高邮鸭生长抑制素基因外显子3多态性与腹脂率的关联分析

本研究采用PCR-SSCP技术检测了2个不同高邮鸭群体和1个绍鸭群体肌肉生长抑制素基因(Myostatin,MSTN)外显子3的单核苷酸多态性,并与腹脂率进行关联性分析。结果表明,在MSTN基因外显子3的第2701bp处检测到G→A的同义突变。在3个鸭群中,均检测到3种基因型(AA、BB和AB基因型),且都以B等位基因为优势等位基因。最小二乘法分析结果表明,不同基因型对高邮鸭群的腹脂率有显著影响;BB型高邮鸭腹脂率显著高于AB型和AA型(P<0.05)。新组建闭锁群BB基因型频率低于原闭锁群,但未达到显著水平。就外显子3而言,MSTN基因作为影响腹脂率的候选基因有待于进一步的研究。     

7个品种鸭MSTN基因5’-调控区单核苷酸多态性研究

为了研究肌肉生长抑制素(MSTN)基因在鸭群体中的遗传变异情况,试验以莆田黑鸭、连城白鸭、绍兴鸭、攸县麻鸭、建昌鸭、高邮鸭及北京鸭为材料,采用连接酶检测反应(LDR)的方法对MSTN基因5’-调控区第1 024位点单核苷酸多态性(SNP)进行基因分析,并统计该位点在群体中的基因型频率、等位基因频率和Hardy-Weinberg平衡情况。结果表明:在7个品种鸭中,检测MSTN基因第1 024位点均含CC、CG和GG 3种基因型。在连城白鸭、攸县麻鸭和高邮鸭中,CC基因型占优势,且以连城白鸭最高(0.72);在高邮鸭和建昌鸭中,CG基因型占优势;在北京鸭中,GG基因型占优势;在绍兴鸭中,CC基因型、CG基因型出现的频率相同。建昌鸭和北京鸭等位基因G的频率高于等位基因C的频率,其他品种鸭均为等位基因C的频率大于等位基因G的频率。莆田黑鸭、连城白鸭、绍兴鸭、攸县麻鸭、北京鸭和高邮鸭MSTN基因在第1 024位点均处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05),仅有建昌鸭不符合Hardy-Weinberg平衡状态(P<0.05)。     

不同群体高邮鸭生长及屠宰性能的比较研究

本实验旨在研究3个不同群体高邮鸭和1个绍鸭群体的生长及屠宰性能。以4个群体各90羽(公、母各半)为研究对象,相同条件下饲养,记录初生重和3～10周龄各个体体重。于10周龄屠宰,记录主要屠宰性能指标。结果表明:3个不同群体的高邮鸭初生重差异极显著(P<0.01),以新组建群初生重为最高,保护区高邮鸭群体最低,闭锁群居中。新组建群半净膛率、全净膛率高于闭锁群,腹脂率稍低于闭锁群,但差异不显著(P>0.05)。在4个群体中高邮鸭闭锁群平均腹脂率最高(2.18%),而绍鸭平均腹脂率最低(1.09%),差异极显著(P<0.01)。高邮鸭原闭锁群、保护区群和绍鸭母鸭腹脂率显著(P<0.05)或极显著(P<0.01)高于公鸭。     

高邮鸭MSTN 5′端非编码区SNP突变与生长性状的关联分析

研究利用连接酶检测反应,在高邮鸭群体中筛选出了对肌肉行负调控作用的MSTN基因5′端非编码区的一个SNP位点,该位点为C627452T(BGI_duck_1.0)的突变。此突变位点处于中度多态,具有较高的遗传多样性。其中CC基因型群体在49日龄的体重、胸大肌重、胸大肌横截面积以及胸大肌纤维直径均显著高于TT基因型群体(P0.05),CT基因型上述表型值均介于CC基因型和TT基因型之间,且显著高于TT基因型(P0.05)。结果表明,在肉用性能上C等位基因明显优于T等位基因,可以通过精准剔除T等位基因达到加速育种进程的目的。     

