PURH基因对鸡肉肌苷酸含量的遗传效应及其表达

以鸡氨基咪唑氨甲酰核苷酸转甲酰基酶/次黄嘌呤核苷酸环水解酶基因（PURH）为影响肌肉肌苷酸（IMP）含量的侯选基因,以鸡（Gallus gallus）5个品种为材料,采用PCR-SSCP与测序相结合的方法对PURH基因所有外显子及部分内含子区域进行单核苷酸多态性（SNPs）检测;同时采用实时荧光定量PCR方法对PURH基因在白耳鸡不同组织中的发育性表达进行了初步研究。结果共发现2个单核苷酸多态性位点,分别为外显子9中的A8023T突变和外显子16中的T17446C突变,仅T17446C位点的多态性与肌肉肌苷酸含量存在显著的关联,两个位点单倍型的效应要高于单个基因型的效应,推测PURH基因可能是影响IMP含量的主效基因或与主效基因相连锁,以单倍型作为鸡肉质性状的潜在的分子标记更有优势。在白耳鸡不同生长阶段不同组织中均检测到PURH mRNA的表达,其表达量呈明显的时序性变化,提示PURH基因的表达对肌苷酸的沉积具有一定程度的影响。     

家庭养鸡要注意品种对路

最近,我们对户养鸡作了一次调查,发现有些农户不了解鸡的品种和用途.把肉用型品种当成蛋用型品种喂养,也有一些农户对喂养多年、产蛋量明显下降的老母鸡舍不得淘汰继续喂养,结果造成人力、财力和物力的浪费。鸡的品种比较多,在农村常见到的有米航鸡、星杂二八八、寿光鸡、芦花鸡、济南花、澳洲黑、白洛克和九斤黄等品种。这些可分为三个类型,即蛋用型,肉用型,肉蛋兼用型品种。     

鸡ovr基因SNPs检测及其与蛋用性状的关联分析

为研究鸡卵细胞卵黄生成受体（Occyte vitellogenesis Receptor , OVR）对鸡产蛋性能及蛋品质的影响,本试验以六个鸡种（洪山鸡、江汉鸡、双莲鸡、郧阳大鸡、郧阳白羽乌鸡、海兰褐）的一代混交群体390个个体为研究材料,采用PCR-SSCP、PCR-RF-SSCP及测序的方法进行鸡ovr基因内含子单核苷酸多态性（SNPs）位点筛选,并与鸡群蛋用性状进行关联分析。结果表明,在鸡ovr基因中发现内含子2 T3967G,内含子7 C8099T、A8296G,内含子9 A8839T、G9084A共5个突变位点;其中内含子2 HinfⅠ突变位点与开产日龄、蛋壳厚度相关极显著（p<0.01）,与产蛋量、蛋重、蛋黄比例相关显著（p<0.05）;三种基因型中TT个体在开产日龄、平均产蛋量、蛋重、蛋黄比例等方面都优于其它基因型个体。本研究结果证实了其他学者研究的结论,即ovr基因对鸡的产蛋性能和蛋品质性状有重要的影响。     

3个鸡种GARS-AIRS-GART基因第21号外显子的SNPs检测

采用PCR．SSCP和DNA测序法对安卡鸡、文昌鸡和如皋鸡中GARS-AIRS-GART基因的第21号外显子进行SNPs检测。结果发现该外显子含4个核苷酸多态位点：G29943A、C29968T、T30011C和C30017T,其中3处为非同义突变,分别为：29943处天冬氨酸（Asp）→天冬酰胺（Asn）、30011处色氨酸（Trp）→精氨酸（Arg）、30017处精氨酸（Arg）→半胱氨酸（cys）;另一处为同义突变。对多态位点进行单倍型分析,发现12种单倍型,其中两种单倍型（5号和6号）的频率超过10％,分别为0．3300和0．1628,1号、3号、9号和10号单倍型频率介于1％～10％之间,其余都小于l％。另外共检测到11种基因型,存在5种等位基因,安卡鸡的D和E等位基因的基因频率较高,基因型与其它两个鸡品种之间都存在着极显著的差异（p〈0．01）,表明我国地方鸡种和外来鸡种在遗传组成上存在着差异。本研究将为鸡肉品质相关研究积累基础数据,为今后深入开展肉品质的开发利用奠定理论基础。     

