高质量丝栗栲基因组DNA的提取方法

为了促进丝栗栲分子生物学的研究,采用尿素法、柠檬酸钠法、改良CTAB法和SDS法4种方法提取丝栗栲叶片基因组DNA,并对提取效果进行了比较和分析。结果表明,改良CTAB法较适合丝栗栲基因组DNA提取,其提取的DNA产率高,凝胶检测条带整齐清晰,杂质少、无明显降解,OD260/OD280比值在1.8左右;而尿素法难以提取基因组DNA,SDS法提取的DNA得率较低,柠檬酸钠法有蛋白质、多糖等杂质污染均不太适用丝栗栲基因组DNA提取。采用改良CTAB法提取得到丝栗栲幼叶、老叶、嫩芽和幼茎基因组DNA,产率分别为177.3、167.1、242.0和156.7μg/g。酶切分析也证明,改良CTAB法提取的不同组织DNA适用于进行后续分子生物学研究。     

金叶含笑叶片基因组DNA提取方法的比较

以金叶含笑叶片为实验材料,分别采用CTAB法、改良CTAB法、简易提取方法、高盐沉淀法和SDS法5种方法提取金叶含笑叶片的基因组DNA,并通过琼脂糖凝胶电泳、紫外分光光度计及ISSR扩增3种方法对所提取的DNA样品进行检测.DNA纯度、含量比较以及扩增结果表明:5种方法中简易提取法和SDS法提取的DNA纯度较高.高盐沉淀法得到的DNA产量较高.5种方法提取的DNA用于ISSR扩增,其扩增结果基本一致.简易提取方法操作简单.省时省力,是用于ISSR扩增的金叶含笑基因组DNA提取的最佳选择.     

乌桕基因组DNA提取方法研究

以改良CTAB法和SDS法提取乌桕基因组DNA,对提取条件进行了正交试验,优化出乌桕基因组DNA提取的适宜条件,采用紫外分光光度检测、琼脂糖凝胶电泳分析及限制性内切酶进行了检测。结果表明:改良CTAB法的A1B2C2D2组合提取的基因组DNA纯度高,无拖尾现象,OD260/280值在1.8～2.0,OD260/230在2.0。     

杜鹃基因组DNA提取方法的研究及应用

杜鹃是广泛分布于北亚热带地区的常绿或者落叶灌木。本研究以杜鹃成熟叶片为材料,比较了4种方法提取基因组DNA的效率,并分别采用琼脂糖凝胶电泳和紫外分光光度计检测所提取DNA的浓度和纯度,用ISSR和SSR两类分子标记进一步检测了DNA的质量。结果表明改良的3×CTAB法提取的基因组DNA效果最好,提取的DNA浓度为487.9μg/mL,得率为81.31μg/g,该种方法提取的DNA可直接用于分子标记扩增分析。因此,3×CTAB法是一种高效、可靠且非常适合杜鹃等灌木植物分子生物学研究的DNA提取方法。     

试剂盒法提取山杨基因组DNA的条件优化

利用DNA提取试剂盒提取山杨叶片DNA,对其过程进行改良优化,从而获得一种快速、简便的提取山杨高质量基因组DNA的方法.在原试剂盒的操作基础上,对异丙醇是否冰预冷、消化时间、洗脱液用量、材料用量等条件进行了优化,并对所提取的基因组DNA的浓度、纯度进行了检测.优化后的方法提取到了较高质量的山杨基因组DNA.     

平邑甜茶基因组DNA提取方法的比较

为获得高质量的基因组DNA,以平邑甜茶及其与扎矮山定子杂交所得四倍性矮生后代33#、45#新鲜叶片为试材,分别采用常规CTAB法、改良的CTAB法和基因组试剂盒法提取平邑甜茶总DNA,进行琼脂糖凝胶电泳,使用核酸蛋白仪对DNA质量和纯度进行检测。结果表明:利用基因组试剂盒法、常规CTAB法和改良CTAB法均可获得DNA,但获得的DNA质量和纯度存在一定的差异。试剂盒法和CTAB法可以获得较高质量的DNA。但由于基因组试剂盒法成本相对较高,改良CTAB法较耗时,建议采用常规CTAB法提取平邑甜茶及其杂交后代33#、45#品种基因组DNA。     

