3种不同羽色鸡MC1R基因SNPs鉴定及羽色相关性分析

为了深入挖掘与鸡羽色形成密切相关的SNPs位点,以略阳黑羽乌鸡、青脚麻鸡和丝羽乌鸡为研究对象,对3个品种70个样本的MC1R基因序列进行序列比对,分析序列变异导致的MC1R氨基酸变异、蛋白质结构和性质的变化,进行SNPs与羽色的相关性分析。结果表明:3个鸡种MC1R基因CDS区大小没有差异,均为945 bp,但品种间DNA序列存在序列变异,共检测到8个SNPs位点,其中4个SNPs位点引起错义突变:212(T/C)、398(T/C)、637(T/C)和644(A/C),且与鸡羽色极显著相关(P0.001)。基于SNPs造成的氨基酸序列变异,以红原鸡MC1R氨基酸序列为参考,将其定义为I型,在略阳黑羽乌鸡、青脚麻鸡和丝羽乌鸡发现了Ⅱ型、Ⅲ型、Ⅳ型和Ⅴ型4种MC1R类型,并对4种类型的理化性质、二级结构和三级结构进行比较分析,发现不同类型的氨基酸差异位点均不在跨膜区上,α-螺旋、β-折叠和无规则卷曲比例均存在差异,蛋白质三级结构也存在一定变化。研究表明,在3个不同羽色鸡种上检测到的8个SNPs中,有4个导致MC1R蛋白理化性质和结构的变化,进而影响MC1R蛋白功能。     

放养鸡规模化养殖及疾病防治的初步探讨

1品种及场地的选择 1．1放养鸡品种主要选本地黑土鸡、怀化的青脚黑鸡、麻鸡、湖西黑鸡,广东的三黄鸡、浙江的青脚麻鸡、河南及广西的乌鸡等。雏鸡需在室内饲养15～25天,对外界环境适应性强、抗病力强、成活率高,个体重达到0．25kg,且外观酷似土鸡,     

不同鸡种TAP1基因SNPs和INDEL比对分析

为探究抗原加工相关转运体1(TAP1)基因在不同鸡种中的遗传多样性及其进化机制,采用目标序列捕获测序技术对29个不同鸡种TAP1基因的序列进行比对分析。结果显示:在29个鸡种中共有270个单核苷酸多态性(SNPs),其中TAP1基因外显子中共有116个SNPs,主要发生在外显子9和外显子1上,分别占突变核苷酸总数的25%和24%;引起非同义突变的SNPs共有82个,突变最多的是A/G,氨基酸同源性高于核苷酸;所有29个鸡种中都存在SNPs,快大型青脚麻鸡和红色原鸡在外显子上具有最多的SNPs,发生碱基缺失的鸡种包括固始鸡、安卡鸡、斗鸡罗斯鸡杂交品种、绿壳蛋鸡、来航鸡,其中固始鸡缺失片段最长。TAP1基因在不同鸡种中存在高度变异性,说明这种多样性对于鸡抗病性具有重要作用,研究结果也为鸡的抗病育种提供了参考。     

鲁禽3号麻鸡优良肉质性状分子遗传标记筛选

脂肪酸结合蛋白(FABP)参与细胞内脂肪代谢,在鲁禽3号麻鸡体内不同组织中特异性表达7种FABP基因。试验旨在从7种FABPs中寻找到能够应用于家禽优良肉质性状筛选及育种的分子遗传标记。提取鲁禽3号麻鸡血细胞基因组DNA,分别扩增出FABP1-7基因全部外显子,采用测序与酶切结合的方法检测SNP位点的位置,并进行基因型与生产性状的关联性分析。结果表明:7种FABP基因中存在9个SNP位点,其中在鲁禽3号麻鸡体内能够用作优良肉质筛选与育种的分子遗传标记是FABP1-E2-83(外显子2第83位)、FABP4-E1-51(外显子1第51位)两个SNP位点。     