ADSL、GARS-AIRS-GART基因多态位点和聚合基因型对白耳鸡肌苷酸（IMP）含量的效应分析

采用PCR-SSCP方法检测白耳鸡ADSL基因外显子2和GARS-AIRS-GART基因5’侧翼区多态性,分析多态位点不同基因型及聚合基因型与90日龄胸肌肌苷酸（IMP）含量的关联,并比较分析了不同聚合基因型个体的生产性能。结果表明：ADSL基因外显2和GARS-AIRS-GART基因5,侧翼区的多态位点C3484T、C-179T与IMP含量显著相关（P<0.05）,TT为两种有利单基因型,其对IMP含量的加性效应分别为0.1710 mg/g和0.128 mg/g,显性效应分别为-0.025 mg/g和0.031 mg/g 。两种有利单基因型聚合个体TTTT的IMP含量显著高于其他基因型聚合个体（除TTCC型）,且在聚合基因型中两种有利单基因型TT对IMP含量的影响均达到显著水平（P<0.05）,但两者间的互作效应并不显著（P>0.05）。TTTT聚合基因型个体的90日龄平均体重、72周龄产蛋性能仍保持相对稳定。     

黑素皮质素受体3基因(MC3R)多态性及其单倍型组合与京海黄鸡屠体性状的关联分析

本研究旨在探讨黑素皮质素受体3基因(melanocortin 3 receptor,MC3R)对鸡(Gallus gallus)屠体性状的影响。采用聚合酶链式反应-单链构象多态性(polymerase chain reaction-single strand conformation polymorphism,PCR-SSCP)检测及测序的方法,检测MC3R在京海黄鸡群体中的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs),并对这些多态位点进行连锁不平衡和单倍型分析。结果表明,在MC3R编码区序列(coding sequence,CDS)共检测到6个SNPs位点,各位点间均不存在强连锁不平衡;6个SNPs位点在379只京海黄鸡的群体中形成了5种单倍型和11种单倍型组合。最小二乘法分析结果表明,不同单倍型组合间京海黄鸡屠体性状(包括活体重、屠体重、胸肌重、腿肌重、全净膛重、半净膛重和腹脂重)存在显著或极显著差异(P<0.05或P<0.01),其中单倍型组合H3H4和H3H3的各种屠体性状均极显著高于单倍型组合H4H5(P<0.01),也显著高于其他部分单倍型组合(P<0.05),为屠体性状优势组合;单倍型组合H4H5各屠体性状均为最低,均显著或极显著低于其他大部分单倍型组合(P<0.05或P<0.01),为屠体性状劣势组合。因此,MC3R可能是影响鸡屠体性状的主效基因或与主效基因连锁,本研究为京海黄鸡屠体性状分子标记辅助选择提供了参考依据。     

寿光鸡褪黑素受体基因(MTNR1A)5'控区多态性与产蛋性状的关联分析

褪黑素(melatonin)是由松果体和视网膜分泌的一种内分泌激素,具有广泛的生物学功能.为研究褪黑素受体基因(MTNR1A)对寿光鸡产蛋性状的影响,本研究采用直接测序法检测MTNR1A基因5’调控区的单核苷酸多态性(SNPs),并分析对寿光鸡(Gallus gallus)产蛋性状的影响.结果表明,在MTNR1A基因5’调控区存在8个SNPs位点,其中-34、-151和-617位点多态信息含量(PIC)值分别为0.13、0.12和0.05,呈低度多态,-100、-110、-126、-329和-538位点PIC值分别为0.37、0.37、0.37、0.37和0.36,呈中度多态.-100、-110、-126和-329位点对寿光鸡开产日龄和前期20～25周龄的产蛋数均有显著影响(P＜0.01或0.05),-538位点仅对开产日龄有显著影响(P＜0.05).单倍型分析显示-100、-110和-126位点紧密连锁,构建了TTT、TTC和GCT 3种单倍型和6种双倍型.与单倍型GCT相比,单倍型TTC可使开产日龄提早2.6 d,早期产蛋数增加1.4枚.综上所述,寿光鸡MTNR1A基因5’调控区SNPs位点丰富,单倍型TTC可使开产日龄提前和早期产蛋数增加,是具有潜在应用价值的分子遗传标记,可为寿光鸡早熟性状的选育提供技术支持.     

