柿属植物叶绿体蛋白质编码基因密码子用法

为给后续柿属植物叶绿体基因工程研究提供基础,利用Codon W、CUSP、SPSS软件对5个柿属植物叶绿体基因组中的55条蛋白质编码基因序列进行密码子使用模式分析。结果显示,柿属植物叶绿体基因组密码子第3位碱基GC含量为26.9%~27.8%,有效密码子数在49.58~50.18之间,密码子偏好性较弱;柿叶绿体基因组不同位置的有效密码子数不同,取值范围为32.36~59.64;中性绘图分析和ENC-plot绘图分析结果表明,柿叶绿体基因组的密码子偏好性主要受选择的影响;通过高频密码子和高表达优越密码子分析相结合的方法,筛选出23个柿属植物最优密码子,且这些密码子主要以A和U碱基结尾。     

灰毛浆果楝叶绿体基因组密码子使用特征分析

通过分析灰毛浆果楝叶绿体基因组密码子的使用特征,探讨影响其密码子使用偏性的主要因素。从灰毛浆果楝叶绿体基因组中筛选出54条编码序列(CDS),利用Codon W 1.4.2和CUSP软件计算不同基因密码子各位置的GC含量,以明确灰毛浆果楝叶绿体基因组密码子的使用偏性规律。结果显示:灰毛浆果楝叶绿体基因组密码子第3位碱基的GC含量为28.95%,即第3位密码子富含A和U,有效密码子数(Nec)在34.60~61.00之间,Nec值大于45的CDS有39个;相对同义密码子使用度(URSC)值大于1的密码子有29个,其中16个以U结尾,12个以A结尾;中性绘图分析结果显示GC 12和GC 3的相关系数为0.0984,相关性不显著,回归系数(对角线斜率)为0.1379;基因N ec比值大多数分布在-0.05~0.05区间外,即大部分基因N ec值与预期值差距较大;相关关系分析显示,GC 3与GC1、GC2均未达到显著相关,Nec与GC3呈极显著相关。综合分析发现灰毛浆果楝叶绿体基因组密码子偏好性较弱,选择为主要影响因素,同时受到其他因素的影响。结合高表达优越密码子和高频密码子确定GUU、GUA、UCU、AGU、CCU、ACU、GGU、GCU、CAA、AAA、UGU、AGA和AUU等13个密码子为最优密码子。     

银白杨叶绿体基因组密码子用法分析(英文)

通过计算银白杨叶绿体基因组中各基因的ENc值、RSCU值、CAI值和GC3s的含量,分析银白杨叶绿体基因组密码子用法,并采用目前普遍使用的多变量统计分析方法(对应分析)和ENc.plot方法探讨了若干重要因子对银白杨叶绿体基因组密码子用法的效应。对应分析结果显示在影响最大的第一条向量轴上,基因的坐标位置与GC3s(r=349)极显著相关,而与该基因的表达水平(CAI)无显著相关性,但是在第二、三向量轴上基因的坐标位置与该基因的表达水平(CAI)呈极显著相关(r=-0.348和r=0.602,),说明碱基突变是影响密码子发挥作用的主要因素,而少数基因密码子用法受到翻译选择的作用;ENC-plot分析结果也证明了这一点。图2表2参34。     

Analysis of synonymous codon usage in chloroplast genome of Populus alba

The pattern of codon usage in the chloroplast genome of Populus alba was investigated. Correspondence analysis （a commonly used multivariate statistical approach） and method of effective number of codons （ENc）-plot were conducted to analyze synonymous codon usage. The results of correspondence analysis showed that the distribution of genes on the major axis was significantly correlated with the frequency of use of G＋C in synonymously variable third position of sense codon （GC3S）, （r=0.349）, and the positions of genes on the axis 2 and axis 3 were significantly correlated with CAI （r=-0.348, p〈0.01 and r=0.602, p〈0.01）. The ENc for most genes was similar to that for the expected ENc based on the GC3s, but several genes with low ENc values were lying below the expected curve. All of these data indicated that codon usage was dominated by a mutational bias in chloroplast gcnome ofP. alba. The selection in nature for translational efficiency only played a minor role in shaping codon usage in the chloroplast genome ofP alba.     