日粮中添加蝇蛆干对青脚麻鸡产肉性能、肉营养品质及风味物质的影响

本试验旨在研究日粮中添加蝇蛆干对青脚麻鸡产肉性能、肉营养品质及风味物质的影响。选择1200只35日龄的青脚麻鸡公雏,随机分为2组,每组4个重复,每个重复150只。对照组饲喂不添加蝇蛆干基础日粮,试验组在饲喂基础日粮的基础上添加3%蝇蛆干。在相同条件下饲养至70日龄,每组随机抽取8只进行屠宰并分别取胸肌和腿肌样品进行测定。结果表明:①两组产肉性能优良,无显著差异(P>0.05);②与对照组相比,试验组青脚麻鸡胸肌、腿肌中粗蛋白质含量分别提高了8.8%和4.4%(P<0.05),总氨基酸含量分别提高了11.0%和2.3%(P<0.05);试验组青脚麻鸡肉中肉豆蔻烯酸、十五烷酸相对含量显著高于对照组(P<0.05);③与对照组相比,试验组青脚麻鸡胸肌、腿肌中鲜味氨基酸含量分别提高了11.9%和3.5%,胸肌中肌苷酸含量显著提高了21.1%(P<0.05);试验组青脚麻鸡肉中测出双戊烯、1-甲氧基-2-丙酮、3-壬酮和乳酸異丁酯4种特有的挥发性风味物质,且香味呈味物醛类和1-辛烯-3-醇的含量明显高于对照组。由此可知,日粮中额外添加3%蝇蛆干能提高青脚麻鸡肉中粗蛋白质、氨基酸、鲜味物质和挥发性香味物质的含量,对于生产营养风味俱佳的青脚麻鸡具有一定的促进作用。     

6个品种鸡LPL基因的PCR-RFLP分析

采用PCR-RFLP方法对金水乌鸡、武定鸡、湖北红鸡、青脚麻鸡、矮黄鸡和隐性白羽肉鸡6个品种共计360只鸡LPL基因进行多态性分析,选用Hha Ⅰ、HaeⅢ、Hinf Ⅰ、Bam HⅠ、EcoRⅠ和PstⅠ 6种限制性内切酶对PCR产物进行单酶切,结果发现HinfⅠ-RFLP具有多态性,有AA和tBB两种基因型,采用独立性X2检验方法检验该基因座频率分布差异,结果表明,蛋用品种湖北红鸡与药用观赏型珍禽金水乌鸡间差异显著(P<0.05);矮黄鸡、隐性白羽鸡2个肉鸡品种间的差异不显著,而它们与其它品种间的差异均达到极显著水平(P<0.01);金水乌鸡、武定鸡、青脚麻鸡3个品种间差异不显著。     

基于转录组测序的新城疫疫苗免疫鸡胸腺差异表达基因分析

为研究新城疫(ND)疫苗接种的青脚麻鸡胸腺组织相关基因与调控通路变化,对无特定病原体(SPF)的青脚麻鸡人工接种ND疫苗48 h后,取胸腺组织采用Illumina HiSeq 2500高通量测序技术进行转录组测序,使用TopHat2软件对测序得到的reads序列与鸡(Gallus_gallus-5.0)的参考基因组比对,筛选出差异表达基因后,在GO和KEGG数据库中进行功能注释、富集分析和聚类分析。结果显示:接种ND疫苗后,共筛选到1 514个差异表达基因,其中1 016个基因上调,498个基因下调;GO功能分类注释到生物学过程、细胞组成和分子功能数据库中的差异表达基因分别有823、815和985个,注释到KEGG通路中差异表达基因1 274个,显著富集通路52个(P0.05);在差异基因中筛选出70个与鸡先天免疫相关的基因,并使用STRING构建蛋白质相互作用网络。研究提示:ND疫苗免疫接种后激活了青脚麻鸡先天免疫相关基因或通路,改善了体内的抗体水平,对探索鸡的宿主-病原体相互作用具有重要意义,为进一步探究青脚麻鸡接种ND疫苗后机体免疫应答反应提供了研究基础。     

