蛋白质组学研究方法及应用的研究进展

蛋白质是细胞生理功能的具体执行者,并常以蛋白复合体或与核酸相互作用的形式来发挥作用。蛋白质组代表在一定时间和特定条件下,1个细胞、组织或生物个体所表达的全部蛋白,因此蛋白质组会随着时间和空间的改变而发生动态变化。蛋白质组学从整体水平研究蛋白质组的结构、功能、表达模式及其相互作用的方式。根据研究内容的不同,蛋白质组学可分为表达蛋白质组学、结构蛋白质组学和功能蛋白质组学等。研究蛋白质组学有助于了解蛋白的结构、细胞的功能、生命的本质及活动规律,为疾病的诊断、治疗、疫苗及新药开发提供科学依据。研究蛋白质组学的常用手段主要有：双向聚丙烯酰胺凝胶电泳、质谱、酵母双杂交系统及蛋白芯片法等,文章将对蛋白质组学常用的技术方法及应用进行综述。     

应用双向电泳分析2株不同毒力的副猪嗜血杆菌蛋白质表达的差异

副猪嗜血杆菌是猪常见细菌性疾病的病原之一,临床表现为多发性纤维素性浆膜炎、关节炎和脑膜炎。运用蛋白质组学技术对不同毒力的副猪嗜血杆菌(Haemophilus parasuis)进行比较研究,明确差异蛋白质信息,对揭示其致病机制具有重要意义。本试验通过应用建立的双向电泳方法对选取同为4型的2株不同H.parasuis临床分离株(菌株A和菌株B)进行蛋白质组学研究,二者相互比较,共鉴定出10个差异表达蛋白质,其中菌株A有3个蛋白质表达量为增加,分别是谷氨酰tRNA合成酶、半胱氨酸合成酶和假设蛋白;菌株B有7个蛋白质表达量为增加,包括Yae T蛋白(omp85)、CTP合酶、天冬氨酰tRNA合成酶(有3个)、尿苷激酶、SecB蛋白。差异蛋白质的功能主要集中在蛋白质合成、氨基酸合成和嘧啶合成。研究结果进一步丰富了H.parasuis的毒力因子和致病机制的相关信息,也为今后开展H.parasuis免疫蛋白质组学研究奠定了基础。     

家蚕差异蛋白质组学研究

2003年4月15日,美、英、德、日、法、中等6个国家共同宣布了人类基因组序列框架图的完成,这标志着生命科学进入了后基因组时代。到目前为止,已有大肠杆菌、秀丽线虫、果蝇、拟南芥、酿酒酵母、小鼠、家蚕等数十种生物的基因组序列图完成测序,并且还有上百种生物的基因组测序正在进行。蛋白质组学作为功能基因组学研究的主要内容,其研究模式主要有3种:第1种是检测蛋白质组理化参数的完全蛋白质组学;第2种是研究蛋白质间的相互作用;第3种是差异蛋白质组学——即通过比较分析不同状态下蛋白质表达图谱,实现对体内代谢调控的动态监测。近年来,越…     

基于质谱的蛋白质组学技术及其在绒毛用羊中的应用

蛋白质组学(proteomics)是指应用蛋白质分离、鉴定和定量的技术研究蛋白质组的一门学科,与之对应的蛋白质组学技术随之快速发展,基于质谱的蛋白质组学技术更是在相关领域广泛应用。作者主要就蛋白质的相互作用、差异蛋白质组学和蛋白质的定量研究,一些基于质谱的蛋白质组学技术的原理和优缺点,以及绒毛用羊毛囊研究现状和基于质谱的蛋白质组学技术在绒毛用羊中的应用进展等方面进行了综述。最后,对蛋白质组学技术在绒毛用羊毛囊研究中的应用前景做出展望。     

植物低温胁迫蛋白质组学研究进展

寒害是一种主要的非生物胁迫因子,限制了许多植物的产量和地理分布,寒害胁迫能引起大量蛋白质在种类和表达量上的变化。蛋白质组学是后基因组时代功能基因组学研究的新兴学科和热点领域。蛋白质组学的分析有助于详细了解寒害胁迫的伤害机制以及植物的适应机制,目前已应用于拟南芥Arabidopsis thaliana、水稻Oryza sativa等模式植物,以及其它一些草本、木本植物上,对发生变化的蛋白质的种类及功能等进行了鉴定。     

