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1.
在传统CTAB方法的基础上进行改良,建立了适用于华南五针松成熟针叶DNA提取的CTAB法,该方法具有稳定、操作简单、可靠等特点。使用该方法对不同地理分布的华南五针松成熟针叶进行基因组DNA的提取,经紫外分光光度计检测其A260/A280在1.60~1.78之间,OD260/OD230比值介于2.0~2.3之间,无降解现象,RNA去除干净。经ISSR-PCR分析,条带清晰,完全能够达到分子标记的操作要求。 相似文献
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高质量丝栗栲基因组DNA的提取方法 总被引:1,自引:0,他引:1
为了促进丝栗栲分子生物学的研究,采用尿素法、柠檬酸钠法、改良CTAB法和SDS法4种方法提取丝栗栲叶片基因组DNA,并对提取效果进行了比较和分析。结果表明,改良CTAB法较适合丝栗栲基因组DNA提取,其提取的DNA产率高,凝胶检测条带整齐清晰,杂质少、无明显降解,OD260/OD280比值在1.8左右;而尿素法难以提取基因组DNA,SDS法提取的DNA得率较低,柠檬酸钠法有蛋白质、多糖等杂质污染均不太适用丝栗栲基因组DNA提取。采用改良CTAB法提取得到丝栗栲幼叶、老叶、嫩芽和幼茎基因组DNA,产率分别为177.3、167.1、242.0和156.7μg/g。酶切分析也证明,改良CTAB法提取的不同组织DNA适用于进行后续分子生物学研究。 相似文献
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一种改良的CTAB法提取马尾松基因组DNA 总被引:1,自引:0,他引:1
以马尾松针叶为试验材料,利用改良的CTAB法抽提基因组DNA,其浓度和纯度符合PCR实验的要求,经凝胶电泳检测,DNA纯化效果好。 相似文献
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以华山松(Pinus armandi)种子胚乳为实验材料,分别采取经典CTAB法、简易CTAB法和SDS法微量法提取华山松基因组DNA,并通过琼脂糖凝胶电泳、紫外分光光度计分析、标准差和标准误、卡方检验和SPSS软件显著性分析,将它们在DNA产量、质量和方法稳定性等方面的优缺点进行总结。得出结论:通过对数据进行卡方检验,所有数据都是差异是由方法所引起的,不是偶然误差所引起的;相比于经典CTAB法,SDS微量法和简易CTAB法的(OD260-OD320)/(OD280-OD320)标准差和标准误相差不大,数据相对精确,结果相对精确;通过SPSS软件分析分析,简易CTAB法和其他2种方法相比存在显著差异性,SDS微量法与经典CTAB法的P〉0.05,差异不显著,提取效果相差不大。综上所述:相比于简易CTAB法,SDS微量法与经典CTAB法的(OD260-OD320)/(OD280-OD320)都接近2.0,可能存在RNA污染污染,DNA的浓度也相对较低,SDS微量法与经典CTAB法不适合华山松胚乳DNA提取。简易CTAB法的(OD260-OD320)/(OD280-OD320)比率很接近1.80,不存在蛋白质和RNA污染,DNA纯度也最好,DNA浓度最高,比较适合华山松胚乳DNA提取。 相似文献
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以华山松(Pinus armandi)针叶为实验材料,分别采取经典CTAB法、简易CTAB法、改良CTAB法和Zigenhagen法提取华山松基因组DNA,并通过琼脂糖凝胶电泳、紫外分光光度计分析、标准差和标准误、卡方检验和SPSS软件分析。通过对实验数据进行卡方检验,所有数据的差异是由DNA提取方法所引起的,不是偶然误差造成的。对(OD260-OD320)/(OD280-OD320)的标准差和标准误分析表明:改良CTAB法的标准差和标准误最小,经典CTAB法次之,再其次是简易CTAB法,说明改良CTAB法稳定性最好,数据精确度最好。通过紫外分光光度计和SPSS分析,经典CTAB法存在RNA污染,(OD260-OD320)/(OD280-OD320)的比值大于1.90,简易CTAB法和Zigenhagen法存在少量蛋白质污染,(OD260-OD320)/(OD280-OD320)的比值小于1.80,而改良CTAB法(OD260-OD320)/(OD280-OD320)的比值是1.855,接近理论值(1.80),且标准差和标准误最小,数据稳定性和精确性最好,提取DNA纯度最好。 相似文献
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4种不同广玉兰基因组DNA提取方法的比较 总被引:3,自引:1,他引:2
采用常规CTAB法、常规SDS法、改良CTAB法、改良SDS法4种方法对广玉兰(Magnolia grandiflora)叶片基因组DNA的提取进行比较,并进行ISSR—PCR检测,结果表明:改良的CTAB法提取的基因组DNA效果比常规CTAB法、常规和改良SDS法都好,提取DNA的浓度和纯度高,无蛋白质和RNA等杂质影响,并且可以很好的应用于ISSR分子标记分析,ISSR—PCR反应体系中模板DNA的最佳浓度是30ng/20μl. 相似文献
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