基于网络药理学的人参、红参、黑参、人参叶、西洋参和三七抗心力衰竭的作用机制及活性成分研究

目的利用网络药理学的研究方法探究人参、红参、黑参、人参叶、西洋参和三七治疗心力衰竭的作用机制及不同药性的药物治疗心力衰竭的差异性。方法利用TCMIP v2.0、Swiss Target Prediction数据库并结合文献挖掘筛选各药物的成分及作用靶点;GeneCards、OMIM等数据库筛选有关心力衰竭靶点;取交集后将交集靶点通过String数据库构建靶点蛋白互作网络;运用GO、KEGG数据库对靶点基因信号通路分析;由Cytoscape.v3.7.2构建网络并挖掘人参、红参、黑参、人参叶、西洋参和三七治疗心力衰竭的作用机制并赋值法比较不同药性的药物治疗心力衰竭的差异。结果人参活性成分64种,红参活性成分30种,人参叶活性成分27种,西洋参活性成分26种和三七活性成分40种;各药物治疗心力衰竭潜在靶点分别为157、108、96、80、93、106个。GO功能富集显示各药物生物功能主要集中在炎症反应的调节、蛋白激酶活性等方面;KEGG通路富集显示各药物治疗心力衰竭主要涉及蛋白多糖、EGFR酪氨酸激酶抑制剂耐药性通路、PI3K-AKT等信号通路。对各药物成分、靶点、通路赋值得到温热性药物治疗心力衰竭的主要成分为人参皂苷Rh3等,主要靶点为CDK8、AGTR1、GYS1、MMP1,主要通路为脂质与动脉粥样硬化通路;寒性药物治疗心力衰竭的主要成分为人参皂苷Rh6等,主要靶点为CYP1A2、EPAS1、ATP1A3、ATP1A,主要通路为受体活化通路。结论通过构建“活性成分-靶点-信号通路-疾病”网络和赋值分析法,从多成分、多靶点、多通路角度阐释人参、红参、黑参、人参叶、西洋参和三七治疗心力衰竭的作用机制,分析比较不同药性治疗心力衰竭的的差异性,为后续研究中药传统功效提供了新的思路与基础。     

基于网络药理学探究百合治疗肺癌的作用机制

目的 利用网络药理学的方法探讨百合治疗肺癌多靶点,多成分,多通路的作用机制。方法 通过TCMSP数据库检索出百合化学成分,筛选出化学成分的蛋白靶点,从UniProt数据库获得蛋白靶点的简称,Gene Cards数据库、DisGe NET数据库查找到疾病靶点。利用Venny2.1.0数据库,筛选药物和疾病的交集,并将交集靶点导入STRING网站分析,STRING数据库构建PPI靶点互作图,将数据导入Cytoscape靶点构建蛋白质相互作用网络(PPI),确定出核心靶点,借助Cytoscape3.7.0软件构建药物-成分-作用靶点网络。通过Metascape分析网站进行KEGG和GO富集分析。结果在TCMSP共获得化学成分84个,甄别后确定16个化学成分、80个靶点蛋白。通过GeneCard和DisgeNeT检索得到疾病靶点5702个。得到57个药物和疾病的交集靶点。构建药物-成分-靶点网络图,进行分析得到degree值较高的四个成分,分别是西多糖苷、大黄素、β-谷甾醇,豆甾醇。筛选得到TNF、TP53、MYC、JUN、ESR1等核心靶点。获得p53信号通路、PI3K-Akt信号通路、MAPK信号通路、Ras信号通路、TNF信号通路、NF-kappa B信号通路等。结论 网络药理学分析结果表明百合可通过多通路以及作用于多靶点来治疗肺癌,西多糖苷、大黄素、β-谷甾醇、豆甾醇等核心成分可能调节TNF、TP53、MYC、JUN、ESR1核心靶点来发挥作用。     

