| 利用转录组数据开发意大利蜜蜂的SSR分子标记 |
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| 引用本文： | 郭睿,陈华枝,庄天艺,熊翠玲,郑燕珍,付中民,陈恒,陈大福. 利用转录组数据开发意大利蜜蜂的SSR分子标记[J]. 安徽农业大学学报, 2018, 45(3): 404-408. DOI: 10.13610/j.cnki.1672-352x.20180620.015 |
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| 作者姓名： | 郭睿 陈华枝 庄天艺 熊翠玲 郑燕珍 付中民 陈恒 陈大福 |
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| 作者单位： | 福建农林大学蜂学学院,福州,350002;福建农林大学蜂学学院,福州,350002;福建农林大学蜂学学院,福州,350002;福建农林大学蜂学学院,福州,350002;福建农林大学蜂学学院,福州,350002;福建农林大学蜂学学院,福州,350002;福建农林大学蜂学学院,福州,350002;福建农林大学蜂学学院,福州,350002 |
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| 基金项目： | 现代农业产业技术体系建设专项基金(CARS-44-KXJ7)，福建省教育厅中青年教师教育科研项目(JAT170158)，福建省大学生创新创业训练计划项目(201610389113 |
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| 摘 要： | 意大利蜜蜂(简称意蜂)是自然界重要的授粉昆虫,广泛用于世界各国的养蜂生产,具有很高的生态和经济价值。为了开发意蜂的SSR分子标记,利用MISA软件对基于前期获得的意蜂幼虫肠道转录组数据组装得到的12 115条unigenes进行搜索,共预测出分布于2 149条unigenes的6 312个SSR位点,其中主要的重复类型为二核苷酸重复(54.42%)和三核苷酸重复(32.49%),主要基元为AT/AT(31.2%)和AG/CT(18.6%)。进一步利用软件设计出18 444对特异性引物,随机选取24对引物对国内3个不同来源的意蜂幼虫样品进行SSR位点扩增,有22对成功扩增出目的片段。研究开发出的SSR分子标记可用于意蜂的种群遗传和分子进化等研究,结果表明利用转录组数据鉴定非模式生物SSR位点的方法可行且高效。
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| 关 键 词： | 转录组 意大利蜜蜂 SSR 特异性引物 |
| 收稿时间： | 2017-11-08 |
Exploitation of SSR markers for Apis mellifera ligustica based on transcriptome data |
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| GUO Rui,CHEN Huazhi,ZHUANG Tianyi,XIONG Cuiling,ZHENG Yanzheng,FU Zhongmin,CHEN Hen and CHEN Dafu. Exploitation of SSR markers for Apis mellifera ligustica based on transcriptome data[J]. Journal of Anhui Agricultural University, 2018, 45(3): 404-408. DOI: 10.13610/j.cnki.1672-352x.20180620.015 |
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| Authors: | GUO Rui CHEN Huazhi ZHUANG Tianyi XIONG Cuiling ZHENG Yanzheng FU Zhongmin CHEN Hen CHEN Dafu |
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| Affiliation: | College of Bee Science, Fujian Agriculture and Forestry University, Fuzhou 350002,College of Bee Science, Fujian Agriculture and Forestry University, Fuzhou 350002,College of Bee Science, Fujian Agriculture and Forestry University, Fuzhou 350002,College of Bee Science, Fujian Agriculture and Forestry University, Fuzhou 350002,College of Bee Science, Fujian Agriculture and Forestry University, Fuzhou 350002,College of Bee Science, Fujian Agriculture and Forestry University, Fuzhou 350002,College of Bee Science, Fujian Agriculture and Forestry University, Fuzhou 350002 and College of Bee Science, Fujian Agriculture and Forestry University, Fuzhou 350002 |
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