山羊促性腺激素释放激素1基因外显子克隆及序列分析

促性腺激素释放激素1(gonadotropin-releasing hormone 1,GnRH1)是GnRH存在于脑下垂体的主要形式,它在调节生殖内分泌系统产生促性腺激素方面起着主要作用。根据牛GnRH1基因全序列设计3对引物,采用PCR-SSCP技术检测GnRH1基因外显子2、3和4在高繁殖力山羊品种（济宁青山羊）、中等繁殖力山羊品种（波尔山羊）和低繁殖力山羊品种（内蒙古绒山羊和安哥拉山羊）中的单核苷酸多态性,分析该基因对山羊高繁殖力的影响;并对山羊GnRH1基因3个外显子进行克隆测序,推导出编码的氨基酸序列,然后将山羊核苷酸和氨基酸序列与牛、人、狗、黑猩猩、猴、大鼠和小鼠7个物种的序列进行同源性比较。结果表明,在4个山羊品种中均未检测到GnRH1基因3个外显子的多态性;8个物种的核苷酸和氨基酸序列的同源性分别为73.6%～99.3%和62.0%～97.8%。可见,哺乳动物GnRH1基因外显子2、3和4序列保守性较强,该区域可能不是影响山羊高繁殖力的功能结构域。     

不同来源标准抗原对H5-4抗体检测结果的影响

为了分析不同来源抗原对各鸡种抗体效价的影响,找出适合特定品种的抗原,提高鸡的免疫活性,试验以35～52日龄健康青脚麻鸡、三黄鸡及53～70日龄健康雪山草鸡、雪山麻鸡、雪山黄鸡、乌骨鸡为研究对象,按照1‰比例从免疫后的健康鸡群中随机采集血样,并采用血凝抑制试验利用A公司和B公司的抗原检测样本血清抗体效价。结果表明:来自A公司的抗原检测出的样本血清抗体效价平均值接近于实际值;两种抗原在35～52日龄青脚麻鸡和三黄鸡的抗体效价检测中差异不显著(P0.05),但B公司的免疫合格率显著高于A公司(P0.05);除53～61日龄雪山草鸡外,来自A公司的抗原检测出的样本血清抗体效价免疫合格率显著高于B公司的抗原(P0.05)。说明B公司的标准抗原适合35～52日龄的青脚麻鸡和三黄鸡,A公司的标准抗原合适其他日龄段各品种的商品鸡。     

浅谈西南山区农村养鸡技术要点

正1鸡品种选择购买雏鸡要选择正规种鸡场孵出的健康、体壮的品种。在相同饲养条件下,专门品种的生产性能要高于杂牌品种。"快大型"品种长得快,但肉质差,市场价格不高。地方土鸡长势慢些,但肉质好,市场价格高。产蛋鸡应选用蛋鸡品种。西南山区常用的几个品种主要是青脚麻鸡、三黄鸡、绿壳蛋鸡、山地乌骨鸡等。青脚麻鸡是杂交品系,西南地     

膨化菜籽对青脚麻鸡生产性能及器官的影响

将1020羽50日龄青脚麻鸡随机分为4组,每组3个重复,每重复85羽鸡,各组在基础日粮中添加0、4%、7%和10%的膨化菜籽,试验期为25d。结果表明:添加不同比例的膨化菜籽对青脚麻鸡的生产性能无显著影响;病理组织学的结果显示:添加膨化菜籽比例越大对内脏器官损伤越严重;添加4%的膨化菜籽经济效益最高。     

5个绵羊品种BMP6基因部分片段的多态及序列分析

根据GenBank发表的绵羊骨形态发生蛋白6（Bone morphogenetic protein6,BMP6）基因部分序列所包含的外显子5、6、7和小鼠BMP6基因外显子5、6、7序列设计3对引物,采用PCR-SSCP技术检测BMP6基因外显子5、6和7在小尾寒羊、湖羊、多赛特、特克塞尔、考力代5个绵羊品种301个个体中的单核苷酸多态性。结果发现这3对引物的扩增片段在检测的5个品种中均无多态性,说明所检测的BMP6外显子5、6、7序列比较保守。同时克隆了小尾寒羊（695bp）和济宁青山羊（699bp）部分BMP6mRNA以及小尾寒羊BMP6基因外显子3—4的内含子序列和两端部分外显子序列（785bp）。发现小尾寒羊和济宁青山羊的核苷酸和氨基酸序列差异很小,两者的核苷酸序列同源性高达99．28％,氨基酸序列同源性为98．1％,除济宁青山羊中插入一个丙氨酸外,两者只有4个氨基酸的差异。绵羊与牛、人、小鼠和大鼠的核苷酸同源性分别为97．04％、81．82％、84．68％和85．06％;氨基酸序列同源性分别为99．05％、91．43％、90．48％和92．38％,均大于90％,表明各物种BMP6核苷酸序列虽然差异较大,但氨基酸序列却非常保守。     