基于网络药理学研究五味子抗心力衰竭作用

目的 运用网络药理学方法系统研究五味子治疗心力衰竭（HF）的作用机制。方法 通过检索TCMSP数据库筛选五味子化学成分,构建药物-成分-靶点网络图。通过GeneCards数据库收集HF疾病靶点,将五味子与HF相关的靶点取交集,得到五味子治疗HF的靶点。通过STRING数据库构建交集基因的蛋白互作网络（PPI）,应用Cytoscape3.9. 2软件分析PPI网络中核心靶点,然后进行GO功能富集分析和KEGG通路富集分析,构建“成分-靶点-疾病-通路”网络。结果发现五味子中8个化学成分,包括当归酰基戈米辛、五味子乙素、五味子醇乙、戈米辛R、五味子丙素、戈米辛R等和11个潜在作用靶点,ACHE、CHRM2、PTGS2、CHRM1、AR、KCNMA1、NR3C2、F2R、DPP4、NOS3、F10参与治疗HF作用。GO功能和KEGG通路富集分析结果显示这11个作用靶点主要涉及95个生物过程通路,与8条代谢通路相关。结论 基于网络药理学对五味子治疗心力衰竭（HF）的初步研究表明,五味子可通过多成分、多靶点干扰多条信号通路发挥治疗HF的效果,为阐述五味子治疗HF潜在作用机制提供理论依据。     

基于网络药理学和分子对接研究黄芪-丹参配伍治疗糖尿病溃疡的作用机制

目的基于网络药理学和分子对接验证探讨黄芪-丹参药对治疗糖尿病溃疡(Diabetic Ulcer)的作用机制。方法利用中药系统药理平台(TCMSP)和Uniprot数据库对人类已验证的黄芪-丹参药物作用靶点及有效成分进行筛选;通过检索人类基因数据库(GeneCards)和人类孟德尔遗传研究平台(OMIM)获取糖尿病溃疡的疾病靶点;筛选药物与疾病交叉靶点,应用Cytoscape软件构建“药物-成分-靶点”网络图;利用STRING平台搭建蛋白质互作网络(PPI);利用微生信平台进行KEGG通路分析和GO功能富集分析。基于Autodock和Pymol软件进行主要活性成分和关键靶点分子对接验证。结果本次研究包括46个化合物和152个关键作用靶点。通过拓扑分析得出主要活性成分槲皮素、山奈酚和木犀草素等治疗糖尿病溃疡可能与AKT1、TP53、TNF、IL6和VEGFA等蛋白密切相关,并通过血脂与动脉粥样硬化信号通路、TNF信号通路和IL-17信号通路等信号通路发挥主要作用。分子对接表明其主要活性成分与关键靶点具有良好的稳定性。结论通过网络药理学及分子对接验证了黄芪-丹参药对具有治疗糖尿病溃疡的效果,并对其治疗的作用机制进行了预测。     

基于网络药理学探究林蛙油治疗慢性咳嗽的作用机制

目的利用网络药理学研究方法,探讨中药林蛙油中治疗慢性咳嗽的活性成分、作用靶点及相关通路,探究其作用机制。方法利用中国知网分别以林蛙油、哈蟆油、蛤蟆油为检索词进行检索,在已发表的相关研究文献中查找中药林蛙油的主要成分并进行筛选。利用GeneCards数据库、Online Mendelian Inheritance in Man(OMIM)疾病数据库以及Drugbank数据库查找慢性咳嗽的疾病靶点并汇总。利用String网站软件构建蛋白质相互作用网络图。利用Metascape网站对林蛙油的药物靶点进行GO分析以及KEGG通路富集分析,并构建药物-有效化合物-通路-作用靶点网络图,确定中药林蛙油治疗慢性咳嗽的关键靶点。结果林蛙油治疗慢性咳嗽的关键靶点有AKT1、IL6、EGFR等12个,关键通路PI3K-Akt、AGE-RAGE等10条信号通路。结论综合林蛙油对慢性咳嗽的治疗机制研究,利用网络药理学方法推测,林蛙油通过多成分、多靶点治疗慢性咳嗽,并且有多条通路与慢性咳嗽疾病通路相匹配,所以中药林蛙油具有一定慢性咳嗽的治疗作用。     