北京鸭肌肉生长抑制素基因多态与屠体性状关系分析

肌肉生长抑制素（Myostatin,MSTN）基因在发育和成熟的骨骼肌中特异表达,对肌肉具有负调控作用。应用聚合酶链式反应单链构象多态性（PCR-SSCP）的方法,对6周龄北京鸭2个群体（Z2系和Z4系）共200个个体Myostatin基因5’调控区进行SNP分析,并对所发现的单核苷酸多态性与胴体重、胸肌重、腿肌重、全净膛重、皮脂重、腹脂重、骨架重、胸肌率、腿肌率、皮脂率、腹脂率进行了关联分析。结果发现,A1/A2位点基因型（AA和AB型）对6周龄Z2系和Z4系北京鸭的腹脂重（P＜0.05）和胸肌重（P＜0.10）有显著影响,因此可以将Myostatin基因作为影响北京鸭Z2系和Z4系腹脂重和胸肌重的候选基因。     

高邮鸭VLDLR基因部分序列的多态性及其与腹脂率的关联分析

极低密度脂蛋白受体(VLDLR)主要功能是结合富含载脂蛋白E的脂蛋白参与甘油三酯的代谢。通过基因测序方法检测了高邮鸭VLDLR基因部分序列的多态性,并利用最小二乘法分析其与腹脂率的关联性。结果显示:在第244 bp处发现G/A转换,同时在第232 bp处发现C/T转换。群体中第244 bp处等位基因G为优势等位基因,基因频率为0.76,该位点属于同义多态;第232 bp处等位基因C为优势等位基因,基因频率为0.94,该位点属于同义突变。通过卡方检验,两位点均处于Hardy-Weinberg遗传平衡状态(P0.05)。最小二乘法分析结果表明,高邮鸭VLDLR基因第244 bp处AG型平均腹脂率(1.52%)极显著低于AA型和GG型(P0.01);AA基因型腹脂率高于GG型,但两者之间差异不显著。这可能是一种杂合子优势,推测这种多态可能是通过改变VLDLR基因转录的效率而影响到脂肪沉积的。     

拜城油鸡肌肉生长抑制素基因多态性与生产性能的相关性研究

试验旨在研究肌肉生长抑制素（myostatin,MSTN）基因在拜城油鸡中的多态性及其与生产性能的关系,探寻可用于拜城油鸡选育的分子遗传标记。选取96只6周龄的拜城油鸡公鸡,随机分为3组,每组32只,分别在12、18和24周龄时对其生产性能指标进行测定,同时采用PCR-RFLP方法检测MSTN基因的多态性,分析MSTN基因多态性与拜城油鸡生产性能的关系。结果显示,在拜城油鸡公鸡中MSTN基因存在多态性,检测到3种基因型:AA、GA、GG,GA为优势基因型,等位基因A为优势等位基因,不符合哈代－温伯格平衡定律（P<0.05）。在12周龄时,AA基因型个体的体重、屠体重、半净膛重、全净膛重、胸肌重和腿肌重均显著高于GA基因型个体（P<0.05）;在18周龄时,GA基因型个体的体重、胸肌重和腿肌重均显著高于GG基因型个体（P<0.05）;在24周龄时,AA基因型个体的体重、屠体重和半净膛重均极显著高于GG基因型个体（P<0.01）,全净膛重和腿肌重显著高于GG基因型个体（P<0.05）,GA基因型个体的体重、屠体重、半净膛重和腿肌重均显著高于GG基因型个体（P<0.05）,其余指标在不同周龄不同基因型个体间差异不显著（P>0.05）。MSTN基因多态性与拜城油鸡部分生产性能指标密切相关,推测该基因可以作为拜城油鸡选育的分子遗传标记之一。     

