烟草不同组织总RNA的提取方法初探

【研究目的】寻找烟草各个组织总RNA最佳的提取方法。【方法】以烟草K326的根、茎、叶、蕾、花和种子为材料,分别采用试剂盒法、Trizol法和CTAB法提取烟草6个组织总RNA进行对比。【结果】烟草不同组织总RNA提取方法有所不同,试剂盒法和Trizol法只能提取出根、茎、叶、蕾和花的总RNA,而不能提取种子总RNA;CTAB法能提取出6个组织的RNA。3种方法提取的RNA质量好,均能满足RT-PCR以及后续实验的要求。【结论】试剂盒法较Trizol法和CTAB法简单、快捷,适合于烟草除种子以外其余组织总RNA快速提取,CTAB法适合烟草所有组织总RNA提取。     

柑橘原生质体总RNA提取方法研究

以悬浮培养的椪柑愈伤组织为材料,通过酶解分离原生质体;采用Trizol法、改良Trizol法、改良CTAB法和TaKaRa RNA提取试剂盒等4种方法提取原生质体的总RNA,通过琼脂糖凝胶电泳、紫外分光光度计和RT-PCR检测其质量和产量。结果表明:4种方法皆能提取出总RNA,其中Trizol法提取的总RNA有降解现象,其他方法所提取的总RNA完整性较好,且D260nm/D280nm和D260nm/D230nm值都在正常范围内;在产量方面,改良Trizol法提取的总RNA产量最高,106个原生质体达43.06μg,分别是改良CTAB法和TaKaRa RNA提取试剂盒的7.74和4.31倍;RT-PCR验证表明,以改良Trizol法提取的RNA为模板所扩增出的目的条带最清晰明亮,且与目的片段大小一致。因此,改良Trizol法是柑橘原生质体总RNA提取的最佳方法。     

非洲菊不同组织总RNA提取

以非洲菊为材料,采用Trizol试剂法、改良的异硫氰酸胍法、CTAB法和尿素—氯化锂法,提取非洲菊的花、花蕾、叶、花梗和根的总RNA。所得RNA经1%琼脂糖凝胶电泳以及紫外分光光度计分析,结果表明Trizol法和改良的异硫氰酸胍法适用于花和根组织,尿素-氯化锂法对花蕾和叶组织RNA有较好的提取效果,而花梗组织RNA最好采用CTAB法。     

猪肝脏总RNA快速提取方法

采用CTAB法和改良的Trizol法提取贵州从江香猪(Sus scrofa domestica)新鲜肝脏的总RNA,通过紫外分光光度法和凝胶电泳检测RNA质量。结果表明,改良的Trizol法提取的总RNA的纯度高,完整性好,优于CTAB法。且改良的Trizol法提取的猪肝脏总RNA可用于RT-PCR等后续分子生物学操作。     

一种有效的可口革囊星虫体壁总RNA提取方法

[目的]为从可口革囊星虫体壁中提取高质量的RNA,以便深入开展分子生物学研究。[方法]采用Trizol法、改良Trizol法和十六烷基三甲基溴化铵(CTAB)法3种方法提取可口革囊星虫体壁中总RNA,并通过琼脂糖凝胶电泳比较不同方法提取总RNA的效果。[结果]改良Trizol法提取的总RNA经电泳后能看到清晰完整的28S rRNA、18S rRNA和5S rRNA条带,无拖尾现象;而Trizol法和CTAB法提取的总RNA电泳条带完整性较差,缺少28S rRNA。[结论]传统的Trizol法和CTAB法不适用于可口革囊星虫体壁总RNA的提取;改良Trizol法提取的总RNA电泳条带清晰、完整性好,质量符合cDNA合成、RT-PCR扩增等后续实验要求,适用于提取可口革囊星虫体壁总RNA。     

三色堇花瓣总RNA 3种提取方法的比较

分别采用TransZol plant法、改良Trizol法和改良CTAB法提取三色堇花瓣的总RNA,并用琼脂糖凝胶电泳和紫外光谱对其提取效果进行检测.结果表明,TransZol plant法提取的总RNA浓度低,且杂质较多;改良Trizol法和改良CTAB法提取的总RNA纯度较高.3种总RNA提取方法中,以改良Trizol法提取的总RNA浓度和纯度最高,D260nm/D280nm在1.83 ～2.03之间.以改良Trizol法提取的总RNA反转录合成的cDNA为模板,能扩增出预期长度的基因片段,说明改良Trizol法提取的总RNA质量高,可用于后续的分子生物学试验.     