基于网络药理学探讨虎眼万年青治疗癌症的作用机制

目的 使用网络药理学方法预测虎眼万年青治疗癌症（Cancer）的药理作用机制。方法 通过中药系统药理学数据库检索虎眼万年青活性成分,使用SwissADME数据库对其活性成分的靶点进行分析预测,使用PharmgKb、OMIM、DrugBank数据库获取与癌症相关的靶点基因,采用Cytoscape3.7.0软件构建“成分靶点网络”及“蛋白质互作网络”,对关键活性组分进行筛选。通过Metascape数据库,对关键靶点的GO及KEGG通路进行富集分析;最后探讨“活性成分-靶点-信号通路”的关系。结果 预测到虎眼万年青的活性成分靶点430个,Cancer相关靶点476个,相互作用的交集靶点蛋白74个,研究得到虎眼万年青化学成分对癌症的治疗作用主要是通过如下信号通路：Pathways in cancer、PI3K-Akt signaling pathway、Prostate cancer、Focal adhesion、Ras signaling pathway、MicroRNAs in cancer、Chemical carcinogenesis-receptor activation、Lipid...     

基于网络药理学和分子对接验证探讨黄芪--大黄治疗糖尿病肾病的作用机制

目的 使用网络药理学方法探讨黄芪-大黄药对治疗糖尿病肾病的关键靶点基因及其潜在作用机制。方法从TCMSP数据库中筛选出黄芪-大黄药对有效组分及相应靶点,通过GeneCards、OMIM、Drugbank数据库得到糖尿病肾病靶点,使用Cytoscape3.7.0软件构建“药对-有效组分-交集靶点”网络图,将交集靶点上传至STRING数据库构建PPI网络图,利用Cytoscape3.7.0软件筛选关键靶点。在Metascape数据库分别进行GO和KEGG富集分析,使用在线作图网站微生信将结果可视化,并进行分子对接验证。结果 筛选得到黄芪-大黄药对中活性成分23种,对应潜在作用靶点354个,药对治疗糖尿病肾病可能与槲皮素、山奈酚、7-O-甲基异丙醇胺、β-谷甾醇、芒柄花黄素等有效成分有关,其发挥重要作用的交集靶点可能为AKT1、TP53、TNF等。KEGG富集表明主要与糖尿病并发症中的衰老信号通路、IL-17信号通路有关。分子对接表明其主要活性成分与关键靶点具有良好的稳定性。结论 本研究初步揭示了黄芪-大黄药对多种成分、多个靶点和多条通路相互作用治疗糖尿病肾病的机制,为糖尿病肾病治疗提供理论基础。     

基于HPLC指纹图谱及内含成分结合网络药理学的雨花茶抗肿瘤机制研究

利用高效液相色谱（HPLC）对不同产地雨花茶中儿茶素组分进行分析与评价，并基于中药网络药理学探讨雨花茶抗肿瘤的潜在作用机制。采用HPLC法建立12批雨花茶的指纹图谱并对其进行含量测定。基于TCMSP、Swiss Target Prediction、PubChem和UNIPROT数据库获取雨花茶中7个成分的靶点信息并导入Cytoscape软件构建成分-靶点网络，借助蛋白互作网络得到核心靶点，对核心靶点进行GO生物过程富集、KEGG通路富集，构建雨花茶抗肿瘤的主要成分-核心靶点-主要通路的网络。结果表明，不同产地雨花茶中儿茶素组分具有一定差异，表没食子儿茶素没食子酸酯为含量最高成分。网络药理学结果显示雨花茶中7个成分主要作用于134个靶点、165条通路发挥抗肿瘤作用，包括转录与凋亡相关的JUN、STAT3、MAPK3、TP53、MAPK1、FOS、ESR1、SP1及血管生成相关的HIF1A和炎症相关的RELA。本研究建立了不同产地雨花茶HPLC指纹图谱和多成分含量测定方法，可为雨花茶等的质量评价提供参考。雨花茶中多成分主要通过促凋亡、抗炎、抗氧化、抗缺氧等多种机制，产生抗肿瘤效应。     

