奶牛业科研试验设计和统计分析(五)

六、最小二乘分析法最小二乘分析是本世纪四十年代初创立的一种试验数据统计分析方法,Yetes等1934年提出了第一个计算程式。七十年代以来,由于生物数学和电子计算机技术的迅速发展,该方法在国外已广泛应用于畜牧业(特别是奶牛业)的育种、饲养等领域的科研中。最小二乘分析法的优点是:在进行方差分析时,不但能检验各因素水平间效应差异是否显著,而且可估计其总体均数及各因素水平的效应值(后者用常规方差分析是无法获得的),     

番鸭基因型与环境互作对屠宰性能影响的研究

本文以番鸭为研究对象，从出雏至70日龄屠宰，设计两种基因型，两种日粮，两种性别，两个试验场的试验，考虑主效应及互作效应进行方差分析和最小二乘均数估计，结果表明：屠宰率，全净膛率，胸肌率，腱肌率，瘦肉率的番鸭品种主效应，皮脂率的日粮主效应和瘦肉率的性别主效应达显著或极显著水平（P＜0．05或P＜0．01），腿肌率的品种与日粮互作，胸肌率，瘦肉率，腹脂率的品种与性别互作，屠宰率的品种与场互作显著。     

金华仔猪生长性状的方差分析和多重比较

本研究资料取自金华猪场 1979— 1999年金华猪的繁殖性能生产记录。测定金华猪 ,外来品种猪大约克夏、长白、杜洛克、汉普夏 ,以及金华猪与外来品种猪杂交所产的 2 35 5头仔猪的生长性状。综合考虑各性状的各种固定效应 ,并建立各性状的固定效应模型 ,对其进行方差分析 ,计算各性状的最小二乘均数 (LSM) ,对影响较大的固定效应在各观察水平上的LSM进行分析与比较。固定效应方差分析结果表明 :年份、季节、品种、同窝仔猪数、胎次等固定效应对初生重影响显著 (P <0 .0 5 )或极显著 (P <0 .0 1)。年份和同窝仔猪数对 2 0日龄重的影响显著 (P <0 .0 5 )。品种、年份、胎次对 6 0日龄重的影响显著或极显著。     

猪活产仔数的方差分析和多重比较

对二花胸猪、大白猪、杂交一代和回交一代四个群体共计２０１０窝活产仔数的资料进行了方差分析和多重比较。结果表明，交配类型、胎次、分娩季节对母猪少产仔数都有极显著（Ｐ〈０．０１）的影响。少磁仔数各固定效应都具有极显著（Ｐ〈０．０１）的最 乘平均值，少磁仔中固定效应最小二乘平均值差异的显著性检验，除Ｍ１～Ｍ３未达显著水准外（Ｐ〉０．０５），其余的均达到极显著水准（Ｐ〈０．０１）。４种交配类型之间、３个胎     

皖南花母猪血清Tf多态性及其与繁殖性能的关系

采用垂直板聚丙烯酰胺凝胶电泳法对 115头皖南花母猪血清转铁蛋白 (Tf)多态性进行检测 ,并用二因素有互作的最小二乘模型对不同Tf基因型与母猪繁殖力的关系进行分析。结果表明 ,皖南花母猪Tf位点受 3个等位基因控制 (TfA、TfB 和TfC) ,Tf位点基因的遗传多样性指数为0 390 7,Shannon信息指数为 0 9985。不同转铁蛋白类型的皖南花母猪繁殖性能存在一定差异 ,其中TfAA个体的产仔数、产活仔数和断奶仔猪数较高 ,TfBC型个体相应指标较差 ,二者在窝产仔数上差异达到显著水平 (P <0 0 5)。但其他Tf型母猪产仔性状的最小二乘均数差异均不显著 (P >0 0 5)。同时 ,Tf型与分娩季节之间有较强的互作效应。     

正确使用t检验与方差分析方法

正确使用ｔ检验与方差分析方法对于正态或近似正态分布且各组数据变异程度相近（具有方差齐性）的计量资料，常用ｔ检验和方差分析方法进行统计处理。ｔ检验主要适用于单因子两组间均数的比较，而不适合于单因子３组及更多组间均数的比较。方差分析则不仅适用于两组间均数...     

应用最小二乘法制订绵羊初生重、断奶重的校正系数(值)

<正> 羔羊初生重、断奶重是绵羊早期选种的重要指标。由于受单、双胎,母羊年龄等母体效应的影响,按表型值选择容易使双羔、初生羔等落选,而且产生对其父亲育种值的错误评价。过去多用平均数比较法或经验常数法进行校正,误差较大。本文提出应用最小二乘法求群体均数及估计各种母体效应制订校正系数(值)的方法。最小二乘法(Ordinary Least Square Estimation)是近年来发展起来的新的统计方法。在统计     

