白斑狗鱼和黑斑狗鱼遗传关系初步研究

运用RAPD技术,研究了分布于额尔齐斯河流域的白斑狗鱼(Esox lucius)和黑龙江流域的黑斑狗鱼(Esox reicherti)的遗传关系。结果表明:(1)运用筛选的34个有效引物,在自斑狗鱼群体内共扩增出谱带257条,其中多态性带130条,平均每个引物扩增谱带7.56条,多态座位比例为50.58％;在黑斑狗鱼群体内共扩增出谱带267条,其中多态性带135条,平均每个引物扩增谱带7.85条,多态座位比例为50.56％。两种狗鱼间多态座位比例差异不显著(P>0.05)。(2)引物S68在黑斑狗鱼群体内扩增出1943bp单态片段,但在白斑狗鱼群体内没有出现,故认为引物S68扩增的1943bp片段可作为区别这两种狗鱼的遗传标记。(3)在两种狗鱼间,遗传相似度是0.8090,遗传距离是0.0125;在种内个体间,遗传相似度白斑狗鱼是0.8171,黑斑狗鱼是0.8213,遗传距离分别是0.1829和0.1787,香农氏遗传多样性指数分别是0.1236和0.1241,三个指标的种间差异均不显著(P>0.05)。     

米心水青冈遗传多样性研究

采用RAPD分子标记技术分析9个自然居群米心水青冈的遗传关系和多样性。20条随机引物共扩出260个条带,平均每条引物扩增出13个条带,其DNA带的分子量在200～3000 bp。其中多态性条带有180条,多态位点比率(PPL)为69.2%。种内Shannon多样性指数为0.302 1,群体内所占比例为72.10%,群体间所占比例为27.90%。种内Nei’s基因多样性为0.204 5,群体内平均基因多样性为0.150 2,基因分化系数GST为0.263 1。米心水青冈的遗传多样性水平处于中等,遗传分化也处于中等水平。     

黑龙江流域黑斑狗鱼遗传多样性的Cytb基因初探

[目的]了解黑龙江流域黑宽狗鱼不同地理群体的遗传多样性,为其种质资源的保护和开发提供分子的依据。[方法]从4尾来自黑龙江、17尾来自乌苏里江和5尾来自牡丹江的黑斑狗鱼中提取DNA,测定其线粒体DNA细胞色素b基因序列,采用Kirmra2-parameter模型计算各群体间和单倍型间的遗传距离;以白斑狗鱼为外类群,用邻接法构建系统发育树,构建单倍型的简约性网络图;根据单倍型多样性和核苷酸多态性等信息评估种群的遗传多样性。[结果]获得黑斑狗鱼细胞色素b（Cytb）基因1053bp序列,其中G含量最低,仅14．2％,A＋T含量（57．7％）高于G＋C含量（42．3％）;变异位点有8个,总变异率为0．76％,其中简约信息住点有3个;序列中无插入和缺失,转射颠换为7／1,26尾黑癍狗鱼中共有7个单倍型,单倍型多样性（H）较高（0．76308±0．00315）,但核苷酸多态性（π）极低（0．00126）;3个地理群体黑斑狗鱼群体间遗传距离小（0．067％～0．143％）。[结论]黑龙江流域3个群体的26尾黑斑狗鱼属于同一个种群,其遗传多样性极为贫乏,种质资源亟需得到有效保护。     

小香羊群体遗传结构的RAPD分析

用扩增猪基因组筛选得到的40条多态引物对12份小香羊DNA样品进行RAPD分析,结果有21条引物扩增出多态性谱带.用Nei公式计算群体内的遗传相似性指数,平均为0.9592±0.0082.结果表明,小香羊品种的遗传基础较单一,遗传多样性贫乏.     

