杉木不完整型EST-SSR特征分析

SSR可以分为完整型(不间断单一型)和不完整型(包含不间断复合型、间断单一型、间断复合型)。本研究旨在分析杉木(Cunninghamia lanceolata)不完整型EST-SSR特征。结果表明:转录组搜索出5 999个不间断单一型EST-SSR,占全部EST-SSR的97.78%,不完整型所包含3种类型EST-SSR的数量接近,SSR数量之和为136个,仅占转录组全部EST-SSR的2.22%。在杉木136个不完整型EST-SSR中,共有单核苷酸、二核苷酸、三核苷酸、四核苷酸、六核苷酸等5种基元重复类型。不间断复合型EST-SSR中基元重复类型的组合数最多,出现了7种组合,间断复合型出现5种组合,间断单一型出现3种组合。