马尾松转录组密码子使用偏好性及其影响因素

【目的】异源表达是植物蛋白功能验证和分子育种的重要手段,而密码子是异源基因高效表达的重要因素,对马尾松转录组基因编码区密码子偏好性分析可以为马尾松分子育种提供一定的理论支持。【方法】利用CodonW、EMBOSS密码子分析软件对马尾松转录组进行密码子参数分析和密码子偏好性分析,根据中性绘图、ENc-GC3s、偏倚性分析推测马尾松密码子偏好性的主要形成原因。通过比较高低表达基因样本同义密码子相对使用度(RSCU)筛选马尾松最优密码子,通过密码子使用频率比值分析马尾松与拟南芥、烟草、欧洲山杨、大肠杆菌、酿酒酵母的密码子偏好性差异。【结果】马尾松转录组编码序列(CDS)密码子平均GC含量为44. 95%,密码子第3位GC含量为38. 95%,尤为偏好A/T。高、低表达基因样本统计分析表明,马尾松转录组RSCU差异较小,筛选出TTA、CAA、TGT、GGT等27个密码子可作为马尾松的最优密码子。中性绘图、ENc-GC3s关联分析以及偏倚分析表明,马尾松密码子偏好性的形成可能主要受突变影响,其次受自然选择等多重因素共同影响。密码子使用频率分析表明马尾松密码子偏好性与烟草、拟南芥和欧洲山杨相比差异较小,与大肠杆菌差异最大,与酿酒酵母差异小于大肠杆菌。【结论】马尾松偏好第3位为A/T的密码子,筛选出27个最优密码子,其中25个密码子第3位为A/T。马尾松密码子使用偏好性形成主要受突变影响,其次受自然选择等多重因素共同影响。烟草可以作为马尾松基因异源表达的优选植物生物体,而微生物中酿酒酵母可能优于大肠杆菌。     

米黑根毛霉脂肪酶在毕赤酵母中的高效表达及酶学性质研究

根据毕赤酵母(Pichia pastoris)密码子使用偏爱性,对米黑根毛霉脂肪酶(RML)成熟肽基因进行全面密码子优化,以提高RML基因在酵母细胞中表达的水平,并对重组脂肪酶的酶学性质进行了研究。运用重叠延伸PCR合成优化后的RML成熟肽基因,并进一步构建毕赤酵母表达载体p PIC9K-RML,通过电击法转化毕赤酵母GS115菌株,经G418抗性和PCR筛选获得高拷贝转化重组子。重组酵母菌用0.5%甲醇诱导异源基因表达,在28℃摇瓶培养168 h后酶活力达到122 U/m L,较未优化的原始菌株的表达酶活提高了10倍。重组脂肪酶最适温度为45℃,最适p H值为7,甲醇体积分数为40%以下时重组RML具有较好的稳定性。     

竹类植物与水稻等其它禾本科作物的系统进化关系及基因序列组成的比较

利用8个全长mRNA基因序列比较了竹类植物和水稻等禾本科作物的系统进化和序列组成等.结果表明,在与水稻、玉米和麦类作物的比较中,竹类植物与水稻有着最近的亲缘关系和更相似的基因序列特征(GC含量分布和密码子使用频率),它们甚至比水稻与玉米或水稻与麦类之间的亲缘关系更近.这一结果提示,水稻作为禾本科植物的模式物种,应与竹类植物存在良好的基因组共线性关系,水稻基因组序列信息对竹类植物基因组研究与分析具有重要参考价值.     