槟榔江水牛群体遗传结构的RAPD分析

 为探讨RAPD标记在水牛遗传多样性方面检测的应用价值，以及了解槟榔江水牛的群体遗传结构状况，研究采用随机扩增多态性DNA标记技术对槟榔江水牛20个个体进行了遗传变异分析，从70个随机引物中筛选出15个多态性丰富的引物对其所有个体的总基因组DNA进行了PCR扩增，结果15条引物共产生105种扩增片段，多态片段95条，平均每条引物的扩增带数为7，各引物多态性片段范围在2～12之间，多态频率在40%～100%之间，多态座位平均为90.48%。表明槟榔江水牛的遗传多样性较丰富。     

黔北麻羊遗传结构的RAPD分析

用27条多态性引物对15份黔北麻羊个体基因组进行 RAPD分析. 结果共扩增出253条带,其中多态带为141条,多态频率在30.00%～75.00%之间,平均多态频率为55.73%. 单个引物获得的扩增带数在2～14条之间,平均每条引物扩增出9.37条带. 扩增带分子量范围在210～2700 bp. Nei氏公式计算品种内个体间遗传相似性指数在0.7290～0.9377之间,平均值为0.8634. 遗传距离指数在 0.0623～0.2710之间,平均值为0.1367. 结果表明黔北麻羊具有较丰富的遗传结构.     

RAPD标记对25份柑桔资源及其芽变系的鉴定和多样性分析

 利用随机扩增多态性DNA（RAPD）技术,对几份柑橘资源及其芽变系共计25份材料进行了鉴定和遗传多样性分析,从70个引物中筛选出多态性好的10个引物组成单引物和双引物对基因组进行扩增,共扩增出142条谱带,其中多态带72条,共同带70条,平均每个单引物出现多态带6.8条,每对双引物出现多态带1.3条。利用UPGMA法分析发现,这些基因型间的遗传相似系数在0.834～0.966之间,在此基础上,构建了各基因型的遗传关系树状图。结果表明RAPD标记可以准确鉴定出各柑橘资源及其芽变系,这25份柑橘资源代表了25个基因型。较高的遗传相似系数揭示了柑橘资源间狭窄的遗传背景。     

基于RAPD和SRAP分子标记的柑桔大实蝇种群多态性及其亲缘关系研究

目的:利用RAPD(Random AmplifiedpolymorphicDNA)和SRAP(Sequence-RelatedAmplifiedPolymorphism) 分子标记技术,研究来自重庆、湖北、四川和陕西4省市10个地理种群柑桔大实蝇的亲缘关系.方法:利用 10条RAPD引物和5对SRAP引物对10个不同地理种群柑桔大实蝇的基因组DNA 进行扩增,统计多态性谱带, 然后运用DPS统计分析软件进行遗传多态性及聚类分析.结果:10条RAPD 引物扩增产生152条清晰稳定的谱 带,其中多态性谱带132条,多态性谱带的比例为86.84%;不同地理种群间的遗传距离在0.2500~0.6250之间, 10个地理种群的柑桔大实蝇被划分为4个大类群.5对SRAP引物扩增共获得66条重复性好的清晰谱带,其中多 态性谱带60条,多态性谱带比例为90.91%,不同地理种群间的遗传距离在0.2000~0.7895之间,10个地理种 群的柑桔大实蝇被分为5个大的类群.将RAPD和SRAP两种标记的数据整合,聚类结果显示,10个地理种群的 柑桔大实蝇被划分为6个大类群.结论:柑桔大实蝇不同地理种群间具有丰富的遗传多样性,两种方法结合分析更 能准确地反映不同地理种群间的亲缘关系.     

黔北麻羊遗传结构的RAPD分析

用27条多态性引物对15份黔北麻羊个体基因组进行RAPD分析．结果共扩增出253条带,其中多态带为141条,多态频率在30．00%～75．00%之间,平均多态频率为55．73%．单个引物获得的扩增带数在2～14条之间,平均每条引物扩增出9．37条带．扩增带分子量范围在210～2700bp．Nei氏公式计算品种内个体间遗传相似性指数在0．7290～0．9377之间,平均值为0．8634．遗传距离指数在0．0623～0．2710之间,平均值为0．1367．结果表明黔北麻羊具有较丰富的遗传结构．     

