辽宁省主栽香菇菌株ISSR遗传差异性分析

以20个辽宁省主栽香菇菌株为试材,采用ISSR分子标记方法,研究了20个菌株的遗传差异性,并采用NTSYS-PCR软件进行聚类分析。结果表明:从30个随机引物中筛选出9个ISSR备用引物,并用这9个引物对供试香菇菌株基因组DNA进行了ISSR-PCR扩增,共扩增出72条清晰条带,其中多态性条带占83.3%。通过聚类分析发现,异化系数在0.36为阈值时,20个菌株聚为4个组群。     

应用RAPD方法鉴别香菇菌株的研究

作者采用单个、10-碱基的随机引物(Operon公司产品)PCR扩增香菇的多态性DNA。测试的7个引物均能扩增15个香菇菌株的DNA,扩增位点为12～19个,DNA片段大小为0.34kp～2.52kp。除菌株ATCC 28759和ATCC 28760所有引物扩增的DNA指纹图谱均相同外,其余13个菌株都有其独特的DNA谱带。结果表明,RAPD方法可用于鉴别香菇菌株间的差异,在食用菌遗传育种研究中具有广泛的用途。     

双孢蘑菇颜色基因分子标记的初步筛选

以4个白色和4个棕色双孢蘑菇(Agaricus bisporus)菌株,对其500个随机扩增多态性DNA(random amplified polymorphic DNA,RAPD)随机引物进行筛选,筛选出的S33、S438、S485 3个引物在棕色菌株组能扩增出4个特异条带(大小300~2000bp),将特异片段回收,克隆测序,将合成的4对特征序列扩增区域(sequence characterized amplified regions,SCAR)标记引物对48个菌株进行验证,结果表明:仅SCAR41200在24个棕色菌株的22个中能扩增出特异条带,而所有白色菌株中都没有此条带,表明该标记与棕色菌株的棕色基因相关。     

灵芝菌株的DNA指纹分析

CTAB法提取灵芝菌丝体总DNA,再以核糖体DNA转录间隔区（ITSⅡ、IGR IPCR RFLP）结合随机引物扩增多态性（RAPD）标记分析30个灵芝菌株间的亲缘关系.结果表明,ITSⅡ、IGR I-PCR RFLP产生了47条带,其中42条显示出多态性,通过聚类分析将30个菌株分成七大类,包括紫芝、黑灵芝、树舌灵芝、薄树灵芝四大类,以及另外三个无法确定具体归属的类群,但没能将赤芝与松杉灵芝区分开.RAPD从247个随机引物中筛选出8个随机引物,共检测到69个多态性位点并全部显示出多态性,通过聚类分析将供试的30个灵芝菌株全部区分开.     

香菇菌株限制性片段长度多态性

香菇菌株的ＤＮＡ片段通过隆转移到质粒载体Ｂｌｕｅｓｃｒｉｐｔ Ｍ１３－（ｐＢＳ）以获得部分基因文库。文库三个随机克隆和一个密环菌中１ＤＮＡ克隆被用作限制性片段长度多态性探针。其中三个探针可检测到多态性，提示了３２个野生和栽培香菇菌株的遗传分离。菌株间的相似性用平均链锁聚类方式（ＵＰＧＭＡ）聚类，相似性超过６０％的分为一组。２３个菌株被分成４组。９个菌株与其它菌株相似性均低于６０％而独立存在。从我们     

应用AP—PCR技术检测香菇栽培菌株的遗传差异

利用３个随机引物对２１个香菇栽培菌株进行了ＰＣＲ扩增,结果表明,３个引物共产生４５条ＤＮＡ谱带,其中分子量最小的０．１８ｋｂ最大的１．１６ｋｂ,聚类分析表明,２１个香菇菌株的相似系数为０．６４～１．００,其中大部分菌析遗传差异较小而相似程度较高。     

从DNA水平上分析香菇不同菌株的遗传差异

本文选取了10个中国香菇野生种和2个栽培种.采用RAPD技术进行遗传差异测定.16个随机引物共扩增出118条DNA带,在此基础上分析并构建了遗传相关聚类图.结果表明,我国的香菇野生资源存在着较大的遗传差异,10个野生种菌株之间的遗传相似性在50%～80 %之间.     

ITS-RFLP及SRAP标记在灰树花种质评价中的应用

以25个灰树花(Grifola frondosa)菌株的子实体为材料提取基因组DNA,ITS扩增后对产物进行酶切,25个菌株的ITS条带处于同一位置,酶切后部分菌株呈现不一样的切点,可将这些菌株大致分为三类.应用扩增清晰、多态性高的47对SRAP引物对这25个菌株进行SRAP分析,共得到138条多态性条带,树状图显示,这些菌株在相似度77%水平上可分为三类,与ITS-RFLP的分析结果类似.SRAP分析结果显示,有10个菌株可以被有效的区分,15个菌株未能找到其相互之间的差异带,说明ITS-RFLP和SRAP标记可以应用于区分菌株,进行种质评价.     

用RAPD与ITSl标记鉴定斑褶菇属与裸盖伞属间疑难菌株

选择10个RAPD引物对一个斑褶菇属菌株P9、一个裸盖伞属菌株8凹和一个两属问形态类似的疑难菌株P）（进行属问多态性分析，然后以一对rDNA-ITSI引物进行斑褶菇属的特异扩增。RAPD分析表明，疑难菌株PX和斑褶菇属菌株P9在C18、C19等引物的特异性条带上表现出更多的相似性。在ITS-1斑褶菇属特异引物下，菌株PX与P9扩增出相同的150bp左右的条带，而裸盖伞属菌株807中未有此条带。RAPD多态性分析结合rDNA-ITSl特异引物扩增将疑难菌株PX鉴定为斑裙菇属。     

中国主栽双孢蘑菇菌株的DNA多态性

本文以中国双孢蘑菇不同主栽产区的9个具代表性的双孢蘑菇菌株为材料,用20个随机引物对其进行RAPD分析。结果表明,20个随机引物中,有15个随机引物的扩增产物DNA片段表现出明显的多态性,其中每个引物对不同菌株扩增出的DNA片段数目各不相同,而且不同引物扩增出的DNA带谱也不同,差异较大。这15个引物对供试菌株总共扩增出168条DNA片段,其中最大的片段可达6.77kb,最小的DNA片段仪有0.31kb。同时,比较了供试菌株两两间的遗传相似性,发现它们之间的变化不大,其相似系数从0.6891到1.0000,而平均相似系数仅为0.8500,表明供试菌株之间的亲缘关系较近,遗传变异不丰富。另外,采用系统聚类法中的类平均法,对供试菌株相似系数两两间进行聚类分析并生成树状图谱,直观准确地揭示了它们之间的差异。当相似系数为77％时,所有供试菌株都被聚为一大类,说明我国主栽双孢蘑菇菌株的遗传基础较狭窄,可能来源于同一品系,这为进一步开展双孢蘑菇菌种的遗传改良提供了理论依据。