新疆8个棉花品种（系）的指纹图谱分析

利用ISSR对8个新疆品种（系）进行指纹图谱构建。通过基因组多态性分析，从60条引物中筛选到11条扩增效果好的引物，用其中2条引物UBC809，UBC841建立8个品种的指纹图谱，统计品种鉴定的置信概率达到1／8388608。结果显示，ISSR分子标记技术对棉花品种的指纹图谱构建具有高效性和准确性。     

ISSR分子标记在白芥和芥菜型油菜品种鉴定中的应用

为了有效地鉴别白芥和芥菜型油菜品种,为白芥种质资源研究和育种工作提供理论依据,本研究利用ISSR分子标记对12份白芥材料和8份芥菜型油菜(辣芥4份,红芥4份)进行了品种鉴定及亲缘关系分析。结果表明:6条ISSR引物成功扩增出39条DNA片段,其中34条具有多态性,引物的多态性位点百分率在66.7%～100.0%间,平均87.7%。通过UPGMA聚类分析和遗传一致度分析发现,所有白芥材料归为一大类,红芥和辣芥材料归为一大类(遗传一致度0.875 0)。白芥表现为同一来源地的材料归为一组,安徽白芥和青海‘白芥1号’的亲缘关系较近(遗传一致度0.750 0),而四川白芥与安徽白芥和青海‘白芥1号’的遗传一致度相对较低,分别为0.641 0和0.589 7。基于6条ISSR引物获得供试材料的指纹图谱,利用引物UBC836、UBC847、UBC821和UBC855可以区分白芥和芥菜型油菜红芥和辣芥。辣芥有1个特异出现条带(UBC850-375)和1个特异缺失条带(UBC821-1000),可用于区分辣芥与红芥。利用引物UBC836、UBC850、UBC855、UBC821,共获得可以区分不同产区白芥的6个特异标记和3个特异缺失标记。利用ISSR标记构建的DNA指纹图谱简单、直观,可有效应用于白芥和芥菜型油菜品种的鉴定。     

应用ISSR分子标记绘制红麻种质资源DNA指纹图谱

以6份红麻种质资源为材料, 对UBC807~UBC80等80个ISSR引物进行筛选, 筛选出多态性好的ISSR引物20个。利用这20个ISSR引物扩增来自国内外84份红麻种质资源, 共获得230条谱带, 平均每个引物扩增出11.5条谱带, 其中多态性谱带185条, 多态性条带比率为80.43%, 表明供试的红麻种质资源遗传多样性较丰富。以供试84份红麻种质资源的ISSR扩增谱带为基础, 建立了供试材料扩增条带指纹数据库的Excel文件。根据指纹图谱唯一性原则, 采用自行开发的DNA指纹数据分析软件, 再从20个多态性好的ISSR引物中遴选出UBC 813、UBC 825、UBC 836、UBC 888和UBC 889引物, 绘制出82个红麻种质资源的DNA指纹图谱, 为红麻种质资源分子身份证的构建奠定了基础。     

利用SRAP、ISSR、SSR标记绘制黄麻基因源分子指纹图谱

以国内外引进保存的231份黄麻种质资源为材料,分别采用SRAP、ISSR、SSR分子标记和编程DNA指纹图谱分析软件,绘制黄麻遗传资源基因组DNA指纹图谱。结果表明,通过筛选出的35对SRAP引物对231份黄麻品种进行标记分析,获得96份黄麻品种DNA指纹图谱;11个ISSR多态性引物对96份材料进行DNA标记分析,获得45份黄麻品种DNA指纹图谱;49对SSR多态性引物对48份黄麻品种进行DNA标记分析,获得13份黄麻品种DNA指纹图谱,累计完成了154份黄麻品种基因组DNA分子指纹图谱绘制。每一个被识别的品种都具有其独特的分子"身份证"。其他77份地方品种因与部分品种遗传相似性过高,未能被识别,表明黄麻地方品种存在较为严重的同种异名现象。     

基于SSR标记新疆陆地棉的DNA指纹图谱构建及遗传多样性分析

【目的】利用Simple sequence repeats(SSR)标记构建新疆近40年间审定的120个陆地棉品种的DNA指纹图谱并进行遗传多样性分析。【方法】从586对候选引物中筛选得到78对多态性高、扩增稳定且均匀分布于棉花染色体上的引物,并用这78对引物构建120个陆地棉品种的DNA指纹图谱。【结果】78对核心引物在120个材料中检测到392个等位位点,其中多态性位点324个,多态性比率达82.7%。24个标记位点在17个品种上具有特征谱带。采用12对引物组合即可鉴定120个棉花品种。聚类分析显示,120个陆地棉品种遗传相似系数变化范围为0.50~0.96,平均为0.73,遗传相似系数偏高,表明新疆陆地棉品种的遗传基础较狭窄。【结论】引物组合法是构建DNA指纹图谱最有效的方法。遗传相似系数矩阵将120个陆地棉品种分为三大类群,与系谱来源较为吻合。     

