禽源冠状病毒监测简报

冠状病毒(Coronaviruses)在分类地位上属于套式病毒目(Nidovirales)冠状病毒科(Coronaviridae)正冠状病毒亚科(Orthocoronavirinae),包括α、β、γ和δ等4个属,可感染包括人类在内的多种动物。其中,α冠状病毒属主要感染人和猪、犬、猫、蝙蝠等,β冠状病毒属主要感染人和牛、马、猪、鼠、蝙蝠等哺乳动物,γ冠状病毒属主要感染鸡、火鸡、鸭、鹅等禽类,δ冠状病毒属主要感染野禽和猪。引起此次新型冠状病毒肺炎疫情的病毒(2019-nCoV)属于冠状病毒科β冠状病毒属。可感染禽类的冠状病毒主要来自γ冠状病毒属和δ冠状病毒属。鸡传染性支气管炎病毒(IBV)等家禽中分离到的冠状病毒均为γ冠状病毒属。家禽冠状病毒感染危害较大的是IBV。此外,鸭冠状病毒、鹅冠状病毒和鸽冠状病毒等在家禽中也有检出。一些野禽可感染δ属冠状病毒(如鹅口疮冠状病毒HKU12等)。2013年以来,中国动物卫生与流行病学中心对全国17省份共计5 249份家禽样品进行了禽源冠状病毒检测,共检测到IBV 446株,新型鸭冠状病毒和新型鸽冠状病毒等新型禽冠状病毒共277株,IBV、新型鸭冠状病毒、新型鸽冠状病毒的检出率分别为8.50%、2.04%、3.24%。对2019-nCoV与禽源冠状病毒的亲缘关系进行分析发现,2019-nCoV与已知的禽源冠状病毒核苷酸同源性较低;基于冠状病毒1ab基因保守区域的进化分析表明,2019-nCoV与禽源冠状病毒亲缘关系较远。基于上述分析,初步排除2019-nCoV来源于已知家禽冠状病毒的可能性。     

猪Delta冠状病毒的研究进展

<正>Delta冠状病毒是冠状病毒科冠状病毒亚科的新成员,可感染禽类和哺乳动物。目前冠状病毒主要分为4个群,包括Alpha冠状病毒、Beta冠状病毒、Gamma冠状病毒和Delta冠状病毒。其中能对猪致病的另外4种病毒,即猪流行性腹泻病毒(PEDV)、猪传染性胃肠炎病毒(TGEV)以及猪呼吸道冠状病毒(PRCV)均属于Alpha冠状病毒。     

猪德尔塔冠状病毒侵入宿主细胞的途径:内吞体途径和细胞膜途径

冠状病毒是目前自然界已知的最大RNA病毒,能够感染人、哺乳动物和禽类,引起呼吸系统、消化系统和神经系统疾病。冠状病毒分为4个属,分别是Alphacoronavirus (α-冠状病毒)、Betacoronavirus(β-冠状病毒)、Gammacoronavirus(γ-冠状病毒)和Deltacoronavirus(δ-冠状病毒).     

简述犬的冠状病毒病

当前出现的人类新型冠状病毒(COVID-19)病给整个社会生活和人民健康带来了巨大的影响。犬也会患冠状病毒病,犬冠状病毒病会不会传染给人呢?于此,就犬冠状病毒病做一个简要的论述。一、冠状病毒病的前世今生冠状病毒按病毒学分类属于尼多病毒目、冠状病毒科、冠状病毒亚科。之所以称为冠状病毒是因为其电镜外形类似皇冠样。     

犬冠状病毒病的特征以及防治对策

犬冠状病毒病具有较高的传染率和致死率,一旦在犬身上发生将严重危害犬的生命健康,该病毒可通过病犬使其他动物感染,严重影响环境安全和生态安全。本文主要介绍犬冠状病毒病的特征、临床症状、流行特点以及诊断方法,并提出了犬冠状病毒病的预防对策和治疗对策,治疗对策包括抗病毒疗法和输液疗法。一、犬冠状病毒病特征和临床症状(一)犬冠状病毒病的特征犬冠状病毒属冠状病毒科,冠状病毒属,多呈圆形或椭圆形。     