茶叶抗癌作用机制的网络药理学分析

目的:通过网络药理学的方法探究茶叶抗癌的作用机制,为揭示茶叶抗癌的科学内涵提供新思路.方法:通过中国知网进行文献研究,收集茶叶中主要的化学成分;利用化源网检索进一步确定各个化学成分的化学结构式,并使用ChemBioDraw软件手动画取;将取得的化学结构式导入SwissTargetPrediction数据库预测成分的作用靶点;利用Genecards和Drugbank两个数据库获取癌症相关靶点;通过String数据库构建PPI网络,并根据Degree值的大小筛选核心靶点;采用Metascape数据库对核心靶点进行GO及KEGG富集分析.结果:通过文献研究最终纳入茶叶中13个化学成分,共预测出165个作用靶点;纳入癌症相关靶点3350个;通过PPI确认IL6、VEGFA、TNF等40个核心靶点;GO生物功能富集分析发现,积极调控细胞迁移、调节平滑肌细胞增殖、对氧气水平的反应等生物过程;膜筏、细胞质核周区域、转录因子复合体等细胞组成;细胞因子受体结合、内肽酶活性、蛋白磷酸酶结合等分子作用;KEGG信号通路结果显示,主要涉及多种癌症的相关通路、PI3K-Akt信号通路和NF-κB信号通路等.结论:茶叶中儿茶素及其酯类衍生物可能是起抗癌作用的主要成分,多成分多靶点的综合调控是茶叶发挥药效物质基础的主要优势.     

基于网络药理学探究柴胡-黄芩药对治疗高血压的作用机制

目的利用网络药理学研究方法,探讨药对柴胡-黄芩治疗高血压的的活性成分、作用靶点及相关通路,探究其作用机制。方法利用中药系统药理学数据库(TCMSP)获取柴胡和黄芩的主要活性成分,利用Uniprot数据库将靶点信息进行基因标准化处理,通过GeneCards、OMIM和Drugbank数据库查找高血压的疾病靶点,与Uniport数据库进行对比与筛选,取药物和疾病的交集靶点,将交集靶点导入STRING数据库构建蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络图,借助Cytoscape3.7.0靶点可视化软件对蛋白质互作网络图进行构建通过网络图筛选药物中的核心作用靶点,构建药物-有效化合物-作用靶点网络,通过Metascape生信在线分析网站对筛选出的靶点进行GO分子函数、GO生物过程、GO细胞组分以及KEGG通路富集分析。结果通过KEGG通路富集分析共获得201条信号通路,GO Molecular Functions富集分析中共得到188条GO功能条目,GO Biological Processes富集分析中共得到1700条GO功能条目,GO Cellular Components富集分析中共得到100条GO功能条目,通过筛选最终得到PI3K-Akt、JAK-STAT、Wnt、cGMP-PKG、AMPK、Hippo、CaN6种关键治疗靶点。结论柴胡-黄芩药对中有多个有效成分和作用靶点,对高血压有治疗效果。     

基于网络药理学研究人参治疗心肌纤维化的相关机制

目的运用网络药理学的方法探讨人参相关活性成分治疗心肌纤维化(myocardial fibrosis,MF)的分子作用机制。方法通过TCMSP数据库和文献挖掘获取人参的主要活性成分,利用人类基因数据库GeneCards预测和筛选人参活性成分的作用靶点。采用String数据库和Cytoscape 3.8.2软件绘制蛋白相互作用网络(PPI),借助DAVID 6.8数据库进行潜在基因的基因本体(GO)分析和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果筛选得到人参与MF相关的17个活性成分,涉及38个作用靶点。GO分析结果显示,人参治疗MF潜在基因的生物功能主要涉及影响核受体的活动,配体激活的转录因子活性,半胱氨酸型内肽酶活性参与凋亡信号通路,半胱氨酸型内肽酶活性参与凋亡过程,转录辅激活结合,G蛋白偶联的神经递质受体活性,类固醇结合,神经递质受体的活动,转录辅因子结合,G蛋白偶联胺受体活性等方面;KEGG通路富集分析结果显示,人参治疗MF在基因的通路主要涉及肿瘤坏死因子信号通路,弓形体病通路,流体剪切应力与动脉粥样硬化通路,前列腺癌通路,糖尿病并发症的AGE-RAGE信号通路,乙型肝炎通路,甲型流感通路,细胞凋亡通路,麻疹通路,军团病通路等。结论人参治疗MF是多成分、多靶点、多通路的复杂过程,主要通过参与抑制心肌炎症反应、NF-κB结合、多种受体的结合及磷酸化等发挥治疗MF的作用。     

