| 团头鲂scxa基因SNP位点与肌间骨数目的关联性分析 |
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| 引用本文： | 王旭东,唐雨甜,熊雪梅,周佳佳,李相珊,曹树洪,高泽霞.团头鲂scxa基因SNP位点与肌间骨数目的关联性分析[J].华中农业大学学报,2021,40(4):149-156. |
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| 作者姓名： | 王旭东 唐雨甜 熊雪梅 周佳佳 李相珊 曹树洪 高泽霞 |
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| 作者单位： | 华中农业大学水产学院/农业农村部淡水生物繁育重点实验室/农业动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室/湖北省名优鱼育种与健康养殖工程技术研究中心/长江经济带大宗水生生物产业绿色发展教育部工程研究中心，武汉 430070；武汉农业检测中心，武汉 430023;湖北省阳新县浮屠镇水产服务中心，黄石 435239;华中农业大学水产学院/农业农村部淡水生物繁育重点实验室/农业动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室/湖北省名优鱼育种与健康养殖工程技术研究中心/长江经济带大宗水生生物产业绿色发展教育部工程研究中心，武汉 430070；湖北洪山实验室，武汉 430070 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目(31872559)；国家大宗淡水鱼类产业技术体系建设项目(CARS-46-08)；中央高校基本科研业务费专项(2662018PY035)；武汉市科技计划项目（2020020601012253） |
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| 摘 要： | 为研究scxa基因序列的多态性与团头鲂肌间骨数量性状之间的关联性,以期进一步获得团头鲂肌间骨数目显著相关的SNP标记,通过克隆获得团头鲂scxa基因的cDNA序列,其开放阅读框为609 bp,共编码202个氨基酸。系统进化分析结果显示团头鲂scxa基因与斑马鱼、鲤、鲫、金线鲃具有较高保守性。荧光定量结果显示,该基因在团头鲂肌肉和肌间骨中的表达量均显著高于其他组织,且肌肉中的表达量显著高于肌间骨(P0.05)。通过比较肌间骨数量极端群体scxa基因外显子序列,共获得与肌间骨数目显著相关的2个SNP位点及1个插入/缺失位点。以上结果表明,scxa基因在肌间骨发育过程中发挥潜在作用,其序列多态性与肌间骨数目具有显著相关性。
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| 关 键 词： | 团头鲂 肌间骨 scxa 表达模式 基因多态性 高通量测序 基因克隆 |
Expression of scxa and correlation analysis between SNP and number of intermuscular bones in Megalobrama amblycephala |
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| WANG Xudong,TANG Yutian,XIONG Xuemei,ZHOU Jiaji,LI Xiangshan,CAO Shuhong,GAO Zexia.Expression of scxa and correlation analysis between SNP and number of intermuscular bones in Megalobrama amblycephala[J].Journal of Huazhong Agricultural University,2021,40(4):149-156. |
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| Authors: | WANG Xudong TANG Yutian XIONG Xuemei ZHOU Jiaji LI Xiangshan CAO Shuhong GAO Zexia |
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