| 黄带拟鲹qRT-PCR内参基因筛选及验证 |
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| 引用本文： | 李杰锋,王焕,李步苏,曾祥辉,柳淑芳,庄志猛. 黄带拟鲹qRT-PCR内参基因筛选及验证[J]. 渔业科学进展, 2023, 44(6): 107-115 |
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| 作者姓名： | 李杰锋 王焕 李步苏 曾祥辉 柳淑芳 庄志猛 |
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| 作者单位： | 上海海洋大学水产与生命学院 上海 201306；中国水产科学研究院黄海水产研究所 农业农村部海洋渔业与可持续发展重点实验室 山东 青岛 266071;中国水产科学研究院黄海水产研究所 农业农村部海洋渔业与可持续发展重点实验室 山东 青岛 266071；海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室 山东 青岛 266071;中国水产科学研究院黄海水产研究所 农业农村部海洋渔业与可持续发展重点实验室 山东 青岛 266071；大连海洋大学水产与生命学院 辽宁 大连 116023 |
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| 摘 要： | 实时荧光定量PCR (qRT-PCR)是研究基因表达的一种广泛使用且有效的方法，选用黄带拟鲹(Pseudocaranx dentex)合适的内参基因，是qRT-PCR技术获得该物种基因表达可靠结果的关键。本研究首先测定了9个常用内参基因(β-actin、RPL13、EF-1α、GAPDH、HPRT、PPIA、β2M、TUB和PP2A)在黄带拟鲹成鱼组织中的表达丰度；同时，利用BestKeeper、NormFinder、geNorm和RefFinder 4种模型预测了内参基因的表达稳定性，发现其表达稳定性排序为RPL13>EF-1α> PP2A>HPRT>PPIA>TUB>β2M>β-actin>GAPDH。进一步通过定量检测目标基因myod1在不同组织的表达情况，验证上述预测结果的准确性。研究发现，RPL13和EF-1α单独或联合作为黄带拟鲹qRT-PCR内参基因，可显著提高目标基因表达量检测结果的稳定性与可靠性。结果表明，RPL13和EF-1α可作为黄带拟鲹不同组织q RT-PCR分析的内参基因。同时，也证实了并不是管家基因的表达在所有...
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| 关 键 词： | 黄带拟鲹 qRT-PCR 内参基因 稳定性 |
| 收稿时间： | 2022-06-22 |
| 修稿时间： | 2022-07-28 |
Screening and evaluating reference genes for quantitative real-time PCR in striped jack (Pseudocaranx dentex) |
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| LI Jiefeng,WANG Huan,LI Busu,ZENG Xianghui,LIU Shufang,ZHUANG Zhimeng. Screening and evaluating reference genes for quantitative real-time PCR in striped jack (Pseudocaranx dentex)[J]. Progress in Fishery Sciences, 2023, 44(6): 107-115 |
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| Authors: | LI Jiefeng WANG Huan LI Busu ZENG Xianghui LIU Shufang ZHUANG Zhimeng |
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| Affiliation: | College of Fisheries and Life Science, Shanghai Ocean University, Shanghai 201306, China; Yellow Sea Fisheries Research Institute, Chinese Academy of Fishery Sciences, Key Laboratory of Marine Fisheries and Sustainable Development, Ministry of Agriculture and Rural Affairs, Qingdao 266071, China;Yellow Sea Fisheries Research Institute, Chinese Academy of Fishery Sciences, Key Laboratory of Marine Fisheries and Sustainable Development, Ministry of Agriculture and Rural Affairs, Qingdao 266071, China; Laboratory for Marine Fisheries Science and Food Production Processes, Qingdao 266071, China;Yellow Sea Fisheries Research Institute, Chinese Academy of Fishery Sciences, Key Laboratory of Marine Fisheries and Sustainable Development, Ministry of Agriculture and Rural Affairs, Qingdao 266071, China; College of Fisheries and Life Science, Dalian Ocean University, Dalian 116023, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Pseudocaranx dentex qRT-PCR Reference gene Stability |
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