6种笛鲷属鱼类线粒体16S rRNA基因片段的序列比较 |
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引用本文: | 周发林,江世贵,苏天凤,吕俊霖. 6种笛鲷属鱼类线粒体16S rRNA基因片段的序列比较[J]. 中国水产科学, 2004, 11(2): 99-103 |
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作者姓名: | 周发林 江世贵 苏天凤 吕俊霖 |
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作者单位: | 中国水产科学研究院,南海水产研究所,广东,广州,510300 |
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基金项目: | 广东科技兴海重大项目(A200099A01). |
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摘 要: | 对笛鲷属(Lutjanus)的紫红笛鲷(Lutjanus argentimaculatus)、白星笛鲷(Lutjanus stellatus)、千年笛鲷(Lutjanus sebae)、勒氏笛鲷(Lutjanus russellii)、红鳍笛鲷(Lutjanus erythropterus)线粒体DNA 16SrRNA基因片段进行了PCR扩增和测序,得到长度约418bp的序列。结合GenBank中斜带笛鲷(Lutjanus decussatus)该区段的16SrRNA序列,用(Clustal_X排序软件进行16SrRNA序列的对位排列。通过Mega2.1软件对所得线粒体16SrRNA片段序列进行比较,共检测53个碱基存在变异,其中包括21个简约信息位点,并用“PairWise distance”计算了各属间的相对遗传距离,结果表明,其序列差异(转换 颠换)在0.027~0.083,其中勒氏笛鲷与斜带笛鲷的序列差异最小,红鳍笛鲷与勒氏笛鲷的序列差异最大。以高体四长棘鲷(Argyrops spinifer)为外类群,采用Mega2.1软件中的“Neighbore-Joining‘’法得到唯一1个分子系统树,系统树各分支的置信度南“Bootstrap”1000循环检验。结果表明,6种笛鲷鱼类聚成明显的3个分支,第1个分支,包括勒氏笛鲷、斜带笛鲷和白星笛鲷;第2个分支,包括紫红笛鲷;第3个分支,包括红鳍笛鲷和千年笛鲷。
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关 键 词: | 笛鲷属 线粒体DNA 16SrRNA 序列比较 |
文章编号: | 1005-8737-(2004)02-0099-05 |
修稿时间: | 2010-04-08 |
Comparative study of mtDNA 16S rRNA gene fragments among six Lutjanus fishes |
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