‘豫杂一号’泡桐叶绿体基因组序列及特征分析

泡桐是中国重要的速生树种,对我国经济发展有着重要作用。以‘豫杂一号’泡桐为材料,IlluminaHiseq2000测序,对其全基因组序列基本结构特征、密码子偏好性和重复序列进行统计分析。结果表明,‘豫杂一号’泡桐为典型的四分体结构,全长序列为154615bp,编码114个基因,含4个rRNA,30个tRNA和80个蛋白质编码基因。该叶绿体全基因组测序的成功促进了叶绿体分子生物学的研究,也为泡桐以及其他物种的遗传育种和创制种质资源奠定了一定的理论基础。     

青檀宣纸原料林栽培利用

青檀,为我国特产树种。其适应性强,在石灰岩山场生长良好,较耐旱和瘠薄,根系发达,萌蘖性强,可经营矮林作业以截取枝条。枝皮富有纤维,绵韧易剥,是制造宣纸的特需原料。一、播种育苗青檀种子具有生理休眠特性,且种子个体的休眠深度差异较大。种子催芽方法,一是将种子装入木桶内,     

Competition-density effect of tree organs in Acacia auriculiformis stands

The competition-density (C-D) effects for mean mass for tree, stem, branch and leaf were analyzed in Acacia auriculiformis stands. Mean tree mass-density and mean organ mass-density were well explained by the C-D equation of tree and the C-D equation of tree organ, respectively. An equation describing the relationship between mean leaf area u and density was formulated that fit the u-data well. The relationship between mean tree mass w and the ratio of each organ to mean tree mass (wo/ w) was examined. With increasing w, the stem mass ratio wS/w increased, whereas the branch mass ratio wB/w and the leaf mass ratio wL/w decreased. The yield difference between the lowest-density stand and the high-density stand became greater with stand growth. However, the yield of the mid-density stand was slightly lower than the yield of the high-density stand during the experimental period. To produce the most desirable combination of demanding individual-tree size and relative high stem yield, the mid-density is recommended as proper planting density for future management of A. auriculiformis stands.     

自动取暖保健热宝的制作

自动取暖保健热宝是传统手炉的替代新产品,该产品不用电可持续供热,它使用方便,价格低廉,是人们冬季的首选暖手用品,也是野外作业人员不可多得的取暖之宝.该产品具有热敷镇痛的功效,深受风湿关节痛、肩周炎、腰腿痛、胃痛等患者的欢迎.该产品每个综合成本1到2元,市场售价8到10元,若日产100个,每个平均利润5元,效益可观,实乃致富好门路.     

太阳能开发利用大有可为

我国太阳能资源十分丰富,目前最主要的利用方式是用于城乡居民热水供应,我国太阳能热水器已经安装了6000万平方米,预计2020年和2050年将分别达到2.7亿和5亿平方米,将替代高峰电力8000万千瓦和2亿千瓦,节约1200万千瓦和30000亿千瓦时的电能.我国太阳能热水器已经成为太阳能利用中应用最为广泛、产业化发展最迅速的领域,太阳能热水器的生产量和使用量都居世界第一.至2003年底,全国太阳能热水器使用量达到5200万平方米,占全球使用量的40%以上.目前我国太阳能热水器生产厂家超过3000家,年生产量超过1000万平方米,全真空玻璃管热水器在世界市场上占据主导地位.     

海藻糖生产技术

海藻糖是一种稳定的非还原性双糖,广泛存在于低等植物、藻类、细菌、真菌、酵母、昆虫及无脊椎动物中,既是一种贮藏性糖类,又是应激代谢的重要产物.由于海藻糖是由特殊双糖分子构成的非还原性糖,特性非常稳定,能够在高温、高寒、干燥失水等恶劣的条件下在细胞表面形成特殊的保护膜,有效地保护生物分子结构不被破坏,从而维持生命体的生命过程和生物特征.海藻糖可广泛用于生物制剂、医药、食品、化妆品及农业科学等各个行业.     

鱼腥草种源试验初报

收集了11省（市）23县（市）的23个鱼腥草种质资源,在浙江省丽水市林业科学研究所百果园基地进行种源特性观察试验,结果表明,23个种源从形态特征上可分为二大类,一类为生长初期叶绿色,茎节间较长,生长盛期叶翠绿色,叶缘波状,茎浅红色;另一类为生长初期叶带紫红色,茎节间较短,生长盛期叶墨绿色,叶近全缘,茎紫红色、浅红色或绿色。物候期较为一致,可分为破土萌芽长叶期（2月下旬到3月下旬）、快速高生长期（3月底到4月中旬）、开花结果期（4月下旬到6月底）3个阶段。不同鱼腥草种源在高、径生长和蒴果、种子数量等方面均存在显著差异。高生长以18号（浙江嵊州）种源最好,平均高度达83．08cm,15号（安徽绩溪）种源最低,仅为41.08cm;径生长以4号（云南会泽）种源最好（0．5063cm）,15号（安徽绩溪）种源最差（0．3cm）。综合性状以4、18、19（浙江长兴）、12（浙江嘉善）、5（贵州安顺）、17（浙江泰顺）等种源表现较好,能获得较高的生物量。单果序蒴果数以7号种源（河南正阳）最多,达83．4颗／果序,蒴果内种子数以10号种源（广函柳州）最高（22.67粒／蒴果）,综合蒴果和种子数量以10、5号种源较好。     