鲜叶保存方法对杜鹃红山茶基因组DNA提取的影响

以富含次生代谢物的杜鹃红山茶嫩叶为材料,研究了杜鹃红山茶鲜叶保存方法及其基因组DNA提取方法。结果表明,改进的CTAB和SDS区室法都适合杜鹃红山茶基因组DNA的提取,能提取到完整性较好、纯度较高的基因组DNA。采用-20℃、液氮、硅胶脱水干燥3种方法保存样品,均可获得高质量DNA,说明硅胶脱水干燥法保存样品的方法可行,为远距离采样提取杜鹃红山茶DNA提供了一种较好的鲜叶保存方法。     

马尾松针叶DNA提取方法研究

采用3种不同的方法（CTAB法、SDS法和试剂盒法）提取马尾松幼嫩针叶基因组DNA,并分别从取样材料类型、样品的保存、提取液中PVP含量、取样质量、抽提过程中提取程序的改进等方面进行提取马尾松基因组DNA效果的凝胶电泳比较．结果表明：CTAB法适合于在马尾松群体分子生物学研究中基因组DNA的提取：采用低温冷藏法保存的春季抽梢针叶0．2g,在CTAB的提取液中加入2％的PVP,常规CTAB法提取程序中添加等体积的混合液（V酚：V氯仿：V异戊醇=25：24：1）并在此前加入1／10体积的10×CTAB,可以有效地提高马尾松基因组DNA的提取质量,获得显带平直、纯度较高的马尾松基因组DNA,OD260／OD280值在1．8左右．这为马尾松群体分子生物学的研究提供了一个经济、简便而有效的DNA提取方法．     

米槠叶片基因组DNA的提取及分析

以米槠(Castanopsis carlesii)群落的叶片为材料,采用改良的CTAB法提取米槠基因组DNA,并对获得的基因组DNA进行浓度检测、PCR扩增、琼脂糖凝胶电泳检测、含量测定分析以及扩增结果测序。结果表明:米槠叶片提取的基因组DNA质量和浓度较好,具有良好的完整性,PCR效果好,电泳图谱条带显示清晰,测序结果长度符合要求。利用该方法提取的DNA可用于米槠遗传多样性的分析,可进一步为米槠和格氏栲等其它栲属植物的DNA提取以及其它分子研究提供参考。     

刺槐高质量基因组DNA提取方法的研究

高效、稳定的基因组DNA提取是进行分子标记辅助育种研究的关键技术环节之一。以刺槐叶片为材料,将传统的CTAB法进行优化改良,结合组织研磨棒液氮研磨建立刺槐基因组DNA的提取方法。将提取获得的基因组DNA进行SSR分子标记技术研究,获得的条带清晰、稳定．表明提取获得的基因组DNA能很好的满足SSR分子标记的需要。为刺槐遗...     

红花檵木SRAP反应体系的建立及优化

为了获得红花檵木清晰的SRAP标记图谱,对红花檵木DNA的提取方法以及SRAP-PCR反应体系的影响因子进行了初步探讨,筛选和建立了扩增多态性高、重复性好、带型清晰的DNA模板和SRAP-PCR反应体系,同时提出了应用SRAP分子标记构建红花檵木遗传图谱的可行性.最佳SPAR-PCR反应体系为:在50μL的反应体系中,Mg2 1.6 mmol/μL,dNTPs 1.0 mmol/μL,DNA模板150 ng,DNA聚合酶3.6 U,上下引物各0.20 mmol/L.扩增程序为:94℃预变性4 min,反应前5个循环在94℃1 min、35℃1 min、72℃1 min条件下运行,随后的30个循环复性温度提高到55℃,最后72℃延伸5 min.     

漾濞核桃叶片基因组DNA的两种提取方法效果比较

以漾濞核桃不同生长期的叶片为材料，采用高盐低pH法和改良CTAB法作提取其基因组DNA的效果比较实验。通过琼脂糖凝胶电泳、紫外分光光度计和RAPD扩增对所提取的DNA样品进行检测，比较所得DNA的产量、质量，认为从漾濞核桃不同发育时期叶片中获得DNA的提取效果不同。4种叶样以冬芽和新叶的效果为好，老叶最差；用两种提取方法从叶片中得到的DNA产量和质量有所不同，高盐低pH法提取的DNA纯度高，但是产量较低；而改良CTAB法则相反，产量高，纯度低。     

