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柳叶芹叶绿体基因组组装与序列特征
引用本文:闫嵩,柳驰,任伟超,刘秀波,徐姣,马伟. 柳叶芹叶绿体基因组组装与序列特征[J]. 东北林业大学学报, 2022, 50(2): 49-52+99. DOI: 10.3969/j.issn.1000-5382.2022.02.009
作者姓名:闫嵩  柳驰  任伟超  刘秀波  徐姣  马伟
作者单位:黑龙江中医药大学,哈尔滨,150040,开姆尼茨工业大学,德国·开姆尼茨,黑龙江中医药大学
基金项目:中药制药过程新技术国家重点实验室开放基金项目(SKL2020M0302);
摘    要:以2020年5月31日采自黑龙江省伊春市的柳叶芹(Czernaevia laevigata turcz.)为试验材料,利用十六烷基三甲基溴化铵法(CTAB)提取基因组DNA,采用Illumina NovaSeq平台进行高通量测序,得到柳叶芹完整的叶绿体基因组序列,分析柳叶芹叶绿体基因组组装、序列特征、系统发育。结果表明:柳叶芹叶绿体基因组总长度146 161 bp,包括1个大单拷贝区长度为93 538 bp、1个小单拷贝区长度为17 779 bp,由2个反向重复序列分别分隔,每个反向重复序列为17 422 bp。对柳叶芹叶绿体全基因组共鉴定出133个基因。系统发育分析表明,柳叶芹与疏叶当归有密切的亲缘关系。柳叶芹的叶绿体基因组序列,为研究伞形科其他植物提供了较为详细、完善的资料,为该物种鉴定以及群体和个体水平的遗传差异分析提供了新的方法。

关 键 词:柳叶芹  叶绿体基因组  系统发育  伞形科

Structural Characteristics and Phylogenetic Relationship of the Chloroplast Genome of Angelica laevigata Fisch
Yan Song,Liu Chi,Ren Weichao,Liu Xiubo,Xu Jiao,Ma Wei. Structural Characteristics and Phylogenetic Relationship of the Chloroplast Genome of Angelica laevigata Fisch[J]. Journal of Northeast Forestry University, 2022, 50(2): 49-52+99. DOI: 10.3969/j.issn.1000-5382.2022.02.009
Authors:Yan Song  Liu Chi  Ren Weichao  Liu Xiubo  Xu Jiao  Ma Wei
Abstract:
Keywords:
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