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一个小麦AP2/ERF转录因子家族单独亚族基因的克隆及分析
引用本文:庄 静,陈建民,彭日荷,高 峰,朱 波,付晓燕,ZHANG Jian,熊爱生,姚泉洪. 一个小麦AP2/ERF转录因子家族单独亚族基因的克隆及分析[J]. 麦类作物学报, 2009, 29(5): 752-759
作者姓名:庄 静  陈建民  彭日荷  高 峰  朱 波  付晓燕  ZHANG Jian  熊爱生  姚泉洪
作者单位:1. 上海市农业科学院,上海,201106;加拿大艾伯塔省研究院,埃德蒙顿,T9C1T4
2. 扬州大学生物科学与技术学院,江苏扬州,225009
3. 上海市农业科学院,上海,201106
4. 加拿大艾伯塔省研究院,埃德蒙顿,T9C1T4
基金项目:国家"863"项目,上海市青年科技启明星跟踪计划项目,上海市自然科学基金项目,上海市-Alberta国际合作项目,国家转基因重大专项 
摘    要:AP2/ERF家族转录因子是植物中重要的一类转录因子,广泛参与植物各类生理过程.为了给该家族转录因子的深入研究提供基础,利用小麦EST数据库(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/UniGene/UGOrg.cgi?TAXID= 4565),以拟南芥AP2/ERF家族转录因子单独亚族成员AtAP2-Soloist的氨基酸序列为探针,搜索到一个小麦UniGene数据,经拼接得到1个全长cDNA序列(TaAP2-Solosit),通过RT-PCR方法从"扬麦15"的cDNA中克隆了该转录因子基因(YM15AP2-Solosit).克隆的转录因子核苷酸序列与电子克隆的序列只有1个碱基不同,两者编码氨基酸序列一致.从cDNA序列、氨基酸序列的相似性、组成成分、理化性质、疏水性/亲水性、进化树、功能域、二级和三级结构等方面进行了分析,结果显示"扬麦15"中的YM15AP2-Solosit转录因子属于AP2/ERF家族中的单独亚族,是亲水性蛋白,在蛋白质的三级结构上与拟南芥的AtAP2-Soloist相似.EST丰度分析显示,YM15AP2-Solosit在根、茎、叶和花中均有表达.

关 键 词:小麦  AP2/ERF转录因子  基因克隆

Cloning and Analysis of an AP2/ERF Soloist Subfamily Transcription Factor from Triticum aestivum L. Yangmai 15
ZHUANG Jing,CHEN Jian min,PENG Ri he,GAO Feng,ZHU Bo,FU Xiao yan,ZHANG Jian,XIONG Ai sheng,YAO Quan hong. Cloning and Analysis of an AP2/ERF Soloist Subfamily Transcription Factor from Triticum aestivum L. Yangmai 15[J]. Journal of Triticeae Crops, 2009, 29(5): 752-759
Authors:ZHUANG Jing  CHEN Jian min  PENG Ri he  GAO Feng  ZHU Bo  FU Xiao yan  ZHANG Jian  XIONG Ai sheng  YAO Quan hong
Affiliation:1.Shanghai Academy of Agricultural Sciences, Shanghai 201106, China; 2. College of Bioscience and Biotechnology, Yangzhou University, Yangzhou, Jiangsu 225009, China; 3. Alberta Research Council, Edmonton, AB T9C1T4, Canada
Abstract:
Keywords:
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