三七根部总 RNA 不同提取方法的比较

为探明三七根部总 RNA 的最佳提取方法,获取高质量 RNA,选取三七根部为材料,比较 Tr-izol 试剂法、CTAB 法、改良 Trizol 法和试剂盒法提取三七根部总 RNA 的质量。结果表明：4种方法提取三七根部 RNA 效果不同,其中以改良 Trizol 法提取 RNA 的质量最高,其 RNA 的 OD260／OD280为2．00, OD260／OD230为1．90,28S∶18S 为1．9,RIN 值为7．4,质量浓度为386μg／μL。而另外3种方法易出现样品降解、盐离子残留。结论：改良 Trizol 法适用于三七根部总 RNA 的提取。     

适于葡萄不同组织RNA提取方法的筛选

比较了CTAB法、改良CTAB法、Trizol法、SDS-苯酚法和改良SDS法5种RNA提取方法提取葡萄叶片、花序、茎尖、卷须和果实组织RNA的效果。并进一步从总RNA中分离出了高质量的低分子量RNA(LMWRNA),建立了葡萄LMWRNA提取的方法。改进后的改良SDS法能够克服果实中RNA提取难度大的问题,能够从果实中提取到质量和产量都很高的RNA。结果表明,改良SDS法适用于葡萄叶片、花序、茎尖、卷须组织中总RNA的提取,改进的改良SDS法是从果实中提得LMWRNA较佳选择。在总RNA提取的基础上建立的葡萄LMWRNA提取方法能够达到研究的要求。     

适合软枣猕猴桃花蕾转录组测序的总RNA提取方法研究

为了得到符合转录组测序要求的软枣猕猴桃花蕾RNA,比较了Trizol法、十二烷基苯磺酸钠(SDS)法、天根植物总RNA提取试剂盒以及改良十六烷基三甲基溴化铵(CTAB)法的提取效果。结果表明,Trizol法、SDS法和天根植物总RNA提取试剂盒均不能有效提取到软枣猕猴桃花蕾总RNA,改良后的CTAB法提取的RNA 28S和18S条带清晰,通过RT-PCR方法扩增出软枣猕猴桃Actin基因片段。将纯化后的RNA送样至测序公司,经深度检测样品合格,可以上机进行转录测序。     

CTAB法用于染病烟草植株中烟草丛顶病毒RNA的提取

 CTAB法是一种广泛用于从染病植物中提取总核酸,并用于后续相关病原物PCR检测的核酸提取法,已普遍运用于DNA病毒、植原体、细菌、真菌侵染植物的总DNA提取和病原检测。本文尝试将CTAB法用于一种由RNA病毒（烟草丛顶病毒）引起的烟草丛顶病染病组织总核酸的提取,以总核酸进行烟草丛顶病毒的RT-PCR检测,并与常规RNA病毒核酸提取法——Trizol法作比较。结果表明CTAB法和Trizol法提取的核酸用于烟草丛顶病毒RT-PCR检测时,均能扩增到目的条带,检测结果一致。在对复合侵染材料进行检测时发现,CTAB法提取的染病植物组织总核酸既包括DNA也包含RNA,有利于对DNA和RNA病原物同时进行检测;CTAB法所用试剂较Trizol法便宜,毒性小,且提取的核酸量较多、保存时间较长。因此CTAB法是一种高效、简便、经济的从烟草丛顶病染病组织中提取烟草丛顶病毒RNA的方法。     

2种大豆总RNA提取方法的改良

对大豆总RNA的提取方法T rizo l法和异硫氰酸胍法进行了改良,比较了改良前后2种方法的提取效果。结果表明,2种改良方法提取的大豆总RNA质量较高、完整性较好,完全可以满足后续研究要求,RNA产率均超过220μg/g。改良T rizo l法适用于大豆根、茎、叶及生长点总RNA的提取,而改良异硫氰酸胍法适用于大豆根、茎及生长点总RNA的提取。     

苹果组织总RNA提取方法的比较研究

本试验以苹果品种富士(Fuji)为材料,采用Trizol法、改良的SDS法和改良的CTAB法提取其茎尖总RNA,并用OD260/OD280值和1.2%琼脂糖凝胶电泳检测RNA的产量、纯度和完整程度。结果表明:通过改变CTAB法的提取缓冲液组成,缩短LiCl和乙醇沉淀的时间,可在2～3h内得到质量好、产量高、反转录和RT-PCR效果好的总RNA,该法是一种快速有效的适宜苹果组织总RNA提取的方法。     

三七种子总RNA提取方法的比较

从三七种子中提取高质量的RNA。采用CTAB法、天根试剂盒法、普通Trizol法、改良Trizol法对三七种子总RNA进行提取比较。结果表明,改良Trizol法提取的三七种子RNA纯度好、浓度高、无DNA污染,且成本低廉、操作简单,质量符合后续的基因克隆、cDNA文库构建、基因表达等分子生物学研究的要求。     

虎杖不同组织总RNA提取方法探索

介绍了一种适合虎杖根、茎、叶、花等不同组织总RNA提取的方法(CTAB法结合酸酚、高盐溶液以及Trizol),该方法较原来的CTAB法耗时短,DNA去除干净,所提取的总RNA可直接用于RT-PCR,GeneRacer,Northern等操作。     