脂滴包被蛋白基因(PLIN)多态性与鸡胴体及脂肪性状的相关性

脂滴包被蛋白基因(perilipin,PLIN)对脂质代谢和脂肪沉积具有重要调控作用。为揭示PLIN基因多态性对鸡(Gallus gallus)胴体及脂肪性状的遗传效应,本研究以384只鲁禽B3系为研究材料,采用DNA测序和PCR-RFLP技术对PLIN进行多态性检测,在供试群体中检测到3个SNPs位点g.2272CT、g.2319CT和g.2467GA。基于这3个SNPs位点,采用PHASE2.0软件构建了7个单倍型,其中C-C-G为最主要单倍型,频率高达71.94%;C-C-A和C-T-A单倍型频率最低,不足1%。基于7个单倍型构建了11个双倍型,H1H1频率最高,为52.60%;关联分析结果表明,双倍型对活体重、屠体重和腿肌重影响极显著(P0.01),对腹脂重和腹脂率影响显著(P0.05),对胸肌肌内脂肪含量有一定影响(P=0.094 9)。最小二乘分析结果表明,H1H3组合的活体重、屠体重、腿肌重、腹脂重和腹脂率最高,H4H6组次之,H6H6组合最低;H4H6组合胸肌肌内脂肪含量最高,H1H3组合最低。表明双倍型H6H6为劣势组合,在实际生产中应该去除,H4H6可以作为提高鲁禽鸡胴体性能和肉质风味的分子标记,在选育过程中应加强选择。本研究结果为PLIN基因应用于鸡分子育种提供了理论基础。     

鸡卵细胞卵黄生成受体基因(ovr)SNPs检测及其与蛋用性状的关联分析

以6个鸡(Gallus gallus)品种混交群体390个个体为研究材料,采用PCR-SSCP、PCR-RF-SSCP及测序的方法进行鸡卵细胞卵黄生成受体(occyte vitellogenesis receptor,ovr)基因内含子单核苷酸多态性(SNPs)位点筛选,并与鸡群蛋用性状进行关联分析.结果表明,在鸡ovr基因中发现内含子2T3967G,内含子7C8099T和A8296G,内含子9A8839T和G9084A共5个突变位点;其中内含子2HinfⅠ突变位点与开产日龄和蛋壳厚度相关极显著(P＜0.01),与产蛋量、蛋重和蛋黄比例相关显著(P＜0.05);3种基因型中订个体在开产日龄、平均产蛋量、蛋重、蛋黄比例等方面都优于其它基因型个体.研究结果证实了ovr基因对鸡的产蛋性能和蛋品质性状有重要的影响.     

