松乳菇ITS序列比较及其在乳菇属中的系统发育分析 |
| |
引用本文: | 陈玉华,刘君昂,周国英,李河,王圣洁,路宗岩.松乳菇ITS序列比较及其在乳菇属中的系统发育分析[J].食用菌学报,2013(1):18-24. |
| |
作者姓名: | 陈玉华 刘君昂 周国英 李河 王圣洁 路宗岩 |
| |
作者单位: | 中南林业科技大学林学院;经济林培育与保护教育部重点实验室,中南林业科技大学 |
| |
基金项目: | 国家自然科学基金项目(编号:30972371)的部分研究内容 |
| |
摘 要: | 提取江苏、云南、江西、湖南、广西、安徽、湖北地区的松乳菇(Lactarius deliciosus)、红汁乳菇(L.hatsudake)、橙色乳菇(L.akahatsu)和鲑色乳菇(L.salmonicolor)共25个子实体样本的基因组DNA,扩增ITS序列,对GenBank下载和本次及以前测序的松乳菇ITS序列的碱基组成、变异位点及碱基替换类型进行分析,从GenBank下载乳菇属其它8个种,构建乳菇系统发育树。结果显示:松乳菇ITS序列共有20 bp长度的变化,碱基C、T含量大于G、A含量。变异位点ITS共有99个(ITS1 58个、5.8S 4个、ITS2 37个),其中主要是T与C的转换,转换与颠换位点数分别为8和5。ITS1、5.8S、ITS2中转换与颠换的比值R分别为2.34、1.95、1.12。基于ITS序列计算不同地区松乳菇间的遗传距离,江西与意大利、西班牙,法国与西班牙序列间的遗传距离最大为0.012,云南和法国序列间遗传距离为0,是同源序列。系统发育树显示:松乳菇和红汁乳菇、橙色乳菇亲缘关系较近。
|
关 键 词: | 松乳菇 ITS序列 系统发育 |
本文献已被 CNKI 等数据库收录! |
|