影响外来猪种早期生长的固定效应

取杭州种猪试验场1996-2001年长白猪、杜洛克和大约克的产仔哺育记录的原始档案，共收集6965窝。在建立固定效应模型的基础上，对仔猪早期生长(初生个重、20天个重、60天个重)的资料进行方差分析和最小二乘平均数估计。结果表明：胎次、年份、季节、品种和同窝仔猪数对仔猪早期生长的影响均达极显著水平(P&lt;0．01)。     

龙陵黄山羊在两个杂交组合中的应用试验

为探索龙陵黄山羊这一地方优良品种的可持续发展方法,本研究以龙陵黄山羊为母本,分别以黄色波尔山羊、黄色波尔山羊与云上黑山羊的F1代黄色公牛为父本,开展杂交组合试验,测定初生重、断奶重,并进行均数t检验和最小二乘均数差异分析.均数t检验结果显示,龙陵黄山羊原种公羊和母羊平均断奶重均极显著低于波龙二元组合(P<0.01),波...     

性别对杜洛克猪主要经济性状的遗传参数估计的影响

通过建立不同模型，采用MTDFREML程序，对韩国京畿道二川郡的某原种猪场的3443头鉴定的杜洛克猪的资料进行了性别对杜洛克猪主要经济性状的遗传参数的研究。结果表明，杜洛克猪主要经济性状的最小二乘均值在公母猪之间有明显的差异（P＜0．05），模型中同时考虑母体效应时得到的遗传力均低于没有考虑母体效应时的遗传力。同时，将性别作为固定效应时的各性状间的遗传相关高于只考虑公猪时的各性状间的遗传相关，但低于只考虑母猪时的各性状间的遗传相关。     

湖羊产羔性状的微卫星标记与可能生产力的关联性分析

选择位于绵羊第6号染色体上与多胎基因（Fec^B）紧密连锁的微卫星OarAE101、BM1329、BM143和OarHH55标记以及位于第4号染色体上的OarHH35标记对湖羊的产羔性状进行研究,结果显示：湖羊的5个微卫星座位都达到了高度多态水平（PIC〉0．5）,5个微卫星座位可以用于湖羊产羔性状的遗传多样性的评估。方差分析结果表明：5个基因座中OarAE101、BM143各基因型产羔数生产力之间存在极显著差异（P〈0．01）,OarHH35各基因型产羔数可能生产力之间存在显著差异（0.01〈P〈0．05）,BM1329、OarHH55各基因型产羔数可能生产力之间差异不显著（P〉0．05）。在OarAE101标记中107／113的产羔数最小二乘平均值为最大,与基因型103／113、107／107、101／111、113／113、107／111和103／103之间产羔数可能生产力最小二乘平均值差异不显著（P〉0．05）,但与101／101和103／107之间产羔数最小二乘平均值差异显著（O．01〈P〈0．05）,与115／115和111／111之间产羔数可能生产力最小二乘平均值差异极显著（P〈0．01）。在OarHH35标记中139／139的产羔数可能生产力最小二乘平均值为最大,与基因型139／141、139／127、137／125之间产羔数可能生产力最小二乘平均值差异不显著（P〉0．05）,但与127／127、125／125和139／125之间产羔数可能生产力最小二乘平均值差异极显著（P〈0．01）。在BM143标记中118／118的产羔数可能生产力最小二乘平均值为最大,与基因型118／106、118／110、106／104和112／114之间产羔数可能生产力最小二乘平均值差异不显著（P〉0．05）,但与118／116和102／106之间产羔数可能生产力最小二乘平均值差异显著（0.01〈P〈0．05）,与102／104、112／102和116／112之间产羔数可能生产力最小二乘平均值差异极显著（P〈0．01）。研究将在今后湖羊品种的标记辅助选择和分子育种中具有重要的应用价值。     

荷斯坦奶牛STAT5A基因的SNPs检测及其与产奶性状的关联分析

根据GenBank公布的牛STAT5A基因的2个SNPs（AJ237937和AF079568）的引物序列,采用PCR-SS-CP方法对758头中国荷斯坦奶牛进行了STAT5A基因多态性检测,并将其与5个产奶性状进行了关联分析。在SNP1的9501碱基处发现A→G突变;SNP2中发现2个连锁点突变,即12 440位T→C和12 550位的CCT插入/缺失;方差分析结果表明：SNP1对乳蛋白率有显著影响（P〈0.05）;SNP2对产奶量有极显著影响（P〈0.01）,对乳脂量、乳蛋白量有显著影响（P〈0.05）;单倍型组合对产奶量和乳蛋白量有极显著影响（P〈0.01）,对乳脂量有显著影响（P〈0.05）。多重比较分析表明SNP2的AB基因型的产奶量、乳脂量和乳蛋白量的最小二乘均数极显著（P〈0.01）或显著（P〈0.05）高于基因型AA;而单倍型组合H1H2的产奶量、乳脂量和乳蛋白量的最小二乘均数显著（P〈0.05）或极显著（P〈0.01）高于其它4种单倍型组合;H3H4对产奶量和乳蛋白量的效应极显著高于其它4种单倍型组合（P〈0.01）。结果提示：STAT5A基因可以作为奶牛产奶性状的候选分子遗传标记。     

