京海黄鸡G蛋白偶联受体1基因生物信息学及组织表达分析

试验旨在研究参与激素调节并调控卵巢功能的可能基因，挑选候选基因G蛋白偶联受体1（G protein-coupled receptor 1），深入研究其是否参与激素调节。根据转录组测序获得的京海黄鸡GPR1基因的CDS序列设计一对引物，利用实时荧光定量RT-PCR方法，检测GPR1基因在高、低产京海黄鸡卵巢组织中的表达情况，并与生物信息学进行关联，使用多种生物软件和在线工具对目的序列进行生物信息学分析，分析GPR1基因与其他物种的同源性、蛋白质的理化性质、蛋白质序列的跨膜区、亚细胞定位、亲水性、潜在的磷酸化位点、保守结构域及该基因所编码蛋白质的二、三级结构。结果显示，京海黄鸡与GenBank中原鸡、人、牛、野猪、黑猩猩、家兔、马、绵羊、藏羚羊、大鼠、小鼠、斑马鱼的同源性分别为100.0%、69.0%、69.1%、69.3%、68.9%、69.6%、69.2%、68.8%、68.9%、67.5%、69.0%和50.3%；氨基酸分析发现GPR1蛋白为疏水性蛋白，分子质量为40.41 ku，理论等电点为6.91，为7次跨膜蛋白；亚细胞定位显示，该蛋白属于非分泌蛋白；预测该蛋白含有25个潜在的磷酸化位点，1糖基化位点；二级结构以无规则卷曲为主，三级结构为7次跨膜螺旋结构；组织表达分析显示，GPR1基因在低产组的表达情况极显著高于高产组（P<0.01）。本试验结果将有利于GPR1基因功能的进一步分析，为研究该基因对京海黄鸡产蛋性状的调控机理提供理论依据。

Bioinformatics and Tissue Expression Analysis of G Protein-coupled Receptor 1 Gene in Jinghai Yellow Chicken