11个鸡品种产蛋性能与产区生态的聚类分析

 利用主成分分析和聚类分析对我国11个地方鸡品种的产蛋性能和生态特征的资料进行了多元统计分析。单独对4项产蛋性能指标进行聚类分析表明,我国11个地方鸡种大致可以分为大型鸡和小型鸡两类;多元统计分析10项指标的结果表明,主成分分析选取前3个特征值作为3个主成分（占总信息量的94.99%）。根据各品种的前3个主成分值计算相似系数,并用最短距离法进行聚类分析,表明11个地方鸡品种可划分为高海拔型和低海拔型两类,这说明了生态因子亦是品种分类中的一个重要依据。     

异地保种地方鸭品种群体结构分析

为检测我国异地小群保种地方鸭群体的遗传结构,利用荧光STR分型技术结合ABI-3730XL型DNA测序平台,对异地小群保种的9个品种在12个位点进行基因分型,利用SPSS19.0对所有等位基因行PCA分析,并使用Structure2.0软件进行群体结构分析。结果显示:12个位点的多态性丰富,共检测到90个等位基因,PCA分析得到8个主成分,前6个主成分对群体分类的累积贡献率达到88.091%。Structure构建的9个群体的遗传分化结构图显示靖西麻鸭与山麻鸭亲缘关系最远,攸县麻鸭与临武鸭距离最近,与PCA分析构建的三维散点图基本一致。     

我国家鸭品种资源遗传多样性保护等级分析

本研究旨在分析我国地方鸭品种资源遗传多样性保护等级,为更好地制定我国地方鸭品种资源保护方案提供理论依据.采用28个微卫星标记计算我国24个地方鸭品种间DR遗传距离、基因流(Nm)、多态信息含量(PIC)和杂合度,并采用Weitzman和Caballero两种遗传多样性保护理论,分析各品种在遗传多样性最大化保护中的相对重要性.结果表明,28个微卫星座位的Ewens-Watterson检验均属选择中立性,各位点平均多态信息含量为0.494 4;三穗鸭(SS)的观察杂合度最高(0.8648),大余鸭(DY)的观察杂合度最低(0.7208),靖西大麻鸭(JXD)的多态信息含量最高(0.581 6),金定鸭(JD)的多态信息含量最低(0.434 7);四川麻鸭(SC)和汉中麻鸭(HZ)之间的遗传距离最远(0.425 7),基因流最小(0.471 1),广西小麻鸭(XL)和靖西大麻鸭之间的遗传距离最近(0.166 4),基因流最大(1.380 8).Weitzman保护理论分析中,临武鸭(LW)、四川麻鸭(SC)、高邮鸭(GY)和北京鸭(BJ)的贡献率较高(>5.0%);Caballero保护理论分析中,绍兴鸭(SX)、四川麻鸭、巢湖鸭(CH)和兴义鸭(XY)具有较高的正贡献率(>0.2%),与Weitzman保护理论确定的等级顺序存在一定差异,主要原因是Weitzman保护理论没有考虑到品种内遗传多样性.在分析我国地方鸭品种资源遗传多样性保护等级时,应充分考虑品种问遗传多样性和品种内遗传多样性.绍兴鸭、四川麻鸭、巢湖鸭、兴义鸭、高邮鸭、临武鸭、汉中麻鸭、沔阳麻鸭(MY)、荆江麻鸭(JJ)、三穗鸭、恩施麻鸭(ES)、北京鸭、淮南麻鸭(HN)、云南麻鸭(YN)、攸县麻鸭(YX)、微山麻鸭(WS)16个品种对我国家鸭资源总体遗传多样性具有较高的贡献率,在品种资源保护中应当给予优先保护等级.     

基于主成分分析法建立鸭肉质的评估模型

对金定鸭、樱桃谷鸭、苏牧麻鸭和番鸭的失水率(X1)、剪切力(X2)、pH值(X3)、肉色(X4)、粗脂肪((X5)、多不饱和脂肪酸(PUFA,X6)、必需脂肪酸/(EFA,X7)、肌原纤维直径(X8)等8个肉质指标进行了测定,运用主成分分析对肉品质指标进行分析,并建立了主成分综合评价模型(y=-0.301zx1+0.367zx2-0.033zx3-0.223zx4-0.342zx5+0.250zx6+0.249zx7+0.267zx8).结果表明,选取前2个特征值作为2个主成分(累计贡献率达到85.15％),基本上反映了原所有肉质指标包含的全部信息;番鸭主成分综合得分最高,其次分别为金定鸭、苏牧麻鸭,樱桃谷鸭表现较低,结果与预期完全吻合.     

6个地方鸭品种蛋品质测定与分析

为阐明不同鸭品种间蛋品质的差异,以绍兴鸭、攸县麻鸭、荆江麻鸭、云南麻鸭、山麻鸭、金定鸭6个品种的鸭蛋为材料,对其蛋品质、金属元素含量、氨基酸含量进行测定。结果表明:不同品种的鸭蛋蛋品质参数存在显著差异。云南麻鸭的蛋黄色泽以及蛋黄的重量显著高于其他5个品种的鸭蛋(P0.05)。攸县麻鸭在蛋白高度和哈氏单位上显著高于其他5个品种(P0.05)。蛋品质性状间相关系数分析显示,蛋黄的重量与蛋形呈显著正相关(P0.05),与蛋黄色泽呈极显著正相关(P0.01),而与蛋白高度、哈氏单位呈显著负相关(P0.05);氨基酸含量与蛋形呈显著负相关(P0.05)。对性状标准化数据进行主成分分析,可提取3个主成分,累计贡献率达到91.65%,建立的鸭蛋品质主成分综合评价模型(Y=0.266zx_1-0.283zx_2+0.357zx_3+0.238zx_4+0.114zx_5-0.110zx_6+0.200zx_7)可最大限度反映蛋品质的综合水平。     

