肉山羊体重及体尺随机扩增多态DNA标记研究

利用RAPD技术研究了RAPD标记与肉山羊体重及体尺的相关性。结果表明 ,RAPD标记OPO0 2 1,OPO0 71,OPQ0 6 2和OPQ0 6 5不仅与肉山羊体重有显著或极显著相关 ,而且与体重呈显著相关的体尺间也同时存在显著或极显著的相关 ,特别是OPQ0 6 2和OPQ0 6 5对体重和体尺影响较大 ;标记OPQ16 4 ,OPQ182 ,OPQ0 6 4 ,OPP0 4 4 ,OPQ0 6 3,OPP173,OPQ16 2 ,OPO113和OPO15 1与各项体尺存在显著或极显著相关     

RAPD技术在苜蓿耐盐遗传育种中的应用

以中苜一号苜蓿和繁盐苜蓿大西洋为材料,应用RAPD技术,对14组280条随机引物进行筛选,结果表明:OPW三条引物、OPV三条引物、OPM四条引物、OPT五条引物、OPQ五条引物、OPZ三条引物、OPP三条引物、OPK三条引物、OPL一条引物、OPO七三条引物,共37条都呆作炎DNA多态性引物,为耐盐苜蓿的耐盐基因分子遗传标记的研究奠定了基础。     

利用SSR、ISSR和RAPD技术构建苜蓿基因组DNA指纹图谱

在建立可靠的苜蓿基因组DNA提取分离和PCR扩增技术体系的基础上,筛选具有稳定多态性位点的RAPD、SSR和ISSR引物,建立苜蓿基因组DNA的SSR、ISSR和RAPD分子标记技术体系,并利用分子标记检测苜蓿品种(系)的DNA分子标记多态性,构建苜蓿品种的DNA指纹图谱.筛选出36个RAPD引物,8个SSR引物和12个ISSR随机引物,通过PCR扩增在55个国内外苜蓿品种(系)中获得了182个RAPD多态性位点和丰富的SSR和ISSR多态性位点,构建了55个苜蓿品种(系)的SSR、ISSR和RAPD指纹图谱.结果表明,不同苜蓿品种(系)的SSR多态性有较大差异;苜蓿品种ISSR指纹图谱多态性丰富,稳定性比RAPD强;可以通过2～3个引物鉴别我国主要苜蓿品种和引进品种,SSR和ISSR指纹图谱可以更好地用于苜蓿品种鉴定和遗传多样性分析.     

以随机扩增多态性DNA(RAPD)技术筛选意大利蜜蜂重要农艺性状遗传标记

为了获得意大利蜜蜂重要农艺性状的分子遗传标记 ,本研究以 30种RAPD随机引物对平湖浆蜂、美意、澳意、苏意等 4个在产浆、采蜜和抗病性上存在较大差异的意蜂品系的基因组DNA进行RAPD_PCR扩增筛选。试验结果显示 ,随机引物W 1 8(5′_CGGACGGCGG_3′)和W2 3(5′_GTACCGCCCG_3′)的扩增图谱呈多态性。其中 ,在引物W 1 8所扩增出的 9条片断中 ,2 35 2bp和 36 4bp条带为美意所特有 ,表明可将之用于鉴别美意 ;2 0 92bp条带仅出现于蜂蜜高产的美意和澳意中 ,意味着该条带为一个蜂蜜高产性状的遗传标记 ;而 6 32bp条带在王浆高产品系平湖浆蜂中出现的频率 (0 91 )显著高于 (P <0 0 1 )美意(0 0 4 )、澳意 (0 0 2 )和苏意 (0 0 0 ) ,说明 6 32bp条带可能为王浆高产性状的一个遗传标记。在W2 3引物扩增条带中 ,6 5 1bp条带为澳意所特有 ,可用于澳意鉴别     

