适于草果遗传多样性分析的RAPD引物筛选

以云南省文山州西畴县和德宏州陇川县的12株草果优良无性系为材料,利用RAPD标记技术,选用192个RAPD随机引物,对草果进行PCR扩增,并用UPGMA法对RAPD引物扩增条带进行聚类分析,计算其遗传相似系数,以期筛选出适用于草果遗传多样性分析的RAPD有效引物。实验共筛选出21个条带清晰、多态性丰富并具有可重复性特点的有效引物。21个引物在实验选用的12份样品中共扩增出177条DNA带,其中多态性带数为119条,占扩增总带数的67.2%,每个引物平均扩增出8.4条带。结果表明,12份草果样品聚为A组和B组,其中A组又分为两个亚组,聚类结果与所选用材料的地理来源基本一致,这也说明该研究所筛选得到的21个RAPD引物适用于草果的遗传多样性分析。该研究为应用RAPD标记技术对草果进行遗传多样性分析等研究奠定了基础。     

油松DNA的提取及RAPD标记技术试验初报

本试验利用RAPD技术,对陕西陇县八渡林场油松种子园14个无性系进行遗传分析.试验确立了提取油松嫩梢DNA方法,提取的DNA可用于RAPD扩增;通过对RAPD反应体系的优化,建立了油松扩增的反应体系和反应程序;用筛选出的8个引物对14个油松无性系进行扩增.共扩增出23个条带,其中具有多态性的条带为14条,占总扩增条带数的60.8%,结果表明:检测到了14个油松无性系具有较丰富的DNA多态性.     

油茶岑软系列优良无性系的ISSR分子鉴别及遗传分析

为了解决油茶良种生产上种苗品种混乱的问题,本研究采用ISSR分子标记技术,对广西岑溪软枝油茶10个优良无性系进行分子鉴别及遗传分析,结果表明:筛选出10条多态性高、条带清晰、稳定性好的引物,共扩增得到108条条带,81条为多态性条带,多态性比率占75%;根据引物扩增的ISSR图谱条带,建立了10个‘岑软系列’无性系的ISSR鉴定识别卡,其中3条引物可独立对区分所有供试品种;聚类分析表明,岑软系列无性系间遗传距离为0.083~0.448之间,在遗传距离为0.411处可较明显将10份供试材料可分为2类。     

常山胡柚优良无性系的RAPD分析

采用改良的CTAB法成功提取到常山胡柚叶片DNA，并对常山胡柚的12个优良无性系及7个优株之间进行了RAPD分析。从初选的0peron公司的60个随机引物中又筛选出12个扩增效果较好的引物，共产生随机扩增位点103个，平均每个引物产生8．6个识别位点，但都没有发现多态性位点。由此表明，目前所选的常山胡柚优良无性系及优株之间在分子水平上并无什么差异，其经济性状方面的差异可能主要受生长发育阶段、生态环境条件及经营管理水平等因素的影响。     

利用ISSR标记鉴别珍珠黄杨无性系

利用ISSR-PCR方法对珍珠黄杨5个无性系进行了基因组多态性分析,从100个ISSR引物中筛选出19个多态性引物用于扩增,共扩增出256条谱带,其中多态性条带211条,占总带数的82.4%,平均每条引物扩增的DNA带数目为13.5条,依据扩增结果进行Nei相似性系数和遗传距离分析,利用UPGMA法构建聚类树状图.结果表明:ISSR分析产生了一些无性系特有的指纹图谱,认为ISSR技术在珍珠黄杨无性系鉴定和阐明遗传关系中有一定的应用潜力.     

几个桉树优良无性系的ISSR指纹图谱分析

利用ISSR-PCR方法对尾叶桉广林4号、巨尾桉广林5号、巨尾桉广林9号3个优良桉树品种(无性系)及粗皮桉的34个个体进行了基因组多态性分析,从100个ISSR引物中筛选出4个多态性引物用于正式扩增,共扩增出63条DNA条带,其中多态性DNA条带54条,占其总扩增带数的85.7 %,平均每个引物扩增的DNA带的数目为13.5条.实验不仅检测到3组无性系之间、无性系和实生苗之间的特异性条带,还根据ISSR扩增结果,利用UPGMA法构建了3个桉树品种(无性系)及1个桉树外缘种的聚类树状图,在一定程度上反映了其种间的遗传关系.     

