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驴肌内脂肪沉积关键调控因子研究
引用本文:李武峰,孙瑜彤,关家伟,赵婧微,杜敏.驴肌内脂肪沉积关键调控因子研究[J].畜牧兽医学报,2021,52(2):364-375.
作者姓名:李武峰  孙瑜彤  关家伟  赵婧微  杜敏
作者单位:1. 山西农业大学生命科学学院, 太谷 030801;2. 美国华盛顿州立大学动物科学系, 美国华盛顿州普尔曼 99164-6310
基金项目:山西省重点研发计划(指南)项目,国际科技合作方面(201803D421022);山西农业大学横向科技项目(2019HX78)。
摘    要:旨在基于转录组(RNA-Seq)和代谢组(UPLC-MS/MS)关联分析,筛选驴肌内脂肪沉积的关键调控因子。本研究选用饲养条件相同、平均体重为236.10 kg的雌性广灵驴30头,对其背最长肌进行肌内脂肪(IMF)含量的测定,选择年龄一致的驴,并根据其IMF含量的高低分为两组:低肌内脂肪组(L组,每组3头)与高肌内脂肪组(H组,每组3头),进行转录组学和代谢组学测序分析,对差异表达基因(DEGs)和差异代谢物(DAMs)进行KEGG关联分析和相关性分析,并构建相关性网络图。结果表明,在L组和H组之间共鉴定出72种差异代谢物,其中27种代谢物上调,45种代谢物下调;关联分析表明,在差异表达基因和差异代谢物之间共有35条共富集通路,其中甘油脂代谢、甘油磷脂代谢、花生四烯酸代谢、亚油酸代谢和不饱和脂肪酸的生物合成5条通路与IMF沉积相关,有8个差异表达基因和15种差异代谢物在这5条通路中富集,包括DGKADGAT2、PLA2G3、GPCPD1和SCD等差异表达基因以及甘油-3-磷酸(glycerol-3-phosphate,G3P)、溶血卵磷脂酸16:0(lysophosphatidic acid,LPA)、溶血卵磷脂酰胆碱16:0(lysophosphatidylcholine,LPC)、二十二碳六烯酸(docosahexaenoic acid,DHA)和花生四烯酸(arachidonic acid,AA)等差异代谢物。另外,通过网络图分析发现,甘油脂代谢通路和甘油磷脂代谢通路中的DGAT2、PLA2G3、GPCPD1和DGKA基因与它们相应的代谢产物具有高度相关性。本研究所鉴定差异表达基因可作为IMF沉积相关的潜在候选基因,为今后进一步探究驴IMF沉积的分子调控机制和驴的肉品质分子育种提供理论依据。

关 键 词:广灵驴  肌内脂肪沉积  转录组  代谢组  关联分析  
收稿时间:2020-07-15

Key Regulatory Factors of Intramuscular Fat Deposition in Donkey
LI Wufeng,SUN Yutong,GUAN Jiawei,ZHAO Jingwei,DU Min.Key Regulatory Factors of Intramuscular Fat Deposition in Donkey[J].Acta Veterinaria et Zootechnica Sinica,2021,52(2):364-375.
Authors:LI Wufeng  SUN Yutong  GUAN Jiawei  ZHAO Jingwei  DU Min
Institution:1. College of Life Sciences, Shanxi Agricultural University, Taigu 030801, China;2. Department of Animal Sciences, Washington State University, Pullman WA 99164-6310, USA
Abstract:
Keywords:
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