基于ISSR标记的四照花栽培品种指纹图谱构建及亲缘关系分析

四照花观赏价值极高,其栽培品种繁多且难以区分。为了快速有效地鉴定四照花栽培品种,本研究利用ISSR标记,建立了44个四照花主要栽培品种及其亲本的指纹图谱,并分析了其亲缘关系,为四照花的推广应用提供依据。利用优化的ISSR-PCR体系,从100条ISSR引物中筛选出7条,对44个四照花样本的基因组DNA进行PCR扩增。通过2条引物UBC834和UBC847的扩增,建立了品种特异性指纹码,可将44个样本中的42个加以区分。7条ISSR引物共获得91条扩增带,其中多态性条带90条,多态性比例为98.9%,平均每个引物扩增出13个位点;在遗传距离为0.60处,可以将44个样本分为3类:第1类包括大花四照花原种、所有大花四照花栽培品种和以大花四照花为母本的杂交品种37号(C.‘Rutban’)和38号(C.‘Celestial Shadow’);第2类为所有日本四照花和中国四照花及其两者的栽培品种、以日本四照花为亲本的杂交品种36(C./Ruth Ellen/‘Rutlan’)、39(C.‘Rutcan’Constellation)、40(C.‘KN4-43’Starlight),和未知品种41号;第3类,未知样本42号单独聚为一类,但在遗传距离为0.62处与第1类聚到一起,推测其可能是源于大花四照花的品种。本研究基于ISSR标记构建的指纹图谱可有效用于四照花栽培品种鉴定,并揭示其亲缘关系。     

基于SSR标记的38份欧洲报春种质资源遗传多样性分析

为加快欧洲报春育种进程,本研究以‘庆典’、‘丹诺雅’、‘丹诺雅XL’、‘丹妮莎’、‘普利罗曼’以及上海源怡种苗股份有限公司自主育种的‘春晖’系列共38个欧报春品种为材料,利用24对SSR引物通过毛细管电泳检测法进行了欧洲报春遗传多样性和遗传关系分析。供试的24对SSR引物中11对引物稳定性和多态性较好,可用于遗传多样性和聚类分析。多态性信息指数为0.360 3～0.953 3,平均值为0.814 9。38个欧洲报春品种分别来源于6个不同品系,6个品系遗传距离都维持在较高水平,其中‘丹妮莎’和‘普利罗曼’间的遗传距离最小,上海源怡种苗股份有限公司自主育种的‘春晖’系列与‘庆典’的遗传距离最大,且‘春晖’系列与其余5个品系的遗传距离均大于0.5。通过STRUCTURE分析发现6个群体中存在5个基因库,且不同品系、不同花色的品种在基因库组成比例存在较大差异。本研究初步通过已有SSR标记开展欧洲报春遗传多样性分析,筛选出的标记可用于不同品系遗传距离的分析,但在不同品种DNA指纹图谱构建中还存在一定欠缺。后续将通过多种途径开展欧洲报春SSR标记的开发,以推进欧洲报春的育种进程以及新品种鉴定工作。     

ISSR分子标记技术在桃品种鉴定中的应用

为了有效地鉴别桃苗木优良品种或类型,为桃种质资源研究和新品种保护提供理论基础,利用ISSR标记对28份桃种质进行了品种鉴定及亲缘关系检测。结果发现：23条ISSR引物共扩增出188条DNA片段,其中96条具有多态性,多态性频率为51.06%;材料间遗传相似系数GS变幅为0.84～0.97,平均为0.92。获得28份供试材料的指纹图谱,鉴定出9条特异出现DNA片段和11条特异缺失DNA片段。通过UPGMA聚类分析发现,供试材料中地理来源及部分农艺性状相近的品种或类型聚为小类,但大的聚类群没有明确的划分标识,可能与桃种质在地区间互换及所选择的ISSR标记有关。     