基于网络药理学探究人参、红参与黑参治疗气虚的药效物质基础与机制

目的 基于网络药理学探究人参、红参与黑参治疗气虚的药效物质基础与机制。方法 通过查阅文献,筛选三种人参的有效成分和靶点。采用Swiss target prediction等平台预测其有效成分与靶点信息。结合GeneCards数据库检索与气虚相关的靶点,运用Cytoscape 3.7.2软件,构建药物-活性成分-靶点-疾病网络图。在String平台上构建靶点蛋白互作网络,利用R软件对关键靶点基因进行KEGG通路富集分析,揭示三种人参治疗气虚的作用机制与潜在信号通路。结果 经条件筛选,人参中kaempferol(山奈酚)、Ginsenoside Rk2(人参皂苷Rk2)、20(S)-protopanaxatriol(原人参三醇)等23个核心成分可通过VEGFA(血管内皮生长因子A)、HPSE(乙酰肝素酶)、HSP90AA1(热休克蛋白90AA1)等19个核心靶点作用于115条通路上;红参中Panaxytriol (人参三醇)、20 (R)-Ginsenoside Rh1 (人参皂苷Rh1)、Ginsenoside Rk2 (人参皂苷Rk2)等17个核心成分可通过VEGFA(血管内皮生长因子A)、HPSE(乙酰肝素酶)、HSP90AA1(热休克蛋白90AA1)等11个核心靶点作用于83条通路上;黑参中Ginsenoside Rk3(人参皂苷Rk3)、Ginsenoside Rh3(人参皂苷Rh3)、Ginsenoside Rh4 (人参皂苷Rh4)、Ginsenoside Rk1 (人参皂苷Rk1)4个核心成分可通过VEGFA(血管内皮生长因子A)等5个核心靶点作用于33条通路上。三种人参主要涉及抑制细胞分裂周期、调节胰岛素代谢、控制炎症反应等方面,发挥多靶点、多通路治疗气虚的作用。结论 人参、红参与黑参及其活性成分可通过VEGFA (血管内皮生长因子A)、HPSE (乙酰肝素酶)、HSP90AA1(热休克蛋白90AA1)等多个关键靶点干预PI3K-Akt信号通路、肿瘤坏死因子信号通路等。进一步揭示了三种人参可通过多个靶点、多条通路发挥治疗气虚的作用。预测三种人参对于气虚的治疗作用为:人参>红参>黑参。     

含西洋参中成药益心胶丸的鉴别

益心胶丸具有益气补心、养血通脉,主治胸闷气短、心悸失眠、健忘多梦、疲乏无力、心律不齐、心前区疼痛等症.益心胶丸处方由西洋参、冬虫夏草、阿胶、龙眼肉、丹参、生地、炒枣仁、桂枝、汉三七、甘草等10味中药组成,西洋参为君药.处方中西洋参、丹参、桂枝为主要组成成分,其他组成成分检出方法还存在一定困难.现就其西洋参、丹参、桂枝的薄层签定方法报告如下.     

西洋参药理作用研究的最新进展

西洋参 (ＰａｎａｘｑｕｉｎｑｕｅｆｏｌｉｕｍＬ .)的成分、药理与临床应用 ,详见赵汉钟和本人主编的《人参西洋参研究大全》一书。现就几年来大量药理研究的新成就、参考文献予以补充。西洋参和人参的主要活性成分是人参的皂苷。含量因种类、生长环境、药用部位和提取方法而不同 ,西洋参的总皂苷量 ,以 4年生者最高 ,2 4(Ｒ)—拟人参皂苷Ｆ11是西洋参的特征成分。1　对中枢神经系统的作用1 1　抗疲劳、增加耐缺氧能力西洋参含片和胶囊对耐缺氧和抗疲劳的比较研究 ,表明剂量效用的相关。并显示含片效能较胶囊稍强〔1〕。郭氏用西洋参和其…     