中国地方鸡品种生态因子及生产性能因子分析及系统聚类

为研究生态因子、体重体尺及屠宰性能对中国地方鸡品种聚类影响,采集110个中国地方鸡品种所在地5个生态因子,8个体重体尺和7个屠宰性状共计35个指标,利用主成分分析法提取出10个主因子,包括2个生态因子(累积贡献率为80.60%),公母鸡各1个体重体尺因子(累积贡献率分别为62.70%和56.819%)和3个屠宰性能因子(累积贡献率分别为80.40%和81.29%)。利用所提取的10个主因子对110个地方品种鸡进行聚类分析,结果显示110个地方鸡品种根据体型大小以及所生长地区生态环境等分为明显南方小型、南方中等偏小型、南方中等偏大型、北方高寒高海拔型和南北方大体型五种类型。     

我国6个地方鸭种的群体结构分析

为深入揭示我国地方鸭种的群体遗传结构,本研究利用荧光标记微卫星引物结合ABI-3730XL型DNA测序平台,对国家级水禽基因库(泰州)保存的6个品种鸭(426只)在12个位点上的等位基因进行STR分型,利用SPSS19.0和Structure2.0软件对群体结构进行分析。结果表明:12个座位的多态性丰富,共检测到88个等位基因,PCA分析得到6个主成分,前4个主成分对群体分类的累积贡献率达到88.091%。Structure程序成功构建出了6个群体的遗传分化结构图和群体的独立类群分布图,推断6个群体在所属推断类别中的平均基因组分数分别为93.88%、96.08%、90.89%、93.01%、88.67%、92.65%;且未发现有个体发生迁移。Structure程序构建的系统发育树进一步显示临武鸭与攸县麻鸭、高邮鸭与山麻鸭和广西小麻鸭的遗传距离较近。     

基于主成分分析法建立鸭一般抗病力的评估模型

研究对家鸭(金定鸭、樱桃谷鸭、苏牧麻鸭)、番鸭、半番鸭的白蛋白(X1)、球蛋白(X2)、总蛋白(X3)、IgA(X4)、IgM(X5)、IgG(X6)和AI抗体HI效价(X7)等7个免疫指标进行测定,并对这7个免疫指标进行主成分分析。结果表明:选取前2个特征值作为2个主成分(累计贡献率达到90.70%),基本上反映了原所有免疫指标包含的全部信息;通过建立主成分综合评价模型,比较5个群体主成分综合得分,金定鸭得分最高,其次分别为樱桃谷鸭、番鸭,苏牧麻鸭、半番鸭表现较低。     

微卫星标记法分析9个鸭群体的遗传多样性

为了对巢湖麻鸭、枞阳媒鸭、大余麻鸭、荆江麻鸭、靖西大麻鸭、广西小麻鸭、高邮鸭、吉安红毛鸭和苏牧鸭等9个肉用型(兼用型)的鸭群体遗传多样性进行系统评价,试验选择12个成熟的微卫星位点对9个肉用型(兼用型)鸭群体的遗传多样性进行测定和聚类分析。结果共检测到142个等位基因位于12个成熟的微卫星位点上,多态信息含量(PIC)介于0.275 5～0.832 6之间,其中有8个座位为高度多态位点,剩余4个座位为中度多态位点;9个鸭群体在微卫星座位上的平均杂合度在0.408 6～0.559 0之间,大余麻鸭的PIC最高达到了0.6091,吉安红毛鸭的PIC最低达到了0.499 4;荆江麻鸭和巢湖麻鸭的遗传距离(DA)最近,为0.095;苏牧鸭和其它鸭群体的遗传距离都较远,并且苏牧鸭和高邮鸭的遗传距离最远,达到0.319;聚类分析将9个鸭群体分为三大类,其中巢湖麻鸭、荆江麻鸭、枞阳媒鸭、靖西大麻鸭以及大余麻鸭先后聚为一类;高邮鸭首先和吉安红毛鸭聚为一类,接着与广西小麻鸭聚为一类;而苏牧鸭被单独分为一类。结果表明9个鸭群体中遗传多样性较为丰富,遗传变异程度以中等水平为主,为今后我国肉用型地方鸭品种资源的合理开发和科学杂交利用提供更加准确的数据。     

中国6个地方鸭品种蛋品质比较

本研究测定了处于产蛋高峰6个地方鸭品种同一天各30枚种蛋的蛋重、壳重、蛋黄重、蛋白重、膜重、蛋黄蛋白比、哈氏单位、蛋壳厚度、蛋黄色泽、蛋形指数、蛋壳强度等11项蛋品质的指标。结果表明:高邮鸭除哈氏单位稍低外,其他10项指标均比其他5个鸭品种高;11项指标主成分分析说明了蛋重是蛋品质的一个重要指标,6个鸭品种分别依特征值排序的结果中,由前到后顺序为:高邮鸭、金定鸭、莆田黑鸭、山麻鸭、攸县麻鸭、连城白鸭。研究结果为进一步开发利用品种资源提供了参考依据。