番石榴遗传多样性的ISSR分析及指纹图谱构建

为研究59份番石榴种质资源的遗传多样性，并绘制指纹图谱。以番石榴为试材，利用ISSR分子标记技术和UPGMA聚类分析方法，绘制番石榴DNA指纹图谱。利用筛选获得的10条ISSR核心引物对59份番石榴样品进行扩增，共得到126条条带，其中多态性条带113条，多态率为89.68%。通过UPGMA聚类分析得知，59份供试番石榴种质资源样品间遗传相似系数为0.50～0.96，平均遗传相似系数为0.73。根据遗传距离的远近，可将59份种质资源分成4组，第1组包含种质34份，第2组包含种质6份，第3组包含种质18份，编号C26‘草莓’番石榴样品单独为第4组。成功构建了59份番石榴种质的DNA指纹图谱，可用于番石榴种质资源的分类与鉴定。     

62株草菇遗传多样性分析

为了借助分子标记手段对草菇菌株进行鉴别，利用7个RAPD、ISSR，对62个草菇菌株基因组DNA进行PCR扩增，对草菇菌株的遗传差异进行分析。结果表明，7个引物共扩增出46条清晰的DNA片段，其大小介于250-2000bp，其中多态性片段43条，平均多态性位点百分率为93.5%。DNA指纹图谱分析结果表明，所有的供试菌株间的DNA指纹均存在差异性，各菌株间的遗传相似系数在0.63~0.97之间。聚类分析结果表明，62个草菇菌株在遗传相似系数为0.80处可以分成25个群组 草菇V0062、V0079和V0004与其它菌株之间的遗传距离最远。菌株V0084和V0085相似系数为0，需要借助其它方法进行进一步的鉴定。     

基于ISSR标记的龙眼种质资源遗传多样性及亲缘关系分析

为明确收集的龙眼种质资源遗传多样性水平和亲缘关系,以20份龙眼种质资源为研究对象,采用ISSR分子标记进行遗传多样性及亲缘关系分析。11条引物共扩增出113条DNA片段,其中多态性片段90条,占总扩增片段数的79.65%。供试龙眼材料的遗传相似系数介于0.5487~0.8673之间,平均遗传相似系数0.7758。20份龙眼资源材料的ISSR聚类结果表明,供试龙眼材料间的亲缘关系较近,聚类结果受亲本关系影响,一定程度上反映了品种的地理分布情况,与传统分类方法较为一致。研究结果为龙眼种质资源的分类、遗传进化研究及杂交组合选配提供一定的理论和技术支持。     

粤西龙眼遗传多样性的RAPD分析

为了保护和利用粤西野生和栽培龙眼种质资源,通过RAPD技术对粤西野生和栽培共5个龙眼品种的遗传多样性进行分析。结果表明：从100个10 bp长的随机引物中筛选出14个重复性好、稳定性高的有效引物,共扩增出70条带,其中多态性带42条,占总扩增条带的60%。聚类分析结果表明：5个龙眼品种间的遗传差异性不大,但野生龙眼与其他4个龙眼品种的遗传距离相对较大,平均为0.07375,在系统树上单独聚为一支,其余4个品种聚为另一支,说明野生龙眼与栽培品种之间的亲缘关系相对较远。‘双孖木’与‘大乌圆’的遗传距离最小,仅为0.01236,在系统树上构成姊妹类群,推测二者具有共同起源或为近缘品种。     

8份剑麻种质亲缘关系的ISSR和RAPD分析

为了揭示剑麻栽培品种的遗传多样性,利用ISSR和RAPD分子标记技术对8份剑麻种质的亲缘关系进行分析。结果表明,筛选后选用的8条ISSR引物和8条RAPD引物,分别产生了53条和66条扩增条带,其中多态性条带分别为44条和61条,多态性条带百分率分别为83.02%和92.42%。根据2种标记的扩增结果,用UPGMA法对8份剑麻种质进行聚类分析,供试材料之间具有较高的遗传多样性,其品种间遗传相似系数分别为0.59~0.80和0.52~0.76。2个标记的聚类结果基本一致,但有点差异,可将供试的8份剑麻种质划分为2类群,而且2个标记聚类结果呈显著相关性,相关系数为0.70。可见,剑麻种质资源的遗传多样性丰富。     

福建地区火龙果种质资源调查及ISSR分析

为摸清福建地区的火龙果种质资源分布情况,了解其亲缘关系,对福建地区火龙果种植情况进行调查并取样。用ISSR技术对收集的20份火龙果材料进行遗传多样性分析。从40条ISSR随机引物中筛选出11条适合的引物,扩增获得142个位点,多态性比率为74.65%。Jaccard聚类分析显示,20份种质间相似系数（GS值）在0.487~0.937,平均值为0.646,当GS值为0.559时可分为3类。初步揭示了福建地区火龙果种质资源的分布情况和亲缘关系,‘白巨龙’、‘洛红’和‘红仙蜜1号’适合在福建推广,为火龙果栽培选种和育种工作提供参考价值。     

