绵羊TPT1基因CDS区遗传结构及组织表达研究 |
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引用本文: | 刘旭莹,乔利英,刘建华,杨凯捷,赵弼时,王凤,刘文忠.绵羊TPT1基因CDS区遗传结构及组织表达研究[J].中国畜牧杂志,2021(4):101-105. |
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作者姓名: | 刘旭莹 乔利英 刘建华 杨凯捷 赵弼时 王凤 刘文忠 |
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作者单位: | 山西农业大学动物科学学院 |
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基金项目: | 国家自然科学基金项目(31972560);山西省“1331工程”重点学科建设计划(J201811301)。 |
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摘 要: | 本研究旨在克隆绵羊TPT1基因序列,通过生物信息学分析探究其序列特征及编码蛋白的结构与功能,通过实时荧光定量PCR检测TPT1基因在绵羊不同组织中的空间表达规律。以小尾寒羊为研究对象,PCR扩增获得TPT1的完整编码区(CDS)区并进行测序,对所得序列进行生物信息学分析。结果显示:绵羊TPT1基因CDS为660 bp,编码219个氨基酸,核酸序列与山羊的同源性最高。TPT1蛋白为亲水性蛋白,主要分布在线粒体,存在16个磷酸化位点;二级结构主要包含α-螺旋和无规则卷曲,与预测的三级结构相似。定量PCR结果显示TPT1基因在肾中表达量最高,其次是肌肉、肝、脂肪和肺,在心和脾中表达量最低。结果表明,TPT1基因在生物进化中是保守的,但其表达的蛋白质结构不稳定,在绵羊不同组织中均有表达。
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关 键 词: | 绵羊 TPT1基因 克隆 生物信息学 |
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