与毛白杨性别相关的RAPD标记

应用RAPD技术筛选与毛白杨性别相关的分子标记,对毛白杨雌雄株的基因组DNA进行混合分组分析（BSA）．结果表明：在88条随机引物中有12条引物能够在雌雄DNA反应池间形成多态性条带,应用这12条引物分别对毛白杨雌雄个体（雌雄个体各选取5个）进行RAPD分析,其中引物S60扩增得到1个约为1800bp的与雄性相关的RAPD标记．该标记的获得进一步表明毛白杨雌雄株间存在基因水平的差异,为毛白杨的性别研究提供了分子依据．     

四川不同地区硬头黄竹RAPD和ISSR分析

以四川不同地区硬头黄为研究对象,通过随机扩增多态性DNA标记（RAPD）和简单序列重复区间（ISSR）标记进行扩增,探讨硬头黄竹的遗传多样性。研究表明,6个RAPD引物扩增出42条条带,多态性高达69．05％;5个ISSR引物扩增出47条条带,多态性为61．70％。利用Popgen32和NTYS软件进行聚类分析,可将不同地区硬头黄竹类型区分开来,其遗传距离分别为0．1823～0．6022和0．0435～0．6721,RAPD和ISSR分子标记为硬头黄竹的遗传改良提供理论依据。     

油茶优良无性系的RAPD分子鉴别

油茶优良无性系是当前生产上的主要良种.通过采用RAPD分子标记方法,从180多个引物中筛选出22个具有多态性的随机引物进行扩增,得到141个位点,其中有91个是多态位点,以此为基础建立油茶优良无性系的RAPD分子鉴别体系.同时还探索出油茶叶片总DNA的分离技术和建立了RAPD反应体系,为油茶分子技术育种积累了相关的知识并奠定了DNA技术基础.     

23个油橄榄品种的RAPD分析

采用RAPD技术对23个引种的油橄榄品种进行分类和鉴定研究.从80个10 bp的随机引物中筛选出11个扩增效果较好的引物进行扩增,共产生127条带,其中78条为多态性带,占61.4%,平均每个引物扩增的DNA多态性带数为7.09条.4个品种具有特异的位点,可作为种质鉴定的依据.根据扩增结果构建反映品种间亲缘关系的UPGMA聚类图,23个品种可划分为2大类.     

运用RAPD技术进行杉木无性系识别研究

以湖北省的４０个杉木优树为研究材料,初步开展了运用ＰＣＲ—ＲＡＰＤ技术对杉木优树进行识别的研究。研究表明,运用 ８个引物的 １７个分子标记可以对其中的３８个无性系进行识别,只有２个无性系相互不能识别。说明湖北省杉木遗传资源变异幅度较大,可以运用 ＤＮＡ技术对优树进行品系管理。     

Population genetic structure and diversity of high value vulnerable medicinal plant <Emphasis Type="Italic">Acorus calamus</Emphasis> in India using RAPD and chloroplast microsatellite markers

Acorus calamus is a highly valued medicinal plant with global distribution used in several drugs of health care systems. We evaluated the genetic diversity and population structure of 50 populations of A. calamus from different geographical regions in India through RAPD and chloroplast microsatellite markers. From the total screened 82 RAPD primers and 18 cpSSR primers, 10 RAPD and nine cpSSRs were found polymorphic. The selected 10 RAPD primers produced a total of 96 reproducible bands, out of which 65 wer...     

Assessment of genetic diversity in <Emphasis Type="Italic">Dalbergia sissoo</Emphasis> clones through RAPD profiling

We studied the genetic polymorphism among 29 clones of shisham (Dalbergia sissoo Roxb) belonging to different geographic regions using random amplified polymorphic DNA (RAPD) markers. Out of 30 primers used, only 20 primers generated polymorphism in amplified product. In total 232 bands were amplified with 20 primers, of which 192 (82%) were polymorphic with an average of 9.6 bands/primer. The resolving power (Rp) ranged from 2.14 (Primer 5) to 11.93 (Primer 4). Primer 4 and Primer 3 possessed high Rp value. Polymorphism information content (PIC) ranged from 0.15 (Primer 5) to 0.37 (Primer 4). Primer 4 amplified total 18 bands in 29 genotypes with PIC value of 0.37 hence; this set of primer was most informative. The similarity coefficient analysis revealed two clusters. The first cluster comprised of only 10 clones and the second major cluster comprised of 19 clones. The genetic similarity among 29 clones ranged from 25.86% (clone 10 and 235) to 100% (clone 19 and 59), suggesting a wide genetic base in shisham clones.     