木材DNA条形码鉴定研究进展

木材种属鉴定具备显著的生物学与经济意义, 但传统的以显微特征观察为主的方法已不能适应高通量和精细化鉴别的需要。DNA条形码是根据特定基因片段的序列差异, 利用生物信息学技术对生物物种进行快速分类与鉴别的方法。近年来, DNA条形码技术已被陆续应用于木本植物及相应木材的种质鉴定, 在目标基因选择、木材DNA提取及生物信息学分析等方面均取得显著进展。在使用优化的微量DNA提取技术的前提下, 干燥木材中也可提取出满足扩增要求的DNA。经过生命条形码联盟等国际机构的长期努力, 确定了rbcL+ matK组合等通用植物条形码标记及ITS2等补充标记, 并建立了BOLD等数据库系统。传统的条形码序列分析主要通过BLAST比对、遗传距离分析及系统进化分析来实现, 近年来随着生物信息学的发展, DNA条码数据库不断完善, 新的数据分析方法和软件正不断涌现。文中在总结现有研究成果和实施规范的基础上, 综述国内外应用DNA条形码技术进行木材鉴别的新进展, 并着重阐述新型序列分析方法和相应的生物信息学工具。     

Polymorphism and heredity of cpDNA and mtDNA in the Section Leuce of <Emphasis Type="Italic">Populus</Emphasis>

The chloroplast DNA (cpDNA) and mitochondrial DNA (mtDNA) of 16 Populus species (Section Leuce) and their F1 generation were detected using PCR-RFLP technique. The results show that cpDNA in the F1 generation of 22 hybrid combinations was inherited maternally, which supported the conclusions of the study of plasmid cytology. The mtDNA fragments amplified by PCR were consistent with the restriction maps in all hybrid combinations and no polymorphism was detected, indicating that the Section Leuce is highly conserved in mitochondrial gene sequences. These results provided direct evidence of maternal chloroplast inheritance in Populus tomentosa, P. bolleana, P. davidiana, P. adenopoda, P. tomentosa × P. bolleana, P. alba × P. glandulosa and P. alba × P. tomentosa.     

连翘叶片总DNA提取方法的比较

以连翘[Forsythia suspensa(Thunb.)Vahl]的新鲜叶片为材料,分别采用CTAB法、高盐低pH法和SDS法3种不同方法提取其总DNA,用琼脂糖凝胶电泳检测获得的DNA的质量,以期从中找出提取连翘总DNA的最适方法。结果表明对于连翘的新鲜叶片,无论从产率上还是质量上,CTAB法都明显优于其他两种方法。     

松树DNA的分离和Southern印迹杂交技术

松树ＤＮＡ的分离和Ｓｏｕｔｈｅｒｎ印迹杂交技术曾令海（广东林业科学研究所广州５１０５２０）ＣＤａｎａＮｅｌｓｏｎ（ＦｏｒｅｓｔＭｏｉｅｃｕｌｏｒＧｅｎｅｔｉｃｓＬｏｂ．Ｇｕｌｆｐｏｒｔ，ＵＳＡ）关键词ＤＮＡ，ＲＦ，ＬＰＤＮＡ分析技术在林业上的应用起步...     

DNA技术在木材来源鉴定中的应用

DNA技术在木材树种鉴别和产地鉴定方面有较高的准确性,可用于提高木材合法性检验的可信度和木制品产销链跟踪,具有国际通用性和可行性.然而由于DNA技术特点和木材特性,其实际应用尚有一定难度.未来还需加大投资和研发力度,尽快建立公共数据库,发挥其在合法木材贸易中的重要作用.     

从土壤中提取DNA方法的研究进展

从土壤中获得微生物的传统的方法是富集、培养、分离，在此过程中造成微生物多样性的丢失，种群构成发生变化。不经过传统培养，直接从土壤提取总DNA并进行分子生物学分析来研究土壤微生物种群情况，能够更直接更可靠地反映土壤微生物的原始组成情况，是近几年发展起来的、全新的实验手段。本文介绍了从土壤中直接提取DNA的方法及其研究成果。     

百合鳞叶DNA提取及RAPD分析

以百合新鲜鳞叶为材料,利用RAPD分子标记对来自我国5省共16份百合样品进行了分析。结果表明:采用改良CTAB法提取百合鳞叶中DNA条带清晰较,且从120条随机引物中筛选出35条有效引物,共得到769个扩增位点,其中628个位点具有多态性,占81.7%。聚类分析表明,16个百合材料在阈值为0.940 7时分为2个RAPD群,即分别属于百合科的百合属和大百合属;阈值为0.579 0时,百合属分为3个种,即分别为百合、卷丹和细叶百合。这些均可为进一步研究百合的分子生物学特性打下基础,为鉴定中药材百合品种品系的新方法提供充分的实验依据。