猪捷申病毒云南流行株的遗传进化

【目的】了解云南省猪场捷申病毒(porcine teschovirus,PTV)的感染情况及流行毒株分子进化特征，为预防控制该病提供参考。【方法】从云南曲靖、弥勒和大理的猪场随机采集粪便样品，采用RT-PCR方法对PTV 5′-UTR部分基因片段进行扩增、克隆及测序，通过生物信息学软件进行同源性分析并构建系统进化树。【结果】PTV核酸阳性率达27.3%(32/117)，测序后去除重复序列得到6条序列。同源性分析结果显示：株间核苷酸同源性为93.2%～98.9%，与参考序列核苷酸同源性为89.7%～100.0%；系统进化树构建结果显示：YNDL-2和YNDL-3与四川省分离的PTV毒株亲缘关系较近；YNQJ-1与日本分离的PTV毒株亲缘关系较近；YNDL-1、YNQJ-4和YNQJ-5聚为一簇，与多米尼加分离的毒株亲缘关系较近，表明同一猪场存在不同血清型感染。【结论】云南猪场PTV感染率较高，流行株间进化关系差异较大，同一猪场存在不同基因型的病毒感染，未体现出明显的地域性。研究结果为PTV致病机理、疫苗研制及防控等奠定了基础。