RAPD分子标记在蜜蜂遗传育种中的应用

利用RAPD分子遗传标记，估测蜜蜂性别决定位点（x)与低幼虫存活率位点的标记序列位置（STS）之间的遗传距离为1．6c.M；构建蜜蜂的遗传连锁图，确定蜜蜂的性基因位点（x)，黑色体色基因位点（blk)，苹果酸脱氢酶I(Mdh-l)位点分别位于第三，六，十八个连锁群，确定了影响蜜蜂采粉，报警信息素水平，螯刺行为和体长等数量性状的基因座位，筛选出5种引的，这些引物所扩增的RAPD标记可作为鉴别欧洲蜜蜂和非洲蜜蜂的分子标记；蜜蜂高产性状RAPD标记的研究取得一定进展。     

EAV/DNA指纹图谱条带J与OPAY02型标记对新扬州鸡体质量和生长影响的联合研究

随机选择新扬州鸡大型系和小型系交后代48只，联合研究EAV／DNA指纹图谱带J与OPAY02型2种分子遗传标记与新扬州鸡体质量和生长的关系，结果表明，8、10、26周龄新扬州鸡体质量在2种分子标记的不同组合间比较均存在极显著的差异，尤其是J^-S1^-S2^＋产条带组合遗传标记，8、10、26周龄新扬州鸡体质量均显著或极显著地高于其他JS1S2组合，根据数量性状多基因假说，可以推测J、S1和S2可能是影响鸡增重的多基因，2种分子遗传标记组合J^-S1^-S2^＋遗传标记有望成为鸡体质量选择的遗传标记。     

分子标记与地方猪品种的遗传多样性研究

分子标记已成为目前家畜遗传多样性研究的主要工具.本文简要综述了多种分子标记(RFLPs, mt-DNA, RAPD, DNA指纹图谱,微卫星DNA,AFLP,SNPs)的检测方法及其在地方猪品种遗传变异和遗传关系检测分析中的应用,为类似研究提供参考材料.     

近交系小鼠RAPD标记的观察

采用随机扩增多态性DNA技术(RAPD),分析BALB/c、C57BL/6、DBA/2、C3H/He等4个近交系小鼠的基因多态性,探讨用RAPD作为遗传标记,对近交系小鼠进行遗传检测。结果表明,4种小鼠表现出了各自不同的多态性RAPD标记,证明RAPD可作为近交系小鼠的分子标记,在DNA水平区别4种近交系小鼠。     

微卫星标记及其在羊遗传育种中的应用

微卫星DNA(Microsatellite DNA)与其他DNA分子标记相比较,具有数量多、分布广且均匀、多态性丰富、呈孟德尔共显性遗传、易于检测、分析快速方便等一系列优点,并在动植物遗传多样性评估、遗传连锁图谱构建、绘制系统发生树、QTL定位、标记辅助选择、疾病诊断及血缘关系鉴定等研究领域中得到广泛应用.本文就微卫星标记及其在羊品种遗传育种中的应用作一综述.     

微卫星标记及其在羊遗传育种中的应用

微卫星DNA (Microsatellite DNA)与其他DNA分子标记相比较,具有数量多、分布广且均匀、多态性丰 富、呈孟德尔共显性遗传、易于检测、分析快速方便等一系列优点,并在动植物遗传多样性评估、遗传连锁图谱构建、 绘制系统发生树、QTL定位、标记辅助选择、疾病诊断及血缘关系鉴定等研究领域中得到广泛应用。本文就微卫星标记 及其在羊品种遗传育种中的应用作一综述。     

基于SRAP分子标记构建的菊苣遗传连锁图谱

基于SRAP标记,以遗传关系和表型差异大的菊苣亲本PI 651947和PI 652007杂交获得的84个F₁单株为作图群体,进行连锁图谱的构建。采用Map Manager QTX b20软件进行连锁分析,分别构建了PI 651947和PI 652007的分子连锁框架图,共获得77个SRAP标记,其中父本遗传图谱涉及4个连锁群,包含19个标记,图谱总长为450.9 cM,标记间平均图距为23.7 cM。母本遗传图谱涉及13个连锁群,包含58个标记,图谱总长为1404.8 cM,标记间平均图距为24.2 cM。研究结果可为菊苣重要农艺性状QTL定位奠定基础,为菊苣分子育种研究提供了基础信息。     

