| 大豆TPS基因家族全基因组鉴定、分类与表达分析 |
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| 引用本文： | 谢翎,汪章勋,黄 勃. 大豆TPS基因家族全基因组鉴定、分类与表达分析[J]. 中国油料作物学报, 2014, 36(2): 160. DOI: 10.7505/j.issn.1007-9084.2014.02.004 |
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| 作者姓名： | 谢翎 汪章勋 黄 勃 |
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| 作者单位： | 1. 安庆师范学院生命科学学院，安徽 安庆 246011；
2. 安徽农业大学微生物防治省重点实验室，安徽 合肥 230036 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目(31201568)；安徽省高校省级自然科学项目(KJ2013B123)；安徽省高校省级自然科学项目(KJ2011B081)；安庆师范学院科研启动项目(044-K05000000281) |
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| 摘 要： | 本研究利用大豆基因组数据库，通过生物信息学分析，鉴定并获得大豆TPS 家族基因所有成员的全序列、基因结构和定位信息。研究还利用序列比对对大豆TPS 家族基因进行进化和分类分析，同时通过soybase大豆发育表达芯片数据库相关信息，对该家族基因成员的组织表达谱进行了检测。研究结果表明，大豆基因组中含有20个TPS家族基因成员。系统发育分析将这些TPS基因分成了两个亚家族。基因定位分析表明，这些成员基因分别分布于大豆的14条染色体上。启动子分析表明，全部大豆TPS 家族基因的启动子区都含有逆境反应顺式作用元件。转录水平芯片数据分析同时显示，大豆TPS家族基因大多在花、根、根瘤等组织中存在优势表达。该研究结果将促进大豆TPS家族基因的功能研究与利用。
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| 关 键 词： | 大豆 TPS家族基因 全基因组鉴定 进化分析 差异表达 |
Genome-wide identification,classification and expression of TPS family genes in soybean |
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| XIE Ling,WANG Zhang-xun,HUANG Bo. Genome-wide identification,classification and expression of TPS family genes in soybean[J]. Chinese Journal of Oil Crop Sciences, 2014, 36(2): 160. DOI: 10.7505/j.issn.1007-9084.2014.02.004 |
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| Authors: | XIE Ling WANG Zhang-xun HUANG Bo |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Key words: Glycine max TPS family genes Genome-wide identification Phylogenetic analysis Differential expression |
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