豨莶精醇对免疫性血小板减少症的网络药理学与实验研究

目的通过网络药理学的方法,研究豨莶精醇对免疫性血小板减少症的作用及作用机制,并通过细胞实验对其作用进行初步探究。方法通过SwissTargetPrediction数据库绘制豨莶精醇结构,预测豨莶精醇作用的靶点,通过GeneCards数据库,以"Immune Thrombocytopenia"为关键词获取疾病相关靶点,通过Cytoscape 3.5.0软件绘制化合物-靶点-疾病网络图,获得豨莶精醇与免疫性血小板减少症共有靶点,使用David 6.8数据库进行GO生物学过程分析和KEGG通路分析,STRING数据库分析获得关键靶点;通过刀豆蛋白A诱导脾细胞增殖,使用豨莶精醇进行干预,检测细胞增殖变化。结果网络药理学分析显示,豨莶精醇与血小板减少性紫癜共有靶点56个,发挥治疗作用的生物学过程与调节多个蛋白通路的磷酸化、调节一氧化氮的合成、调控JAK-STAT级联、调控细胞的增殖凋亡和迁移等相关,涉及的通路有癌症的途径、催乳素信号通路、PI3K-Akt信号通路、ErbB信号通路、胶质瘤、白细胞跨内皮迁移、FoxO信号通路、GnRH信号通路等,关键靶点有STAT3、EGFR、ESR1、HSP90AA1、MAPK8;细胞实验显示豨莶精醇对刀豆蛋白A诱导的脾细胞增殖具有一定的抑制作用。结论豨莶精醇对免疫性血小板减少症具有一定治疗作用,主要的作用机制是通过影响多个基因表达,调节多通路,来影响免疫相关细胞的增殖及凋亡。     

西洋参加工中出现的青支与红支 Ⅲ挥发油成分分析质量研究

在第Ⅰ、Ⅱ报中〔1〕〔2〕对皂甙类及污染微生物作了分析 ,本文对挥发油成分进行了分析。因为挥发油成分是西洋参特有的香味成分。有关西洋参挥发油成分的研究 ,报道的很少〔3〕,为了对西洋参加工中出现的青支与红支的质量评价 ,进一步阐明青支和红支西洋参是否能够利用 ,全面评价青支和红支西洋参 ,我们为此对西洋参加工中出现的青支与红支西洋参与正品西洋参进行了对比分析 ,将乙醚提取物经色谱一质谱联用仪进行了分离和鉴定 ,现将结果报告如下。1　试验材料正品西洋参、青支和红支西洋参由北京西洋参联合总公司 (怀柔 )提供。2　试验方法…     

国产西洋参分等质量标准的研究与讨论(四)——氨基酸标准

前报对国产西洋参的外观质量、西洋参皂甙成分、西洋参农药残留量及有害元素等进行研究。氨基酸类成分也是西洋参主要的有效成分之一。过去曾有人进行过一些分析研究,没有从质量标准方面进行比较。国产西洋参由于和原产地美国、加拿大气候条件和栽培方式等因素影响,其质量差异有多大,我们国产西洋参总氨基酸含量指标定为多少合适?这需要从实际分析得到的数据来决定。现将分析结果报告如下。     

西洋参叶袋泡茶总皂昔的含量分析

采用比色法分析检测西洋参叶袋泡茶中的总皂苷含量,结果其总皂苷含量为8.21%.高于西洋参根(6.89%),表明西洋参叶袋泡茶是富含西洋参活性成分的新型保健茶.     

西洋参果汁化学成分的研究

本文对加拿大产西洋参果汁挥发性成分及部分化学成分进行了研究。结果表明:西洋参果汁中含有挥发性成分近30余种,经GS- MS鉴定出9种化合物,其中含量较高为亚油酸甲酯,约 28.3% ,另外含有β- 谷甾醇等成分。     

国产西洋参分等质量标准的研究与讨论(五)——浸出物标准

前报对国产西洋参的外观质量、西洋参的皂甙成分、西洋参农药残留量及有害元素、氨基酸含量等进行了研究与讨论。浸出物包括醚溶性浸出物、醇溶性浸出物和水溶性浸出物。浸出物的含量高低也是一种常用的衡量有效成分的一种方法。西洋参中脂溶性成分有脂肪油和游离脂肪酸、甾类化合物和挥发油类都在醚溶性浸出物中,皂甙类和低聚糖类以及部分亲脂性较弱的成分都在醇溶性浸出物中,皂甙类、低聚糖、果胶类、氨基酸、以及水溶性多糖类都在水溶性浸出物中。在没有条件进行皂甙类成分测试时,可用浸出物测定来衡量西洋参的品质好坏,也是中国药典(一部)评价中药材质量的常用方法。