利用SSR标记鉴定西瓜杂交种纯度的研究

建立快速、准确、稳定的种子纯度检测技术是保证西瓜杂交种质量的有效措施。利用分子标记技术对小型西瓜‘美月’杂交种纯度进行鉴定。从均匀分布于不同西瓜染色体上的88对SSR引物中筛选出8对引物在‘美月’亲本间表现明显的多态性,分别位于第1、2、3、6、8、9、10染色体上,多态性比率为9.09%,多态性标记均为共显性标记。为了提高检测效率,结合多态性片段大小,同时对标记SSR48和SSR62进行扩增,可成功获得221 bp和131 bp的两组特异性条带,成功建立了双重PCR体系。为了提高鉴定结果的准确性,选用位于西瓜不同染色体上的4对共显性标记对‘美月’进行纯度检测,4对标记的检测结果高度一致,‘美月’杂交种纯度为99.44%。标记鉴定结果与田间表型鉴定结果比较分析表明,2种鉴定结果高度一致。研究结果可为西瓜杂交品种纯度快速检测和品种权保护提供理论依据与技术支撑。     

热辣2号辣椒纯度鉴定及优良自交系遗传多样性分析

为了提高种子质量和充分利用辣椒种质资源,应用SSR分子标记对热辣2号杂交种纯度进行鉴定并对部分辣椒优良自交系进行遗传多样性分析。以热辣2号母本材料CAYB02和父本材料CAYB01为模板筛选85对辣椒SSR引物,其中12对引物在亲本间能扩增出明显的多态性,多态性比率为14.12%,多态性标记分别位于辣椒1、3、4、6、7、9、11、12号染色体,利用3对位于不同染色体上的SSR标记对热辣2号黄灯笼椒杂交种的纯度进行鉴定,热辣2号种子纯度为98.79%,标记鉴定结果与田间鉴定结果一致。研究结果表明,利用SSR标记鉴定辣椒杂交种纯度是切实可行的。利用12对多态性明显、稳定可靠的SSR引物对部分辣椒自交系进行遗传多样性分析,共扩增出60条条带,多态性位点比率为100%,平均每对引物检测出5个等位基因。30份辣椒自交系间遗传相似系数变幅为0.33~1.00,平均为0.65,表明供试材料间具有丰富的遗传多样性。聚类分析结果表明,在遗传相似系数为0.47时,可以将中国辣椒和一年生辣椒区分开来。在遗传相似系数为0.85时,30份辣椒优良自交系分为11个类群,辣椒种质遗传关系与地理来源和农艺性状具有一定的相关性。     

应用SSR标记技术鉴定玉米杂交种纯度

以张玉1号、纪元1号、蠡玉6号、万佳11杂交种及其各自亲本为实验材料．利用16对玉米SSR引物进行SSR扩增,筛选出了适合该杂交种纯度鉴定的SSR引物．建立了一套利用SSR标记技术快速、准确、简便易行地进行玉米杂交种纯度鉴定的技术。     

利用SSR标记技术检测玉米杂交种纯度

对玉米子粒DNA提取、SSR扩增片段检测方法等进行了研究,并以4个利用常规种子贮藏蛋白质电泳技术难以鉴定纯度的玉米杂交种及相应自交系和9对玉米SSR位点引物为材料,分别筛选出适合这些不同杂交种纯度鉴定的SSR位点引物,建立了一套利用SSR标记进行玉米杂交种纯度鉴定的技术规程.该程序包括从粉碎干种子提取DNA和利用非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳分离SSR扩增片段,对仪器设备要求较低、简单、快速,易于推广。     

SSR分子标记技术在杂交水稻种子纯度鉴定中的应用

SSR标记由于具有数量丰富、多态性高、遗传上呈共显性、实验操作简单、结果稳定可靠、引物序列易交流等优点，已成为杂交水稻种子纯度鉴定的一种理想分子标记。概述了SSR分子标记技术应用于杂交水稻种子纯度鉴定的原理、技术要点及其研究进展，并就该技术产业化应重点考虑的问题进行了讨论。     

甘蓝型油菜自交不亲和系杂种纯度鉴定

利用共显性分子标记技术SSR、显性形态标记性状花叶及显性生化标记种子芥酸含量鉴定甘蓝型油菜自交不亲和系SI-1300与恢复系花叶恢杂种F1种子纯度.结果表明,3种方法鉴定结果基本一致,F1杂种种子纯度达到91%以上;不同SSR引物鉴定结果完全相同,一对SSR引物即可用于鉴定F1杂种纯度.SSR扩增产物具有很高的多态性和严格的保守性,不仅可以用于油菜杂种纯度鉴定,亦可以用于不同品种(组合)真实性鉴别.研究结果还表明,自然条件下放养蜜蜂用于自交不亲和系杂种制种是一种稳妥、切实可行的方法.     