藏猪生长激素基因核苷酸多态性分析

本文应用PC R方法,体外扩增了藏猪5个个体的生长激素(GH)基因64～2022位之间1959 bp的片段(包含完整的5个外显子和4个内含子),并进行了序列测定。结合网上下载的猪GH基因同源区段序列进行比较分析,结果表明:藏猪GH基因有较丰富的核苷酸多态性;检出的24个核苷酸突变位点中有6个发生在外显子区,外显子2内有4个突变位点,导致2个氨基酸变异,外显子3和外显子4内各有一个突变位点,特别是外显子4内这个突变位点引起了1个氨基酸变异;单核苷酸转换(21个位点)大于颠换(5个位点)。     

广西地方鸡种线粒体基因SNP筛选研究

为了从线粒体基因水平筛选广西地方鸡种质资源DNA条形码,研究利用混合池基因组DNA为模板,利用PCR和直接测序技术,对6个广西地方鸡品种和1个商业化肉鸡品种线粒体上6个基因的SNP进行了分析。结果显示:16 S rRNA在7个品种中都未发现SNP,其他5个基因在7个品种中存在SNP。其中广西三黄鸡、广西麻鸡和龙胜凤鸡SNP位点的百分比相似,南丹瑶鸡和东兰乌鸡SNP位点的百分比相似,而霞烟鸡与艾维茵肉鸡SNP位点的百分比相似。研究结果为进一步开发广西地方鸡品种的DNA条形码奠定了基础。     

水牛κ-酪蛋白外显子4基因的克隆及序列分析

本研究根据普通牛的κ-酪蛋白基因设计一对引物,首次成功扩增出了水牛的κ-酪蛋白外显子4基因,并经序列分析,结果表明κ-酪蛋白外显子4基因片段长780 bp。利用GenBank上的Blast进行比较,中国水牛κ-酪蛋白外显子4序列与地中海水牛、牛、牦牛的κ-酪蛋白外显子4序列同源性分别为99.5%、96.4%、95.9%;氨基酸同源性比较,中国水牛、地中海水牛、牛、牦牛均编码260个氨基酸,中国水牛与地中海水牛、牛、牦牛同源性分别为98.9%、92.0%和91.2%。核苷酸和氨基酸序列同源性结果显示,中国水牛和地中海水牛κ-酪蛋白基因变异不大。但由于在碱基230 bp处发生了一个碱基(A→C)的变化,从而导致其氨基酸也发生了变化,即K(Lys赖氨酸)→R(Arg精氨酸)。本研究为进一步对该基因的功能奠定基础。     

广西5个品种地方鸡肌肉氨基酸分析和营养评价

为深入了解广西地方鸡种肌肉的营养价值,本实验选取120日龄广西三黄鸡、南丹瑶鸡、广西麻鸡、广西乌鸡(东兰乌鸡)和霞烟鸡5个广西地方鸡种各20只,公、母各半,测定其胸肌和腿肌肌肉氨基酸的组成和含量。基于联合国粮农组织和世界卫生组织(FAO/WHO)标准模式谱对其营养价值进行评定。结果显示:在5个广西地方鸡种中,霞烟鸡的必需氨基酸含量、氨基酸总量和味觉氨基酸含量最高,分别为16.88、42.76、22.95g/100g;5个地方鸡种胸肌和腿肌的必需氨基酸含量存在一定差异,且胸肌显著高于腿肌;不同品种胸肌和腿肌的必需氨基酸/氨基酸总量(EAA/TAA)、必需氨基酸/非必需氨基酸(EAA/NEAA)均符合FAO/WHO提出的理想蛋白源标准;缬氨酸是广西三黄鸡的第一限制性氨基酸,蛋氨酸+胱氨酸是其他4个品种的第一限制性氨基酸。5个地方鸡种的胸肌和腿肌具有丰富的味觉氨基酸,风味氨基酸/氨基酸总量均高于50%,且腿肌比胸肌风味更佳。     