鸡CEBPA和Six1基因的多态性及其与屠体和体尺性状的相关分析

CCAAT/增强子结合蛋白α基因(CCAAT/enhancer binding protein alpha gene,CEBPA)在脂肪生成、生长发育过程中发挥重要作用,同源异型基因Six1(sine oculis homeobox homolog 1 gene)在骨骼肌的发育和肌纤维类型的转化中起调控作用,且两者均与骨骼的发育密切相关。本研究以CEBPA和Six1基因为候选基因,采用直接测序法检测2个基因外显子的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs),并分析其对无量山乌骨鸡(Gallus gallus)屠体和体尺性状的影响。研究结果表明,在CEBPA基因外显子上共检测到74 CG、552 GA、936 CT 3个突变位点,在Six1基因外显子上共检测到375 GA和564 GA 2个突变位点,其中只有CEBPA基因74 CG位点的突变引起了氨基酸的变化,且为中性突变。连锁不平衡(linkage disequilibrium,LD)分析发现,CEBPA基因的各突变位点间、Six1基因的各突变位点间均不存在强连锁不平衡。在无量山乌骨鸡群体中,CEBPA基因的3个SNPs位点形成了5种单倍型和7种双倍型,Six1基因的2个SNPs位点形成了4种单倍型和5种双倍型。关联分析表明,CEBPA基因的74 CG突变位点对半净膛率、全净膛率、体斜长、胸宽、胸深和龙骨长有显著或极显著影响(P0.05或P0.01),936 CT突变位点对活重、屠体重、半净膛重、全净膛重、胸肌重、体斜长、骨盆宽和胫长有显著或极显著影响(P0.05或P0.01)。双倍型H1H1、H4H4的半净膛率、全净膛率,H1H2的胸肌重、骨盆宽、胫长,H1H4和H4H4的体斜长,H4H4的胸宽、胸深、龙骨长分别显著高于其他部分双倍型(P0.05或P0.01);Six1基因的375 GA和564 GA突变位点对部分屠体和体尺性状有显著性影响(P0.05或P0.01),双倍型H6H6、H6H7、H6H8的胸肌重、胸肌率,H6H7的屠宰率,H6H8的全净膛重、胸深、骨盆宽,H7H7的胸角、胫长、胫围,分别显著高于其他部分双倍型(P0.05或P0.01)。本研究结果表明,CEBPA基因和Six1基因的多态性对无量山乌骨鸡的屠体和体尺性状有显著影响,可作为无量山乌骨鸡及其他鸡种屠体和体尺性状分子标记辅助性选择的候选基因。     

G位点的多态性及其与体重、脂肪沉积性状的相关性

摘要：β-1.4-N-乙酰半乳糖胺转移酶(β-1.4-N-acetylgalactosaminyl-transferase,Galnact-2)是催化O－聚糖合成第一步的糖基转移酶。本研究根据已公布的鸡Galnact-2基因的DNA序列，在突变位点c.363C>G的侧翼（区）设计引物，用PCR- XhoⅠ-RFLP方法在隐性白洛克鸡、杏花鸡、泰和丝毛乌骨鸡、白耳黄鸡、康乐鸡、南城黑鸡等276个体中检测其多态性，并运用华南农业大学杏花鸡与隐性白洛克鸡资源群全同胞参考家系研究这个突变对鸡体重、脂肪沉积性状的影响。结果表明：(1)该突变位点在各品种中具有丰富的多态性；(2)该位点与鸡的体重显著相关。GG型个体的体重比CC型大，两者在出生重及21、28、35、49、56、63、77、84日龄体重差异极显著(P <0.01)；GC型与CC型之间的出生重及21、56、63日龄体重差异极显著(P <0.01)， 35、49、77、84日龄体重差异显著(P <0.05)；GG型与GC型个体体重差异不显著。(3)各种基因型个体的皮下脂肪厚、腹脂重、脂肪带宽、胸肌粗脂肪含量、腿肌粗脂肪含量等5种脂肪沉积性状之间均未见显著性差异。     

鸡解耦联蛋白基因型与活性氧含量、初生重的相关性分析

为了研究解耦联蛋白基因(uncoupling protein,UCP)对鸡(Gallus gallus)初生重及活性氧含量的影响,本实验通过对3个品种鸡初生重、UCP C353T多态位点基因型以及肌肉组织活性氧(ROS)含量的测定,发现丝羽乌鸡ROS值显著低于白莱航、寿光鸡,UCP TT基因型ROS值显著高于CT和CC基因型,而ROS含量与雏鸡初生重之间存在着正向的相关性(r=0.5011),UCP TT基因型的初生重显著高于CT和CC基因型。实验结果揭示了鸡UCP基因型对初生重性状具有选择效应。     