青海省几个主要春性甘蓝型油菜杂交种的SSR分析

为了探明青海省主要甘蓝型油菜品种的遗传变异,建立准确高效的种子纯度鉴定方法,本研究选取5个青海省甘蓝型油菜主栽品种,利用140对简单重复序列(Simple sequence repeat,简称SSR)引物对其进行分子标记分析,从中筛选出26对能清晰扩增出多态性主带的引物,进一步对包括这5个品种及其中4个杂交品种的7个亲本系进行扩增后,经6%聚丙烯酰胺凝胶电泳分离和带型分析,成功构建出5个青海省甘蓝型油菜主栽品种及其中4个杂交种亲本系的指纹图谱,并鉴定出了这4个杂交种的共显性标记。这些标记不仅可用于亲本材料和杂交品种真伪的鉴别,还可为杂交种纯度的鉴定提供可靠方法,对亲本知识产权的保护及杂交种推广具有重要的意义。     

利用SSR标记检测棉铃种仁DNA鉴定杂交种纯度

利用棉铃种皮DNA和种仁DNA的差异，通过Simple sequence repeats (SSR)分子鉴定技术在棉花制种后期快速检测制种质量。筛选杂交种亲本间的多态性SSR引物，应用多态性引物鉴定棉铃种仁的指纹图谱，指纹图谱与种皮一致，表明该棉铃为自交铃；种仁图谱为共显性谱带，则该棉铃为杂交铃，计算杂交铃的比例得出杂交种的制种纯度。F₂的图谱分离验证了遗传的分离规律，F₂的个体间具有不同的指纹图谱，育种过程中的杂交后代的分子检测能加速育种进程。     

SSR指纹图谱在棉花杂交种C111纯度鉴定中的应用研究

采用8对SSR（Simple sequence repeats）核心引物构建了棉花杂交种C111 F1的电泳指纹图谱,在花铃期考察株型、主茎茸毛和颜色、叶形和叶色、花和铃形等性状,比对田间表型与分子检测结果。结果显示：SSR引物检测认定的杂株和大田检测认定的杂株之间没有对应关系,田间表型鉴定纯度高于分子标记检测纯度。本试验结果将为进一步研究分子检测棉花杂交种纯度提供借鉴。     

三亚地区不同类型砧木嫁接对苦瓜的影响

引进5份不同类型苦瓜砧木品种嫁接热研1号油绿苦瓜，研究不同砧木对苦瓜亲和性、生长发育、产量及品质的影响。结果表明，昌砧南瓜是嫁接热研1号油绿苦瓜较好的砧木。     

SSR分子标记技术在杂交棉纯度鉴定中的应用

 利用SSR(Simple sequence repeats)分子标记技术,对湖北惠民农业科技有限公司的3个品种的棉花杂种F₁共计31份田间材料进行分子标记纯度鉴定。通过田间纯度鉴定与SSR分子标记纯度鉴定对比,运用相关分析和回归分析的统计方法,研究SSR分子标记纯度鉴定在杂交棉花制种中的可行性。结果表明,相关分析得出SSR分子标记鉴定纯度和田间鉴定纯度具有很强的相关性,相关系数在0.7以上;回归分析得出SSR分子标记鉴定纯度与田间鉴定纯度呈现极显著正相关,SSR分子标记鉴定纯度能够准确预测田间纯度。因此,SSR分子标记纯度鉴定能够应用于棉花杂交制种。     

利用微卫星标记鉴定北方杂交粳稻种子纯度的研究

利用48对SSR引物对7个北方杂交粳稻组合的杂种F1与其父母本间的多态性进行了筛选，每个组合获得4-11对多态性好的特异引物，利用特异性引物可将杂交种与其相应的不育系、保持系和恢复系分开，说明SSR标记可应用于北方杂交梗稻种子纯度鉴定，具有较高的实用价值。     

2011年黄河流域棉花区试对照种的SSR指纹图谱

 利用22对核心引物对2011年黄河流域棉花品种区域试验的对照种中植棉2号、鲁棉研28和瑞杂816进行SSR标记纯度检测,3个对照种纯度均较好。参考SSR标记纯度结果进行田间比对,每个品种抽取2个有代表性的植株用24对核心引物构建指纹图谱,并比较品种间的差异,每个品种均有特异的指纹图谱。     

基于NY/T 1433—2014推荐SSR标记检测不同世代恢复系配制杂交种的纯度研究

采用田间性状稳定的不同世代恢复系YR179(F8、F9和F10代)、YR092(F8和F9代)和YR018(F8和F9代)及其与稳定不育系03S配制的杂交种为材料,利用《水稻品种鉴定技术规程SSR标记法》(NY/T 1433—2014)中推荐的48对SSR引物检测各世代恢复系的纯合位点数,通过室内分子鉴定与田间植株性状鉴定的一一对应检测,研究不同世代恢复系所配杂交种种子室内分子鉴定纯度结果与田间种植鉴定纯度结果的吻合度,并对各杂株类型进行一一对应分析。结果表明,当YR179、YR092和YR018分别选育至F10、F9和F9代时,全部48个位点均已完全纯合,此时,其对应杂交种室内分子鉴定纯度与田间种植鉴定纯度吻合率分别为99.4%、99.4%和100%,且各杂株类型的室内与田间鉴定结果也基本一致。说明当恢复系完全纯合时,可用室内SSR分子标记鉴定替代田间种植鉴定来鉴定其杂交种的纯度。     

