近几十年来,养殖新品种的开发获得成功,大大提高了产量,改善了品质。但是由于盲目的开发利用,许多重要的鲤养殖种类的种质资源遭到破坏。"江西三红"(Cyprinuscarpiovar.xingguonensis、Cyprinuscarpiovar.wuyuanensis、Cyprinuscarpiovar.wananensis)、黄河鲤(Cyprinusycarpiovar.)和黑龙江野鲤(Cyprinuscarpiohaematopterus)是中国鲤几个具有代表性的养殖品种和野生种,在我国鲤鱼遗传育种研究中均占有非常重要的地位。应用第二代分子标记,即微卫星标记(microsatellite)84个,对以上5个具有代表性的中国鲤进行了全基因组DNA检测。结果表明,当退火温度提高至60℃时,有43对标记引物扩增出清晰的条带,其中有14对在群体间呈现多态性,扩增等位基因位点为2～4个。微卫星座位MFW4,MFW19,MFW23和MFW26在群体内显示了高度的多态性,扩增等位基因位点为7～13个。统计实验结果发现,"江西三红"3个品种间遗传差异较小,兴国红鲤和荷包红鲤的亲缘关系较近(0.93);属于同一亚种不同地理种群的黄河鲤和黑龙江野鲤具有较高的遗传相似性(0.89)。另外,根据微卫星多态性分析结果,探讨了这5种鲤的遗传多样性。     

红镜鲤6个微卫星座位的遗传多样性初探

利用6个多态性微卫星标记对红镜鲤(Cyprinus carpio red var．mirror)进行了群体遗传多样性评估。结果显示,6个座位的平均等位基因数为4．3个；每个座位包含的平均多态信息含量为0.6522；平均每个座位的观测杂合度和预期杂合度分别为0．7792和0.7111,有2个座位具有极高的观测杂合度(1．00)；除MFW1外,其余各座位均偏离了哈代—温伯格平衡(P＜0．01)。这表明红镜鲤群体仍具有较高的变异水平,但遗传漂变和人工选择已对群体产生了较大影响。     

江西三种红鲤起源与遗传多样性研究的进展

遗传多样性 (ｇｅｎｅｔｉｃｄｉｖｅｒｓｉｔｙ)是生物多样性的重要组成部分。广义的遗传多样性是指地球上所有生物携带的遗传信息的总和。这里指的遗传多样性主要是指种内不同群体之间或一个群体内不同个体之间的遗传变异的总和 ,这或许可称是遗传多样性狭义的定义[1] 。产于江西省婺源县的荷包红鲤 (Ｃｙｐｒｉｎｕｓｃａｒｐｉｏｖａｒ.ｗｕｙｕａｎｅｎｓｉｓ)、兴国县的兴国红鲤 (Ｃｙｐｒｉｎｕｓｃａｒｐｉｅｖａｒ.ｘｉｎｇｇｕｏｎｅｎｓｉｓ)和万安县的玻璃红鲤 (Ｃｙｐｒｉｎｕｓｃａｒｐｉｏｖａｒ.ｗａｎａｎｅｎｓｉｓ)是我…     

Application of the random amplified polymorphic DNA technique in a study of heterosis in common carp, Cyprinus carpio L.

Random amplified polymorphic DNA (RAPD) analysis was applied to three varieties of common carp, Cyprinus carpio L.: Xingguo red carp, German mirror carp and Russian mirror carp. Twenty-seven decamer primers pre-screened from 40 random primers were used to assay polymorphisms within and between the populations. One hundred and ninety-nine fragments were generated in the three populations; 155 of these fragments were polymorphic. The similarity indices and genetic distances within and between the three populations of carp were calculated. The results indicated that the highest value of similarity within populations was obtained for German mirror carp, and the genetic distance between Xingguo red carp and Russian mirror carp was the farthest. It can be presumed that the heterosis between Xingguo red carp and Russian mirror carp is the highest within these three populations.     

Studies on fish heterosis with DNA fingerprinting

One Tilapia hybridization, Oreochromis aureus, (Steindachner) ♂ × Oreochromis niloticus, (Linnaeus) ♀, and two common carp, Cyprinus carpio, (Linnaeus) ♂, hybridizations, Russian mirror carp ♂ × Xingguo red carp ♀, and German mirror carp ♂ × Xingguo red carp ♀ were used to study the feasibility of predicting heterosis using genetic distance from DNA fingerprinting. The results indicated that highly polymorphic DNA fingerprints could be obtained with human minisatellite 33.6 as a probe on the studied varieties. The within‐population similarity indices of O. aureus, O. niloticus, Russian mirror carp, German mirror carp and Xingguo red carp were 0.785, 0.577, 0.432, 0.348 and 0.339 respectively. The similarity indices between F1 and their parents of three hybridization combinations were not significantly different (P > 0.05). There were larger genetic distances between two hybridization combinations, O. aureus♂ × O. niloticus♀ and Russian mirror carp ♂ × Xingguo red carp ♀, which showed heterosis in production and were extensively used in Chinese aquaculture. The genetic distance between O. aureus♂ and O. niloticus♀ was 0.338, and that between Russian mirror carp and Xingguo red carp was 0.344. However, the genetic distance between German mirror carp and Xingguo red carp was 0.129; this corresponded with the fact that their F1 generation did not show heterosis in the Chinese fish hybridization experiment. The study suggested that genetic distance could be used to predict fish heterosis.     