四倍体马铃薯SRAP分子遗传连锁图谱的构建

为了给后期马铃薯块茎高淀粉、高干物质及产量等重要数量性状基因座(QTL)定位和分子标记辅助育种奠定基础,以四倍体马铃薯YSP-4×MIN-021杂种F1的182个分离单株为作图群体,利用相关序列扩增多态性(SRAP)分子标记进行了遗传图谱构建研究。试验从357对SRAP引物中筛选出适宜引物36对。用这些引物对马铃薯杂种F1的182个分离单株及其亲本的基因组DNA进行PCR扩增得到598个SRAP标记。卡方检验显示偏分离标记数为127个,其中母本连锁群59个,父本连锁群68个,偏分离比率均小于30%,符合遗传作图的要求。用软件JoinMap4.0建立了2张四倍体马铃薯双亲的SRAP遗传图谱。母本YSP-4的连锁群总长度为1572.2cM,标记数目为274个,平均间距为5.74cM,12个连锁群的长度范围为14.03~214.44cM;父本MIN-021的连锁群总长度为1932.23cM,标记数目为324个,平均间距为5.96cM,各连锁群的长度范围为93.65~242.06cM。     

多花黑麦草遗传连锁图的构建

利用多花黑麦草(Loliummu ltiflorum)细胞质雄性不育(CMS)F₁群体(124个个体),以来自父本和母本的分离位点采用SSR、AFLP、EST-CAPS(表达序列标签酶切扩增多态性)和RGA-CAPS(抗病基因类似物酶切扩增多态性)等标记方法进行多态性的选择并对父、母本分别构建遗传连锁图。母本连锁图包含362个标记位点,分别包含SSR标记240个、AFLP标记84个、EST-CAPS标记24个和RGA-CAPS标记14个,由7个连锁群组成,覆盖全长776.4cM,各连锁群长度在85.8至135cM之间,相邻标记之间的平均距离为2.14cM;父本7个连锁群,包含376个标记,其中SSR标记252个、AFLP标记82个、EST-CAPS标记29个和RGA-CAPS标记13个,连锁图全长710.0cM,相邻标记之间的平均距离为1.89cM;标记密度高、标记分布均匀、连锁图长度中等。     

利用RAPD技术构建四倍体苜蓿遗传连锁图谱

 利用随机扩增ＤＮＡ 多态性分子遗传标记（ＲＡＰＤ）对Ｆ₂ 群体进行分析。Ｆ₂ 群体由Ｆ_１ 群体（高产紫花苜蓿×高抗黄花苜蓿得到Ｆ_１代）自交获得。应用ＭＡＰＭＡＫＥＲ／ＥＸＰ（３．０）与ＪｉｏｎＭａｐ４．０并结合ＭａｐＤｒａｗＶ２．１软件构建四倍体苜蓿的遗传连锁图谱。从１９２个随机引物中筛选出７２个引物,对９４个Ｆ_２ 个体及Ｆ_１ 双亲ＤＮＡ 样本进行了ＲＡＰＤ 扩增,共获得５１个ＲＡＰＤ 标记,构建了四倍体苜蓿分子遗传连锁框架图,其中包含８个连锁群,标记覆盖的基因组总长度约为１２６１．５ｃＭ,标记间平均距离为２４．７３ｃＭ。本图谱为构建饱和的四倍体苜蓿分子遗传图谱提供了框架结构,为进一步开展苜蓿分子遗传方面的研究奠定了基础。     

A Male Genetic Map Designed for Quantitative Trait Loci Mapping in Norwegian Cattle

A male bovine linkage map was constructed using six half-sib families of the Norwegian Cattle population. The family material consisted of six sires and 285 sons, with the number of sons per sire ranging from 32 to 71. Of the 288 markers analysed, 261 were anonymous microsatellites and 27 were coding genes. Eleven of the coding genes were mapped by a two-step procedure involving intron/exon sequencing in the six sires and development of polymerase chain reaction-based methods for efficient genotyping in heterozygous families. Linkage analysis including both informative and non-informative sons was performed in order to obtain unbiased estimates of recombination fractions. The autosomal genome length of the Norwegian Cattle Map (NCM) was estimated as 2682 cM, with an average interval of 12.5 cM. The map provides sufficient marker density for scanning the whole bovine genome to locate quantitative trait loci. The large number of common markers between NCM and previously published maps will contribute to the comparison and integration of bovine maps.     