鸡apoB基因T123G多态位点与生长和体组成性状的相关性研究

载脂蛋白B（apoliprotein B，apoB）在能量的转运和代谢过程中具有重要作用，是研究生长和体组成性状的重要候选基因。以东北农业大学高、低腹脂双向选择品系第8世代仔鸡为试验材料，对鸡apoB基因进行SNP检测，探讨npoB基因与生长和体组成性状（尤其是体脂）的关系。本研究通过测序的方法在apoB基因26外显子上发现SNP（T→G），相关性研究结果表明该突变位点对1周龄体重、3周龄体重、7周龄腹脂重和腹脂率有显著影响（P〈0．05）。对于1周龄体重，基因型为GT的个体显著高于GG个体；而3周龄体重，基因型为TT和GT的个体显著高于GG个体；对于腹脂重和腹脂率，TT基因型个体显著高于GT和GG基因型个体（P〈0．05）。群体遗传学分析表明该位点的基因型在两系间差异显著（P〈0．05）。因此初步推断apoB基因可能是控制生长发育、腹脂沉积的主基因或与主基因紧密连锁。     

鸡MSTN基因多态性及其与屠体性状的关联分析

为了探明肌肉生长抑制素(Myostatin,MSTN)基因对鸡屠体性状的影响,以优质鸡S3系为研究对象,采用PCR-RFLP及测序技术进行多态性检测.结果发现MSTN基因存在G195C和A234G 2个突变位点,均出现3种基因型.公鸡群体在G195C位点处于非Hardy-Weinberg平衡状态(P＜0.05),各群体在G195C和A234G位点均处于Hardy-Weinberg平衡状态(P＞0.05).最小二乘方差分析显示,MSTN基因A234G位点处GG基因型S3系优质公鸡半净膛率和全净膛率显著高于AG基因型(P＜0.05),而AA型与GG型和AG型在这两项上差异不显著(P＞0.05);G195C位点CC基因型S3系优质母鸡的半净膛率、全净膛率、胸肌重和腿肌重均显著高于GG基因型(P＜0.05),GC型与GG型和CC型均不显著(P＞0.05).因此,MSTN可能是影响鸡骨骼肌生长的一个主效基因或与控制该性状的主效基因连锁,能够作为候选基因用于地方鸡屠体性状的分子标记辅助选择.     

澳洲白绵羊美丽臀和肌肉生长抑制素基因基因型的检测

美丽臀(callipyge,CLPG)及肌肉生长抑制素(myostatin,MSTN)是全世界公认的与肌肉生长发育相关的基因,突变后分别产生“美丽臀”和“双肌”的优良性状。为研究国外进口品种澳洲白绵羊是否携带2种基因的突变位点,本试验以澳洲白绵羊为试验动物,采用PCR-RFLP技术对CLPG、MSTN基因的多态性进行分型。结果发现:CLPG基因上有1个C→T的SNP位点,澳洲白绵羊群体中有CC和CT 2种基因型;MSTN基因在3'-UTR区发现1个G→A的SNP位点,澳洲白绵羊群体中有GG和GA 2种基因型。用R语言程序对所测数据进行性别间不同基因型与生长发育状况的单因素方差分析得知,CLPG和MSTN基因不同基因型对澳洲白公羊体重、体高、体斜长、尻宽、背膘厚和眼肌面积均无显著性影响(P>0.05);CLPG基因CT基因型在母羊体重上显著高于CC基因型(P<0.05),在体斜长上极显著高于CC基因型(P<0.01),MSTN基因GA基因型母羊眼肌面积极显著高于GG基因型(P<0.01)。澳大利亚进口澳洲白绵羊中筛选到含有CLPG和MSTN基因的突变位点,且该突变位点对绵羊体尺性状有显著性作用,因此澳洲白绵羊引进后可以作为改良本地羊品种、基因聚合及三元配套系的终端父本。     

