Sequence homogeneity of the ψserA-trmU-tufB-secE-nusG-rplKAJL-rpoB gene cluster and the flanking regions of ‘Candidatus Liberibacter asiaticus’ isolates around Okinawa Main Island in Japan

In Japan and Southeast Asia, ‘Candidatus Liberibacter asiaticus’ (Las) is the dominant causal agent of citrus greening (huanglongbing) disease. Using PCR techniques, we determined the 11168-nucleotide sequence of the ψserA-trmU-tufB-secE-nusG-rplKAJL-rpoB gene cluster and the flanking regions for 51 Japanese, four Taiwanese, four Indonesian, and three Vietnamese isolates of Las. The sequence is identical in 62 isolates collected from Japan, Taiwan, Indonesia, and Vietnam, except for nucleotide substitutions at 11 positions. Some Las isolates from Sakishima Islands near Taiwan had unique nucleotide mutations, but all Las isolates around Okinawa Main Island were homologous. On the basis of the pattern of single nucleotide polymorphisms (SNPs) of the 11 nucleotide substitutions, the 62 Las isolates from Japan, Taiwan, Indonesia, and Vietnam could be divided into 12 pattern groups, and the 51 Japanese isolates consisted of six patterns. The results suggested that one unique genetic group is dominant around Okinawa Main Island, whereas several different are commonly distributed around islands near Taiwan.     

水稻条斑病细菌hrp调节基因hrpGXooc和hrpXooc的克隆和序列分析

 Xanthomonas oryzae pv. oryzicola基因文库的hrp基因克隆pUHRS138携39.3-kb大小的hrp基因片段。经系列亚克隆和对hrp^-突变体的功能互补验证,4.5-kb BamHI-KpnI为最小功能片段,该片段可使X. o. pv. oryzicola的hrp^-突变体恢复在烟草上激发产生HR和在水稻上具致病性。序列测定和分析显示,4.5-kb hrp片段中含hrpXooc和hrpG_Xooc基因。单独的hrpG_Xooc和hrpXooc不能功能互补hrp^-突变体。hrpXooc与其它黄单胞菌中已克隆的hrpX的同一性达83%以上,推测的蛋白质水平上的差别主要在32、141、164、175、213、247和357位点上。HrpX序列中α-螺旋-转-α-螺旋结构在黄单胞菌中高度保守。hrpG_Xooc与水稻白叶枯病菌的hrpGXoo同一性达96%,与X. campestris pv. vesicatoria的hrpG_Xcv同一性达87%,与Ralstonia solanacearum的hrpG_Rs同源性较低,4种HrpG蛋白质水平上的差别主要集中在22、29、115和252位点上。HrpGXooc和HrpGXcv同列比较显示,3~9和216~220区域的氨基酸序列有所不同,可能反映了HrpG蛋白在感知环境信号和调节hrp基因表达方面的差别。     

稻瘟菌无毒基因AVR-Pikm的定位

 无毒基因是病原物中决定寄主抗病性表达与否的功能基因,其功能的丧失导致毒性小种的产生。在先前的研究中,本研究小组从稻瘟病菌中分离了与无毒基因AVR-Pik^m连锁的2个SCAR标记SCO12₉₄₆和SCE12₁₄₀₆。在本研究中,作者首先通过TAC克隆末端核苷酸序列的测定及其与70-15全基因组序列的比较,将这2个标记定位到稻瘟菌第1号染色体上;然后,利用稻瘟菌70-15全基因组草图序列和SSR技术,又分离了与无毒基因AVR-Pik^m连锁的4个SSR标记:SSR47T34、SSR50CA24、SSR52TAGG18和SSR56A28。进一步分析表明:上述4个SSR标记位于与SCO12₉₄₆和SCE12₁₄₀₆相反的一侧,与AVR-Pik^m位点的遗传距离分别为4.90、7.01、19.12和21.94cM,无毒基因AVR-Pik^m位于SCE12₁₄₀₆和SSRA7T34之间。本研究获得的稻瘟菌无毒基因AVR-Pik^m的精细定位为通过染色体步移克隆该基因奠定了基础。     

