百合LoXTH23基因克隆、生物信息学分析及在鳞茎休眠解除过程中的表达动态

【目的】研究西伯利亚百合(Lilium oriental ‘Siberia’)休眠解除过程中LoXTH23基因的作用。【方法】以西伯利亚百合鳞茎为试验材料，从前期转录组测序结果中筛选出1个休眠解除期差异显著的XTH家族基因，利用RT-PCR技术扩增该基因cDNA全长序列，命名为LoXTH23。采用生物信息学软件对LoXTH23基因结构、理化性质等进行分析；采用荧光定量PCR技术测定LoXTH23基因在鳞茎休眠解除过程中的相对表达量。【结果】LoXTH23基因开放阅读框全长858 bp，编码285个氨基酸，包含GH16结构域，属于XTH家族基因；编码的蛋白相对分子量约为3.19 ku，理论等电点为6.19，是存在跨膜结构域和信号肽的不稳定亲水蛋白；二级结构中以随机卷曲为主，存在30个磷酸化位点；荧光定量PCR结果显示：LoXTH23基因的表达量在鳞茎休眠完全解除10 d时最高。【结论】LoXTH23可能在百合鳞茎休眠解除调控进程中起重要作用。