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沃柑叶片响应柑橘溃疡病菌侵染的转录组分析
引用本文:邱发发,潘贞珍,李鸾翔,夏黎明,黄桂香.沃柑叶片响应柑橘溃疡病菌侵染的转录组分析[J].果树学报,2022,39(4):631-643.
作者姓名:邱发发  潘贞珍  李鸾翔  夏黎明  黄桂香
作者单位:广西大学农学院,南宁530005,广西大学农学院,南宁530005;广西南亚热带农业科学研究所,广西崇左532400
基金项目:广西科技重大专项;广西现代农业产业技术体系柑橘创新团队;国家重点研发计划
摘    要:【目的】了解沃柑叶片响应柑橘溃疡病侵染的分子机制及易感品种与柑橘溃疡病菌的互作应答机制,筛选出柑橘溃疡病菌危害沃柑叶片时的相关应答基因,为抗性育种提供基因基础。【方法】以接种溃疡病菌后0、2、4、6和8 d的沃柑叶片为试材,利用Novaseq 6000平台进行转录组双向测序,并对数据进行生物信息学相关性分析。【结果】接种无菌水(CK)后0、2、4、6和8 d获得的Clean reads分别是48 482 127、47 270 288、50 998 549、53 201 972和47 924 731条,接种柑橘溃疡病菌(JZY)后0、2、4、6和8 d获得的Clean reads分别是51 042 967、49 552 248、46 734 029、47 940 345和45 371 891条。接种后0、2、4、6和8 d的上调差异表达基因数量分别为1、947、1081、656和2108个,下调差异表达基因数量分别为1、343、753、303和1908个。在接种后2、4、6和8 d有374个基因均表达差异,其中上调基因为61个,下调基因为313个。GO功能富集分析结果显示,沃柑叶片响应溃...

关 键 词:沃柑  柑橘溃疡病  离体接种  转录组  差异表达基因
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