水生动物冠状病毒研究进展

冠状病毒在自然界中普遍存在,可感染多种哺乳动物和鸟类,给畜牧业生产安全和公共卫生安全带来严重威胁。自北京新发地批发市场从切割进口三文鱼案板上检测到人新型冠状病毒(SARS-CoV-2)核酸以来,三文鱼以及水生动物冠状病毒与SARS-CoV-2的关系成为公众关注的焦点。本文详细描述了白鲸、宽吻海豚、三文鱼等水生动物感染冠状病毒后的临床症状,以及病毒基因组结构特征,并对水生动物冠状病毒与SARS-CoV-2进行了遗传演化分析,结果显示目前已知的水生动物冠状病毒属于γ冠状病毒属和Alphaletovirus属,而SARS-CoV-2属于β冠状病毒属,二者基因组和主要基因(1ab、S、E、M、N)核苷酸同源性仅为43.7%～54.1%,可初步排除SARS-CoV-2来源于已知水生动物冠状病毒的可能性。本文通过系统阐述水生动物冠状病毒感染状况,旨在进一步提高公众对水生动物冠状病毒的认知,为科学防控冠状病毒提供理论依据。     

禽源冠状病毒感染情况概述

以国内外对冠状病毒在禽类中的流行病学调查、监测和基因分析等研究报道为基础,从病毒分类学角度,对各“种”冠状病毒在禽类中的感染情况和引起的相关疾病进行简要概述。全球在禽类中发现的冠状病毒种类较多,至少涉及丙型和丁型冠状病毒属。其中,鸡传染性支气管炎病毒几乎在全球所有养鸡国家中存在,并呈地方性流行;火鸡冠状病毒、鸭冠状病毒、鹅冠状病毒、鸽冠状病毒也在禽类中被发现,部分病毒已在禽群中流行;其他丁型冠状病毒属病毒仅在少数野鸟中被发现。     

貂源冠状病毒与2019新型冠状病毒的遗传进化关系

为进一步明确貂源冠状病毒与新型人冠状病毒HCoV-19的遗传进化关系,比较了NCBI上公布的3株水貂冠状病毒、5株雪貂冠状病毒以及人冠状病毒HCoV-19和SARS-Cov的全基因组、ORF1a、ORF1ab和病毒表面蛋白Spike的序列同源性,分析了其遗传进化关系,以及组成病毒的结构蛋白和非结构蛋白的种类、基因位置及氨基酸数量。结果显示:貂源冠状病毒与新型冠状病毒HCoV-19全基因组、ORF1a、ORF1ab、Spike蛋白的相似性分别为68%、46.96%、52.44%、47.36%;貂源冠状病毒与HCoV-19不属于同一分支,且亲缘关系较远;同时,貂源冠状病毒与HCoV-19全基因组在蛋白组成、氨基酸数量、基因位置上均存在显著差异。结果表明,貂源冠状病毒与新型冠状病毒HCoV-19不是同一种冠状病毒,此次在人群中流行的新型冠状病毒HCoV-19由貂源冠状病毒重组而成的可能性很小,因此可初步排除HCoV-19来源于水貂和雪貂的可能性。     

新型冠状病毒的分类和进化特点

<正>收集和整理引起新型冠状病毒肺炎(Corona Virus Disease 2019,COVID-19)的致病病毒的分类资料和最近2～3年来新型冠状病毒的变异毒株,并将新型冠状病毒的重点关注突变体的进化特点进行对比总结。1新型冠状病毒的基本概述1.1冠状病毒的分类冠状病毒属于套式病毒目（Nidovirales）,冠状病毒科（Coronaviridae）,冠状病毒亚科（Coronaviridae）,冠状病毒属（Coronaviridae）,是一类具有囊膜的单股正链RNA病毒,在所有已知RNA病毒中冠状病毒基因组是最大的,通常在26-32 kb。其基因组被包装于由核衣壳蛋白（N）形成的螺旋衣壳中,再被病毒囊膜包裹。     

动物冠状病毒通用PCR方法的建立及基因序列分析

参考GenBank中公布的冠状病毒相关序列,根据动物冠状病毒聚合酶基因的保守区段设计一对通用引物。用这对引物对犬冠状病毒、猫冠状病毒等8种动物冠状病毒的cDNA模板进行通用PCR扩增和通用PCR反应条件的优化,结果均得到与试验设计相符的449 bp条带;特异性试验结果表明犬冠状病毒、猫冠状病毒等均扩增出449 bp目的条带,而阴性对照没有。敏感性试验结果表明,其敏感程度与常规PCR方法相同。将扩增的聚合酶基因与冠状病毒的参考毒株进行同源性比对,同源率在56.69%～99.55%之间。进化树分析结果与文献中对冠状病毒根据血清学与基因学角度分类报道相一致。