芙蓉鲫(芙蓉鲤♀×红鲫♂)及其原始亲本的形态学分析

本研究随机采集芙蓉鲫及其原始亲本(芙蓉鲤、红鲫、散鳞镜鲤、兴国红鲤),测定了7项可数性状和12项可量性状,研究芙蓉鲫与其原始亲本之间的表型差异。结果表明:芙蓉鲫(Cyprinus capiofurong.♀×Carassiusauratusred var.♂)可数性状稳定,介于父母本之间,可量性状中芙蓉鲫有5项偏向父本,3项偏向母本、4项超父母本。聚类分析显示芙蓉鲫可量性状更接近于父本红鲫,而与另3种亲本差异较远。判别分析结果也显示芙蓉鲫与红鲫形态更为接近,各组判别准确率依次为芙蓉鲫100%,红鲫96%,兴国红鲤87%,散鳞镜鲤81.3%,芙蓉鲤73.1%。     

异源四倍体鲫鲤及其原始亲本遗传变异的RAPD分析

在优化RAPD检测条件的基础上，从100个随机引物中筛选出60个扩增较好的引物对异源四倍体鲫鲤及其原始亲本红鲫和湘江野鲤相互间扩增DNA片段的异同性进行比较研究。结果显示，60个引物共产生1554条带，单一引物扩增的DNA片段数在6～20条之间，片段大小在200～3500bp之间。遗传相似率分析表明，异源四倍体鲫鲤与其原始母本红鲫的相似率为69．41％，与其原始父本野鲤的相似率为64．47％，说明异源四倍体鲫鲤接受原始母本红鲫的遗传物质要多一些；而红鲫和野鲤之间的相似率为42．18％，说明两者的基因组成有较大的相似性，从分子水平证实了红鲫和野鲤的远缘杂交具有较大的亲和性。在分析中，还发现异源四倍体鲫鲤有4条非亲本带，非亲本带谱率达0．72％，这些非亲本带可以作为异源四倍体鲫鲤特异性的分子标记。     

中国红鲤四群体线粒体DNA遗传多样性、起源及分化

用13种限制性内切酶对兴国红鲤、玻璃红鲤、荷包红鲤及瓯江彩鲤4种红鲤的线粒体DNA(mtDNA)进行RFLP分析。共产生17种限制性态型,其中5种酶为限制性片段长度多态性(RFLPs),归结为5种单倍型;兴国红鲤、玻璃红鲤、荷包红鲤和瓯江彩鲤的核苷酸多样性(Ⅱ)分别为0．0087、0．0059、0．0094、0．0286,瓯江彩鲤的遗传多样性最为丰富;瓯江彩鲤起源于单倍型Ⅱ为主的母系祖先,推算分化时间分别约在11．5万年、9．5万年前;玻璃红鲤和荷包红鲤起源于单倍型I为主的母系祖先,推算分化时间分别约为5～5．6万年、2万年前。     

斑马鱼SSLP标记检测鲤鱼种间的遗传多态性

用500对斑马鱼SSLP标记引物对黑龙江野鲤（Cyprinus carpio haematopterus Temminck et Schlegel)和柏氏鲤（Cyprinus Pellegrini pellegrini Tchang)进行种间遗传差异分析，共发现110个斑马鱼标记在鲤鱼种间表现出差异，故可作为黑龙江野鲤和柏氏鲤间的分子标记，也可作为建立遗传连锁图谱的遗传标记。     

分子群体遗传学方法处理鲤形态学数据的适用性

在鱼类形态学性状的数据处理分析中,主要利用数理统计分析软件进行形态学数据的聚类分析、主成分分析和判别分析,而随着现代分子生物学技术的发展,一系列分子群体遗传学数据分析方法和处理软件应运而生。为研究分子群体遗传学方法对鱼类形态学数据分析的适用性,实验以兴国红鲤、玻璃红鲤、荷包红鲤完全双列杂交产生的9个群体形态学数据为对象,比较了传统形态学方法与分子群体遗传学方法对鱼类形态学性状的分析效果。结果发现,两类方法的聚类分析结果一致;主成分分析的结果表明,传统形态学分析方法能反映个体间的形态差异,而分子群体遗传学方法则能更好地反映群体间的形态差异;判别分析结果显示,两类方法的综合判别率相当;利用STRUCTURE软件进行的遗传聚类分析结果也发现,两类方法所得的结果一致。研究表明,应用传统形态学方法与分子群体遗传学方法分析鲤形态学性状是一致的,分子群体遗传学方法处理鲤科鱼类形态学数据是可行的。     

兴国红鲤、草鱼及其杂种一代血清蛋白质的电泳分析

用聚丙烯酰胺凝胶垂直平板电泳分析了兴国红鲤、草鱼及其杂种一代的血清蛋白。结果表明,它们各有不同的电泳图谱,杂种一代为双亲的嵌合型,相对而言,MA带偏向母本,MI带偏向父本。     

德国镜鲤选育系F4天津群体中不同体型的遗传结构分析

本文利用15对微卫星分子标记，对德国镜鲤选育系F4天津群体中的高背型和长条型德国镜鲤的遗传结构进行分析，结果表明：两种体型德国镜鲤F4群体平均等位基因数分别为5．0和5．1，平均期望杂合度分别为0．5527和0．5591．平均观测杂合度分别为0．5906和0．5824，平均多态信息含量分别为0．5653和0．5470。以卡方检验估计群体Hardy—Weinberg平衡显示有大部分位点发生了偏离。两体型间遗传相似性为0．8330，相似性较高。群体间遗传分化微弱（Fst=0．0242），群体内变异占总变异的97．58％。说明高背型德国镜鲤和长条型德国镜鲤在遗传结构上差异较小。由天津群体的等位基因数为5．05，期望杂合度为0．5559，观测杂合度为0．5865，多态信息含量为0．5562，可知天津群体属于中度多态，遗传多样性保持较高水平。