转基因烟草中PVYN CP基因沉默及其介导的抗病性受温度的调控

 本研究以转不可翻译的马铃薯Y病毒坏死株系外壳蛋白基因(PVY^N CP)烟草的T₃代植株为材料,在获得高度抗病植株并证明转基因植株的抗病性是由RNA沉默介导的基础上,采用Northern杂交及ELISA检测病毒的方法,分析了温度对转基因烟草中RNA沉默以及转基因植株抗病水平的影响。结果表明,低温可以改变转基因植株中已发生的RNA沉默和转基因植株的抗病状态。在15℃低温下生长的转基因植株,转基因产生的RNA沉默被抑制,转基因植株失去了对PVY^N高度抗病的特性,表现感病症状;而在25℃或以上高温(30℃、35℃)下生长的转基因植株,转基因产生的RNA沉默没有发生被抑制的现象,转基因植株对PVY^N病毒的侵染仍保持高度抗病性。     

基于避蚊胺/β-环糊精/O-羧甲基壳聚糖亲水性纳米胶囊载药及缓释性能研究

为了改善避蚊胺（diethyltoluamide,以下简称DEET）在水中的溶解度,首先采用饱和溶液法制备了避蚊胺/β-环糊精（diethyltoluamide/β-cyclodextrin,以下简称DEET/β-CD）包合物,其结构通过差示扫描量热仪（DSC）和X-射线衍射仪（XRD）表征;再采用离子交联法,以氯化钙为交联剂,制备了避蚊胺/β-环糊精/O-羧甲基壳聚糖（diethyltoluamide/β-cyclodextrin/O-carboxymethyl chitosan,以下简称DEET/β-CD/O-CMC）亲水性纳米胶囊,用紫外-可见分光光度计（UV）、激光粒度分析仪和扫描电子显微镜（SEM）考察其理化性质;最后,考察包合物和纳米胶囊的缓释性能。结果表明:DEET与β-CD以物质的量之比1:1进行了包合,β-CD的加入使DEET的溶解度增加约27倍,该纳米胶囊的包封率为（79.93±2.08）%,载药量为（12.11±0.09）%,纳米胶囊呈椭圆形,平均粒径为（230.50±11.34）nm,Zeta电位为（–19.08±0.99）mV,PDI为0.055。在Tris-HCl（pH=7.4）缓冲液中释放试验显示,DEET/β-CD/O-CMC亲水性纳米胶囊比DEET/β-CD包合物有更好的缓释性能,24 h累积释放率分别为27.04%和38.10%。     

一个新的与稻瘟病菌无毒基因AVR-Pikm紧密连锁的SCAR标记

 无毒基因是病原物中决定寄主抗病性表达的功能基因,其功能的丧失导致毒性小种的产生。本研究利用随机引物扩增DNA多态性技术,从稻瘟病菌菌株S1522中新筛选到1个与无毒基因AVR-Pik^m紧密连锁的DNA标记OPE12₁₄₀₀。根据OPE12₁₄₀₀的核苷酸序列,设计了1对含有17个核苷酸的特异性SCAR引物,并利用该引物对无毒表型亲本S1522和毒性表型亲本S159及其有性杂交后代的108个菌株进行了PCR扩增。结果表明:所有无毒表型的菌株均能特异性扩增出1条与OPE12₁₄₀₀大小相近的DNA片段,而毒性表型的菌株除2个重组体外,均不能扩增出此片段。根据计算,这一SCAR标记与目标无毒基因AVR-Pik^m之间的遗传距离为1.89 cM,与本研究小组先前报道的另一个标记OPO12₁₀₀₀位于目标基因的同一侧,但与OPO12₁₀₀₀相比,距目标基因近了2.86 cM。本标记的获得将有助于确定AVR-Pik^m在染色体上的位置,有助于确定用于进一步筛选位于相反一侧的连锁标记的重叠群区域。     

单嘧磺酯的HPLC/MS/MS研究

采用反相高效液相色谱和质谱联用技术(HPLC/MS),以电喷雾电离质谱(ESI/MS)和大气压化学电离质谱(APCI/MS),研究了单嘧磺酯的质谱特征。单嘧磺酯的ESI/MS正离子模式主要形成 +、 +、 +、 +等准分子离子峰和金属离子加合离子峰及二聚离子峰;ESI/MS负离子模式主要形成 -和 -;单嘧磺酯质谱裂解形成的碎片离子得到了ESI多级质谱的证实。而APCI/MS主要形成 +、 -及与单嘧磺酯结构有关的碎片离子峰(m/z:110.31,136.24,168.18,244.19)。ESI/MS和APCI/MS负离子模式扫描形成明显的准分子离子峰且干扰小,可用于单嘧磺酯的结构表征和定性分析。APCI/MS正离子模式则有助于分析单嘧磺酯的碎片离子裂解方式。