怀化市成立森林消防应急营

2008年4月1日,湖南省怀化市召开森林消防应急营成立大会,并举行了检阅仪式和实战演习.森林消防应急营共有340人,下设4个连和1个特勤队.人员分别由中坡国家森林公园护林员、国有泸阳林场一线产业工人和武警怀化支队官兵、怀化军分区预备役战士、武警怀化消防支队官兵组成.     

Characteristics of soil organic carbon mineralization and influence factor analysis of natural Larix olgensis forest at different ages

Soil organic carbon(SOC)mineralization is closely related to carbon source or sink of terrestrial ecosystem.Natural stands of Larix olgensis on the Jincang forest farm,Jilin Province were selected to investigate the dynamics of SOC mineralization and its correlations with other soil properties in a young forest and mid-aged forest at soil depths of 0–10,>10–20,>20–40 and>40–60 cm.The results showed that compared with a mid-aged forest,the SOC stock in the young forest was 32%higher.Potentially mineralizable soil carbon(C0)in the young forest was 1.1–2.5 g kg^-1,accounting for 5.5–8.1%of total SOC during the 105 days incubation period and 0.3–1.5 g kg^-1 in the mid-aged forest at different soil depths,occupying 2.8–3.4%of total SOC.There was a significant difference in C0 among the soil depths.The dynamics of the SOC mineralization was a good fit to a three-pool(labile,intermediate and stable)carbon decomposition kinetic model.The SOC decomposition rate for different stand ages and different soil depths reached high levels for the first 15 days.Correlation analysis revealed that the C0 was significantly positively related with SOC content,soil total N(TN)and readily available K(AK)concentration.The labile soil carbon pool was significantly related to SOC and TN concentration,and significantly negatively correlated with soil bulk density.The intermediate carbon pool was positively associated with TN and AK.The stable carbon pool had negative correlations with SOC,TN and AK.     

重阳木白带黑斑蛾的发生与防治

重阳木,为大戟科重阳木属落叶乔木,生长高大,枝叶茂密,树姿优美,城镇绿化多见孤植大树或小片成群栽植。重阳木深根性,抗风力极强,又是生长快的阳性树种之一,有些地方用以作防护林或用材林,效果很好。2005年,祁门县对赤岭口公路两旁重阳木进行病虫害调查,发现重阳木白带黑斑蛾幼     

国外提高蛋鸡产蛋量10种妙法

1.加喂维生系C.俄罗斯的研究结果表明:当鸡舍温度为32℃时,在每千克饲料中添加60毫克维生素C,10周内可提高产蛋率12%左右;舍温为35℃时,在每千克饲料中添加44毫克维生素C,在20周内可提高产蛋率11%.在17.8至24.4℃的气温下,在每千克饲料中添加维生素C400毫克,3个月可增产约6%的鸡蛋;在7至20℃的气温下,在每千克饲料中添加30毫克维生素C,48周内增产鸡蛋7%.     

绿博会展现安徽风采

由全国绿化委员会、国家林业局和河南省人民政府共同主办的第二届中国绿化博览会,于9月26日至10月5日在郑州举办。省长助理邵国荷、省林业厅厅长韩柏泉、副厅长赵波率安徽省代表团参加了开幕式。     

董勇的故事

《天仙配》的故事在中国可谓人尽皆知,那首树上的鸟儿成双对,绿水青山带笑颜……。虽不是流行歌曲却被广泛传唱,人们无不羡慕其中男耕女织的幸福生活。