四倍体彩色马铃薯花青素含量及产量性状的QTL定位

为确定彩色马铃薯薯块花青素含量、单株产量和商品薯率3个重要性状的QTL位点,以四倍体彩色马铃薯‘黑美人’בMIN-021’杂种F₁代分离群体的210个单株无性株系及其亲本为材料,通过对这3个重要性状进行两年一点的观测试验,以及亲本间和杂种株系间的差异显著性分析,用TetraploidMap软件在已构建出的2张双亲的高密度彩色马铃薯分子遗传连锁图谱上分别定位其QTL。结果显示,这3个性状在亲本间和杂种株系间差异显著,且F₁群体单株株系间各性状观测值均呈正态分布,适合QTL分析。在母本‘黑美人’的遗传连锁图谱上检测到13个QTL,其中控制花青素含量的有5个、单株产量和商品薯率各有4个,遗传贡献率变幅为7.98%~19.62%。在父本‘MIN-021’的遗传连锁图谱上检测到11个QTL,其中花青素含量和单株产量各有4个、商品薯率有3个,遗传贡献率范围在8.70%~21.62%之间。     

对家蚕第2隐性赤蚁基因(ch-2)的SSR标记定位及连锁分析

家蚕蚁蚕体色突变之一的第2隐性赤蚁(ch-2)有作为特殊遗传系统的实用价值。采用家蚕正常黑蚁品种P50和第2隐性赤蚁品种k04为亲本组配正反交群体,回交后获得回交群体(k04×P50)×k04和k04×(k04×P50),分别记作BC1F和BC1M,基于雌性家蚕的W与Z染色体不发生交换的特点,用已构建的家蚕SSR分子标记连锁图谱对ch-2基因进行定位和连锁分析。在第18连锁群上的20个多态性标记中共筛选出7个与ch-2基因连锁的SSR标记。根据第18连锁群上已有但不表现多态性的微卫星序列,寻找其所在Scaffold上的其他SSR位点并设计引物,结果找到2个新的多态性SSR标记。BC1F群体中的所有黑蚁个体均表现出与F1(k04×P50)相同的杂合型带型,而所有赤蚁个体带型与亲本k04一致,为纯合型,说明家蚕ch-2基因位于第18连锁群。利用另一个群体BC1M构建了ch-2基因的SSR分子标记遗传连锁图,连锁图的遗传距离为70.7cM,ch-2基因位于69.6 cM处。2个与ch-2最近的SSR标记为S1814和S1819,与ch-2的距离分别为7.9、1.1 cM。     

南江黄羊体重体尺性状的RAPD分析研究

选用4种扩增多态性良好的RAPD引物,对45只南江黄羊基因组DNA进行PCR扩增,对多态标记结果应用SPSS统计之星软件进行统计分析。结果表明:南江黄羊基因组多态频率为84%。RAPD多态标记条带与体重紧密连锁的标记有CY0816引物扩增的ABCF片段和F09引物扩增的ABDF片段,这两种标记组合对体重的贡献率分别为32.6%和28.9%;与体长(A1)、胸围(A3)和胸深(A5)紧密连锁的标记有CY0816引物扩增的ABF片段和F09引物扩增的ABEF片段,其贡献率均在24.2%～28.9%之间。     

A male linkage map constructed for QTL mapping in Spanish Churra sheep.

A male ovine linkage map has been constructed on the basis of 11 half-sib families of a commercial population of Spanish Churra sheep as part of a genome scan for quantitative trait loci mapping. A total of 1421 daughters and their sires were genotyped for 182 microsatellite markers evenly distributed along the ovine autosomes. A total of 259,192 genotypes were obtained, generating an average of 669 informative meioses per marker. An autosomal genome length of 3262 cM was estimated for the Churra population with a mean marker interval of 17.86 cM. Our map represents an approximate 90% coverage of the autosomal ovine genome and constitutes a useful tool for the genetic dissection of complex traits in this breed. General agreement was found between the Churra map and other published maps for sheep, despite certain length discrepancies.