海南、云南油棕种质材料遗传多样性的ISSR分析

为进一步开发利用海南和云南油棕种质资源,从DNA分子水平上对海南和云南油棕种质资源进行遗传多样性研究.应用ISSR技术对海南和云南的63份油棕种质材料进行遗传多样性分析,用23个引物共扩增得到201条扩增条带,其中有多态性的条带为155条,多态性条带占总扩增条带的77.1%.聚类分析的结果将不同地方采集的种质明显的分为8类,采自不同地方的种质材料能明显的根据种质来源相对集中在一起,油棕种质材料可按采集地进行分类.     

不同来源棉花种质资源遗传多样性的ISSR分析

 采取ISSR分子标记对48份棉花种质资源的遗传多样性进行分析,从60条ISSR引物中筛选出11条引物,这11条引物共扩增出92个条带,平均每条引物扩增出8.36个条带;其中多态性带77个条带,多态率达83.70％。UPGMA聚类分析显示,48份材料的相似性系数（GS）变化范围在0.27～0.93之间。聚类将48个种质资源划分为 4个大类(GS=0.55),湛江野生棉、廉江野生棉与其它品种在遗传上有很大差别,属于较原始类型,归为一类;长绒棉与陆地棉品种存在明显的遗传差异也单独归为一类;其它不同省份的陆地棉品种在遗传上有较高的相似性,归为其它类型。分析结果表明,ISSR具有丰富遗传多样性和稳定性, 是一种较好的遗传分子标记,适宜于棉花品种遗传多样性分析     

云南椰子种质资源遗传多样性的ISSR分析

为摸清云南椰子种质资源遗传多样性现状,促进资源的有效利用,以在云南收集的60份椰子种质为试材,利用ISSR分子标记技术对其遗传多样性进行了分析。结果表明：27条ISSR引物共扩增出272个位点,其中230个为多态性位点,多态性比率为84.56%,引物多态性指数为0.85,SM遗传相似系数平均值为0.664。根据各种质的SM,运用NTSYSpc2.10e软件的UPGMA方法构建了种质的系统聚类图,60份椰子被聚为3个类群(A、B、C)。其中,A类群为全部由本地种质组成的一个独立类群;C类群既包括部分本地种质,也包括来源于本地以外的其他种质。研究结果显示出云南椰子种质具有较高的遗传多样性;这些种质与外地种质具有独立性和关联性的特点。该研究结果可为云南椰子种质资源的进一步研究和利用提供参考。     

洋葱种质资源遗传多样性的ISSR分析

应用ISSR标记对32份洋葱种质资源的遗传多样性进行了分析。从31个ISSR引物中筛选出4条扩增产物条带清晰、多态性高的引物,在32份资源样品中共扩增出39条带,其中31条带为多态性位点,平均每个引物扩增的多态带数为7.75条,多态性条带比率（PPB）为79.48%。资源间的遗传相似系数在0.552~0.960之间,具有较为丰富的遗传多样性。ISSR聚类分析表明,在L取值为D=0.68时,可将32份洋葱资源分成5类：第一类包括18份种质资源,主要以Yellow Sweet Spanish系统为主;第二类包括1份种质资源,为Bejo Daytona;第三类包括3份种质资源,为Yellow Globe系统;第四类包括9份种质资源,为Yellow globe danvers系统;第五类包括1份种质资源,为Yellow Danvers system系统。较好地揭示了洋葱种质资源间的遗传多样性与亲缘关系,可为洋葱遗传育种和杂交亲本选择提供科学依据。     

33份“红橘”种质资源的ISSR分析

为分析"红橘"种质资源,利用ISSR分子标记对33份"红橘"种质资源进行遗传多样性分析,利用NTsys 2.10e构建UPGMA树状图,从27条引物中筛选出14条,对33份"红橘"种质资源的DNA进行PCR扩增,得到148条谱带。其中多态性条带120条,多态位点百分率80.53%。33份"红橘"种质资源的遗传相似系数在0.570~0.970之间。以遗传相似系数0.780为阈值,将33份"红橘"种质资源划分为7个组(A,B,C,D,E,F,G)。该研究结果表明33份种质资源遗传差异较大,ISSR能较好地将它们区分开,有助于福橘果实品质改良和福建省红橘种质资源的发展。