崇明白山羊遗传多样性的ISSR分析

应用ISSR分子标记对崇明白山羊3个群体和黄淮山羊群体进行遗传多样性分析。用筛选出的12条引物对127个个体进行扩增,共扩增出147条谱带,其中多态性谱带67条。分析结果显示:崇明白山羊遗传多样性较为丰富,在物种水平上平均多态位点百分率(PPB)=42.18%,Shannon's信息指数(Ho)=0.2085;在群体水平上,PPB=38.55%,Ho=0.1946。崇明白山羊各群体间遗传差异较小,遗传稳定性较高。UPGMA聚类分析显示:崇明白山羊3个群体间亲缘关系较近,优先聚为1支,再与黄淮山羊相聚。     

白斑狗鱼与黑斑狗鱼的形态差异与判别分析

将传统形态学测定和框架测定相结合,采用聚类分析、主成分分析和判别分析3种多元分析方法,对白斑狗鱼Esox lucius和黑斑狗鱼Esox relchrti的不同地理居群共115尾标本的36个测量性状和12个可数性状数据进行统计分析,以探讨两种狗鱼的形态差异。可数性状卡方检验结果表明,自斑狗鱼与黑斑狗鱼的背鳍棘数、臀鳍棘数、臀鳍分支鳍条数、纵行鳞数、侧线上鳞以及侧线下鳞差异极显著。在可量性状上,聚类分析与主成分分析结果一致,黑斑狗鱼乌苏里江种群与嫩江种群差异最小,首先聚为一支,后与黑龙江种群聚为一支,两种狗鱼差异明显,白斑狗鱼为单独一支。判别分析结果表明,不同种群形态差异极显著（P〈0．01）,判别准确率P1为96．4％～100％。分析结果显示两种狗鱼在形态上已产生一定程度的差异。     

白斑狗鱼与黑斑狗鱼繁殖力的比较研究

对白斑狗鱼Esoxlucius和黑斑狗鱼Esoxreichrti的个体繁殖力进行了比较,并对两种狗鱼的个体繁殖力与其各主要体征指标的关系进行分析。结果表明：白斑狗鱼绝对繁殖力（F）为3 808～173 500粒/尾,黑斑狗鱼的F为5 380～184 630粒/尾,两种狗鱼的个体相对繁殖力（FW）差异极显著（P〈0.01）,F和相对繁殖力（FL）差异不显著。F、FW和FL与各主要体征指标呈正态分布,白斑狗鱼F、FW和FL与各主要体征指标关系密切;黑斑狗鱼F与各主要体征指标关系密切,FW和FL与各体征指标的关系均不密切。白斑狗鱼的F、FL、FW与各体征指标的多元逐步回归方程分别为F=-50090.38＋421.661Wo-74.083Wn＋205.845L,FL=6.977＋0.271Wo,FW=-5.88＋0.37L＋0.514M;黑斑狗鱼F、FL、FW与各体征指标的多元逐步回归方程分别为F=-19300.721＋33.262Wn＋728.415M,FL=-20.948＋0.129Wn＋2.056M-0.071W,FW=15.743＋0.661M。根据两种狗鱼的卵径频率分布图判断,白斑狗和黑斑狗鱼都为一次性产卵鱼类。     

乌苏里江上游黑斑狗鱼种群的生长特性

于2003年秋季对乌苏里江上游黑斑狗鱼Esoz reichertl的种群结构和生长特性进行了调查研究,共采集样本840尾。结果表明：该水域的黑斑狗鱼主要由6^＋龄以下个体组成,其中以3^＋龄以下个体为主。体长与体重之间的关系为形：0．0051L^3.1023（r=0．9762）;生长方程为L1=120．17[1-e^0.1215（t＋0.5983）],Wt=15139．22[1-e^-0.1215（t＋0.5983）]^3.1023;生长拐点年龄t=8．7龄,拐点体重形=4531．7g,说明黑斑狗鱼在8^#龄前均能维持较快增长。鉴于目前的捕捞状况,应对4^#～8^#龄之间的个体适当加以保护。     

