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水牛泌乳期与非泌乳期乳腺组织差异miRNAs的表达模式鉴定及分析
引用本文:蔡小艳,王鹏程,邓凯,王萍,冯万有,张晓溪,任艳萍,刘庆友,石德顺.水牛泌乳期与非泌乳期乳腺组织差异miRNAs的表达模式鉴定及分析[J].中国畜牧兽医,2017,44(11):3220-3228.
作者姓名:蔡小艳  王鹏程  邓凯  王萍  冯万有  张晓溪  任艳萍  刘庆友  石德顺
作者单位:1. 广西大学, 亚热带生物资源保护利用国家重点实验室, 南宁 530004;
2. 广西壮族自治区畜牧研究所, 南宁 530001
基金项目:国家863重点项目课题(2013AA102504):广西科技厅项目(桂科合14125008-2-13、桂科AD17129043、桂科AA16380026)
摘    要:为了探求水牛泌乳和非泌乳期关键调控差异表达miRNAs及其表达模式,试验结合Solexa高通量测序和生物信息学分析结果筛选出18个水牛乳腺组织在泌乳期和非泌乳期差异表达的miRNAs,设计、筛选可行的miRNAs反转录及实时荧光定量PCR引物,进行实时荧光定量PCR验证差异表达miRNAs的表达模式。结果发现,miRNA的差异表达模式与测序结果基本一致。泌乳期miRNA-103、miRNA-125a、miRNA-30a-5p和miRNA-148a的表达量均显著高于非泌乳期(P<0.05);miRNA-29a在非泌乳期表达量显著高于泌乳期(P<0.05);miRNA-141、miRNA-125b和miRNA-497在泌乳期表达量均高于非泌乳期,但差异不显著(P>0.05);低丰度的miRNA-490和miRNA-592在泌乳期表达量均显著高于非泌乳期(P<0.05)。Novel-123b在泌乳期和非泌乳期差异不显著(P>0.05),Novel-57在泌乳期比非泌乳期高29.79倍(P<0.01)。本试验结果为后续水牛乳腺研究提供了16个miRNA的可用特异性反转录引物和实时荧光定量PCR引物,miRNA-103、miRNA-125a、miRNA-30a-5p、miRNA-148a、miRNA-29a和Novel-57 6个水牛差异表达miRNAs值得进一步研究。

关 键 词:水牛  泌乳期  非泌乳期  乳腺组织  miRNA  鉴定  实时荧光定量PCR  
收稿时间:2017-04-26

Identification and Analysis of Differential Expression miRNAs in the Lactation and Non-lactation of Buffalo Mammary Gland
CAI Xiao-yan,WANG Peng-cheng,DENG Kai,WANG Ping,FENG Wan-you,ZHANG Xiao-xi,REN Yan-ping,LIU Qing-you,SHI De-shun.Identification and Analysis of Differential Expression miRNAs in the Lactation and Non-lactation of Buffalo Mammary Gland[J].China Animal Husbandry & Veterinary Medicine,2017,44(11):3220-3228.
Authors:CAI Xiao-yan  WANG Peng-cheng  DENG Kai  WANG Ping  FENG Wan-you  ZHANG Xiao-xi  REN Yan-ping  LIU Qing-you  SHI De-shun
Institution:1. Key Laboratory of Subtrobical Bioresource Conservation and Utlization, Guangxi University, 530004, China;
2. Guangxi Institute of Animal Science, Nanning 530001, China
Abstract:
Keywords:buffalo  lactation  non-lactation  mammary gland  miRNA  identification  Real-time quantitative PCR  
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