我国主要杂交水稻组合及其亲本SSR标记和纯度鉴定

选用分布于水稻12条染色体上的26对SSR引物对我国9个主要的杂交水稻组合及其亲本进行了SSR标记分析,21对多态性引物共扩增出62条条带,平均2.95条,能够有效地区分所有恢复系和大部分不育系。杂交种条带均为父母本的互补型,很适合做杂交种纯度鉴定。用引物RM17对杂交稻组合汕优63和两优培九进行了100粒单种子SSR鉴定,所测纯度分别为96.0%和98.0%,与田间纯度96.2%和97.7%非常接近,显示出SSR技术在品种认证和纯度鉴定中有广阔的前景。     

玉米功能性Insertｉon/Deｌetｉon(InDeｌ)分子标记的挖掘及其在杂交种纯度鉴定中的应用

InDel作为重要的遗传标记已被广泛用于作物连锁图谱的构建及多样性研究。通过生物信息学方法从玉米全基因组水平进行InDel标记的挖掘并对其在玉米杂交种纯度鉴定中的应用进行分析,根据B73全基因组序列(第二版)及Mo17的二代电子拼接序列发现了40 000多个InDel位点,其中约有11 400个含有InDel位点的序列可用于特异性引物的开发。新发展的143个代表基因(<1 kb)或基因内部的功能性InDel标记在B73及Mo17间得到了验证并用于玉米杂交种纯度的鉴定。经过分析,共有13个共显性InDel标记在6个杂交种亲本间表现出明显的长度多态(>50 bp)。结合玉米子粒DNA快速提取方法,利用这些共显性InDel标记对6个杂交种1 400多个样本纯度进行鉴定,结果显示该方法可以快速、准确、经济地鉴定玉米杂交种纯度。     

SSR分子标记鉴定橡胶树F1真伪杂种

早期快速鉴定橡胶树F₁杂交子代,获取真杂种对橡胶树优良品系的创育和遗传学研究具有重要的意义。以橡胶树优良品系‘PR107’和‘93-114’进行杂交,获得杂交组合子代,以亲本作为模板从104对SSR引物中筛选出3对多态性引物对35株杂交子代进行真实性鉴定,结果表明：35株杂交子代均鉴定为真杂种苗;筛选出的3对多态性引物都具有较高的杂种鉴定率,并验证了1对引物鉴定真伪杂种的可靠性,后续可作为橡胶树杂交子代真实性鉴定的理想SSR分子标记。     

鉴定玉米杂交种郑单958种子纯度的SSR标记筛选

利用SSR标记技术,选用50对SSR引物以玉米杂交种郑单958及其父母本DNA为材料,筛选出了4对在杂交种中呈现双亲互补带型的引物。研究表明：这4对引物均可用于玉米杂交种郑单958种子的纯度鉴定。     

2个杂交籼稻和2个粳稻品种SSR指纹图谱的构建及双重PCR技术的初步研究

 用460对水稻SSR引物对5个杂交籼稻及其双亲和16个粳稻品种（系）进行了PCR扩增和聚丙烯酰胺凝胶电泳,筛选出12对稳定性好、多态性高、杂带少的SSR引物作为核心引物,构建了国稻6号和两优培九的SSR指纹图谱。另外,还筛选出9对核心引物,构建了粳稻品种盐稻8号和徐稻4号的分子指纹图谱。其中,筛选出国稻6号的特异性标记5个,两优培九的特异性标记3个,盐稻8号的特异性标记1个,徐稻4号的特异性标记2个。这些特异标记可用于种子纯度的快速鉴定。另外,挑选扩增条带稳定、特异性较好的引物组合,进行了双重PCR分析。     

利用SSR标记鉴定两系杂交稻种子纯度

利用SSR标记RM21和田间种植调查鉴定了30份两优287杂交稻材料的纯度．并利用SSR标记1LM21对田间调查鉴定中的全部10种杂株类型的特异性进行了验证。标记检测和田间调查鉴定结果基本吻合．而且标记检测的样本数量越大,其与田间调查的结果吻合度越高．对企业两系种子的销售具有一定的指导意义。同时利用SSR标记RM21对所有杂株类型的进一步研究发现．所选择的SSR分子标记能有效地区分其中6种杂株类型．对由串粉和变异引起的4种杂株类型则不能有效地区分开。因此．利用SSR标记RM21检测两优287的纯度．必须结合杂交种子大田生产的实际情况具体分析。