微生物蛋白质组学研究现状

正随着人类基因组的绘制成功,标志着后基因组时代的到来。由于基因的功能主要是通过其表达的蛋白质来实现,要了解该基因的全部信息,必须对其编码的蛋白质进行深入研究。蛋白质组学分析为研究微生物的生命活动和细胞功能提供了广阔的视野。因此,蛋白质组学在生命科学研究中具有十分重要的位置,随着研究的不断深入,蛋白质组学必将对人类的生活和生产带来十分重大的影响。本文主要就目前微生物蛋白质组学的研究现状进行简要阐述。     

蛋白质组学技术在人乳与牛乳中的研究进展

乳蛋白是生命最初阶段中最为重要的营养功能成分,并且种类多样、含量丰富.通过一系列的遗传改变、丰富的蛋白质翻译后修饰,使乳蛋白的构成变得非常复杂、数量异常庞大.采用蛋白质组学方法对乳蛋白进行系统、整体地研究,可以认识乳蛋白质在构成以及调控一些生命活动中的规律.这样能够非常全面、深入地表明乳蛋白质的表达水平.本文阐述了蛋白质组学中的主要技术,包括双向电泳技术、高效液相色谱技术、同位素标记相对和绝对定量(isobaric tags for relative and absolute quantitation,iTRAQ)技术、质谱技术以及生物信息学技术.分别讨论了蛋白质组学技术在人乳、牛乳中的应用,并对人乳与牛乳的差异蛋白质组学进行讨论.利用蛋白质组学技术分析人乳与牛乳蛋白,能够更有目的地加强对人乳与牛乳的认识,旨在为婴幼儿食品以及乳制品提供理论依据.     

家蚕蛋白质组研究进展

蛋白质组学是后基因组学研究的重要内容,是功能基因组学研究的重要组成部分。近几年来,家蚕蛋白质组的研究越来越受到人们的重视,包括家蚕丝腺、血液、脂肪体、中肠、马氏管等10多种组织器官的蛋白质组都已成为人们研究的热点,大量高水平家蚕蛋白质组学研究论文相继发表。本文将对近几年内家蚕蛋白质组学的研究进展做归纳整理,并对家蚕蛋白质组学未来的发展趋势进行展望。     

基于label-free技术的梅花鹿(Cervus nippon)茸角蛋白组分比较

旨在探究不同生长时期梅花鹿鹿茸的蛋白质组分信息,为鹿茸有效活性物质的挖掘提供理论依据。本研究利用label-free蛋白质组学技术及生物信息学方法对不同生长时期(10、20、40、60、130与360天)梅花鹿茸角蛋白质组分进行比较研究。结果显示,梅花鹿茸角含有丰富的蛋白质,10、20、40、60、130与360天蛋白质含量依次为65.35、70.90、74.00、82.25、56.00、28.02 mg·g~(-1)。应用label-free蛋白质组学技术共鉴定出636种梅花鹿茸角蛋白质,其中218种蛋白质为显著差异表达,主要参与了蛋白质合成、发育、细胞骨架、转运等生物学过程。不同生长阶段茸角的蛋白质表达有各自的特点,为梅花鹿茸角药理活性成分的筛选及茸角相关产品的开发奠定理论基础。     

鸡蛋黄中蛋白质研究进展

鸡蛋蛋黄中蕴含丰富的蛋白质,占蛋黄总重量的17％,其种类繁多,并且具有特殊的功能特性.目前最新的鸡蛋蛋黄蛋白质组学研究,通过组合式肽配体库(CPLL)在蛋黄中发现了255种蛋白质[1].但在蛋黄贮存期间,时间、温度以及理化因素等对蛋黄蛋白质变化的影响,目前报道的还比较少.本文介绍了蛋黄蛋白质组学的研究状况、鲜蛋与贮存蛋的蛋白质在蛋清和蛋黄间的分布情况、鸡胚胎发育期间蛋黄蛋白质含量变化以及辐照对蛋黄的影响等,并对蛋黄蛋白质的研究前景进行了展望.