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口蹄疫病毒结构蛋白的二级结构及其B细胞抗原表位的预测
作者姓名:云涛 刘光清 冷青文 郭慧琛 刘在新 张居农 谢庆阁
作者单位:[1]中国农业科学院兰州兽医研究所,甘肃兰州730046 [2]石河子大学动物科技学院,新疆石河子832003
摘    要:以口蹄疫病毒OLZ02株基因组序列为材料,采用Garnier—Robson法、Chou-Fasman法和Karplus—Schulz法预测了其结构蛋白的二级结构,用Kyte-Doolittle法分析了各结构蛋白的亲水性,Emini法预测了各结构蛋白的表面可能性,Jameson—Wolf法预测了各蛋白的抗原指数,综合评价了口蹄疫病毒结构蛋白的B细胞抗原表位。结果表明,VPl蛋白含有的B细胞优势抗原表位最多,是研制口蹄疫基因工程疫苗的首选免疫原,但其他结构蛋白也含有少量的B细胞抗原表位,有的甚至有可能成为优势抗原表位。

关 键 词:口蹄疫病毒 B细胞表位 二级结构
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