鸡IGF-Ⅰ基因单核苷酸多态性及其与屠体性状关系的研究

本研究采用PCR-RFLP技术,对438只黄羽矮小型肉鸡的胰岛素样生长因子-Ⅰ基因(IGF-Ⅰ)的5′端进行遗传多态性研究,发现该区域的PCR扩增产物经Hinf Ⅰ酶切后出现GG、GT和TT 3种基因型。经χ2检验,群体在该位点上处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05)。方差分析结果显示,性别对9个性状(活体重、屠体重、皮脂厚、半净膛、全净膛、胸肌重、腿肌重、腹脂重、腹脂率)有极显著影响(P<0.01),对肌间脂肪含量有显著影响(P<0.05)。家系效应在8个性状上(活体重、屠体重、半净膛、全净膛、胸肌重、腿肌重、腹脂重、腹脂率)达到极显著水平(P<0.01);而基因型效应只在腹脂率上达到显著水平(P<0.05),腹脂重没有达到显著水平(P=0.0669)。不同基因型的最小二乘均值间多重比较结果发现,TT型的腹脂重和腹脂率均显著低于GT型(P<0.05),而GG型和GT、TT型的差异不显著(P>0.05)。     

延边黄牛UCP2、UCP3基因多态性及其与生长性状的关联分析

试验旨在探究延边黄牛解耦联蛋白2（uncoupling protein 2,UCP2）和解耦联蛋白3（uncoupling protein 3,UCP3）基因多态性及其与生长性状的相关性。以120头24月龄的延边黄牛为试验对象,提取血液基因组DNA后构建混池,运用DNA测序法对UCP2、UCP3基因进行测序分析,应用高分辨率熔解曲线分型技术对延边黄牛UCP2、UCP3基因进行分型检测,并结合生长性状数据进行关联分析。结果显示,在24月龄延边黄牛群体中,UCP2基因53 412 568 bp处存在C>G突变（g.53412568 C>G）,产生2个等位基因：C和G,形成3种基因型：CG （0.358）、GG （0.125）和CC （0.516）;UCP3基因53 443 536 bp处存在C>T突变（g.53443536 C>T）,产生2个等位基因：C和T,形成3种基因型：CT （0.383）、CC （0.450）和TT （0.167）。关联分析显示,UCP2基因g.53412568 C>G位点CC基因型体重、腰角宽均显著高于GG基因型,CG基因型个体背高显著高于GG基因型（P<0.05）;UCP3基因g.53443536 C>T位点CC基因型胸围显著高于TT基因型（P<0.05）。以上结果表明,UCP2和UCP3基因在延边黄牛生长发育过程中起到一定作用,可为延边黄牛现代分子育种后续研究提供参考。     

拜城油鸡FSHR基因多态性及其与生产性能的关联分析

【目的】探究促卵泡激素受体(follicle stimulating hormone receptor,FSHR)基因多态性与拜城油鸡产蛋性状、蛋品质及孵化性能的关系,为选育高生产性能的种鸡提供新的分子标记。【方法】以129只拜城油鸡为研究对象,利用DNA混池重测序技术筛选SNPs位点,采取Sequenom飞行时间质谱技术进行相关位点分型,通过SPSS 26.0软件的一般线性模型进行FSHR基因多态性与拜城油鸡生产性能的关联分析。【结果】FSHR基因外显子1上存在2个SNPs位点:SNP1(g.7640519 C＞A)、SNP2(g.7640639 T＞C);外显子4和5上分别存在1个SNP位点:SNP3(g.7692270 C＞T)、SNP4(g.7698478 A＞G);外显子10上存在3个SNPs位点:SNP5(g.7716725 G＞C)、SNP6(g.7715900 A＞G)、SNP7(g.7716470 T＞C),除SNP6外,检出率均在90%以上。SNP1位点仅检测到2个基因型:CC和CA,CC为优势基因型;SNP2、SNP3和SNP7位点均存在3种基因型:TT、TC和CC;SNP4位点存在3种基因型:AA、AG和GG;SNP5位点存在3种基因型:CC、CG和GG。相关分析结果表明,SNP2位点CC基因型个体开产日龄极显著高于TT基因型(P＜0.01),显著高于CT基因型(P＜0.05);TT基因型个体蛋重显著高于CT基因型(P＜0.05),入孵蛋死胚率显著高于CC基因型(P＜0.05)。SNP3位点TT基因型个体蛋壳厚度显著高于CC基因型(P＜0.05)。SNP5位点CG基因型个体300日龄总产蛋量极显著高于CC和GG基因型(P＜0.01),300日龄平均蛋重和开产蛋重均显著高于GG基因型(P＜0.05),开产体重显著高于CC基因型(P＜0.05);GG基因型个体蛋壳厚度显著低于CC和CG基因型(P＜0.05)。SNP7位点TT基因型个体开产蛋重和个体蛋重均显著高于CC和CT基因型(P＜0.05),蛋白高度和蛋黄重均显著高于CT基因型(P＜0.05),哈氏单位值极显著高于CC和CT基因型(P＜0.01)。【结论】FSHR基因SNP5(g.7716725 G＞C)位点CG基因型可作为影响拜城油鸡产蛋性能的标记基因型,SNP7(g.7716470 T＞C)位点TT基因型可作为影响拜城油鸡蛋品质的优势基因型。     

