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紫苏甲羟戊酸-5-磷酸激酶基因PfPMK的克隆与表达分析
引用本文:李辉,温春秀,刘灵娣,温赛群,唐映红,姜涛.紫苏甲羟戊酸-5-磷酸激酶基因PfPMK的克隆与表达分析[J].华北农学报,2022,37(2):49-55.
作者姓名:李辉  温春秀  刘灵娣  温赛群  唐映红  姜涛
作者单位:湖南文理学院 生命与环境科学学院,湖南 常德 415000,河北省农林科学院 经济作物研究所,河北 石家庄 050051
基金项目:财政部和农业农村部:国家现代农业产业技术体系资助(CARS-21);
摘    要:为了研究甲羟戊酸-5-磷酸激酶(PMK)在紫苏萜类物质生物合成代谢通路中的重要作用,对紫苏转录组数据进行分析,挖掘出紫苏PMK基因参考序列,采用基因克隆技术从紫苏中克隆了PMK基因,利用生物信息学和实时荧光定量PCR(qRT-PCR)的方法对紫苏PMK基因进行了分析。结果表明,紫苏PMK基因开放阅读框(ORF)全长为1 524 bp,编码507个氨基酸。生物信息学分析显示,PfPMK的分子质量为54.73 ku,等电点为5.20,为亲水蛋白;紫苏PfPMK氨基酸与SmPMK、SsPMK、SbPMK和PvPMK同源性较高,说明紫苏PfPMK蛋白在进化过程中保守性较强。亲缘关系分析显示,PfPMK与丹参和一串红的PMK亲缘关系很近,在线软件WoLF-PSORT预测PfPMK蛋白可能定位于质膜或内质网膜上。qRT-PCR结果表明,PfPMK基因在紫苏根、茎、叶中均有表达,在根中的表达量高于在叶和茎中的表达量;紫苏不同生长发育时期的qRT-PCR分析显示,PfPMK基因在9月中下旬表达量较高。首次从紫苏中克隆出PfPMK基因,生物信息学分析该基因属于甲羟戊酸-5-磷酸激酶基因,参与了紫苏萜类物...

关 键 词:紫苏  PfPMK  萜类  生物信息学  功能分析

Cloning and Expression Analysis of 5-Phosphomevalonate Kinase PfPMK Gene in Perilla frutescens L.
LI Hui,WEN Chunxiu,LIU Lingdi,WEN Saiqun,TANG Yinghong,JIANG Tao.Cloning and Expression Analysis of 5-Phosphomevalonate Kinase PfPMK Gene in Perilla frutescens L.[J].Acta Agriculturae Boreali-Sinica,2022,37(2):49-55.
Authors:LI Hui  WEN Chunxiu  LIU Lingdi  WEN Saiqun  TANG Yinghong  JIANG Tao
Abstract:
Keywords:
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