山葡萄总RNA提取方法的比较

以山葡萄成熟果皮及叶片为材料,对改良CTAB法,SDS法和Trizol法3种不同的总RNA提取方法进行了比较。结果表明,SDS法和Trizol法提取的总RNA均有拖带现象,有部分降解,Trizol法提取的总RNA中有DNA的污染;改良CTAB法提取山葡萄叶片和果皮的总RNA带形完整,28SrRNA和18SrRNA的荧光亮度接近2：1,A260／280值为1．8～2．0,该方法提取的总RNA纯度和提取量最高,提取出的总RNA可用于进行RT-PCR、构建cDNA文库等分子生物学的研究。     

烟草叶片总RNA提取方法的比较

[目的]研究提取烟草叶片总RNA的最佳方法。[方法]利用CTAB法、酚-SDS法和Trizol法等从烟草叶片中提取总RNA。[结果]通过紫外分光光度法和凝胶电泳检测,结果表明,CTAB法、Trizol法、RNAiso法均能得到质量较高的RNA。RNAiso法提取RNA操作步骤简单,所提取的RNA纯度好、质量高且无污染,可以进行下一步的分子生物学研究。[结论]RNAiso法最适用于烟草叶片总RNA的提取。     

桃不同发育时期叶片总RNA提取方法的比较

为了从桃叶片中提取到高质量的RNA,以进行反转录、RT-PCR等后续分子生物学试验,选取了改良硼砂-CTAB法、改良CTAB法、改良SDS-苯酚法、试剂盒法、Trizol法,以及在试验中探索的改良Trizol法Ⅰ和改良Trizol法Ⅱ对桃不同发育时期的叶片总RNA进行提取,测定RNA样品的OD值,结合琼脂糖凝胶电泳检测总RNA样品的质量。结果表明,这些方法虽然都能获得桃叶片总RNA,但是或存在不同程度的DNA残留,或有蛋白、多糖等杂质污染,或降解严重;而改良的Trizol法提取总RNA的完整性和纯度较好;针对生长期和衰老期叶片的不同生理特性可分别采用改良Trizol法Ⅰ和改良Trizol法Ⅱ,提取的总RNA反转录后,通过RT-PCR检测,条带明亮清晰,与预期目的基因片段大小一致,说明这2种方法提取的总RNA能用于后期的分子生物学试验。     

榛子总RNA提取方法的比较研究

【目的】探讨榛子总RNA提取的有效方法,为今后开展榛子的分子生物学等研究奠定基础。【方法】以榛子的成龄叶片、幼嫩叶片和雄花芽为试材,采用植物RNA提取试剂盒、Trizol法、改良的CTAB法Ⅰ、改良的CTAB法Ⅱ、CTAB法和改良的SDS法提取其总RNA,通过琼脂糖凝胶电泳、紫外分光光度计和PCR检测所提取总RNA样品的品质。【结果】除了Trizol法,其他5种方法都能提取到总RNA,但是改良的CTAB法Ⅰ更适合榛子幼嫩叶片、成龄叶片和雄花芽总RNA的提取,此方法提得的总RNA较完整,条带清晰,品质较优,28SrRNA亮度约是18SrRNA的2倍,且无降解现象。经RT-PCR验证,以改良的CTAB法Ⅰ提取的RNA为模板扩增得到的条带清晰,与目的片段大小一致,能够满足后续试验的要求。【结论】改良的CTAB法Ⅰ是榛子幼嫩叶片、成龄叶片和雄花芽等组织总RNA提取的最有效方法。     

菊花叶片总RNA提取方法的比较研究

以菊花C008的叶片为试材,分别采用CTAB法、Trizol法、改良Trizol法和试剂盒法等进行总RNA提取试验,并对提取质量进行分析比较。结果表明:CTAB法提取的总RNA存在DNA污染。Trizol法提取的总RNA条带复杂,有蛋白等杂质污染。改良Trizol法提取的总RNA条带清晰,但RNA存在降解。试剂盒法提取的总RNA条带清晰,纯度更高,D_(260nm)/D_(280nm)为1.889,浓度为144.000μg/m L,是适于菊花叶片总RNA提取的简单、高效的方法。     

几种鲜切花RNA提取方法的比较

以5种鲜切花为材料,分别采用Trizol法、异硫氰酸胍法、改良十六烷基三甲基溴化铵（Cetyltrimethyl ammonium bromide,CTAB）法和RNA plant试剂盒法提取总RNA,并运用琼脂糖凝胶电泳和紫外分光光度计检测比较RNA的完整性和纯度.结果表明,Trizol法和异硫氰酸胍法对百合（Lilium longiflorum）、非洲菊（Gerbera jamesonii）和香石竹（Dianthus caryophyllus）鲜切花RNA的提取效果较好,但不适于月季（Rosa hybrid）和姜花（Hedychium coronarium）的RNA提取.改良CTAB法和RNA plant试剂盒法对鲜切花RNA的提取具有普遍适用性,提取的RNA完整性好、纯度高、不易降解.其中改良CTAB法还具有成本低、提取量大等优点,是提取月季、百合、白姜花、非洲菊和香石竹鲜切花组织RNA的较理想方法.