鸡PRR5L基因5'UTR多态性及其与脂肪性状、屠体性状的关联分析

试验旨在研究类富脯氨酸5（proline rich 5 like，PRR5L）基因遗传变异对鸡脂肪性状及屠体性状的影响。以矮脚黄鸡为研究对象，根据GenBank公布的鸡PRR5L基因全序列（登录号：XM_015287209.1）设计扩增引物，利用PCR直接测序技术检测PRR5L基因的5'UTR区域单核苷酸多态性（SNPs），并用统计学方法分析其与鸡脂肪性状及屠体性状的关联性。结果发现，PRR5L基因5'UTR区域存在C480G、G514A和A579G 3个多态位点，均表现出3种基因型。χ²适合性检验结果发现，群体在G514A位点处于Hardy-Weinberg非平衡状态（P < 0.05）；在C480G和A579G位点均处于Hardy-Weinberg平衡状态（P > 0.05）。基因型与性状关联分析结果显示，在脂肪性状方面，PRR5L基因3个多态位点各基因型间腹脂重、腹脂率和肌内脂肪含量差异均不显著（P > 0.05）；在屠体性状方面，在G514A位点处AG与GG基因型的胸肌重差异显著（P < 0.05），其余指标差异均不显著（P > 0.05）。因此，可推断PRR5L基因5'UTR的G514A位点可能是一个影响鸡胸肌生长发育的位点，但该位点能否作为标识鸡屠体性状的分子标记辅助选择还需要进一步探究。     

中国荷斯坦牛Toll样受体4基因的遗传多态性与体细胞评分的关联分析

试验旨在研究中国荷斯坦牛Toll样受体4(toll-like receptor 4,TLR4)基因的遗传多态性及其与体细胞评分(somatic cell score,SCS)的关联性,寻找与乳房炎相关的分子标记,加快中国荷斯坦牛的抗病育种。利用PCR-RFLP和PCR-SSCP技术对30个公牛家系的610头中国荷斯坦牛TLR4基因进行多态性检测,用最小二乘均数法对TLR4基因的多态位点与SCS进行相关分析。结果发现,试验共检测到2个单核苷酸多态(single nucleotide polymorphisms,SNPs),TLR4基因5'侧翼区存在SNP -226 G>C突变,经PCR-RFLP检测发现3种基因型:GG、GC和CC,基因型频率分别为0.208、0.482和0.310;外显子3存在SNP 1760 C>T突变,经PCR-SSCP检测发现3种基因型:CC、TC和TT,基因型频率分别为0.738、0.225和0.007,以上2位点均偏离Hardy-Weinberg 平衡。对于SNP -226 G>C位点,基因型个体的SCS差异不显著;对于SNP 1760 C>T位点,CC基因型个体的SCS最小二乘均值极显著低于TT和TC基因型个体(P<0.01)。SNP 1760 C>T的CC基因型对于中国荷斯坦牛的SCS有较大的遗传效应,可作为分子标记应用于奶牛乳房炎抗性筛选。     

