植物关联分析的研究进展及其在茶树分子标记辅助育种上的应用前景

茶树是中国重要的经济和饮料作物,由于自交不亲和和长期的异花授粉使其高度异质杂合,选育一个良种耗时长,提高早期选育效率和准确鉴定目标性状成为茶树育种家关心的重大问题之一.关联分析是研究分子标记或候选基因与目标性状关系的一种新方法,现已广泛应用于植物等位基因发掘、功能基因验证以及功能性标记的开发和应用等各方面的研究中,为茶树遗传育种研究提供了新思路.此文主要介绍了关联分析的基本原理、策略和及其在植物中的应用现状,并且探讨了其在茶树分子标记辅助育种研究上的应用前景.     

关联分析及其在植物研究中的应用

关联分析是新近开始在植物数量性状研究和植物育种中应用的一种分析方法,它以连锁不平衡为基础鉴定某一群体内性状与遗传标记或候选基因间的关系,是对分子育种中QTL分析的补充和提高。主要介绍了关联分析的基础,分析了关联分析的研究策略,讨论了关联分析在植物研究中的应用。     

关联分析及其在不同分子标记中的应用综述

关联分析技术在植物中的应用较晚,近些年才在植物数量性状和植物遗传育种研究中得以应用。关联分析以连锁不平衡作图(LD mapping)为基础,用来鉴定植物性状与目标基因之间的关系。关联分析有很明显的应用优势,它不仅不需要特殊的构图群体,而且还能够同时对多个基因位点进行检测,精度非常高。由于其良好的实用性,关联分析技术已经成为国际基因组学的研究热点。介绍了LD的定义和度量方法,综述了基于分子标记的关联分析在植物遗传中的应用,并对其在遗传学中的应用和发展作了展望。     

分子标记在棕榈科植物遗传育种中的应用

随着分子标记的快速发展和应用,其已成为棕榈科植物遗传改良的重要工具,在缩短育种进程、加快品种的选育和培育起到重要作用.综述了常见的分子标记在棕榈科植物遗传多样性和亲缘关系分析,棕榈科植物重要性状的分子标记,遗传图谱的构建等方面的应用.最后指出分子标记在棕榈科植物育种中的应用前景.     

分子标记在棕榈植物遗传育种研究中的应用

随着分子标记的快速发展,已成为棕榈植物遗传改良的重要工具,在缩短育种进程、加快品种的选育和培育起到重要作用。本文综述了常见的分子标记在棕榈植物遗传多样性和亲缘关系分析﹑棕榈植物重要性状的分子标记﹑遗传图谱的构建等方面的应用。最后指出分子标记在棕榈植物育种中的应用前景。     

油棕育种现状及关联分析在油棕分子辅助育种中的应用展望

油棕年产油量4~6 t/hm2,有"世界油王"之称,是我国"十二五"规划重点支持的热带木本油料作物。我国每年需要进口大量的棕榈油,但国内的油棕种植业尤其是良种选育还处于起步阶段。关联分析作为一种快速挖掘遗传标记与作物经济性状间的关联的研究策略,在油棕分子辅助育种中有重要的应用前景。综述了油棕育种的特点、目标及现状,阐述了关联分析在多种作物育种相关研究中的应用实例,并对其在油棕分子辅助育种中的应用前景进行了展望,以期为油棕选育种提供研究思路。     

油棕育种现状及关联分析在油棕分子辅助育种中的应用展望

油棕年产油量4⁶ t/hm2,有"世界油王"之称,是我国"十二五"规划重点支持的热带木本油料作物。我国每年需要进口大量的棕榈油,但国内的油棕种植业尤其是良种选育还处于起步阶段。关联分析作为一种快速挖掘遗传标记与作物经济性状间的关联的研究策略,在油棕分子辅助育种中有重要的应用前景。综述了油棕育种的特点、目标及现状,阐述了关联分析在多种作物育种相关研究中的应用实例,并对其在油棕分子辅助育种中的应用前景进行了展望,以期为油棕选育种提供研究思路。     

DNA分子标记技术在竹亚科植物遗传多样性研究中的应用

近年来,分子标记技术已经在竹亚科植物种质资源鉴定、遗传图谱构建、基因定位以及良种选育中得到较为广泛的运用。介绍了常用的分子标记技术及其在竹亚科植物遗传多样性研究中的应用,指出今后应加强分子标记技术在竹亚科植物遗传图谱构建、遗传多样性分析、种质资源的鉴定、辅助选择育种等方面的研究。     

DNA分子标记在植物上的应用进展

本文介绍了常用DNA分子标记在植物中的最新应用。大多数DNA分子标记应用于植物分子遗传图谱的构建、植物遗传多样性分析与种质鉴定、重要农艺性状基因定位与图位克隆、分子标记辅助育种等方面。也有少数分子标记有特殊的用途,并介绍了几种分子标记在植物中联合应用的例子。     

分子标记在当归属植物遗传多样性研究中的应用

介绍了我国当归属植物资源,并系统阐述了RAPD、ISSR及ITS等分子标记在当归属植物种质资源鉴定及遗传多样性研究中的应用进展.同时指出,应用分子标记研究当归属植物的遗传多样性对当归属的科学分类及新品种选育等具有指导意义.     