养鸡技术讲座：第三十七讲 养鸡业常用生物统计方法（中）

四、方差分析方法在养鸡业中,经常进行多个处理或多个因素的试验,如几种蛋鸡饲料的对比试验、不同鸡的杂交组合与不同饲料的搭配试验等。这类试验资料,须用方差分析的方法进行统计处理。方差分析方法是根据对试验资料变异原因的剖分,利用平方和与自由度的可加性计算各变异项的平方和、自由度及均方;选用合适的均方作为试验误差估计,同时进行     

性别对约克夏猪的主要经济性状遗传参数估计的影响

本文采用动物模型DFREML ,对位于韩国京畿道二川郡的某原种猪场的 6 16 8头鉴定的约克夏猪的资料进行了性别对约克夏猪主要经济性状的遗传参数影响的研究。结果表明 :约克夏猪主要经济性状的最小二乘均值在公母猪之间有明显差异 (P <0 .0 5 ) ;模型中同时考虑母体效应时得到的遗传力均低于没有考虑母体效应时的遗传力。同时 ,将性别视为固定效应时各性状间的遗传相关高于只考虑公猪时各性状间的遗传相关 ,但低于只考虑母猪时各性状间的遗传相关     

正交设计在禽药试验中的应用

引言正交试验设计,简称正交试验法,是研究多因素、多水平的试验设计方法,它可以采用直观分析法从中找出那个是主要因素,那个是次要因素,比较各因素对增产的效果。其方法也比较简便,易为广大农业科技人员所掌握。如果需要提高试验的精确度,又可以采用方差分析,对各因素所得的效果进行F检验,得出差异是否显著的结论,从而进行多重比较。因此正交试验设计是一种     

南阳,皮埃蒙特及其杂交牛的血液生化遗传标记与生长性状关系

利用水平淀粉凝胶的方法测定了１４３头南阳黄牛，皮埃蒙犊牛（Ｐｉｅｍｏｎｔｅｓｅ）及二者杂交后代的血红蛋白（Ｈｂ），白蛋白（Ａｌｂ）淀粉酶和碳酸酐酶的多态性，并对全部个体进行了线性体型评分和体尺测定。运用最小二乘法拟合线性模型对各标记基因型的效应及不同标记基因型间生长性状指标差异显著性进行检验。     

应用可信区间估计总体间差异的大小

应用可信区间估计总体间差异的大小通过由实验获得的几个均数（或率）的表面差异，来估计相应总体间差异的大小，常常是科研人员比较关心的问题。对这类资料常用的显著性检验方法，如ｔ检验、方差分析、χ２检验等，只能回答总体间是否存在差异，而不能说明差异的大小。要...     

影响南江黄羊生长性状的非遗传因素分析

利用四川南江县北极种畜场1987—2002南江黄羊从出生到成年各年龄阶段的体重和体尺记录,对影响南江黄羊生长发育性状的非遗传因素及其之间互作效应进行最小二乘统计分析。结果表明:不同年龄阶段的南江黄羊大多数体重和体尺性状受性别、出生年份及其互作、出生年份与出生季节互作效应的影响,达到极显著(P<0.01)或显著(P<0.05)水平;受出生季节、性别和出生年份的互作效应的影响未达到显著水平(P>0.05)。这些研究为南江黄羊今后在遗传评定与遗传参数估计中设计合理的统计分析模型提供了必要的参考依据。     

鸡IGF-Ⅰ基因SNPs及其对屠体性状的遗传效应分析

以180只3个品系的温岭草鸡为材料,采用PCR-RFLP方法测定了IGF-Ⅰ基因的3个SNPs座位,同时分析了它们对屠体性状的遗传效应.结果显示PstⅠ、HinfⅠ和TaqⅠ识别座位分别发生T→C、C→A和C→T突变,每个SNPs座位各出现了3种基因型,其中A系在3个座位上均处于Hardy-Weinberg平衡状态(P＞0.05).方差分析显示每个座位基因型对部分屠体性状都有极显著或显著的差异(P≤0.01或0.01＜P≤0.05).多重比较显示在其中6个屠体性状上,每个座位3种基因型的最小二乘均值之间均有突变型＞杂合型＞野生型的关系,联合基因型QF/QF和QE/QF的最小二乘均值在4个屠体性状上显著高于(0.01＜P≤0.05)联合基因型PE/QE,每个座位突变等位基因都对部分屠体性状具有增效作用.A系和B系之间的遗传距离为0.005 3,聚类分析表明两系同为1枝.     

饲料配方优化利器：UD-SVR与额外添加支链氨基酸

发展新的试验设计与分析方法,通过实施少量试验,优化配方并解释各因素效应,对动植物营养、发酵工程等多因素多水平试验设计意义重大。正交设计与均匀设计（UD）（特别是后者）能有效降低试验个数,但其后续分析常采用的多元线性回归、二次多项式回归、响应面方法等经验风险最小的回归模型存在诸多弊端,特别是其假定样本充分大或无限大,而配方优化是典型的小样本,