黑番鸭GH基因的克隆与序列分析

根据GenBank中公布的鸭GH基因序列,设计4对引物,以黑番鸭血液基因组DNA为模板,采用PCR方法,扩增出GH基因4650bp的DNA序列,该序列包含了完整的内含子和外显子序列,由5个外显子和4个内含子组成。进一步将克隆的黑番鸭GH基因编码的氨基酸序列与GenBank中其他物种的该基因氨基酸序列进行同源性分析和聚类...     

日粮中添加茶多酚对青脚麻鸡生长性能、胴体品质和血脂的影响

本文研究了在基础日粮中添加0.02%、0.04%和0.06%水平的茶多酚对青脚麻鸡生长性能、胴体品质和血脂的影响。试验选用15日龄健康青脚麻鸡160只,随机分为4个处理组,每组4个重复,每个重复4只鸡。试验期42 d。试验结果表明:在饲粮中添加一定浓度水平的茶多酚能有效提高青脚麻鸡生产性能(P<0.05),但饲料转化率不和日粮中茶多酚添加量成正比;茶多酚对青脚麻鸡胴体品质的影响效果在不同性别间和部位间差异不同,可以有效降低胸、腿肌剪切力,显著提高青脚麻鸡肉的嫩度(P<0.01);随茶多酚添加浓度增加能有效降低青脚麻鸡的腹脂率(P<0.05),同时对青脚麻鸡与脂肪代谢有关的血液生化指标TC、TG、HDL-C、LDL-C和GLU影响在其43日龄左右的生长中期效果显著。要达到显著效果,茶多酚的添加量不少于0.04%为宜。     

柞蚕溶菌酶基因的克隆和序列分析

采用cDNA末端扩增(RACE)方法及简并引物克隆了柞蚕溶菌酶(Antheraea pernyilysozyme)基因(Gen-Bank登录号:DQ353869)。该基因cDNA序列全长675 bp,由3个外显子和2个内含子组成,其开放读码框(ORF)长420 bp,编码140个氨基酸。生物信息学分析表明,该基因编码蛋白的1-20位氨基酸为信号肽序列,21-140位氨基酸为柞蚕溶菌酶成熟蛋白(分子质量14 kD,等电点8.46)。柞蚕溶菌酶氨基酸序列中含有c型溶菌酶分子所特有的活性中心Glu32、Asp50以及8个半胱氨酸残基,与鳞翅目昆虫溶菌酶的氨基酸序列同源性较高,属非钙结合型c型溶菌酶。柞蚕溶菌酶的模拟三级结构与印度柞蚕(Antheraea mylitta)溶菌酶的三级结构十分相似。     

益生素、甜叶菊提取物对鸡生长、屠宰、免疫性能及血清尿素氮的影响

试验旨在探讨饲料中添加益生素、甜叶菊提取物对青脚麻鸡生长性能、屠宰性能、免疫性能及血清尿素氮含量的影响。将160只青脚麻鸡随机分为四组,每组4个重复,每个重复10只。A组日粮添加0.2%益生素;B组日粮添加0.2%甜叶菊提取物和0.2%益生素;C组日粮添加0.2%甜叶菊提取物;D组为空白对照组饲喂基础日粮。饲养试验时间为8周。结果表明:与空白对照组(D组)相比,在生长性能方面,A、B组的体重在第6周和第8周时显著增加(P0.05);在屠宰性能方面,A、B组青脚麻鸡的宰前活重、屠宰率、全净膛率和半净膛率均显著增加(P0.05);在免疫器官指数方面,B组青脚麻鸡的法氏囊指数显著增加(P0.05);在血清尿素氮含量方面,A、B、C三组青脚麻鸡血清尿素氮的含量显著降低(P0.05)。综上所述,饲料中添加益生素可以改善青脚麻鸡的生长性能和屠宰性能,并降低其体内血清尿素氮的含量,当与甜叶菊提取物一起添加时,还可提高其法氏囊指数。