乌苏里江流域尖吻细鳞鲑及钝吻细鳞鲑群体遗传多样性分析

采用扩增片段长度多态性(Amplified Fragment Length Polymorphism,AFLP)技术对乌苏里江尖吻和钝吻两种形态的细鳞鲑各10个个体进行了遗传多样性分析。结果显示,12对选择性扩增引物共扩增得到433个位点,其中多态性位点322个,多态性百分比为74.36%。且在12对选择性扩增引物中,引物B3的聚丙烯电泳图谱显示,在130 bp和136 bp处,钝吻群体有两条特异性扩增条带产生。对2个群体的Shannon多样性指数,Nei氏基因多样性等各项参数进行了相关分析。尖吻和钝吻细鳞鲑个体UPGMA聚类树分为两个明显的大分支,群体的遗传相似度为0.836 7,遗传距离为0.178 3,而钝吻细鳞鲑的各项多样性指数均略高于尖吻细鳞鲑。     

乌苏里江流域尖吻细鳞鲑及钝吻细鳞鲑群体遗传多样性分析

采用扩增片段长度多态性(Amplified Fragment Length Polymorphism,AFLP)技术对乌苏里江尖吻和钝吻两种形态的细鳞鲑各10个个体进行了遗传多样性分析。结果显示,12对选择性扩增引物共扩增得到433个位点,其中多态性位点322个,多态性百分比为74.36%。且在12对选择性扩增引物中,引物B3的聚丙烯电泳图谱显示,在130 bp和136 bp处,钝吻群体有两条特异性扩增条带产生。对2个群体的Shannon多样性指数,Nei氏基因多样性等各项参数进行了相关分析。尖吻和钝吻细鳞鲑个体UPGMA聚类树分为两个明显的大分支,群体的遗传相似度为0.836 7,遗传距离为0.178 3,而钝吻细鳞鲑的各项多样性指数均略高于尖吻细鳞鲑。     

古银杏种质遗传关系及特异种质的AFLP分析

从64对EcoRI/MseI引物(其中Msel引物为荧光标记物)中筛选出7对扩增产物多态性高、谱带清晰的引物,对来自山东的29个古银杏种质的遗传关系及特异种质进行了研究.结果表明:7对引物共产生1003条谱带,138个特异位点(其中缺失带36条、单态带102条),多态带915条,多态带的比例为91.21%;每对引物鉴别效率为100%.29个古银杏种质之间相似系数为0.43～0.84,来自不同地区的银杏种质遗传变异程度不同.当相似系数为0.71时,供试种质可分为四类,古银杏种质的聚类与地理位置的远近并不完全相关.根据对古银杏种质的特异位点、相似系数、聚类结果等进行综合分析表明,‘任城'、‘胶州'、‘崂山2'、‘诸城2'、‘安山1'、‘安山2'、‘蒙阴'、‘郯城1'、‘郯城2'、‘叶籽银杏1'10个种质是山东古银杏种质中的重要特异种质.     

中国沿海管角螺4个自然群体遗传多样性的RAPD分析

利用RAPD技术对管角螺(Hemifusus tuba Gmelin)4个自然群体(广西北海、广东湛江、浙江温州、江苏连云港)的遗传多样性进行了分析。所选择的19条有效引物在4个自然群体200个个体中总共产生182个扩增片段,片段数量为19 983个,片段大小在250～2 500 bp之间。其中每条引物可产生4～17条带,平均5.28个位点。4个自然群体共检测到149个多态位点,多态位点比例为81.87%,其中北海群体的多态位点比例最高,占66.48%,其次是湛江群体为47.25%,温州群体为44.51%,连云港群体为36.81%。4个群体中均未检测到各群体特有的扩增带。4个自然群体管角螺的Nei’s指数和Shannon指数表现为一致性,表明遗传多样性在4个自然群体的大小为北海群体>湛江群体>温州群体>连云港群体。4个自然群体的遗传距离在0.054 2～0.137 4之间。基于群体间遗传距离的值进行聚类分析,结果表明,4个群体中,北海与湛江群体首先聚在一起,温州与连云港群体随后聚在一起,最后4个群体聚在一起。研究亮点:利用RAPD技术首次对我国管角螺4个不同分布区自然群体的DNA多态性进行种内遗传差异分析,并...