用RAPD技术估测柳树种及无性系的变异

利用１２个引物对柳树２种１６个无性系基因组分别进行了ＲＡＰＤ检测，从电泳图谱可直观看出，引物ＣＨＬ－１可对柳树两种识别：引物Ｄｅｃａ－４可对１６个无性系基因组扩增产物经电泳产生的图谱中ＤＮＡ条的统计，利用ＮＴ－ＳＹＳ对其进行分析建立系统树，结果表明，利用ＲＡＰＤ获得的两种柳树种的分类结果与经典方法得到的结果一致。     

Differentiation of poplar and willow clones using RAPD fingerprints

The technique of random amplified polymorphic DNA (RAPD) fingerprinting was used to differentiate species and identify clones of 15 poplar and 15 willow clones (ramets of three poplar clones were also included to verify the stability of the results). Four random DNA primers (Deca-11, Chl-1, Chl-4 and Chl-10) and an M13 universal primer were used to determine DNA polymorphism among the clones. Based on the DNA banding pattern obtained with the four DNA primers by polymerase chain reaction (PCR) amplification we conclude that RAPD fingerprinting with properly selected primers can be used for clonal and species differentiation of poplar and willow. The technique is simple, accurate and inexpensive.     

板栗主要栽培品种的分子鉴别

应用ＲＡＰＤ分子标记手段，研究板栗品种的遗传多样性，建立了板栗品种ＲＡＰＤ标记的标准程度，以及板栗品种种的ＤＮＡ指纹数据库，并为板栗品种鉴别提供了准确、可靠的标准方法，４６个板栗品种的样品的ＤＮＡ，用１６个引物进行扩增反应的位点总数为１１９个，产生６９个多态位点，建立了４６个板栗品种的ＤＮＡ指纹数据库，并分析出这些板栗品种分子鉴别的最优化引物组合。对特定的引物组合，计算品种间的遗传距离矩阵，从而确定引物组合对这些品种鉴别的特异性。     

DNA fingerprinting of Populus trichocarpa clones using RAPD markers

Nine trees from a single, natural population of black cottonwood (Populus trichocarpa Torr. et Gray) in Alaska were screened for randomly amplified polymorphic DNA (RAPD) markers with ten different 10-base random oligonucleotide primers in order to evaluate the use of RAPD analysis for distinguishing black cottonwood clones. Nine primers amplified the genomic DNA targets; two primers were able to differentiate all clones. Eight clones were distinguished among the nine tree samples assayed. Two trees showed identical banding patterns with all primers used; therefore it is suggested that these trees are from the same clone. The RAPD fingerprinting method is simple and powerful-one primer can distinguish different clones, while the use of multiple primers reduces fingerprint similarity and resolves discrepancies.     

利用RAPD分析药用石斛的遗传多样性及亲缘关系

通过对9种药用石斛进行遗传多样性和亲缘关系的分析,为更好地开发利用石斛资源奠定基础。采用RAPD技术,应用NTSYS软件对9种石斛的RAPD-PCR结果进行分析。利用从103条随机引物中筛选出的70条随机引物对供试材料DNA进行随机扩增,共得到520条带,其中多态性带有491条,多态性百分率为94.42%。采用UPGMA类平均法对扩增出的谱带进行遗传聚类分析,得出反映各种间亲缘关系的树状图。在遗传距离（D）=0.44处,可将供试材料分为2类,RAPD对基因组的分析结果与传统分类学的结果差异不大。试验结果表明,RAPD技术可有效地应用于药用石斛的遗传多样性及亲缘关系的研究。     

利用RCR-RAPD法和同功酶分析法日本柳杉无性系的识别方法研究

以日本福岛县林业试验场日本柳杉种子园的 ２４个无性系为材料,利用 ＰＣＲ—ＲＡＰＤ法和同功酶分析法对日本柳杉无性系的识别方法进行了比较研究。结果显示：同功酶法和由７个标记构成的ＲＡＰＤ分析法不能完全识别２４个无性系,用１７个和２７个标记构成的ＲＡＰＤ分析法识别这２４个无性系是可能的;同功酶标记是一种基因型标记,具有稳定性高的特点,适合于分析遗传构造的相似程度,特别适合于群体遗传分析,但是,由于能获得清晰话带的同功酶种类有限,在用于个体识别上比较困难;ＲＡＰＤ标记是一种显性标记,稳定性较差,但只要反应体系和条件稳定,利用ＲＡＰＤ标记正确进行无性系识别是完全可能的。