江西地方鸡种的AFLP多态性及其群体遗传关系

摘要：利用15对AFLP引物组合,检测了8个地方鸡种(南城黑鸡、余干五黑鸡、崇仁麻鸡、宁都三黄鸡、万载康乐黄鸡、广丰白耳黄鸡、东乡绿壳蛋鸡和泰和丝羽乌骨鸡)、1个培育品种（景德黄鸡）和1个外来鸡种（以色列隐性白羽鸡）池DNA的遗传变异,计算了10个鸡种的遗传相似系数,其中南城黑鸡与余干五黑鸡的遗传相似系数最高（0.7790）,其次为广丰白耳黄鸡与景德黄鸡（0.6726）,崇仁麻鸡和以色列隐性白羽鸡的遗传相似系数最低（0.2801）。在UPGMA聚类关系图中,8个江西地方鸡种及培育鸡种景德黄鸡聚成一大类,其中余干五黑鸡与南城黑鸡、广丰白耳黄鸡与景德黄鸡分别两两相聚,以色列隐性白羽鸡另聚成一类。实验结果表明,江西省地方鸡种和引进品种之间的亲缘关系较远;南城黑鸡和余干五黑鸡的遗传距离最近,两者有着极密切的亲缘关系。结合生产性能、体形外貌及此前RAPD研究结果,认为南城黑鸡和余干五黑鸡可能是“同种异名”。广丰白耳黄鸡和景德黄鸡也表现出较密切的亲缘关系,这与RAPD分析结果及广丰白耳黄鸡是景德黄鸡的原始亲本之一的育种历史相一致。     

Effects of hen egg yolk immunoglobulin in passive protection of rainbow trout against Yersinia ruckeri

Anti-Yersinia ruckeri egg yolk immunoglobulin (IgY) was transferred to egg yolk after immunization of White Leghorn hens with formalin-killed whole cells of serovar 1 (RS1154) and serovar 2 (RS1153)Y. ruckeri and its lipopolysaccharide (LPS). The IgY was specific for its homologous LPS in western immunoblot, whereas some protein bands were commonly recognized, even by IgY from eggs of unimmunized hens. Purified LPS from both Y. ruckeri serovar types 1 and 2 had a very poor immunogenicity. The IgY activity was stable when processed into pellet form by a microbial transglutaminase treatment and showed a considerable resistance against acid pepsin for at least 2 h. Feeding specific anti-serovar 1 Y. ruckeri IgY to fish either before or after immersion infection produced marginal reductions in mortalities and in intestine infection. The same IgY did passively protect rainbow trout against infection when administered by intraperitoneal injection 4 h before an immersion challenge.     

基于改进卷积神经网络的多种植物叶片病害识别

针对训练收敛时间长,模型参数庞大的问题,该文将传统的卷积神经网络模型进行改进,提出一种批归一化与全局池化相结合的卷积神经网络识别模型.通过对卷积层的输入数据进行批归一化处理,以便加速网络收敛.进一步缩减特征图数目,并采用全局池化的方法减少特征数.通过设置不同尺寸的初始层卷积核和全局池化层类型,以及设置不同初始化类型和激活函数,得到8种改进模型,用于训练识别14种不同植物共26类病害并选出最优模型.改进后最优模型收敛时间小于传统卷积神经网络模型,仅经过3次训练迭代,就能达到90%以上的识别准确率;参数内存需求仅为2.6 MB,平均测试识别准确率达到99.56%,查全率和查准率的加权平均分数为99.41%.改进模型受叶片的空间位置的变换影响较小,能识别多种植物叶片的不同病害.该模型具有较高的识别准确率及较强的鲁棒性,该研究可为植物叶片病害的识别提供参考.     

