半冬性小麦品种资源遗传距离及聚类分析

本文对来自全国６个省份的２５个优异小麦品种资源的６个差异显著的性状进行主成份分析，选取其累积贡献率大于８５％的抽穗期，株高和穗长前三个特征根和特征向量，并分别计算２５个材料的三个主成份值和各品种间的遗传距离，根据其遗传距离进行系统聚类，把２５个材料分为四个类型，１５组。     

苦荞数量性状遗传距离的测定

对来自不同地区的４５个苦荞品种的６个性状进行了方差分析，相关分析及主成分分析，并测定品种间两两的遗传距离，品种间遗传差异与地理距离没有必然联系，亲本选配应以主茎节数为主，兼顾单株粒重和千粒重性状。     

甘薯主要亲本材料的主成分分析及聚类分析

对我国甘薯杂交育种中常用的亲本材料40份进行了主成分及聚类分析。方差分析表明品种间确实存在真实遗传差异。用9个主成分中代表95.26%变异的6个主成分计算品种间遗传距离,将供试材料聚为8个类群,性状差异大的品种分别聚为不同的类群。     

寒地水稻不同品种(系)的农艺性状分析

以建三江地区历年主栽或新选育的水稻品种为材料,分别考查了98个水稻品种(系)的9个主要农艺性状,定义品种标准化主成分间的欧氏平方距离为遗传距离,采用Between-groups linkage法对其进行了聚类分析。结果表明:当阈值为12.5时,供试的98个材料被划分为4个品种类群。表现出遗传距离较近,遗传基础狭窄的特点,并且寒地水稻品种主要集中在第1类群。因此,在确定水稻育种杂交亲本选配时,要在类群间进行,并结合米质的选择,则有望选育出农艺性状优良、优质、高产的新品种。但改良品种个别性状时,亲本之一符合育种目标,另一亲本也可选用遗传距离不大的品种。认为水稻杂交亲本应在遗传距离较大的类群间进行选择,杂种优势较强。     

亚麻种质资源聚类分析及核心品种抽取方法

对亚麻种质资源进行了聚类分析并探讨了核心品种的抽取方法。以134份亚麻品种为材料，通过14个性状的分析，采用离差平方和法进行聚类，根据树状图，将该亚麻群体分为7个类群，对各类群品种性状进行了分析。根据取样比例，将该群体分为23个组，在各组内，采用随机抽样、按样品间最小遗传距离和最大遗传距离抽样三种方法，构建了3个亚麻核心种质库，并加以比较。结果显示最大遗传距离法构建的核心种质库，能最大限度地保存原群体的遗传多样性。     

色稻碾米品质性状的遗传效应分析

以６个色稻和１个普通稻品种为材料，采用７×７完全双列杂交法分析色稻主要碾米品质性状糙米率的跗主其与主要营养品质性状间的遗传相关性。结果表明，色稻糙米率的遗传符合加性－显性模型，显生作用和加性作用都重要基因的平均显性作用表现完全显性和部分超显性，显性等位基因对提高糙米率起增效作用，隐性等位基因起减效作用，且其广义遗传力和狭义遗传力均较高，在品种改良中适宜有早期世代进行选择。     

胡麻品种间数量性状的遗传差异及其在育种上的应用

本研究采用多元分析的方法,以主成分值和遗传距离为尺度定量地测定了23个胡麻品种(系)间的遗传差异,并据此对品种进行了综合评选和聚类分析。结果指出,主要分析可以作为评价品种综合性状优劣、选择优良亲本的一种方法。遗传距离的大小在一定程度上反映了品种(系)间的亲缘关系,它能较精细地度量出品种间数量性状的遗传差异。根据遗传距离的大小和主成分分析的结果,初步提出了一些较优组合供育种工作参考。     

亚麻种质资源聚类分析及核心品种抽取方法

对亚麻种质资源进行了聚类分析并探讨了核心品种的抽取方法.以134份亚麻品种为材料,通过14个性状的分析,采用离差平方和法进行聚类,根据树状图,将该亚麻群体分为7个类群,对各类群品种性状进行了分析.根据取样比例,将该群体分为23个组,在各组内,采用随机抽样、按样品间最小遗传距离和最大遗传距离抽样三种方法,构建了3个亚麻核心种质库,并加以比较.结果显示最大遗传距离法构建的核心种质库,能最大限度地保存原群体的遗传多样性.     

黑芝麻数量性状的主成份分析及其应用

对３６个黑芝麻品种的８个数量性状进行了主成份分析，以供试品种的４个标准化主成份值为依据，结合具体育种目标，提出了青麻、武宁黑芝麻等１０个可供选配的黑芝麻亲本品种。     

川渝地区地方和育成大豆品种SSR标记多样性分析?