中国草原红牛PDK4基因多态性及其与肉质性状的关联分析

【目的】 研究中国草原红牛丙酮酸脱氢酶激酶4（pyruvate dehydrogenase kinase 4，PDK4）基因多态性与肉质性状的关系。【方法】 挑选120头中国草原红牛为研究对象，采用Sanger测序法检测PDK4基因第1~11外显子的单核苷酸多态性（SNP）位点，分析SNP位点的基因型频率、基因频率及群体遗传参数等。利用SPSS 21.0软件对中国草原红牛PDK4基因SNP位点多态性与肉质性状（熟肉率、肉嫩度、失水率、pH、滴水损失、肌内脂肪含量、初水分含量、蛋白质含量）进行关联分析。【结果】 在中国草原红牛PDK4基因外显子8和外显子11上共检测到3个SNPs；PDK4基因第8外显子57 bp处存在1个SNP位点（G57C），且引起编码氨基酸的改变，存在GG、GC和CC 3种基因型；PDK4基因第11外显子在330和389 bp处存在2个SNPs位点（G330T和C389T），在G330T位点上存在GG、GT和TT 3种基因型；在C389T位点上存在CC、CT和TT 3种基因型。卡方适合性检验结果显示，中国草原红牛第8外显子G57C位点偏离Hardy-Weinberg平衡状态（P<0.05），第11外显子的G330T和C398T符合Hardy-Weinberg平衡状态（P>0.05）；群体遗传参数分析发现，第8外显子G57C突变位点属于低度多态性位点（PIC<0.25），等位基因数为1.1429，表明其在中国草原红牛中的变异较小；第11外显子G330T和C398T属于中度多态性位点（0.25<PIC<0.5），等位基因数分别为1.6431和1.6447，说明该遗传标记能够提供遗传信息。关联分析结果表明，PDK4基因第8外显子中G57C位点GG和CC基因型个体肌内脂肪含量显著高于GC基因型（P<0.05）；第11外显子G330T位点GG基因型滴水损失和初水分量显著高于GT基因型（P<0.05）；GG基因型肉嫩度显著高于TT基因型（P<0.05）；GT基因型肌内脂肪含量显著高于TT基因型（P<0.05），C389T处CT基因型失水率显著低于TT基因型（P<0.05）。【结论】 PDK4基因多态性与中国草原红牛肉质性状相关，可作为肉质性状的候选基因。     

兴义鸭肌肉生长抑制素基因多态性与屠宰性状的相关性分析

为了解兴义鸭肌肉生长抑制素(myostatin,MSTN)基因SNPs与屠宰性状的相关性,本研究采用基因克隆及PCR产物直接测序的方法,将MSTN基因作为鸭屠宰性状的候选基因,对兴义鸭的MSTN基因外显子进行多态性检测.结果表明,在60个兴义鸭个体中筛选出8个SNPs,其中,第1外显子有5个突变位点:SNP1(G77A)、SNP2(A91G)、SNP3(G130A)、SNP4(C325T)和SNP5(C331T);在第2外显子中并未发现突变位点;第3外显子有3个突变位点:SNP6(C206T)、SNP7(A235G)和SNP8(C256A);对这8个SNPs与屠宰性状进行关联性分析,结果并未达到显著水平(P>0.05).本研究结果可丰富MSTN基因的研究数据,为鸭的育种提供参考.     

湖羊PLAG1基因5'调控区多态性及其与早期体重的关联分析

旨在克隆湖羊PLAG1基因5'调控区序列,明确PLAG1基因5'调控区多态性与湖羊早期体重的关系,寻找用于湖羊生长性状辅助选择的分子标记.本研究利用5'RACE技术鉴定PLAG1基因转录起始位点,以456只断奶湖羊为对象,利用测序法筛选PLA G1 5'调控区SNP位点,使用SPSS 18.0软件分析不同基因型对湖羊初...