当前我国养鸡生产形势浅析

我国自1988年以来,连续三年养鸡生产持续上升,但从1991年秋开始,养鸡业出现了前所未有的严重滑坡。该文分析了造成滑坡的主要原因,并认为,滑坡造成的后果利大于弊。养鸡业在发展过程中,高峰和低谷的周期性变化总是会有的,希望这种波动来得不要太突然,波动幅度不要大起大落。预测了蛋鸡生产将逐步回升;虽然肉鸡生产的回升要比蛋鸡慢,但从饲料利用效率和改变人民的肉食结构来看,我国的肉鸡生产有很大潜力。     

当前我国养鸡生产形势浅析

我国自1988年以来,连续三年养鸡生产持续上升,但从1991年秋开始,养鸡业出现了前所未有的严重滑坡。该文分析了造成滑坡的主要原因,并认为,滑坡造成的后果利大于弊。养鸡业在发展过程中,高峰和低谷的周期性变化总是会有的,希望这种波动来得不要太突然,波动幅度不要大起大落。预测了蛋鸡生产将逐步回升;虽然肉鸡生产的回升要比蛋鸡慢,但从饲料利用效率和改变人民的肉食结构来看,我国的肉鸡生产有很大潜力。     

Conjugated linoleic acids alter the fatty acid composition and physical properties of egg yolk and albumen

Effects of dietary conjugated linoleic acids (CLAs) and docosahexaenoic acid (DHA) on the fatty acid composition of different egg compartments after storage were studied. Four dietary treatments [supplemented with safflower oil (SAFF, control group), DHA, CLAs plus DHA (CAD), and CLAs alone] were administered to Single Comb White Leghorn (SCWL) laying hens. Eggs from the different treatment groups were collected and stored for 10 weeks at 4 degrees C before analysis. Fatty acids from the yolk (yolk granules and plasma), egg albumen, and vitelline membrane were analyzed by gas chromatography. The yolk of eggs from hens given CLAs had significantly higher amounts of saturated fatty acids, typically 16:0 and 18:0, but lower amounts of polyunsaturated fatty acids (PUFAs) compared to eggs from the control group (SAFF). CLA content was highest in the yolk and present in both neutral and polar lipids, with the greatest concentrations in neutral lipids. DHA was incorporated mainly into yolk polar lipids. Lipids in yolk plasma and granules contained similar amounts of CLAs. The fatty acid compositions of vitelline membrane and egg albumen mirrored that of the egg yolk. CLA supplementation resulted in hard and rubbery yolks when compared to hard-cooked eggs from the control group. This study showed that feeding CLAs to hens led to accumulation of the isomers in polar and neutral lipids of the egg yolk and that these isomers migrated into egg albumen. Because the sensory properties of hard-cooked eggs were negatively affected by the enrichment of a mixture of CLA isomers in this study, further research should be conducted to evaluate how the different isomers alter the properties of egg yolk and albumen so that the quality of designed eggs containing CLAs and DHA can be improved.     

Regioisomerism of triacylglycerols in lard, tallow, yolk, chicken skin, palm oil, palm olein, palm stearin, and a transesterified blend of palm stearin and coconut oil analyzed by tandem mass spectrometry.

Triacylglycerols (TAG) of lard, tallow, egg yolk, chicken skin, palm oil, palm olein, palm stearin, and a transesterified blend of palm stearin and coconut oil (82:18) were investigated by chemical ionization and collision-induced dissociation tandem mass spectrometry. Accurate molecular level information of the regioisomeric structures of individual TAGs was achieved. When existing in a TAG molecule of lard, palmitic acid occupied 90-100% of the sn-2 position. Within the major fatty acid combinations in tallow TAGs, the secondary position sn-2 was preferentially occupied in the decreasing order by oleoyl > palmitoyl > stearoyl residues, the order in saturated TAGs being myristoyl > stearoyl = palmitoyl. TAGs in egg yolk were more asymmetric than in chicken skin, with linoleic acid highly specifically attached in the yolk sn-2 carbon. Nearly 50% of yolk TAGs contained 52 carbon atoms with two or three double bonds. Linoleic, oleic, and palmitic acids were in the sn-2 location in decreasing quantities in palm oil and its fractions. Triacylglycerols of equal molecular weight behaved similarly in the fractionation process. Randomization of the parent oil TAGs was seen in the transesterified oil. The tandem mass spectrometric analysis applied provided detailed information of the distribution of fatty acids in individual combinations in TAGs.