利用基本均匀分布于大豆20条染色体的135对SSR标记，对232份包括6个地方品种地域亚群和1个育成品种亚群进行全基因组扫描。结果表明：所有的标记都有多态性，所有检测到的位点都是纯合基因型，说明所选用品种高度纯合，每个标记存在2～4个等位变异，平均2.66个。亚群多态信息含量变异范围0.2751-0.3165，整个群体为0.3208；亚群内Nei遗传距离变异范围0.325 8～0.359 4，整个群体为0.3711，说明川渝地区大豆遗传变异较小。亚群间的遗传一致度（GI ≥ 0.8862）较高，亚群间遗传距离（GD ≤ 0.1208）较小，地方品种亚群间遗传差异更小，育成品种亚群与自然地域亚群的遗传差异相对较大。亚群间基因分化系数（Fst）平均为 0.0722，基因流（Nm）平均为 3.214，说明不同亚群之间存在一定的基因交流。主坐标分析表明第一、二和三主成分分别解释总变异的4.97%、3.54%和3.33%。来自同一区域的品种资源基本聚集在同一亚群，聚类分析同样表明同一自然地域亚群品种资源虽不能完全聚集到同一个遗传类群中，但具有一定的聚集效应，说明川渝大豆品种资源遗传变异与地理位置有一定的关系。分子方差分析表明亚群内变异占总变异的97%，亚群间变异仅占总变异的3%。Mantel收敛分析表明地方品种自然地域亚群的遗传距离与所处的地理位置距离（纬度和海拔）呈显著的正相关关系（R2=0.723）。川渝地区大豆种质资源群体遗传丰富度不高，当前的育成品种未蕴含本地区所有遗传变异。     

基于表型的樱桃番茄种质遗传多样性分析

为研究樱桃番茄种质的遗传多样性,科学评价种质,以21份自交系为材料,对其12个表型性状进行遗传变异、主成分和聚类分析。结果表明:各性状的变异系数为14.97%~216.48%,Shannon多样性指数为0.66~1.34。选取累积贡献率为76.619%的前4个主成分,所包含的9个表型性状是种质评价的主要指标,5份材料综合表现优良(F>0.8)。进一步系统聚类,在欧氏距离8~11之间将供试种质分为四类,分别包含6、10、4和1份材料,可用于不同类型品种的选育。21份樱桃番茄种质具有较丰富的遗传多样性,为相关资源的利用及品种选育提供了参考。     

104个甘薯品种的cpSSR指纹图谱构建及遗传多样性分析

基于甘薯叶绿体基因组,利用cpSSR分子标记,对104份甘薯栽培品种和地方品种进行遗传多样性分析并构建指纹图谱,为甘薯资源的保护鉴定和遗传改良提供参考。使用了11对cpSSR引物,在104个甘薯材料中总共扩增得到58条条带,多态性条带为47条,单条引物平均扩增的条带数为5.27,平均多态性百分率为81.03%。根据引物在甘薯材料中的扩增结果,构建104个甘薯品种的指纹图谱。对104个甘薯品种的扩增结果进行聚类分析,每个品种间的遗传距离为0.0386~5.2723,平均遗传距离为0.2201,在遗传系数为0.74时将104个甘薯品种分为5组。     

应用亲缘关系指数分析山东省不同年代主栽花生品种的遗传多样性

应用亲缘关系指数对山东省不同年代及不同类型的主栽花生品种进行了亲缘关系和遗传多样性分析。 结果表明,约１１．１１％ 品种组合间的亲缘系数（ＣＯＰ）值为０,所有供试品种ＣＯＰ值变异范围为０．０００～０．８１９,平均 值为０．１２３,表明大多数品种在系谱上的遗传关系很小;进一步通过ＣＯＰ值聚类分析,在欧式距离＝１．６１处,可将 供试材料分为４个类群,但整体上聚类结果比较分散,说明山东省主栽花生品种遗传差异及多样性较大。     

小麦亲本间分子遗传距离与F1杂种优势的相关性分析

为了探讨利用小麦亲本间分子遗传距离预测F1杂种优势的可行性，以河南省8个不同类型的小麦品种（系）为材料，分别于2003年和2004年按不完全双列杂交组配28个组合，分析与产量相关的9个性状的F1杂种优势。分别选用均匀分布于小麦21条染色体上的287对SSR引物和33个二核苷酸重复ISSR引物，计算8个亲本间的分子遗传距离．进而分析亲本间分子遗传距离与F1杂种优势表现的相关性。结果表明，SSR和ISSR两种标记估算的遗传距离间相关极显著（相关系数为0．832），表明用两种分子标记对小麦品种进行遗传差异分析的结果是一致的。除株高外，利用两种分子标记计算的亲本间分子遗传距离与F1杂种优势在全部28个组合中相关不显著，而在12个极端组合中相关系数得到较大提高，并在株高、主茎千粒重和千粒重3个性状上相关达到显著或极显著水平，且两年的研究结果一致。这说明亲本间分子遗传距离与F1杂种优势的相关性与材料的选择有关。因此认为利用小麦亲本间的SSR和ISSR遗传距离预测F1的杂种优势还需进一步研究。     