分子标记技术及其在种猪选育中的应用

本文旨在探索分子标记在种猪育种中的应用方法。本文对影响猪重要经济性状的主效基因及因果突变位点研究的进展进行综述,并对可应用分子标记进行分类,追踪了部分分子标记辅助育种在温氏集团的应用效果,归纳了分子标记在种猪选育中的应用方法。为同行在猪育种中应用分子标记辅助选择技术提供参考。     

木薯分子标记研究进展

综述分子标记技术在木薯属植物品种(系)的鉴定、遗传多样性研究、分子遗传图谱构建以及目标性状的基因定位等方面的应用，并展望分子标记在我国木薯研究中的应用前景。     

玉米近等基因系群体的构建及其应用

玉米是我国重要的粮食作物,也是研究植物遗传和功能基因组学的理想材料。近等基因系群体是构建分子遗传图谱、QTL定位和分子辅助育种重要的材料。我国广泛栽培的杂交种先玉335和郑单958在植株形态、果穗性状、籽粒含水量和脱水速率等方面存在差异。以郑单958亲本郑58和昌7-2为材料,分别与先玉335的亲本PH6WC和PH4CV进行杂交、回交和多代自交,构建了含有先玉335亲本背景的近等基因系材料的混合群体,利用玉米55K芯片分析了这些材料的基因型和群体结构。对2016年和2017年在廊坊与三亚的2年4点的表型数据进行了性状差异分析及性状间相关性分析,结果表明这些材料在株型、果穗性状、籽粒含水量等方面存在差异。利用该群体,应用全基因组关联分析准确定位到了控制穗轴颜色的基因。未来可利用该群体结合全基因组关联分析,开展株高、穗位、籽粒脱水速率等数量性状的基因定位、分子标记开发和分子辅助育种等工作,提高育种效率。     

水貂GHR基因SNPs检测及其与生长性状的关联分析

为了检测水貂GHR基因多态性及其与生长性状的相关性分析,寻找可用于选育水貂生长性状的分子遗传标记,以同龄同场的短毛黑水貂、红眼白水貂和咖啡水貂为研究对象,采用PCR产物直接测序检测GHR基因的单核苷酸多态性,利用SPSS 19.0软件将该基因多态性与水貂生长性状进行关联分析.结果表明,存在3个SNPs位点,分别为外显子...     

分子标记在植物抗病育种中的应用

植物种质库通常有携带抗病基因的植物材料,通过育种的方法将这些抗病基因导入植物是保护植物免于病虫害的重要而有效的方法。当前研究表明,抗病基因分子标记将有利于高效筛选含抗病基因的植物材料。该文简要概述了分子标记的特点,重点分析了其在植物抗病育种研究中的应用,主要在辅助选育多基因聚合体,构建抗病基因相关的遗传图谱,抗病基因定位及克隆,遗传多样性分析等方面进行阐述,并对其发展趋势作出展望。     

关联分析在水稻产量性状遗传研究中的应用

水稻地方品种具有丰富的遗传多样性、变异性和大量有价值的基因,长期以来一直被认为是多种有价值基因的来源。对不同水稻种质资源重测序,有助于挖掘有益的等位基因或单倍型变异,进而利用其遗传多样性。关联分析作为挖掘和分析复杂数量性状位点的有效方法,能够快速鉴定自然群体中的有益等位变异,定位与目标性状高度关联的候选基因,在水稻产量性状遗传研究中发挥了巨大作用。本文简要描述了关联分析的基本原理,综述了关联分析在水稻产量性状遗传研究中的进展,并讨论关联分析在未来水稻育种工作中的应用。     

棉花数量性状的连锁作图和关联作图最新进展

现代分子生物学技术和新的统计方法,大大促进了植物数量性状基因(QTL)的解析.连锁作图和关联作图是目前植物数量性状基因解析的重要方法,两者在QTL定位的精度和广度、提供的信息量、统计分析方法等方面具有明显的互补性.连锁作图可以初步对目标性状基因进行定位,而关联作图则可快速对目标基因进行验证和精细定位,并针对特定候选基因提供大量信息,验证候选基因的功能.综述了近10年来棉花数量性状的连锁作图和关联作图最新进展,并结合两种方法对棉花的QTL研究前景进行了展望.     

本刊外聘编委 黎志康研究员

中国农业科学院农作物基因资源与基因改良国家重大科学工程首席科学家、国际水稻研究所驻中国代表科学家和全球水稻分子育种协作网协调科学家。专业特长:植物分子遗传学(基因定位、数量性状遗传作图、植物分子标记辅助育种、功能等位基因发掘和复杂农艺性状的功能基因组研究)及其在水稻育种、遗传和进化中的应用。国际动植物基因组年会植物分子     

植物分子育种研究进展

由于植物分子育种技术克服了常规育种方法周期长、预见性差、选择效率低的局限性,可以打破物种界限,实现优良基因重组和聚合,能够对农作物新品种定向选育,使得分子育种成为育种研究的热点。在介绍植物分子育种的发展、研究内容、特点的基础上,探讨了植物分子育种的研究进展,并对其研究和应用前景进行了展望。     

新疆棉花产量和纤维品质性状SSR关联分析

【目的】研究新疆陆地棉品种资源目标相关性状QTL紧密连锁的分子标记,发掘与目标性状相关的具有重要利用价值的基因源。【方法】利用54对SSR标记,分析94份新疆自育陆地棉品种的基因组。【结果】群体结构分析表明,94个品种总体被划分为2个类群,同时还出现了1个混合群。关联分析结果表明,在P值＜0.05时,GLM（Q）模型中共有36个标记位点与纤维品质性状和农艺产量性状关联,其中与比强度、马克隆值、长度、伸长率、铃重、生育期和衣分相关联的位点分别为12、4、13、1、4、1和1个。【结论】主成分分析和群体结构分析从不同角度反映了新疆棉花品种的亲缘关系的远近,自育品种遗传多样性不够丰富,在分子水平上差异并不大,需要努力拓宽品种选育的遗传基础。