45个莲瓣兰品种的表型多样性研究

收集45个莲瓣兰（Cymbidium tortisepalum）主栽品种,对29个表型性状进行数据收集。计算性状变异系数,进行主成分分析、相关性分析及聚类分析探究莲瓣兰品种间亲缘关系及遗传差异大小。结果表明：45份材料各性状的变异幅度为10.1%~133.1%,具有丰富的遗传差异;主成分分析结果表明共得到7个特征值大于1的主要成分,累积方差贡献率高达75.461%,其中第一和第二主成分主要代表了花部综合性状;相关性分析结果表明大部分性状都具有相关关系,其中93对性状显著相关,65对性状极显著相关;聚类分析结果表明在欧式遗传距离15时可将45份莲瓣兰分为3个类群。     

芝麻雄性不育系与核心种质间的遗传距离和杂种优势

以3个芝麻细胞核雄性不育系和27个核心种质为试验材料,观测11个数量性状,进行主成分、遗传距离、系统聚类和杂种优势分析.结果表明,30个品种可分为5类,地理差异与分类没有必然的联系.不育系Ms01和Ms03同在第Ⅰ类,Ms02在第Ⅲ类.遗传距离与杂种优势之间对应关系不明显,杂种优势最强的组合是Ms02×ZZM2918,比对照种中芝10号增产22.97%.     

用遗传距离划分籼型水稻优势生态型

利用6个籼型水稻生态型的72份亲本为材料,对主要农艺性状进行主成分分析,以欧氏距离为指标,研究了各生态型间遗传差异。结果表明,云贵籼和华南籼之间的遗传距离最大,为6.345 1,韩国籼与IRRI籼之间的遗传距离最小,只有2.914 1。由于云贵籼和华南籼与其它生态型之间的遗传距离均较大,故初步将其确定为籼型水稻优势生态型。     

小麦抗麦红吸浆虫品种遗传多样性的表型和SSR标记分析

为更深入地揭示小麦抗麦红吸浆虫品种（系）的遗传多样性,从而为进一步选育抗虫品种提供依据,在对田间虫圃1 562份小麦品种（系）损失率鉴定的基础上,取47份年度间鉴定抗性结果较为一致的材料,利用表型和SSR标记,进行遗传多样性分析。这些抗麦红吸浆虫品种农艺性状表现出较大的差异,表型聚类在遗传距离为0.68处将供试材料分为6个类群。19对SSR标记在47份不同抗性品种中检测到104个等位基因,能够将所有品种区分开来,每对引物可以检测到3～8个等位基因,平均5.47个。47个小麦品种间遗传距离为0.40～0.95,平均为0.71。SSR标记聚类分析在遗传距离为0.74处将供试材料分为6大类群。Mental测验结果表明,表型同基因型距离矩阵间存在显著正相关（r=0.76,P〈0.05）。抗虫品种晋麦65号单独聚为一类,同其余品种具有较远的亲缘关系,可作为新的抗源用于抗虫育种,并在吸浆虫发生地块推广种植。     

糯玉米自交系的遗传距离分析及类群鉴定

应用多元统计分析法对50个糯玉米自交系的18个性状的表型平均值标准化,然后进行协方差分析和遗传相关分析,得到7个主成分因子,按主成分因子评价糯玉米自交系的优劣,并按照50个糯玉米自交系间的遗传距离进行聚类分析,得到7大类群。结果表明,糯玉米自交系间遗传距离大小与其表型差异、地理差异、亲缘关系并无必然联系,进行杂交育种时,亲本的选配和杂种优势的预测应以亲本间遗传距离大小作为重要依据。     

19个亚洲国家大麦种质材料的遗传多样性分析

为了解大麦种质材料的遗传多样性,并为合理选择育种亲本及保护与利用大麦种质资源材料提供依据,采用21对SSR荧光标记引物对来自19个亚洲国家的175份大麦种质材料进行遗传多样性分析,筛选出的19对SSR引物共检测到134个等位变异,平均每对引物检测到7.05个等位变异,其中SSR17位点对亚洲大麦基因组DNA变异检测最有效,其多态性信息含量指数(PIC)和标记指数MI均最高,分别为0.9和10.77;基于SSR数据,对19个亚洲国家175份大麦材料进行UPGMA聚类分析,结果聚为三组:组群Ⅰ共包含19个国家的161个品种;组群Ⅱ共包含4个国家的12个品种;组群Ⅲ只包括来自土库曼斯坦的2个品种。根据按国家划分的19个群体的遗传一致度数据,聚类分析可以分为3组群(其中组群1可分为4个亚组),主坐标分析可分为3个组群和7个亚组。本研究表明,聚类法和主坐标分析法结果基本吻合,均表明亚洲大麦种质资源存在丰富的变异,但主坐标分析法更精细。